MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	G	7	7	1002	1008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002679	G	6	6	4021	4026	0 %	0 %	100 %	0 %	13488323
3	NC_002679	C	6	6	5685	5690	0 %	0 %	0 %	100 %	13488051
4	NC_002679	G	7	7	5912	5918	0 %	0 %	100 %	0 %	13488051
5	NC_002679	A	6	6	6711	6716	100 %	0 %	0 %	0 %	13488179
6	NC_002679	A	6	6	12596	12601	100 %	0 %	0 %	0 %	13488181
7	NC_002679	G	6	6	21287	21292	0 %	0 %	100 %	0 %	13488188
8	NC_002679	T	6	6	23636	23641	0 %	100 %	0 %	0 %	13488189
9	NC_002679	T	6	6	26776	26781	0 %	100 %	0 %	0 %	13488056
10	NC_002679	A	6	6	31914	31919	100 %	0 %	0 %	0 %	13488192
11	NC_002679	C	6	6	42510	42515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_002679	A	6	6	42670	42675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002679	T	6	6	43242	43247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002679	T	9	9	43623	43631	0 %	100 %	0 %	0 %	13488058
15	NC_002679	G	6	6	45557	45562	0 %	0 %	100 %	0 %	13488202
16	NC_002679	T	6	6	47672	47677	0 %	100 %	0 %	0 %	13488203
17	NC_002679	C	7	7	49833	49839	0 %	0 %	0 %	100 %	13488204
18	NC_002679	G	7	7	51659	51665	0 %	0 %	100 %	0 %	13488204
19	NC_002679	C	6	6	56034	56039	0 %	0 %	0 %	100 %	13488060
20	NC_002679	A	7	7	56228	56234	100 %	0 %	0 %	0 %	13488060
21	NC_002679	G	6	6	57002	57007	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002679	G	6	6	60901	60906	0 %	0 %	100 %	0 %	13488324
23	NC_002679	T	7	7	61530	61536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002679	A	6	6	65045	65050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002679	A	6	6	68819	68824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002679	A	7	7	72058	72064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002679	A	6	6	73547	73552	100 %	0 %	0 %	0 %	13488329
28	NC_002679	A	6	6	76317	76322	100 %	0 %	0 %	0 %	13488066
29	NC_002679	A	6	6	82689	82694	100 %	0 %	0 %	0 %	13488071
30	NC_002679	A	6	6	85533	85538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002679	T	6	6	89865	89870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002679	A	6	6	93034	93039	100 %	0 %	0 %	0 %	13488216
33	NC_002679	C	6	6	93819	93824	0 %	0 %	0 %	100 %	13488217
34	NC_002679	T	6	6	94159	94164	0 %	100 %	0 %	0 %	13488217
35	NC_002679	A	7	7	94532	94538	100 %	0 %	0 %	0 %	13488218
36	NC_002679	T	6	6	95227	95232	0 %	100 %	0 %	0 %	13488218
37	NC_002679	A	6	6	95665	95670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002679	T	7	7	100553	100559	0 %	100 %	0 %	0 %	13488076
39	NC_002679	C	6	6	120889	120894	0 %	0 %	0 %	100 %	13488085
40	NC_002679	T	6	6	121548	121553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002679	T	7	7	121569	121575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002679	A	6	6	122425	122430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002679	A	6	6	124287	124292	100 %	0 %	0 %	0 %	13488088
44	NC_002679	T	6	6	128918	128923	0 %	100 %	0 %	0 %	13488093
45	NC_002679	T	6	6	140836	140841	0 %	100 %	0 %	0 %	13488101
46	NC_002679	A	7	7	141075	141081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002679	A	6	6	141161	141166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002679	C	6	6	143004	143009	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_002679	C	6	6	145058	145063	0 %	0 %	0 %	100 %	13488104
50	NC_002679	G	6	6	145086	145091	0 %	0 %	100 %	0 %	13488104
51	NC_002679	C	6	6	146800	146805	0 %	0 %	0 %	100 %	13488106
52	NC_002679	G	6	6	153469	153474	0 %	0 %	100 %	0 %	13488109
53	NC_002679	G	6	6	153838	153843	0 %	0 %	100 %	0 %	13488109
54	NC_002679	G	6	6	157401	157406	0 %	0 %	100 %	0 %	13488229
55	NC_002679	T	6	6	160270	160275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002679	G	6	6	162595	162600	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002679	T	6	6	169397	169402	0 %	100 %	0 %	0 %	13488368
58	NC_002679	G	6	6	169598	169603	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002679	T	6	6	176752	176757	0 %	100 %	0 %	0 %	13488118
60	NC_002679	C	6	6	179419	179424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_002679	T	6	6	186303	186308	0 %	100 %	0 %	0 %	13488238
62	NC_002679	A	8	8	187843	187850	100 %	0 %	0 %	0 %	13488239
63	NC_002679	A	6	6	189593	189598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002679	G	6	6	191426	191431	0 %	0 %	100 %	0 %	13488241
65	NC_002679	A	6	6	202155	202160	100 %	0 %	0 %	0 %	13488246
66	NC_002679	C	7	7	203936	203942	0 %	0 %	0 %	100 %	13488247
67	NC_002679	G	6	6	204782	204787	0 %	0 %	100 %	0 %	13488248
68	NC_002679	G	7	7	209177	209183	0 %	0 %	100 %	0 %	161621457
69	NC_002679	C	6	6	212893	212898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_002679	C	6	6	227413	227418	0 %	0 %	0 %	100 %	13488339
71	NC_002679	A	6	6	233980	233985	100 %	0 %	0 %	0 %	13488265
72	NC_002679	G	6	6	234235	234240	0 %	0 %	100 %	0 %	13488265
73	NC_002679	T	6	6	237201	237206	0 %	100 %	0 %	0 %	13488268
74	NC_002679	T	6	6	242555	242560	0 %	100 %	0 %	0 %	13488272
75	NC_002679	G	6	6	243141	243146	0 %	0 %	100 %	0 %	13488273
76	NC_002679	A	6	6	251169	251174	100 %	0 %	0 %	0 %	13488280
77	NC_002679	A	6	6	253642	253647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002679	A	6	6	254059	254064	100 %	0 %	0 %	0 %	13488282
79	NC_002679	T	7	7	256140	256146	0 %	100 %	0 %	0 %	13488285
80	NC_002679	C	6	6	266620	266625	0 %	0 %	0 %	100 %	13488291
81	NC_002679	G	6	6	281208	281213	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002679	T	6	6	282433	282438	0 %	100 %	0 %	0 %	13488298
83	NC_002679	T	6	6	283275	283280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002679	G	6	6	285522	285527	0 %	0 %	100 %	0 %	13488300
85	NC_002679	A	6	6	286284	286289	100 %	0 %	0 %	0 %	13488301
86	NC_002679	A	6	6	289267	289272	100 %	0 %	0 %	0 %	13488149
87	NC_002679	G	6	6	294015	294020	0 %	0 %	100 %	0 %	13488153
88	NC_002679	A	6	6	299533	299538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002679	G	6	6	299671	299676	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002679	A	6	6	300762	300767	100 %	0 %	0 %	0 %	13488366
91	NC_002679	G	6	6	307582	307587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002679	A	6	6	311287	311292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002679	A	7	7	312627	312633	100 %	0 %	0 %	0 %	13488163
94	NC_002679	C	6	6	313492	313497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_002679	G	6	6	314552	314557	0 %	0 %	100 %	0 %	13488164
96	NC_002679	T	6	6	316343	316348	0 %	100 %	0 %	0 %	13488306
97	NC_002679	C	6	6	319284	319289	0 %	0 %	0 %	100 %	13488166
98	NC_002679	T	6	6	322598	322603	0 %	100 %	0 %	0 %	13488308
99	NC_002679	A	7	7	322648	322654	100 %	0 %	0 %	0 %	13488308
100	NC_002679	A	6	6	324036	324041	100 %	0 %	0 %	0 %	13488169
101	NC_002679	T	6	6	325193	325198	0 %	100 %	0 %	0 %	13488309
102	NC_002679	C	6	6	327215	327220	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_002679	G	6	6	327463	327468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002679	A	6	6	331256	331261	100 %	0 %	0 %	0 %	13488172
105	NC_002679	T	6	6	331375	331380	0 %	100 %	0 %	0 %	13488172
106	NC_002679	A	6	6	331815	331820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002679	A	6	6	332294	332299	100 %	0 %	0 %	0 %	13488310
108	NC_002679	C	7	7	332901	332907	0 %	0 %	0 %	100 %	13488310
109	NC_002679	A	6	6	334553	334558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002679	G	7	7	334817	334823	0 %	0 %	100 %	0 %	13488312
111	NC_002679	G	6	6	335522	335527	0 %	0 %	100 %	0 %	13488312
112	NC_002679	A	6	6	335717	335722	100 %	0 %	0 %	0 %	13488312
113	NC_002679	T	6	6	336801	336806	0 %	100 %	0 %	0 %	13488313
114	NC_002679	G	6	6	338017	338022	0 %	0 %	100 %	0 %	13488315
115	NC_002679	T	6	6	341133	341138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002679	G	8	8	342253	342260	0 %	0 %	100 %	0 %	13488173
117	NC_002679	A	6	6	343368	343373	100 %	0 %	0 %	0 %	13488173
118	NC_002679	T	7	7	343667	343673	0 %	100 %	0 %	0 %	13488174
119	NC_002679	T	6	6	344515	344520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002679	C	6	6	346552	346557	0 %	0 %	0 %	100 %	13488177
121	NC_002679	A	6	6	349995	350000	100 %	0 %	0 %	0 %	161621456
122	NC_002679	T	6	6	351451	351456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.