MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002679	G	6	6	4021	4026	0 %	0 %	100 %	0 %	13488323
2	NC_002679	C	6	6	5685	5690	0 %	0 %	0 %	100 %	13488051
3	NC_002679	G	7	7	5912	5918	0 %	0 %	100 %	0 %	13488051
4	NC_002679	A	6	6	6711	6716	100 %	0 %	0 %	0 %	13488179
5	NC_002679	A	6	6	12596	12601	100 %	0 %	0 %	0 %	13488181
6	NC_002679	G	6	6	21287	21292	0 %	0 %	100 %	0 %	13488188
7	NC_002679	T	6	6	23636	23641	0 %	100 %	0 %	0 %	13488189
8	NC_002679	T	6	6	26776	26781	0 %	100 %	0 %	0 %	13488056
9	NC_002679	A	6	6	31914	31919	100 %	0 %	0 %	0 %	13488192
10	NC_002679	T	9	9	43623	43631	0 %	100 %	0 %	0 %	13488058
11	NC_002679	G	6	6	45557	45562	0 %	0 %	100 %	0 %	13488202
12	NC_002679	T	6	6	47672	47677	0 %	100 %	0 %	0 %	13488203
13	NC_002679	C	7	7	49833	49839	0 %	0 %	0 %	100 %	13488204
14	NC_002679	G	7	7	51659	51665	0 %	0 %	100 %	0 %	13488204
15	NC_002679	C	6	6	56034	56039	0 %	0 %	0 %	100 %	13488060
16	NC_002679	A	7	7	56228	56234	100 %	0 %	0 %	0 %	13488060
17	NC_002679	G	6	6	60901	60906	0 %	0 %	100 %	0 %	13488324
18	NC_002679	A	6	6	73547	73552	100 %	0 %	0 %	0 %	13488329
19	NC_002679	A	6	6	76317	76322	100 %	0 %	0 %	0 %	13488066
20	NC_002679	A	6	6	82689	82694	100 %	0 %	0 %	0 %	13488071
21	NC_002679	A	6	6	93034	93039	100 %	0 %	0 %	0 %	13488216
22	NC_002679	C	6	6	93819	93824	0 %	0 %	0 %	100 %	13488217
23	NC_002679	T	6	6	94159	94164	0 %	100 %	0 %	0 %	13488217
24	NC_002679	A	7	7	94532	94538	100 %	0 %	0 %	0 %	13488218
25	NC_002679	T	6	6	95227	95232	0 %	100 %	0 %	0 %	13488218
26	NC_002679	T	7	7	100553	100559	0 %	100 %	0 %	0 %	13488076
27	NC_002679	C	6	6	120889	120894	0 %	0 %	0 %	100 %	13488085
28	NC_002679	A	6	6	124287	124292	100 %	0 %	0 %	0 %	13488088
29	NC_002679	T	6	6	128918	128923	0 %	100 %	0 %	0 %	13488093
30	NC_002679	T	6	6	140836	140841	0 %	100 %	0 %	0 %	13488101
31	NC_002679	C	6	6	145058	145063	0 %	0 %	0 %	100 %	13488104
32	NC_002679	G	6	6	145086	145091	0 %	0 %	100 %	0 %	13488104
33	NC_002679	C	6	6	146800	146805	0 %	0 %	0 %	100 %	13488106
34	NC_002679	G	6	6	153469	153474	0 %	0 %	100 %	0 %	13488109
35	NC_002679	G	6	6	153838	153843	0 %	0 %	100 %	0 %	13488109
36	NC_002679	G	6	6	157401	157406	0 %	0 %	100 %	0 %	13488229
37	NC_002679	T	6	6	169397	169402	0 %	100 %	0 %	0 %	13488368
38	NC_002679	T	6	6	176752	176757	0 %	100 %	0 %	0 %	13488118
39	NC_002679	T	6	6	186303	186308	0 %	100 %	0 %	0 %	13488238
40	NC_002679	A	8	8	187843	187850	100 %	0 %	0 %	0 %	13488239
41	NC_002679	G	6	6	191426	191431	0 %	0 %	100 %	0 %	13488241
42	NC_002679	A	6	6	202155	202160	100 %	0 %	0 %	0 %	13488246
43	NC_002679	C	7	7	203936	203942	0 %	0 %	0 %	100 %	13488247
44	NC_002679	G	6	6	204782	204787	0 %	0 %	100 %	0 %	13488248
45	NC_002679	G	7	7	209177	209183	0 %	0 %	100 %	0 %	161621457
46	NC_002679	C	6	6	227413	227418	0 %	0 %	0 %	100 %	13488339
47	NC_002679	A	6	6	233980	233985	100 %	0 %	0 %	0 %	13488265
48	NC_002679	G	6	6	234235	234240	0 %	0 %	100 %	0 %	13488265
49	NC_002679	T	6	6	237201	237206	0 %	100 %	0 %	0 %	13488268
50	NC_002679	T	6	6	242555	242560	0 %	100 %	0 %	0 %	13488272
51	NC_002679	G	6	6	243141	243146	0 %	0 %	100 %	0 %	13488273
52	NC_002679	A	6	6	251169	251174	100 %	0 %	0 %	0 %	13488280
53	NC_002679	A	6	6	254059	254064	100 %	0 %	0 %	0 %	13488282
54	NC_002679	T	7	7	256140	256146	0 %	100 %	0 %	0 %	13488285
55	NC_002679	C	6	6	266620	266625	0 %	0 %	0 %	100 %	13488291
56	NC_002679	T	6	6	282433	282438	0 %	100 %	0 %	0 %	13488298
57	NC_002679	G	6	6	285522	285527	0 %	0 %	100 %	0 %	13488300
58	NC_002679	A	6	6	286284	286289	100 %	0 %	0 %	0 %	13488301
59	NC_002679	A	6	6	289267	289272	100 %	0 %	0 %	0 %	13488149
60	NC_002679	G	6	6	294015	294020	0 %	0 %	100 %	0 %	13488153
61	NC_002679	A	6	6	300762	300767	100 %	0 %	0 %	0 %	13488366
62	NC_002679	A	7	7	312627	312633	100 %	0 %	0 %	0 %	13488163
63	NC_002679	G	6	6	314552	314557	0 %	0 %	100 %	0 %	13488164
64	NC_002679	T	6	6	316343	316348	0 %	100 %	0 %	0 %	13488306
65	NC_002679	C	6	6	319284	319289	0 %	0 %	0 %	100 %	13488166
66	NC_002679	T	6	6	322598	322603	0 %	100 %	0 %	0 %	13488308
67	NC_002679	A	7	7	322648	322654	100 %	0 %	0 %	0 %	13488308
68	NC_002679	A	6	6	324036	324041	100 %	0 %	0 %	0 %	13488169
69	NC_002679	T	6	6	325193	325198	0 %	100 %	0 %	0 %	13488309
70	NC_002679	A	6	6	331256	331261	100 %	0 %	0 %	0 %	13488172
71	NC_002679	T	6	6	331375	331380	0 %	100 %	0 %	0 %	13488172
72	NC_002679	A	6	6	332294	332299	100 %	0 %	0 %	0 %	13488310
73	NC_002679	C	7	7	332901	332907	0 %	0 %	0 %	100 %	13488310
74	NC_002679	G	7	7	334817	334823	0 %	0 %	100 %	0 %	13488312
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76	NC_002679	A	6	6	335717	335722	100 %	0 %	0 %	0 %	13488312
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81	NC_002679	T	7	7	343667	343673	0 %	100 %	0 %	0 %	13488174
82	NC_002679	C	6	6	346552	346557	0 %	0 %	0 %	100 %	13488177
83	NC_002679	A	6	6	349995	350000	100 %	0 %	0 %	0 %	161621456

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.