MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 3889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002678	ATTGGG	2	12	6325173	6325184	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	13476343
3502	NC_002678	AGCCGT	2	12	6329415	6329426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476349
3503	NC_002678	CGCGCA	2	12	6330309	6330320	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476349
3504	NC_002678	CATAGG	2	12	6330519	6330530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476349
3505	NC_002678	CGCAAG	2	12	6332169	6332180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476351
3506	NC_002678	AACGGC	2	12	6334478	6334489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476354
3507	NC_002678	GCAGGC	2	12	6334957	6334968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476354
3508	NC_002678	CGGCAT	2	12	6335155	6335166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476354
3509	NC_002678	AGCCGC	2	12	6335929	6335940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476355
3510	NC_002678	GGAAAA	2	12	6336703	6336714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13476356
3511	NC_002678	GAGGGC	2	12	6336798	6336809	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	13476356
3512	NC_002678	TGCGGG	2	12	6336970	6336981	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	13476357
3513	NC_002678	CCCGCA	2	12	6337379	6337390	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13476357
3514	NC_002678	ACCGAC	2	12	6338504	6338515	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13476359
3515	NC_002678	GGCGCG	2	12	6340835	6340846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13476361
3516	NC_002678	GCCAGC	2	12	6341415	6341426	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476361
3517	NC_002678	GCATCG	2	12	6343374	6343385	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476363
3518	NC_002678	GCCGAT	2	12	6346431	6346442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476366
3519	NC_002678	TGACGC	2	12	6347987	6347998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476368
3520	NC_002678	GCCCTT	2	12	6350770	6350781	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13476371
3521	NC_002678	CGCTTC	2	12	6351940	6351951	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13476372
3522	NC_002678	TCACCG	2	12	6352806	6352817	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13476372
3523	NC_002678	CTTCGT	2	12	6354772	6354783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476374
3524	NC_002678	TCGTCT	2	12	6357118	6357129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476376
3525	NC_002678	TTCTGG	2	12	6365391	6365402	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	13476386
3526	NC_002678	TCGCTG	2	12	6365529	6365540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476386
3527	NC_002678	CGCTGG	2	12	6365794	6365805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476386
3528	NC_002678	TCGGCC	2	12	6366181	6366192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476386
3529	NC_002678	GCGCGG	2	12	6366782	6366793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13476387
3530	NC_002678	CCCGCA	2	12	6367297	6367308	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13476388
3531	NC_002678	CCGGCG	2	12	6370583	6370594	0 %	0 %	50 %	50 %	13476390
3532	NC_002678	CCGTCG	2	12	6379446	6379457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476393
3533	NC_002678	ACGGCG	2	12	6380218	6380229	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476394
3534	NC_002678	TCAAGA	2	12	6380495	6380506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13476394
3535	NC_002678	TCGACA	2	12	6381314	6381325	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	13476394
3536	NC_002678	GCTGCC	2	12	6382385	6382396	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476395
3537	NC_002678	CCGGCG	2	12	6384734	6384745	0 %	0 %	50 %	50 %	13476397
3538	NC_002678	CGGCCA	2	12	6388650	6388661	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476402
3539	NC_002678	CGGAAG	2	12	6389605	6389616	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	161621444
3540	NC_002678	ACCGCC	2	12	6390171	6390182	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	161621444
3541	NC_002678	CGCGGG	2	12	6390197	6390208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161621444
3542	NC_002678	CGGTAT	2	12	6394275	6394286	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476409
3543	NC_002678	TCAGCG	2	12	6394833	6394844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476409
3544	NC_002678	GAGGTT	2	12	6396147	6396158	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	13476410
3545	NC_002678	GCGTCA	2	12	6397770	6397781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476411
3546	NC_002678	CGGGGG	2	12	6400517	6400528	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	13476413
3547	NC_002678	GCCGGC	2	12	6401719	6401730	0 %	0 %	50 %	50 %	13476414
3548	NC_002678	TGCCGC	2	12	6405020	6405031	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476417
3549	NC_002678	TGCGCA	2	12	6405554	6405565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476418
3550	NC_002678	CGTAGC	2	12	6405851	6405862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476418
3551	NC_002678	GCCGCA	2	12	6412483	6412494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476425
3552	NC_002678	TGGCCC	2	12	6413495	6413506	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476426
3553	NC_002678	TGGCGC	2	12	6413534	6413545	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476426
3554	NC_002678	GTCCGC	2	12	6414087	6414098	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476426
3555	NC_002678	CTCGGC	2	12	6415596	6415607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476427
3556	NC_002678	GCCGGC	2	12	6417135	6417146	0 %	0 %	50 %	50 %	13476428
3557	NC_002678	GCCAGG	2	12	6418174	6418185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476429
3558	NC_002678	GCTTGG	2	12	6420428	6420439	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476432
3559	NC_002678	GGTGTT	2	12	6420943	6420954	0 %	50 %	50 %	0 %	13476433
3560	NC_002678	TCGCCG	2	12	6421762	6421773	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476434
3561	NC_002678	CGACAA	2	12	6422568	6422579	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	13476435
3562	NC_002678	AAGGAC	2	12	6424734	6424745	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	13476436
3563	NC_002678	CGAAGG	2	12	6426056	6426067	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	13476438
3564	NC_002678	CATCGG	2	12	6427128	6427139	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476440
3565	NC_002678	CGGCGT	2	12	6427991	6428002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476441
3566	NC_002678	GATGCC	2	12	6429405	6429416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476443
3567	NC_002678	CCGGCT	2	12	6429565	6429576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476443
3568	NC_002678	GAACCG	2	12	6430753	6430764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476444
3569	NC_002678	ACGTCA	2	12	6431438	6431449	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	13476444
3570	NC_002678	TCACGA	2	12	6431693	6431704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	13476444
3571	NC_002678	GCCGTC	2	12	6432210	6432221	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476445
3572	NC_002678	CGCGGC	2	12	6433109	6433120	0 %	0 %	50 %	50 %	13476446
3573	NC_002678	CGCTGG	2	12	6433339	6433350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476446
3574	NC_002678	GCATCG	2	12	6434275	6434286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476446
3575	NC_002678	CGGCGC	2	12	6435017	6435028	0 %	0 %	50 %	50 %	13476446
3576	NC_002678	ATCGGC	2	12	6435580	6435591	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476447
3577	NC_002678	CTGGTG	2	12	6438192	6438203	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476450
3578	NC_002678	CGAGGA	2	12	6438925	6438936	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	13476451
3579	NC_002678	GGTGCC	2	12	6439318	6439329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476451
3580	NC_002678	CTGGCG	2	12	6441582	6441593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476454
3581	NC_002678	TCCAGC	2	12	6444455	6444466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13476460
3582	NC_002678	CGGAGA	2	12	6447709	6447720	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	13476462
3583	NC_002678	CACGGC	2	12	6451041	6451052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476466
3584	NC_002678	ATGACC	2	12	6456863	6456874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	13476474
3585	NC_002678	AGGTCG	2	12	6458154	6458165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476475
3586	NC_002678	CGCTGG	2	12	6459053	6459064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476476
3587	NC_002678	GCACCG	2	12	6459215	6459226	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476476
3588	NC_002678	CACCGC	2	12	6460620	6460631	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13476478
3589	NC_002678	GTCGGC	2	12	6460886	6460897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476478
3590	NC_002678	TCAGCG	2	12	6467535	6467546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476485
3591	NC_002678	GTCAAG	2	12	6468570	6468581	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476486
3592	NC_002678	GACGGT	2	12	6469007	6469018	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476487
3593	NC_002678	GCCGGC	2	12	6469341	6469352	0 %	0 %	50 %	50 %	13476487
3594	NC_002678	CACCGC	2	12	6471822	6471833	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13476490
3595	NC_002678	GCCCTT	2	12	6473436	6473447	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13476490
3596	NC_002678	TTGGTG	2	12	6474130	6474141	0 %	50 %	50 %	0 %	13476491
3597	NC_002678	CGATGG	2	12	6476851	6476862	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476494
3598	NC_002678	CCAGCA	2	12	6476881	6476892	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13476494
3599	NC_002678	TCGCTG	2	12	6477737	6477748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476495
3600	NC_002678	CCGGCA	2	12	6479936	6479947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476498
3601	NC_002678	CGATGA	2	12	6486183	6486194	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476503
3602	NC_002678	CTGGAA	2	12	6488823	6488834	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476507
3603	NC_002678	TGGCCT	2	12	6488918	6488929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476507
3604	NC_002678	GACGTC	2	12	6489366	6489377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476507
3605	NC_002678	ATGTGC	2	12	6489841	6489852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476507
3606	NC_002678	CCTTGA	2	12	6490659	6490670	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476508
3607	NC_002678	CGGTCG	2	12	6491318	6491329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476510
3608	NC_002678	GTGCTG	2	12	6492561	6492572	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476511
3609	NC_002678	CGTCAA	2	12	6492707	6492718	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	13476511
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3611	NC_002678	GCCAGC	2	12	6495439	6495450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476512
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3613	NC_002678	CTTCGG	2	12	6499463	6499474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476516
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3709	NC_002678	ATGACG	2	12	6719430	6719441	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476760
3710	NC_002678	GGTTTT	2	12	6722678	6722689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13476765
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3712	NC_002678	ACCCGC	2	12	6727112	6727123	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13476773
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3714	NC_002678	GACTTC	2	12	6729864	6729875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476776
3715	NC_002678	CGGTCG	2	12	6730751	6730762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476776
3716	NC_002678	GGATTC	2	12	6731324	6731335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476777
3717	NC_002678	CGCCAT	2	12	6732521	6732532	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13476779
3718	NC_002678	GGTCGC	2	12	6732698	6732709	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476779
3719	NC_002678	CGACCG	2	12	6734880	6734891	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476781
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3816	NC_002678	CGCCGG	2	12	6910426	6910437	0 %	0 %	50 %	50 %	13476943
3817	NC_002678	ATCGTG	2	12	6911200	6911211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476944
3818	NC_002678	CGCGCT	2	12	6911280	6911291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476944
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3820	NC_002678	CGTCTT	2	12	6912048	6912059	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476944
3821	NC_002678	GATCGA	2	12	6912197	6912208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476944
3822	NC_002678	TCGGGC	2	12	6912300	6912311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476945
3823	NC_002678	ACGCTG	2	12	6913277	6913288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476946
3824	NC_002678	GCCACC	2	12	6913685	6913696	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13476946
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3829	NC_002678	GACCAG	2	12	6923698	6923709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476958
3830	NC_002678	GTCGAT	2	12	6924705	6924716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476960
3831	NC_002678	GCGGGC	2	12	6926101	6926112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13476961
3832	NC_002678	CCGTGC	2	12	6928301	6928312	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476962
3833	NC_002678	CCGAGC	2	12	6931022	6931033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476964
3834	NC_002678	CAGGAT	2	12	6934034	6934045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476967
3835	NC_002678	AGGCCG	2	12	6935608	6935619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476969
3836	NC_002678	CATTGC	2	12	6938240	6938251	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476971
3837	NC_002678	CGATCT	2	12	6938594	6938605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476971
3838	NC_002678	TCAGCG	2	12	6938797	6938808	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476972
3839	NC_002678	CGCGAC	2	12	6941502	6941513	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476975
3840	NC_002678	GCTGGT	2	12	6941573	6941584	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476975
3841	NC_002678	TGCTGG	2	12	6942382	6942393	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476975
3842	NC_002678	ATCGGC	2	12	6942405	6942416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476975
3843	NC_002678	TGCCGT	2	12	6944386	6944397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476978
3844	NC_002678	GGCCTC	2	12	6946535	6946546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476979
3845	NC_002678	TGGACG	2	12	6948434	6948445	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476981
3846	NC_002678	TGCCGA	2	12	6950064	6950075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476984
3847	NC_002678	GCAAGC	2	12	6950606	6950617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476984
3848	NC_002678	TTTCGC	2	12	6953284	6953295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476988
3849	NC_002678	CGGCGC	2	12	6953527	6953538	0 %	0 %	50 %	50 %	13476988
3850	NC_002678	GCCGGT	2	12	6953702	6953713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476988
3851	NC_002678	GCGATA	2	12	6957654	6957665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476992
3852	NC_002678	GGAAGA	2	12	6961459	6961470	50 %	0 %	50 %	0 %	13476996
3853	NC_002678	GGCGAG	2	12	6961823	6961834	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	13476996
3854	NC_002678	CGATGC	2	12	6965061	6965072	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476999
3855	NC_002678	GTAGCG	2	12	6968061	6968072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477002
3856	NC_002678	CGAGAC	2	12	6973723	6973734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13477007
3857	NC_002678	CGACGG	2	12	6976527	6976538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13477010
3858	NC_002678	GCTTTT	2	12	6976539	6976550	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	13477010
3859	NC_002678	TTCGGC	2	12	6978534	6978545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13477014
3860	NC_002678	CGGTTG	2	12	6978580	6978591	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13477014
3861	NC_002678	CTTGCC	2	12	6979105	6979116	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13477015
3862	NC_002678	GCGCTG	2	12	6979446	6979457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13477015
3863	NC_002678	GAATTT	2	12	6981401	6981412	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	13477017
3864	NC_002678	CAAAGT	2	12	6982330	6982341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13477018
3865	NC_002678	TCGCTG	2	12	6983206	6983217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13477021
3866	NC_002678	CGCCGA	2	12	6988090	6988101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13477027
3867	NC_002678	ACCGCC	2	12	6990581	6990592	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13477029
3868	NC_002678	CGCCAA	2	12	6993814	6993825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13477032
3869	NC_002678	GCGTCC	2	12	6994179	6994190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477032
3870	NC_002678	AGGTCA	2	12	6994552	6994563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13477033
3871	NC_002678	CCTTCA	2	12	6996722	6996733	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	13477037
3872	NC_002678	ACCATC	2	12	6998267	6998278	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	13470327
3873	NC_002678	CAAGAT	2	12	6999672	6999683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13477042
3874	NC_002678	CATCCC	2	12	7000686	7000697	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	13477042
3875	NC_002678	TGCCGC	2	12	7004121	7004132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477046
3876	NC_002678	TTGTCT	2	12	7004941	7004952	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	13477047
3877	NC_002678	CCGATC	2	12	7006038	7006049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13477047
3878	NC_002678	GGTGAA	2	12	7007740	7007751	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	13477048
3879	NC_002678	CCGGTC	2	12	7010161	7010172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477050
3880	NC_002678	TGCGGA	2	12	7012182	7012193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477054
3881	NC_002678	CGGCAG	2	12	7016300	7016311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13477058
3882	NC_002678	GCAACC	2	12	7018236	7018247	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13477059
3883	NC_002678	CGGCCT	2	12	7023171	7023182	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477064
3884	NC_002678	GGCGAT	2	12	7023758	7023769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477065
3885	NC_002678	TTCGAC	2	12	7024668	7024679	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13477066
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3888	NC_002678	CCCAGC	2	12	7030842	7030853	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13477072
3889	NC_002678	CGATGG	2	12	7035701	7035712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477076

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