MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 4160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002678	CGAGGC	2	12	6776907	6776918	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476821
4002	NC_002678	GAGGCT	2	12	6779895	6779906	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476824
4003	NC_002678	TCACCG	2	12	6783640	6783651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13476828
4004	NC_002678	CGATGG	2	12	6792878	6792889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476839
4005	NC_002678	CGCCAG	2	12	6793341	6793352	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476839
4006	NC_002678	CGATGG	2	12	6795241	6795252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476841
4007	NC_002678	GGCGTG	2	12	6799491	6799502	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	13476844
4008	NC_002678	CCTGGA	2	12	6799677	6799688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476844
4009	NC_002678	GCCGGC	2	12	6804132	6804143	0 %	0 %	50 %	50 %	13476848
4010	NC_002678	TCACCA	2	12	6804649	6804660	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	13476848
4011	NC_002678	GGTCGA	2	12	6808133	6808144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476852
4012	NC_002678	CATGGT	2	12	6809906	6809917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476853
4013	NC_002678	AAGGCC	2	12	6810568	6810579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476854
4014	NC_002678	GGTGCC	2	12	6810603	6810614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476854
4015	NC_002678	GTGCCG	2	12	6810715	6810726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476854
4016	NC_002678	TCGGCG	2	12	6810884	6810895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476854
4017	NC_002678	GCTGGC	2	12	6811152	6811163	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476854
4018	NC_002678	GCATCG	2	12	6811496	6811507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476854
4019	NC_002678	AATCGA	2	12	6811915	6811926	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13476855
4020	NC_002678	TGCCGA	2	12	6813120	6813131	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476857
4021	NC_002678	TATCTC	2	12	6816231	6816242	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	13476860
4022	NC_002678	TTGGCG	2	12	6819471	6819482	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476864
4023	NC_002678	TGGCCA	2	12	6819694	6819705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476864
4024	NC_002678	TCAGCG	2	12	6820389	6820400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476865
4025	NC_002678	GTGGAT	2	12	6823729	6823740	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	13476869
4026	NC_002678	CTCGAT	2	12	6824972	6824983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476870
4027	NC_002678	TCGGCG	2	12	6826214	6826225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476871
4028	NC_002678	GACCAC	2	12	6827546	6827557	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13476872
4029	NC_002678	CGCCTT	2	12	6829147	6829158	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13476873
4030	NC_002678	ATGCCG	2	12	6829731	6829742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476873
4031	NC_002678	TGGCGA	2	12	6831805	6831816	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476875
4032	NC_002678	AGATCG	2	12	6832329	6832340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476875
4033	NC_002678	TCGCCA	2	12	6834654	6834665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13476875
4034	NC_002678	CCGCGA	2	12	6834907	6834918	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476875
4035	NC_002678	CGACCG	2	12	6835305	6835316	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476875
4036	NC_002678	GCCGAG	2	12	6835967	6835978	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476875
4037	NC_002678	CGACGG	2	12	6836908	6836919	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476875
4038	NC_002678	CTATGC	2	12	6837340	6837351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476875
4039	NC_002678	GGCGAG	2	12	6838184	6838195	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	13476875
4040	NC_002678	GGGCGA	2	12	6838621	6838632	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	13476875
4041	NC_002678	AGACCA	2	12	6839172	6839183	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	13476875
4042	NC_002678	CTTCTC	2	12	6841424	6841435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_002678	CCTGTT	2	12	6843755	6843766	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476879
4044	NC_002678	GGGCAT	2	12	6843803	6843814	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476879
4045	NC_002678	GAAGAT	2	12	6844903	6844914	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	13476880
4046	NC_002678	CATCAC	2	12	6845267	6845278	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	13476881
4047	NC_002678	CGCCGA	2	12	6847233	6847244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476882
4048	NC_002678	GCACGC	2	12	6848582	6848593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476884
4049	NC_002678	CTTGGC	2	12	6849121	6849132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476884
4050	NC_002678	GCCTTG	2	12	6850463	6850474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476886
4051	NC_002678	TCGCGC	2	12	6852292	6852303	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476887
4052	NC_002678	GGCCTC	2	12	6853233	6853244	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476887
4053	NC_002678	CCTTGG	2	12	6853762	6853773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476888
4054	NC_002678	GATCGA	2	12	6858606	6858617	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476893
4055	NC_002678	AGCGAT	2	12	6859306	6859317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4056	NC_002678	CGATGC	2	12	6859955	6859966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476894
4057	NC_002678	GCACCA	2	12	6860417	6860428	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13476894
4058	NC_002678	GCTGGT	2	12	6862931	6862942	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476896
4059	NC_002678	TTGGCG	2	12	6863416	6863427	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476897
4060	NC_002678	GCTGGC	2	12	6863526	6863537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476897
4061	NC_002678	AGAACG	2	12	6864129	6864140	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	13476898
4062	NC_002678	GCCGTC	2	12	6864965	6864976	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476899
4063	NC_002678	CTCGCG	2	12	6865111	6865122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476899
4064	NC_002678	GAAGAT	2	12	6866215	6866226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	13476900
4065	NC_002678	AGCACC	2	12	6866834	6866845	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13476900
4066	NC_002678	CGAGAT	2	12	6868176	6868187	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476902
4067	NC_002678	TGACGC	2	12	6869827	6869838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476903
4068	NC_002678	ATCGCC	2	12	6875589	6875600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13476906
4069	NC_002678	GTCAGC	2	12	6875919	6875930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476906
4070	NC_002678	ACGGCG	2	12	6876823	6876834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476907
4071	NC_002678	CCTCGA	2	12	6878648	6878659	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13476909
4072	NC_002678	GGTCGG	2	12	6879657	6879668	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4073	NC_002678	GCGGCC	2	12	6883908	6883919	0 %	0 %	50 %	50 %	13476916
4074	NC_002678	GTGCGC	2	12	6889068	6889079	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_002678	CCAAGG	2	12	6892194	6892205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476924
4076	NC_002678	CTCGCC	2	12	6892578	6892589	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	13476925
4077	NC_002678	CGGTGC	2	12	6900430	6900441	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476933
4078	NC_002678	TCTGGA	2	12	6901917	6901928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476934
4079	NC_002678	GCGCAA	2	12	6905435	6905446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470326
4080	NC_002678	GATCCG	2	12	6906047	6906058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476938
4081	NC_002678	ATCGGC	2	12	6906317	6906328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476938
4082	NC_002678	CGAAGG	2	12	6907722	6907733	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	13476940
4083	NC_002678	ATCGGT	2	12	6909015	6909026	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476942
4084	NC_002678	CGCCGG	2	12	6910426	6910437	0 %	0 %	50 %	50 %	13476943
4085	NC_002678	ATCGTG	2	12	6911200	6911211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476944
4086	NC_002678	CGCGCT	2	12	6911280	6911291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476944
4087	NC_002678	GGCATG	2	12	6911902	6911913	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476944
4088	NC_002678	CGTCTT	2	12	6912048	6912059	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476944
4089	NC_002678	GATCGA	2	12	6912197	6912208	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476944
4090	NC_002678	TCGGGC	2	12	6912300	6912311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476945
4091	NC_002678	ACGCTG	2	12	6913277	6913288	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476946
4092	NC_002678	GCCACC	2	12	6913685	6913696	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13476946
4093	NC_002678	CATCGT	2	12	6915320	6915331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476947
4094	NC_002678	TGTTCC	2	12	6917308	6917319	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476949
4095	NC_002678	GACCTG	2	12	6919345	6919356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476951
4096	NC_002678	CGCGCA	2	12	6923037	6923048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476957
4097	NC_002678	GACCAG	2	12	6923698	6923709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476958
4098	NC_002678	GTCGAT	2	12	6924705	6924716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13476960
4099	NC_002678	GCGGGC	2	12	6926101	6926112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13476961
4100	NC_002678	CCGTGC	2	12	6928301	6928312	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476962
4101	NC_002678	CCGAGC	2	12	6931022	6931033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476964
4102	NC_002678	CAGGAT	2	12	6934034	6934045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476967
4103	NC_002678	CGGTGC	2	12	6935071	6935082	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_002678	GAGAAG	2	12	6935234	6935245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_002678	AGGCCG	2	12	6935608	6935619	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13476969
4106	NC_002678	CATTGC	2	12	6938240	6938251	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476971
4107	NC_002678	CGATCT	2	12	6938594	6938605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13476971
4108	NC_002678	TCAGCG	2	12	6938797	6938808	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476972
4109	NC_002678	CGCGAC	2	12	6941502	6941513	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13476975
4110	NC_002678	GCTGGT	2	12	6941573	6941584	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476975
4111	NC_002678	TGCTGG	2	12	6942382	6942393	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13476975
4112	NC_002678	ATCGGC	2	12	6942405	6942416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476975
4113	NC_002678	TGCCGT	2	12	6944386	6944397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13476978
4114	NC_002678	GGCCTC	2	12	6946535	6946546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13476979
4115	NC_002678	TGGACG	2	12	6948434	6948445	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13476981
4116	NC_002678	TGCCGA	2	12	6950064	6950075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476984
4117	NC_002678	GCAAGC	2	12	6950606	6950617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13476984
4118	NC_002678	TTTCGC	2	12	6953284	6953295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	13476988
4119	NC_002678	CGGCGC	2	12	6953527	6953538	0 %	0 %	50 %	50 %	13476988
4120	NC_002678	GCCGGT	2	12	6953702	6953713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13476988
4121	NC_002678	GCGATA	2	12	6957654	6957665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13476992
4122	NC_002678	GGAAGA	2	12	6961459	6961470	50 %	0 %	50 %	0 %	13476996
4123	NC_002678	GGCGAG	2	12	6961823	6961834	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	13476996
4124	NC_002678	CGATGC	2	12	6965061	6965072	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13476999
4125	NC_002678	GTAGCG	2	12	6968061	6968072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477002
4126	NC_002678	CGAGAC	2	12	6973723	6973734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13477007
4127	NC_002678	CGACGG	2	12	6976527	6976538	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13477010
4128	NC_002678	GCTTTT	2	12	6976539	6976550	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	13477010
4129	NC_002678	TTCGGC	2	12	6978534	6978545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13477014
4130	NC_002678	CGGTTG	2	12	6978580	6978591	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	13477014
4131	NC_002678	CTTGCC	2	12	6979105	6979116	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	13477015
4132	NC_002678	GCGCTG	2	12	6979446	6979457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13477015
4133	NC_002678	AATGCC	2	12	6979721	6979732	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_002678	GAATTT	2	12	6981401	6981412	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	13477017
4135	NC_002678	CAAAGT	2	12	6982330	6982341	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13477018
4136	NC_002678	TCGCTG	2	12	6983206	6983217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13477021
4137	NC_002678	CGCCGA	2	12	6988090	6988101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13477027
4138	NC_002678	ACCGCC	2	12	6990581	6990592	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13477029
4139	NC_002678	CGCCAA	2	12	6993814	6993825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13477032
4140	NC_002678	GCGTCC	2	12	6994179	6994190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477032
4141	NC_002678	AGGTCA	2	12	6994552	6994563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13477033
4142	NC_002678	CCTTCA	2	12	6996722	6996733	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	13477037
4143	NC_002678	ACCATC	2	12	6998267	6998278	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	13470327
4144	NC_002678	CAAGAT	2	12	6999672	6999683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	13477042
4145	NC_002678	CATCCC	2	12	7000686	7000697	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	13477042
4146	NC_002678	TGCCGC	2	12	7004121	7004132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477046
4147	NC_002678	TTGTCT	2	12	7004941	7004952	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	13477047
4148	NC_002678	CCGATC	2	12	7006038	7006049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	13477047
4149	NC_002678	GGTGAA	2	12	7007740	7007751	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	13477048
4150	NC_002678	CCGGTC	2	12	7010161	7010172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477050
4151	NC_002678	TGCGGA	2	12	7012182	7012193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477054
4152	NC_002678	CGGCAG	2	12	7016300	7016311	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13477058
4153	NC_002678	GCAACC	2	12	7018236	7018247	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13477059
4154	NC_002678	CGGCCT	2	12	7023171	7023182	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13477064
4155	NC_002678	GGCGAT	2	12	7023758	7023769	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477065
4156	NC_002678	TTCGAC	2	12	7024668	7024679	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13477066
4157	NC_002678	GCAGGC	2	12	7029260	7029271	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	13477070
4158	NC_002678	GTCGGC	2	12	7029649	7029660	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	13477070
4159	NC_002678	CCCAGC	2	12	7030842	7030853	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	13477072
4160	NC_002678	CGATGG	2	12	7035701	7035712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13477076

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.