MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 5616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002678	GCGGT	2	10	1682	1691	0 %	20 %	60 %	20 %	13470332
2	NC_002678	TGACC	2	10	3967	3976	20 %	20 %	20 %	40 %	13470334
3	NC_002678	AAGGC	2	10	4149	4158	40 %	0 %	40 %	20 %	13470334
4	NC_002678	GCGCC	2	10	7663	7672	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_002678	GGCCA	2	10	8729	8738	20 %	0 %	40 %	40 %	13470337
6	NC_002678	CGATG	2	10	9266	9275	20 %	20 %	40 %	20 %	13470338
7	NC_002678	GCTTC	2	10	9749	9758	0 %	40 %	20 %	40 %	13470338
8	NC_002678	TGCCT	2	10	9759	9768	0 %	40 %	20 %	40 %	13470338
9	NC_002678	GAGCC	2	10	10263	10272	20 %	0 %	40 %	40 %	13470338
10	NC_002678	TGGGG	2	10	10592	10601	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002678	CGGCT	2	10	11283	11292	0 %	20 %	40 %	40 %	13470339
12	NC_002678	GCCGC	2	10	13085	13094	0 %	0 %	40 %	60 %	13470342
13	NC_002678	TCGGC	2	10	14033	14042	0 %	20 %	40 %	40 %	13470342
14	NC_002678	CTCGG	2	10	14892	14901	0 %	20 %	40 %	40 %	57165208
15	NC_002678	ACCGC	2	10	15105	15114	20 %	0 %	20 %	60 %	57165208
16	NC_002678	AGAAA	2	10	16541	16550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002678	ATGGA	2	10	20436	20445	40 %	20 %	40 %	0 %	13470348
18	NC_002678	GGTCG	2	10	21073	21082	0 %	20 %	60 %	20 %	13470349
19	NC_002678	GTTCG	2	10	24642	24651	0 %	40 %	40 %	20 %	13470353
20	NC_002678	GCGCC	2	10	26279	26288	0 %	0 %	40 %	60 %	13470354
21	NC_002678	CATGA	2	10	28033	28042	40 %	20 %	20 %	20 %	13470355
22	NC_002678	GGCGC	2	10	28362	28371	0 %	0 %	60 %	40 %	13470355
23	NC_002678	CGGCG	2	10	28553	28562	0 %	0 %	60 %	40 %	13470356
24	NC_002678	CATGG	2	10	32527	32536	20 %	20 %	40 %	20 %	13470359
25	NC_002678	CCTTT	2	10	33210	33219	0 %	60 %	0 %	40 %	13470360
26	NC_002678	TGCGC	2	10	33343	33352	0 %	20 %	40 %	40 %	13470360
27	NC_002678	GCGCC	2	10	34788	34797	0 %	0 %	40 %	60 %	57165209
28	NC_002678	GCGCC	2	10	36095	36104	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_002678	CGTTC	2	10	36922	36931	0 %	40 %	20 %	40 %	13470363
30	NC_002678	GAACC	2	10	36944	36953	40 %	0 %	20 %	40 %	13470363
31	NC_002678	ACATC	2	10	37089	37098	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_002678	CTTGC	2	10	37325	37334	0 %	40 %	20 %	40 %	13470364
33	NC_002678	CGCAT	2	10	37455	37464	20 %	20 %	20 %	40 %	13470364
34	NC_002678	TGCCG	2	10	39521	39530	0 %	20 %	40 %	40 %	13470366
35	NC_002678	AGCCA	2	10	39660	39669	40 %	0 %	20 %	40 %	13470366
36	NC_002678	GCACG	2	10	40225	40234	20 %	0 %	40 %	40 %	13470366
37	NC_002678	CTTCA	2	10	41021	41030	20 %	40 %	0 %	40 %	13470367
38	NC_002678	GGGAT	2	10	42324	42333	20 %	20 %	60 %	0 %	13470370
39	NC_002678	GGTCC	2	10	43084	43093	0 %	20 %	40 %	40 %	13470370
40	NC_002678	AGCGC	2	10	43918	43927	20 %	0 %	40 %	40 %	13470370
41	NC_002678	CTGGC	2	10	45096	45105	0 %	20 %	40 %	40 %	13470372
42	NC_002678	GTGCG	2	10	45520	45529	0 %	20 %	60 %	20 %	13470372
43	NC_002678	AGGTG	2	10	45568	45577	20 %	20 %	60 %	0 %	13470372
44	NC_002678	CGAGC	2	10	47051	47060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_002678	GCCTT	2	10	49428	49437	0 %	40 %	20 %	40 %	13470378
46	NC_002678	ACCGG	2	10	49576	49585	20 %	0 %	40 %	40 %	13470379
47	NC_002678	GCCTT	2	10	50293	50302	0 %	40 %	20 %	40 %	13470379
48	NC_002678	CGCAG	2	10	50492	50501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_002678	CGCGC	2	10	53692	53701	0 %	0 %	40 %	60 %	13470383
50	NC_002678	TGGCG	2	10	55573	55582	0 %	20 %	60 %	20 %	13470385
51	NC_002678	TCGGC	2	10	55792	55801	0 %	20 %	40 %	40 %	13470385
52	NC_002678	GGCGC	2	10	55850	55859	0 %	0 %	60 %	40 %	13470385
53	NC_002678	GGCGC	2	10	56866	56875	0 %	0 %	60 %	40 %	13470386
54	NC_002678	TGCGG	2	10	57257	57266	0 %	20 %	60 %	20 %	13470387
55	NC_002678	ATCCG	2	10	58009	58018	20 %	20 %	20 %	40 %	13470388
56	NC_002678	GCGTT	2	10	59699	59708	0 %	40 %	40 %	20 %	13470390
57	NC_002678	GCCAG	2	10	60087	60096	20 %	0 %	40 %	40 %	13470390
58	NC_002678	CATGT	2	10	60254	60263	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002678	CGCGA	2	10	60344	60353	20 %	0 %	40 %	40 %	13470391
60	NC_002678	AGCGG	2	10	60803	60812	20 %	0 %	60 %	20 %	13470391
61	NC_002678	GCGCC	2	10	63462	63471	0 %	0 %	40 %	60 %	13470395
62	NC_002678	CGAGG	2	10	64461	64470	20 %	0 %	60 %	20 %	13470396
63	NC_002678	GGCCA	2	10	65940	65949	20 %	0 %	40 %	40 %	13470397
64	NC_002678	TGACG	2	10	67984	67993	20 %	20 %	40 %	20 %	13470399
65	NC_002678	TGCAG	2	10	68772	68781	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002678	TTTTG	2	10	68943	68952	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002678	TCGCT	2	10	69092	69101	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_002678	CATTC	2	10	69174	69183	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_002678	GCTTT	2	10	69431	69440	0 %	60 %	20 %	20 %	13470401
70	NC_002678	GGCGC	2	10	70122	70131	0 %	0 %	60 %	40 %	13470402
71	NC_002678	TCGCC	2	10	72178	72187	0 %	20 %	20 %	60 %	13470404
72	NC_002678	AACGC	2	10	72303	72312	40 %	0 %	20 %	40 %	13470404
73	NC_002678	CGGGC	2	10	72469	72478	0 %	0 %	60 %	40 %	13470404
74	NC_002678	CTTGC	2	10	75285	75294	0 %	40 %	20 %	40 %	13470408
75	NC_002678	CTGGC	2	10	76054	76063	0 %	20 %	40 %	40 %	13470408
76	NC_002678	AGGCG	2	10	78221	78230	20 %	0 %	60 %	20 %	13470410
77	NC_002678	CAAGC	2	10	78486	78495	40 %	0 %	20 %	40 %	13470410
78	NC_002678	ACAGC	2	10	79108	79117	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_002678	GGCGC	2	10	79153	79162	0 %	0 %	60 %	40 %	13470412
80	NC_002678	GGGCA	2	10	79771	79780	20 %	0 %	60 %	20 %	13470412
81	NC_002678	TCGCG	2	10	80513	80522	0 %	20 %	40 %	40 %	13470413
82	NC_002678	GAAGG	2	10	80698	80707	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002678	GGCCG	2	10	81125	81134	0 %	0 %	60 %	40 %	13470415
84	NC_002678	GCCTT	2	10	81782	81791	0 %	40 %	20 %	40 %	13470415
85	NC_002678	GATGG	2	10	82969	82978	20 %	20 %	60 %	0 %	13470416
86	NC_002678	GTCGG	2	10	83740	83749	0 %	20 %	60 %	20 %	13470417
87	NC_002678	ATCGC	2	10	86560	86569	20 %	20 %	20 %	40 %	13470421
88	NC_002678	GCCGG	2	10	86884	86893	0 %	0 %	60 %	40 %	13470422
89	NC_002678	GGCAC	2	10	87423	87432	20 %	0 %	40 %	40 %	13470422
90	NC_002678	TGGGT	2	10	87755	87764	0 %	40 %	60 %	0 %	13470423
91	NC_002678	CGATC	2	10	87864	87873	20 %	20 %	20 %	40 %	13470423
92	NC_002678	CGGGC	2	10	88341	88350	0 %	0 %	60 %	40 %	13470424
93	NC_002678	GTCGG	2	10	90047	90056	0 %	20 %	60 %	20 %	13470427
94	NC_002678	CGCGG	2	10	90931	90940	0 %	0 %	60 %	40 %	13470428
95	NC_002678	GCCAC	2	10	91692	91701	20 %	0 %	20 %	60 %	13470429
96	NC_002678	GCAGA	2	10	92729	92738	40 %	0 %	40 %	20 %	13470430
97	NC_002678	AGAAT	2	10	93200	93209	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002678	CGAGG	2	10	96171	96180	20 %	0 %	60 %	20 %	13470431
99	NC_002678	GGTCC	2	10	97645	97654	0 %	20 %	40 %	40 %	13470431
100	NC_002678	ACGGC	2	10	99139	99148	20 %	0 %	40 %	40 %	13470433
101	NC_002678	AGGGC	2	10	100352	100361	20 %	0 %	60 %	20 %	13470435
102	NC_002678	GCGCG	2	10	101734	101743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_002678	CGCAA	2	10	103862	103871	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_002678	GTCGC	2	10	103918	103927	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_002678	CGGCG	2	10	105224	105233	0 %	0 %	60 %	40 %	13470442
106	NC_002678	CCGCG	2	10	106431	106440	0 %	0 %	40 %	60 %	13470444
107	NC_002678	GACGA	2	10	106718	106727	40 %	0 %	40 %	20 %	13470444
108	NC_002678	GCCGT	2	10	107205	107214	0 %	20 %	40 %	40 %	13470444
109	NC_002678	GCAGG	2	10	107575	107584	20 %	0 %	60 %	20 %	13470444
110	NC_002678	GAATG	2	10	108845	108854	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002678	GTGGC	2	10	109115	109124	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_002678	GCGCG	2	10	109150	109159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_002678	GCCGT	2	10	109674	109683	0 %	20 %	40 %	40 %	13470446
114	NC_002678	GTCGG	2	10	109911	109920	0 %	20 %	60 %	20 %	13470446
115	NC_002678	GGTGA	2	10	110446	110455	20 %	20 %	60 %	0 %	13470447
116	NC_002678	TGCCG	2	10	110968	110977	0 %	20 %	40 %	40 %	13470448
117	NC_002678	CGCCA	2	10	111577	111586	20 %	0 %	20 %	60 %	13470448
118	NC_002678	CATCA	2	10	112126	112135	40 %	20 %	0 %	40 %	13470448
119	NC_002678	AGGCC	2	10	112612	112621	20 %	0 %	40 %	40 %	13470449
120	NC_002678	TGGCA	2	10	113765	113774	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_002678	GCGAG	2	10	114136	114145	20 %	0 %	60 %	20 %	13470451
122	NC_002678	CGGCG	2	10	114761	114770	0 %	0 %	60 %	40 %	13470451
123	NC_002678	CGGCG	2	10	116026	116035	0 %	0 %	60 %	40 %	13470452
124	NC_002678	GCGCT	2	10	116297	116306	0 %	20 %	40 %	40 %	13470452
125	NC_002678	GACGG	2	10	118408	118417	20 %	0 %	60 %	20 %	13470456
126	NC_002678	GCCTG	2	10	120392	120401	0 %	20 %	40 %	40 %	13470459
127	NC_002678	GGCGC	2	10	120556	120565	0 %	0 %	60 %	40 %	13470459
128	NC_002678	CTCGG	2	10	120888	120897	0 %	20 %	40 %	40 %	13470459
129	NC_002678	CGATC	2	10	122024	122033	20 %	20 %	20 %	40 %	13470462
130	NC_002678	ATGGC	2	10	123823	123832	20 %	20 %	40 %	20 %	13470463
131	NC_002678	GCAAG	2	10	123869	123878	40 %	0 %	40 %	20 %	13470463
132	NC_002678	GGAGC	2	10	124459	124468	20 %	0 %	60 %	20 %	13470465
133	NC_002678	GTCGG	2	10	125135	125144	0 %	20 %	60 %	20 %	13470466
134	NC_002678	GCGCG	2	10	127027	127036	0 %	0 %	60 %	40 %	13470468
135	NC_002678	CGAAT	2	10	127684	127693	40 %	20 %	20 %	20 %	13470469
136	NC_002678	GGCAA	2	10	127795	127804	40 %	0 %	40 %	20 %	13470469
137	NC_002678	TCGGC	2	10	128894	128903	0 %	20 %	40 %	40 %	13470470
138	NC_002678	CTGCC	2	10	130316	130325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_002678	GGCCA	2	10	131276	131285	20 %	0 %	40 %	40 %	13470473
140	NC_002678	GGCGC	2	10	131296	131305	0 %	0 %	60 %	40 %	13470473
141	NC_002678	CCGCA	2	10	132050	132059	20 %	0 %	20 %	60 %	13470474
142	NC_002678	TGGAT	2	10	135186	135195	20 %	40 %	40 %	0 %	13470478
143	NC_002678	GATCG	2	10	136079	136088	20 %	20 %	40 %	20 %	13470480
144	NC_002678	GGCTG	2	10	139273	139282	0 %	20 %	60 %	20 %	13470484
145	NC_002678	GCTGG	2	10	139296	139305	0 %	20 %	60 %	20 %	13470484
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148	NC_002678	TCGCC	2	10	145092	145101	0 %	20 %	20 %	60 %	13470490
149	NC_002678	GGACT	2	10	146887	146896	20 %	20 %	40 %	20 %	13470490
150	NC_002678	CGTAA	2	10	148124	148133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_002678	ACCGG	2	10	148813	148822	20 %	0 %	40 %	40 %	13470491
152	NC_002678	CGGCG	2	10	150291	150300	0 %	0 %	60 %	40 %	13470492
153	NC_002678	ATACG	2	10	150693	150702	40 %	20 %	20 %	20 %	13470492
154	NC_002678	GCCGG	2	10	151321	151330	0 %	0 %	60 %	40 %	13470492
155	NC_002678	GCTGG	2	10	152224	152233	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
156	NC_002678	TGCCT	2	10	154146	154155	0 %	40 %	20 %	40 %	13470495
157	NC_002678	CCGTT	2	10	154591	154600	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_002678	CGTCG	2	10	155299	155308	0 %	20 %	40 %	40 %	13470497
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161	NC_002678	GACCA	2	10	162061	162070	40 %	0 %	20 %	40 %	13470503
162	NC_002678	GCTGG	2	10	162111	162120	0 %	20 %	60 %	20 %	13470503
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170	NC_002678	GGCCA	2	10	167463	167472	20 %	0 %	40 %	40 %	13470509
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172	NC_002678	GGCAA	2	10	169011	169020	40 %	0 %	40 %	20 %	13470511
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177	NC_002678	GGGAT	2	10	174988	174997	20 %	20 %	60 %	0 %	13470518
178	NC_002678	GCTGC	2	10	176001	176010	0 %	20 %	40 %	40 %	13470520
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181	NC_002678	CGGCC	2	10	178012	178021	0 %	0 %	40 %	60 %	13470522
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183	NC_002678	GCGTC	2	10	180485	180494	0 %	20 %	40 %	40 %	13470524
184	NC_002678	ATCCG	2	10	181809	181818	20 %	20 %	20 %	40 %	13470525
185	NC_002678	GTCGG	2	10	183219	183228	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
186	NC_002678	CCATT	2	10	184920	184929	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
187	NC_002678	ACTGA	2	10	185059	185068	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
188	NC_002678	CGGAC	2	10	187937	187946	20 %	0 %	40 %	40 %	13470533
189	NC_002678	TTCCG	2	10	188517	188526	0 %	40 %	20 %	40 %	13470534
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191	NC_002678	ACGCG	2	10	189615	189624	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_002678	AGCGC	2	10	190309	190318	20 %	0 %	40 %	40 %	13470537
193	NC_002678	GGCGA	2	10	190379	190388	20 %	0 %	60 %	20 %	13470537
194	NC_002678	GACCT	2	10	193713	193722	20 %	20 %	20 %	40 %	13470542
195	NC_002678	GCCGC	2	10	193725	193734	0 %	0 %	40 %	60 %	13470542
196	NC_002678	GACCA	2	10	195006	195015	40 %	0 %	20 %	40 %	13470542
197	NC_002678	GACGC	2	10	195642	195651	20 %	0 %	40 %	40 %	13470542
198	NC_002678	GTGTC	2	10	196717	196726	0 %	40 %	40 %	20 %	13470542
199	NC_002678	CTGGG	2	10	196845	196854	0 %	20 %	60 %	20 %	13470542
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204	NC_002678	GACCT	2	10	204108	204117	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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210	NC_002678	CCCGT	2	10	214431	214440	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
211	NC_002678	CCGCT	2	10	220958	220967	0 %	20 %	20 %	60 %	13470572
212	NC_002678	CAATT	2	10	221898	221907	40 %	40 %	0 %	20 %	13470574
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239	NC_002678	ACCGC	2	10	257599	257608	20 %	0 %	20 %	60 %	13470605
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241	NC_002678	GGCCG	2	10	259180	259189	0 %	0 %	60 %	40 %	13470607
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243	NC_002678	GGGTG	2	10	261492	261501	0 %	20 %	80 %	0 %	13470608
244	NC_002678	GGTCG	2	10	261971	261980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
245	NC_002678	GTTGG	2	10	262231	262240	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
246	NC_002678	CCGGG	2	10	263457	263466	0 %	0 %	60 %	40 %	13470609
247	NC_002678	ACGCT	2	10	263628	263637	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
248	NC_002678	GCGCG	2	10	266022	266031	0 %	0 %	60 %	40 %	13470612
249	NC_002678	GCCGC	2	10	267573	267582	0 %	0 %	40 %	60 %	13470615
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251	NC_002678	GGCCT	2	10	271218	271227	0 %	20 %	40 %	40 %	13470619
252	NC_002678	CGCGT	2	10	272377	272386	0 %	20 %	40 %	40 %	13470620
253	NC_002678	GGCTG	2	10	272444	272453	0 %	20 %	60 %	20 %	13470620
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256	NC_002678	TTTCA	2	10	274637	274646	20 %	60 %	0 %	20 %	13470622
257	NC_002678	GAAAT	2	10	278307	278316	60 %	20 %	20 %	0 %	13470626
258	NC_002678	CGGCT	2	10	281460	281469	0 %	20 %	40 %	40 %	13470630
259	NC_002678	CTGGC	2	10	282459	282468	0 %	20 %	40 %	40 %	13470631
260	NC_002678	GCATC	2	10	285014	285023	20 %	20 %	20 %	40 %	13470633
261	NC_002678	CGCGG	2	10	294906	294915	0 %	0 %	60 %	40 %	13470642
262	NC_002678	CCGGA	2	10	296495	296504	20 %	0 %	40 %	40 %	13470644
263	NC_002678	CTTCG	2	10	298099	298108	0 %	40 %	20 %	40 %	13470645
264	NC_002678	AGGCC	2	10	300340	300349	20 %	0 %	40 %	40 %	13470648
265	NC_002678	CGGAA	2	10	301041	301050	40 %	0 %	40 %	20 %	13470649
266	NC_002678	CGATC	2	10	303688	303697	20 %	20 %	20 %	40 %	13470651
267	NC_002678	ACGCC	2	10	303997	304006	20 %	0 %	20 %	60 %	13470651
268	NC_002678	CGGGC	2	10	304434	304443	0 %	0 %	60 %	40 %	13470651
269	NC_002678	GCCTT	2	10	304449	304458	0 %	40 %	20 %	40 %	13470651
270	NC_002678	CCCAT	2	10	305051	305060	20 %	20 %	0 %	60 %	13470652
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