MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 4698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002678	GCGGT	2	10	1682	1691	0 %	20 %	60 %	20 %	13470332
2	NC_002678	TGACC	2	10	3967	3976	20 %	20 %	20 %	40 %	13470334
3	NC_002678	AAGGC	2	10	4149	4158	40 %	0 %	40 %	20 %	13470334
4	NC_002678	GGCCA	2	10	8729	8738	20 %	0 %	40 %	40 %	13470337
5	NC_002678	CGATG	2	10	9266	9275	20 %	20 %	40 %	20 %	13470338
6	NC_002678	GCTTC	2	10	9749	9758	0 %	40 %	20 %	40 %	13470338
7	NC_002678	TGCCT	2	10	9759	9768	0 %	40 %	20 %	40 %	13470338
8	NC_002678	GAGCC	2	10	10263	10272	20 %	0 %	40 %	40 %	13470338
9	NC_002678	CGGCT	2	10	11283	11292	0 %	20 %	40 %	40 %	13470339
10	NC_002678	GCCGC	2	10	13085	13094	0 %	0 %	40 %	60 %	13470342
11	NC_002678	TCGGC	2	10	14033	14042	0 %	20 %	40 %	40 %	13470342
12	NC_002678	CTCGG	2	10	14892	14901	0 %	20 %	40 %	40 %	57165208
13	NC_002678	ACCGC	2	10	15105	15114	20 %	0 %	20 %	60 %	57165208
14	NC_002678	ATGGA	2	10	20436	20445	40 %	20 %	40 %	0 %	13470348
15	NC_002678	GGTCG	2	10	21073	21082	0 %	20 %	60 %	20 %	13470349
16	NC_002678	GTTCG	2	10	24642	24651	0 %	40 %	40 %	20 %	13470353
17	NC_002678	GCGCC	2	10	26279	26288	0 %	0 %	40 %	60 %	13470354
18	NC_002678	CATGA	2	10	28033	28042	40 %	20 %	20 %	20 %	13470355
19	NC_002678	GGCGC	2	10	28362	28371	0 %	0 %	60 %	40 %	13470355
20	NC_002678	CGGCG	2	10	28553	28562	0 %	0 %	60 %	40 %	13470356
21	NC_002678	CATGG	2	10	32527	32536	20 %	20 %	40 %	20 %	13470359
22	NC_002678	CCTTT	2	10	33210	33219	0 %	60 %	0 %	40 %	13470360
23	NC_002678	TGCGC	2	10	33343	33352	0 %	20 %	40 %	40 %	13470360
24	NC_002678	GCGCC	2	10	34788	34797	0 %	0 %	40 %	60 %	57165209
25	NC_002678	CGTTC	2	10	36922	36931	0 %	40 %	20 %	40 %	13470363
26	NC_002678	GAACC	2	10	36944	36953	40 %	0 %	20 %	40 %	13470363
27	NC_002678	CTTGC	2	10	37325	37334	0 %	40 %	20 %	40 %	13470364
28	NC_002678	CGCAT	2	10	37455	37464	20 %	20 %	20 %	40 %	13470364
29	NC_002678	TGCCG	2	10	39521	39530	0 %	20 %	40 %	40 %	13470366
30	NC_002678	AGCCA	2	10	39660	39669	40 %	0 %	20 %	40 %	13470366
31	NC_002678	GCACG	2	10	40225	40234	20 %	0 %	40 %	40 %	13470366
32	NC_002678	CTTCA	2	10	41021	41030	20 %	40 %	0 %	40 %	13470367
33	NC_002678	GGGAT	2	10	42324	42333	20 %	20 %	60 %	0 %	13470370
34	NC_002678	GGTCC	2	10	43084	43093	0 %	20 %	40 %	40 %	13470370
35	NC_002678	AGCGC	2	10	43918	43927	20 %	0 %	40 %	40 %	13470370
36	NC_002678	CTGGC	2	10	45096	45105	0 %	20 %	40 %	40 %	13470372
37	NC_002678	GTGCG	2	10	45520	45529	0 %	20 %	60 %	20 %	13470372
38	NC_002678	AGGTG	2	10	45568	45577	20 %	20 %	60 %	0 %	13470372
39	NC_002678	GCCTT	2	10	49428	49437	0 %	40 %	20 %	40 %	13470378
40	NC_002678	ACCGG	2	10	49576	49585	20 %	0 %	40 %	40 %	13470379
41	NC_002678	GCCTT	2	10	50293	50302	0 %	40 %	20 %	40 %	13470379
42	NC_002678	CGCGC	2	10	53692	53701	0 %	0 %	40 %	60 %	13470383
43	NC_002678	TGGCG	2	10	55573	55582	0 %	20 %	60 %	20 %	13470385
44	NC_002678	TCGGC	2	10	55792	55801	0 %	20 %	40 %	40 %	13470385
45	NC_002678	GGCGC	2	10	55850	55859	0 %	0 %	60 %	40 %	13470385
46	NC_002678	GGCGC	2	10	56866	56875	0 %	0 %	60 %	40 %	13470386
47	NC_002678	TGCGG	2	10	57257	57266	0 %	20 %	60 %	20 %	13470387
48	NC_002678	ATCCG	2	10	58009	58018	20 %	20 %	20 %	40 %	13470388
49	NC_002678	GCGTT	2	10	59699	59708	0 %	40 %	40 %	20 %	13470390
50	NC_002678	GCCAG	2	10	60087	60096	20 %	0 %	40 %	40 %	13470390
51	NC_002678	CGCGA	2	10	60344	60353	20 %	0 %	40 %	40 %	13470391
52	NC_002678	AGCGG	2	10	60803	60812	20 %	0 %	60 %	20 %	13470391
53	NC_002678	GCGCC	2	10	63462	63471	0 %	0 %	40 %	60 %	13470395
54	NC_002678	CGAGG	2	10	64461	64470	20 %	0 %	60 %	20 %	13470396
55	NC_002678	GGCCA	2	10	65940	65949	20 %	0 %	40 %	40 %	13470397
56	NC_002678	TGACG	2	10	67984	67993	20 %	20 %	40 %	20 %	13470399
57	NC_002678	GCTTT	2	10	69431	69440	0 %	60 %	20 %	20 %	13470401
58	NC_002678	GGCGC	2	10	70122	70131	0 %	0 %	60 %	40 %	13470402
59	NC_002678	TCGCC	2	10	72178	72187	0 %	20 %	20 %	60 %	13470404
60	NC_002678	AACGC	2	10	72303	72312	40 %	0 %	20 %	40 %	13470404
61	NC_002678	CGGGC	2	10	72469	72478	0 %	0 %	60 %	40 %	13470404
62	NC_002678	CTTGC	2	10	75285	75294	0 %	40 %	20 %	40 %	13470408
63	NC_002678	CTGGC	2	10	76054	76063	0 %	20 %	40 %	40 %	13470408
64	NC_002678	AGGCG	2	10	78221	78230	20 %	0 %	60 %	20 %	13470410
65	NC_002678	CAAGC	2	10	78486	78495	40 %	0 %	20 %	40 %	13470410
66	NC_002678	GGCGC	2	10	79153	79162	0 %	0 %	60 %	40 %	13470412
67	NC_002678	GGGCA	2	10	79771	79780	20 %	0 %	60 %	20 %	13470412
68	NC_002678	TCGCG	2	10	80513	80522	0 %	20 %	40 %	40 %	13470413
69	NC_002678	GGCCG	2	10	81125	81134	0 %	0 %	60 %	40 %	13470415
70	NC_002678	GCCTT	2	10	81782	81791	0 %	40 %	20 %	40 %	13470415
71	NC_002678	GATGG	2	10	82969	82978	20 %	20 %	60 %	0 %	13470416
72	NC_002678	GTCGG	2	10	83740	83749	0 %	20 %	60 %	20 %	13470417
73	NC_002678	ATCGC	2	10	86560	86569	20 %	20 %	20 %	40 %	13470421
74	NC_002678	GCCGG	2	10	86884	86893	0 %	0 %	60 %	40 %	13470422
75	NC_002678	GGCAC	2	10	87423	87432	20 %	0 %	40 %	40 %	13470422
76	NC_002678	TGGGT	2	10	87755	87764	0 %	40 %	60 %	0 %	13470423
77	NC_002678	CGATC	2	10	87864	87873	20 %	20 %	20 %	40 %	13470423
78	NC_002678	CGGGC	2	10	88341	88350	0 %	0 %	60 %	40 %	13470424
79	NC_002678	GTCGG	2	10	90047	90056	0 %	20 %	60 %	20 %	13470427
80	NC_002678	CGCGG	2	10	90931	90940	0 %	0 %	60 %	40 %	13470428
81	NC_002678	GCCAC	2	10	91692	91701	20 %	0 %	20 %	60 %	13470429
82	NC_002678	GCAGA	2	10	92729	92738	40 %	0 %	40 %	20 %	13470430
83	NC_002678	CGAGG	2	10	96171	96180	20 %	0 %	60 %	20 %	13470431
84	NC_002678	GGTCC	2	10	97645	97654	0 %	20 %	40 %	40 %	13470431
85	NC_002678	ACGGC	2	10	99139	99148	20 %	0 %	40 %	40 %	13470433
86	NC_002678	AGGGC	2	10	100352	100361	20 %	0 %	60 %	20 %	13470435
87	NC_002678	CGGCG	2	10	105224	105233	0 %	0 %	60 %	40 %	13470442
88	NC_002678	CCGCG	2	10	106431	106440	0 %	0 %	40 %	60 %	13470444
89	NC_002678	GACGA	2	10	106718	106727	40 %	0 %	40 %	20 %	13470444
90	NC_002678	GCCGT	2	10	107205	107214	0 %	20 %	40 %	40 %	13470444
91	NC_002678	GCAGG	2	10	107575	107584	20 %	0 %	60 %	20 %	13470444
92	NC_002678	GCCGT	2	10	109674	109683	0 %	20 %	40 %	40 %	13470446
93	NC_002678	GTCGG	2	10	109911	109920	0 %	20 %	60 %	20 %	13470446
94	NC_002678	GGTGA	2	10	110446	110455	20 %	20 %	60 %	0 %	13470447
95	NC_002678	TGCCG	2	10	110968	110977	0 %	20 %	40 %	40 %	13470448
96	NC_002678	CGCCA	2	10	111577	111586	20 %	0 %	20 %	60 %	13470448
97	NC_002678	CATCA	2	10	112126	112135	40 %	20 %	0 %	40 %	13470448
98	NC_002678	AGGCC	2	10	112612	112621	20 %	0 %	40 %	40 %	13470449
99	NC_002678	GCGAG	2	10	114136	114145	20 %	0 %	60 %	20 %	13470451
100	NC_002678	CGGCG	2	10	114761	114770	0 %	0 %	60 %	40 %	13470451
101	NC_002678	CGGCG	2	10	116026	116035	0 %	0 %	60 %	40 %	13470452
102	NC_002678	GCGCT	2	10	116297	116306	0 %	20 %	40 %	40 %	13470452
103	NC_002678	GACGG	2	10	118408	118417	20 %	0 %	60 %	20 %	13470456
104	NC_002678	GCCTG	2	10	120392	120401	0 %	20 %	40 %	40 %	13470459
105	NC_002678	GGCGC	2	10	120556	120565	0 %	0 %	60 %	40 %	13470459
106	NC_002678	CTCGG	2	10	120888	120897	0 %	20 %	40 %	40 %	13470459
107	NC_002678	CGATC	2	10	122024	122033	20 %	20 %	20 %	40 %	13470462
108	NC_002678	ATGGC	2	10	123823	123832	20 %	20 %	40 %	20 %	13470463
109	NC_002678	GCAAG	2	10	123869	123878	40 %	0 %	40 %	20 %	13470463
110	NC_002678	GGAGC	2	10	124459	124468	20 %	0 %	60 %	20 %	13470465
111	NC_002678	GTCGG	2	10	125135	125144	0 %	20 %	60 %	20 %	13470466
112	NC_002678	GCGCG	2	10	127027	127036	0 %	0 %	60 %	40 %	13470468
113	NC_002678	CGAAT	2	10	127684	127693	40 %	20 %	20 %	20 %	13470469
114	NC_002678	GGCAA	2	10	127795	127804	40 %	0 %	40 %	20 %	13470469
115	NC_002678	TCGGC	2	10	128894	128903	0 %	20 %	40 %	40 %	13470470
116	NC_002678	GGCCA	2	10	131276	131285	20 %	0 %	40 %	40 %	13470473
117	NC_002678	GGCGC	2	10	131296	131305	0 %	0 %	60 %	40 %	13470473
118	NC_002678	CCGCA	2	10	132050	132059	20 %	0 %	20 %	60 %	13470474
119	NC_002678	TGGAT	2	10	135186	135195	20 %	40 %	40 %	0 %	13470478
120	NC_002678	GATCG	2	10	136079	136088	20 %	20 %	40 %	20 %	13470480
121	NC_002678	GGCTG	2	10	139273	139282	0 %	20 %	60 %	20 %	13470484
122	NC_002678	GCTGG	2	10	139296	139305	0 %	20 %	60 %	20 %	13470484
123	NC_002678	CGGAT	2	10	140445	140454	20 %	20 %	40 %	20 %	13470486
124	NC_002678	GCCGC	2	10	141486	141495	0 %	0 %	40 %	60 %	13470487
125	NC_002678	TCGCC	2	10	145092	145101	0 %	20 %	20 %	60 %	13470490
126	NC_002678	GGACT	2	10	146887	146896	20 %	20 %	40 %	20 %	13470490
127	NC_002678	ACCGG	2	10	148813	148822	20 %	0 %	40 %	40 %	13470491
128	NC_002678	CGGCG	2	10	150291	150300	0 %	0 %	60 %	40 %	13470492
129	NC_002678	ATACG	2	10	150693	150702	40 %	20 %	20 %	20 %	13470492
130	NC_002678	GCCGG	2	10	151321	151330	0 %	0 %	60 %	40 %	13470492
131	NC_002678	TGCCT	2	10	154146	154155	0 %	40 %	20 %	40 %	13470495
132	NC_002678	CGTCG	2	10	155299	155308	0 %	20 %	40 %	40 %	13470497
133	NC_002678	CGCCA	2	10	158256	158265	20 %	0 %	20 %	60 %	13470500
134	NC_002678	GACGA	2	10	158789	158798	40 %	0 %	40 %	20 %	13470500
135	NC_002678	GACCA	2	10	162061	162070	40 %	0 %	20 %	40 %	13470503
136	NC_002678	GCTGG	2	10	162111	162120	0 %	20 %	60 %	20 %	13470503
137	NC_002678	CGGGC	2	10	162250	162259	0 %	0 %	60 %	40 %	13470503
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265	NC_002678	ATTGA	2	10	378337	378346	40 %	40 %	20 %	0 %	13470730
266	NC_002678	GACAA	2	10	380324	380333	60 %	0 %	20 %	20 %	13470732
267	NC_002678	AGCGA	2	10	381531	381540	40 %	0 %	40 %	20 %	13470733
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384	NC_002678	ATCGC	2	10	587103	587112	20 %	20 %	20 %	40 %	13470921
385	NC_002678	AGCGC	2	10	590522	590531	20 %	0 %	40 %	40 %	13470922
386	NC_002678	CGCGC	2	10	591032	591041	0 %	0 %	40 %	60 %	13470923
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391	NC_002678	GCCCT	2	10	596853	596862	0 %	20 %	20 %	60 %	13470930
392	NC_002678	ATCGT	2	10	599774	599783	20 %	40 %	20 %	20 %	13470931
393	NC_002678	TCGCG	2	10	604263	604272	0 %	20 %	40 %	40 %	13470935
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396	NC_002678	ATCGA	2	10	605792	605801	40 %	20 %	20 %	20 %	13470935
397	NC_002678	TGCCG	2	10	608812	608821	0 %	20 %	40 %	40 %	13470939
398	NC_002678	GGCTG	2	10	610358	610367	0 %	20 %	60 %	20 %	13470940
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