MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 18217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002678	TTAA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002678	TTCG	2	8	769	776	0 %	50 %	25 %	25 %	13470331
3	NC_002678	AGCG	2	8	1187	1194	25 %	0 %	50 %	25 %	13470332
4	NC_002678	GCTT	2	8	1281	1288	0 %	50 %	25 %	25 %	13470332
5	NC_002678	TCAG	2	8	2089	2096	25 %	25 %	25 %	25 %	13470332
6	NC_002678	GCCT	2	8	2529	2536	0 %	25 %	25 %	50 %	13470333
7	NC_002678	GCCG	2	8	2631	2638	0 %	0 %	50 %	50 %	13470333
8	NC_002678	CGAG	2	8	2788	2795	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002678	GCCG	2	8	3200	3207	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
10	NC_002678	CATC	2	8	3391	3398	25 %	25 %	0 %	50 %	13470334
11	NC_002678	GATC	2	8	3436	3443	25 %	25 %	25 %	25 %	13470334
12	NC_002678	CCGG	2	8	3882	3889	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
13	NC_002678	CGTT	2	8	4140	4147	0 %	50 %	25 %	25 %	13470334
14	NC_002678	CGGC	2	8	4398	4405	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
15	NC_002678	TCGA	2	8	5210	5217	25 %	25 %	25 %	25 %	13470334
16	NC_002678	CGGC	2	8	5508	5515	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
17	NC_002678	CGGC	2	8	5593	5600	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
18	NC_002678	GCTC	2	8	5601	5608	0 %	25 %	25 %	50 %	13470334
19	NC_002678	GCCG	2	8	5791	5798	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
20	NC_002678	GGCC	2	8	6206	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	13470335
21	NC_002678	GCCG	2	8	7018	7025	0 %	0 %	50 %	50 %	13470335
22	NC_002678	CGCT	2	8	7413	7420	0 %	25 %	25 %	50 %	13470335
23	NC_002678	AGGC	2	8	7447	7454	25 %	0 %	50 %	25 %	13470335
24	NC_002678	TGCT	2	8	7630	7637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002678	CATC	2	8	7714	7721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_002678	CGAC	2	8	7886	7893	25 %	0 %	25 %	50 %	13470336
27	NC_002678	CGAT	2	8	8030	8037	25 %	25 %	25 %	25 %	13470336
28	NC_002678	GCAC	2	8	8282	8289	25 %	0 %	25 %	50 %	13470336
29	NC_002678	GCTG	2	8	9475	9482	0 %	25 %	50 %	25 %	13470338
30	NC_002678	CTGG	2	8	9782	9789	0 %	25 %	50 %	25 %	13470338
31	NC_002678	GGCT	2	8	9861	9868	0 %	25 %	50 %	25 %	13470338
32	NC_002678	ATCT	2	8	9996	10003	25 %	50 %	0 %	25 %	13470338
33	NC_002678	CTGA	2	8	10302	10309	25 %	25 %	25 %	25 %	13470338
34	NC_002678	TTCG	2	8	10734	10741	0 %	50 %	25 %	25 %	13470339
35	NC_002678	GCCC	2	8	11004	11011	0 %	0 %	25 %	75 %	13470339
36	NC_002678	GCCA	2	8	11653	11660	25 %	0 %	25 %	50 %	13470340
37	NC_002678	CGCC	2	8	12086	12093	0 %	0 %	25 %	75 %	13470341
38	NC_002678	CCGG	2	8	12359	12366	0 %	0 %	50 %	50 %	13470341
39	NC_002678	CCTG	2	8	13274	13281	0 %	25 %	25 %	50 %	13470342
40	NC_002678	GGCG	2	8	13288	13295	0 %	0 %	75 %	25 %	13470342
41	NC_002678	CGAT	2	8	13451	13458	25 %	25 %	25 %	25 %	13470342
42	NC_002678	CGGC	2	8	13937	13944	0 %	0 %	50 %	50 %	13470342
43	NC_002678	CGGG	2	8	14101	14108	0 %	0 %	75 %	25 %	13470342
44	NC_002678	TGGA	2	8	14300	14307	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002678	CGAT	2	8	14335	14342	25 %	25 %	25 %	25 %	57165208
46	NC_002678	GCTG	2	8	14506	14513	0 %	25 %	50 %	25 %	57165208
47	NC_002678	TCGT	2	8	14961	14968	0 %	50 %	25 %	25 %	57165208
48	NC_002678	CGGA	2	8	16101	16108	25 %	0 %	50 %	25 %	13470343
49	NC_002678	GGCC	2	8	16698	16705	0 %	0 %	50 %	50 %	13470344
50	NC_002678	GAAG	2	8	16929	16936	50 %	0 %	50 %	0 %	13470344
51	NC_002678	TGAT	2	8	17679	17686	25 %	50 %	25 %	0 %	13470345
52	NC_002678	CAGC	2	8	17938	17945	25 %	0 %	25 %	50 %	13470345
53	NC_002678	AGAC	2	8	18704	18711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002678	CGAC	2	8	18927	18934	25 %	0 %	25 %	50 %	13470346
55	NC_002678	CAGG	2	8	19789	19796	25 %	0 %	50 %	25 %	13470346
56	NC_002678	GCCG	2	8	20793	20800	0 %	0 %	50 %	50 %	13470348
57	NC_002678	CCAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	0 %	75 %	13470349
58	NC_002678	GCAA	2	8	21637	21644	50 %	0 %	25 %	25 %	13470350
59	NC_002678	GCCG	2	8	22219	22226	0 %	0 %	50 %	50 %	13470351
60	NC_002678	TGCC	2	8	23050	23057	0 %	25 %	25 %	50 %	13470352
61	NC_002678	CGAT	2	8	23418	23425	25 %	25 %	25 %	25 %	13470352
62	NC_002678	CGGC	2	8	23638	23645	0 %	0 %	50 %	50 %	13470352
63	NC_002678	GCTC	2	8	24164	24171	0 %	25 %	25 %	50 %	13470353
64	NC_002678	ATCG	2	8	25890	25897	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
65	NC_002678	GGGC	2	8	25913	25920	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
66	NC_002678	TCGA	2	8	26031	26038	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
67	NC_002678	CGAA	2	8	26242	26249	50 %	0 %	25 %	25 %	13470354
68	NC_002678	GCAG	2	8	26750	26757	25 %	0 %	50 %	25 %	13470354
69	NC_002678	TCGA	2	8	26910	26917	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
70	NC_002678	GTCG	2	8	27254	27261	0 %	25 %	50 %	25 %	13470354
71	NC_002678	CGCC	2	8	27562	27569	0 %	0 %	25 %	75 %	13470354
72	NC_002678	GCTC	2	8	27781	27788	0 %	25 %	25 %	50 %	13470354
73	NC_002678	GGGC	2	8	27917	27924	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
74	NC_002678	GGCG	2	8	27933	27940	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
75	NC_002678	CCGG	2	8	28158	28165	0 %	0 %	50 %	50 %	13470355
76	NC_002678	TTGC	2	8	28339	28346	0 %	50 %	25 %	25 %	13470355
77	NC_002678	CGAG	2	8	29486	29493	25 %	0 %	50 %	25 %	13470357
78	NC_002678	GGCC	2	8	30382	30389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002678	TTCG	2	8	30500	30507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002678	AGGC	2	8	30611	30618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002678	GCCG	2	8	31451	31458	0 %	0 %	50 %	50 %	13470358
82	NC_002678	CGGC	2	8	31823	31830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002678	CGAG	2	8	32342	32349	25 %	0 %	50 %	25 %	13470359
84	NC_002678	CCGG	2	8	32817	32824	0 %	0 %	50 %	50 %	13470359
85	NC_002678	TGAC	2	8	33096	33103	25 %	25 %	25 %	25 %	13470359
86	NC_002678	GATC	2	8	33721	33728	25 %	25 %	25 %	25 %	13470360
87	NC_002678	CGGC	2	8	33844	33851	0 %	0 %	50 %	50 %	13470360
88	NC_002678	GGCC	2	8	34512	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	57165209
89	NC_002678	CGGG	2	8	34739	34746	0 %	0 %	75 %	25 %	57165209
90	NC_002678	GTCC	2	8	34946	34953	0 %	25 %	25 %	50 %	57165209
91	NC_002678	TCGA	2	8	35131	35138	25 %	25 %	25 %	25 %	57165209
92	NC_002678	TCGA	2	8	35199	35206	25 %	25 %	25 %	25 %	57165209
93	NC_002678	TTCA	2	8	35344	35351	25 %	50 %	0 %	25 %	57165209
94	NC_002678	AGCC	2	8	35405	35412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002678	GCCA	2	8	35514	35521	25 %	0 %	25 %	50 %	13470361
96	NC_002678	GTTT	2	8	36173	36180	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002678	TCGG	2	8	36827	36834	0 %	25 %	50 %	25 %	13470363
98	NC_002678	GCTG	2	8	37281	37288	0 %	25 %	50 %	25 %	13470364
99	NC_002678	GCTC	2	8	37524	37531	0 %	25 %	25 %	50 %	13470364
100	NC_002678	CTGG	2	8	38015	38022	0 %	25 %	50 %	25 %	13470365
101	NC_002678	CAGA	2	8	38093	38100	50 %	0 %	25 %	25 %	13470365
102	NC_002678	CTAT	2	8	39026	39033	25 %	50 %	0 %	25 %	57165210
103	NC_002678	CATC	2	8	39179	39186	25 %	25 %	0 %	50 %	57165210
104	NC_002678	TGGG	2	8	39340	39347	0 %	25 %	75 %	0 %	13470366
105	NC_002678	CAGG	2	8	39988	39995	25 %	0 %	50 %	25 %	13470366
106	NC_002678	CACG	2	8	40174	40181	25 %	0 %	25 %	50 %	13470366
107	NC_002678	CGAG	2	8	40429	40436	25 %	0 %	50 %	25 %	13470366
108	NC_002678	TTGC	2	8	40542	40549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_002678	GTGC	2	8	41241	41248	0 %	25 %	50 %	25 %	13470368
110	NC_002678	CGGG	2	8	41462	41469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002678	TCCG	2	8	41541	41548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_002678	CAGA	2	8	41871	41878	50 %	0 %	25 %	25 %	13470369
113	NC_002678	CTCG	2	8	41979	41986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002678	TCGA	2	8	42273	42280	25 %	25 %	25 %	25 %	13470370
115	NC_002678	AGCG	2	8	42456	42463	25 %	0 %	50 %	25 %	13470370
116	NC_002678	GTCG	2	8	42839	42846	0 %	25 %	50 %	25 %	13470370
117	NC_002678	GGCC	2	8	43498	43505	0 %	0 %	50 %	50 %	13470370
118	NC_002678	AGGC	2	8	43554	43561	25 %	0 %	50 %	25 %	13470370
119	NC_002678	GGGT	2	8	44438	44445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002678	CAAG	2	8	44584	44591	50 %	0 %	25 %	25 %	13470371
121	NC_002678	AAGA	2	8	44594	44601	75 %	0 %	25 %	0 %	13470371
122	NC_002678	CGGC	2	8	44889	44896	0 %	0 %	50 %	50 %	13470372
123	NC_002678	AGCC	2	8	45025	45032	25 %	0 %	25 %	50 %	13470372
124	NC_002678	AGCC	2	8	45213	45220	25 %	0 %	25 %	50 %	13470372
125	NC_002678	GCAA	2	8	45291	45298	50 %	0 %	25 %	25 %	13470372
126	NC_002678	GCCA	2	8	45693	45700	25 %	0 %	25 %	50 %	13470372
127	NC_002678	ATCA	2	8	46212	46219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002678	AGAA	2	8	46253	46260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002678	TCGC	2	8	46370	46377	0 %	25 %	25 %	50 %	13470373
130	NC_002678	TGAC	2	8	46434	46441	25 %	25 %	25 %	25 %	13470373
131	NC_002678	CGAT	2	8	46560	46567	25 %	25 %	25 %	25 %	13470374
132	NC_002678	CACC	2	8	46733	46740	25 %	0 %	0 %	75 %	13470374
133	NC_002678	CGCA	2	8	46925	46932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002678	GGCC	2	8	47116	47123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002678	TGCG	2	8	47226	47233	0 %	25 %	50 %	25 %	13470375
136	NC_002678	GAAA	2	8	47596	47603	75 %	0 %	25 %	0 %	13470376
137	NC_002678	GGCG	2	8	47849	47856	0 %	0 %	75 %	25 %	13470376
138	NC_002678	GGCC	2	8	48687	48694	0 %	0 %	50 %	50 %	13470377
139	NC_002678	CAGG	2	8	48948	48955	25 %	0 %	50 %	25 %	13470377
140	NC_002678	GCGA	2	8	49056	49063	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_002678	GAAG	2	8	50758	50765	50 %	0 %	50 %	0 %	13470380
142	NC_002678	GACT	2	8	50984	50991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002678	GCCG	2	8	51745	51752	0 %	0 %	50 %	50 %	13470381
144	NC_002678	AGCG	2	8	53809	53816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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