MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 2570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002677	ACCAC	2	10	1448	1457	40 %	0 %	0 %	60 %	15826866
2	NC_002677	GCCGA	2	10	3027	3036	20 %	0 %	40 %	40 %	15826867
3	NC_002677	AGGGT	2	10	4724	4733	20 %	20 %	60 %	0 %	15826869
4	NC_002677	TGGTG	2	10	4902	4911	0 %	40 %	60 %	0 %	15826869
5	NC_002677	GCAGC	2	10	7392	7401	20 %	0 %	40 %	40 %	15826871
6	NC_002677	GGCAA	2	10	7655	7664	40 %	0 %	40 %	20 %	15826871
7	NC_002677	AAGCT	2	10	8612	8621	40 %	20 %	20 %	20 %	15826871
8	NC_002677	GGGGT	2	10	10919	10928	0 %	20 %	80 %	0 %	15826871
9	NC_002677	ACCGT	2	10	11624	11633	20 %	20 %	20 %	40 %	15826872
10	NC_002677	TCAGC	2	10	12644	12653	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_002677	ACTGG	2	10	13039	13048	20 %	20 %	40 %	20 %	15826873
12	NC_002677	TCACC	2	10	19279	19288	20 %	20 %	0 %	60 %	15826879
13	NC_002677	TAGCG	2	10	22468	22477	20 %	20 %	40 %	20 %	15826881
14	NC_002677	TGGGG	2	10	25089	25098	0 %	20 %	80 %	0 %	15826883
15	NC_002677	CGGAT	2	10	26009	26018	20 %	20 %	40 %	20 %	15826883
16	NC_002677	CCGCG	2	10	28081	28090	0 %	0 %	40 %	60 %	15826885
17	NC_002677	GCCCT	2	10	28133	28142	0 %	20 %	20 %	60 %	15826885
18	NC_002677	CTCGA	2	10	28587	28596	20 %	20 %	20 %	40 %	15826885
19	NC_002677	ATTTT	2	10	30261	30270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002677	GCCAC	2	10	31424	31433	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_002677	ACAAA	2	10	33030	33039	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_002677	CGTCG	2	10	33940	33949	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_002677	ACCGT	2	10	34383	34392	20 %	20 %	20 %	40 %	15826890
24	NC_002677	CAAGG	2	10	35269	35278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002677	CGATG	2	10	36380	36389	20 %	20 %	40 %	20 %	15826893
26	NC_002677	CGTAC	2	10	37994	38003	20 %	20 %	20 %	40 %	15826893
27	NC_002677	GCACC	2	10	38792	38801	20 %	0 %	20 %	60 %	15826893
28	NC_002677	AATAT	2	10	40240	40249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002677	GATCA	2	10	40831	40840	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002677	GCTGC	2	10	42665	42674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_002677	CTGGG	2	10	44958	44967	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002677	CGATC	2	10	47461	47470	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_002677	CTGAG	2	10	47545	47554	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_002677	TGGCT	2	10	49441	49450	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002677	GAATG	2	10	50635	50644	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002677	GTGGC	2	10	53220	53229	0 %	20 %	60 %	20 %	15826895
37	NC_002677	GTTTT	2	10	54088	54097	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002677	ATATA	2	10	54205	54214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002677	CAGCC	2	10	55210	55219	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_002677	CCGGG	2	10	59308	59317	0 %	0 %	60 %	40 %	15826897
41	NC_002677	GTCGA	2	10	59639	59648	20 %	20 %	40 %	20 %	15826898
42	NC_002677	ACATT	2	10	59956	59965	40 %	40 %	0 %	20 %	15826898
43	NC_002677	GCTGT	2	10	60027	60036	0 %	40 %	40 %	20 %	15826898
44	NC_002677	GGCAG	2	10	62598	62607	20 %	0 %	60 %	20 %	15826901
45	NC_002677	TCTGC	2	10	62944	62953	0 %	40 %	20 %	40 %	15826901
46	NC_002677	GTCAG	2	10	63743	63752	20 %	20 %	40 %	20 %	15826902
47	NC_002677	TCCGG	2	10	64088	64097	0 %	20 %	40 %	40 %	15826902
48	NC_002677	GAACT	2	10	65334	65343	40 %	20 %	20 %	20 %	15826903
49	NC_002677	GGCGT	2	10	68450	68459	0 %	20 %	60 %	20 %	15826904
50	NC_002677	ATTCG	2	10	69201	69210	20 %	40 %	20 %	20 %	15826905
51	NC_002677	CCCGT	2	10	69364	69373	0 %	20 %	20 %	60 %	15826905
52	NC_002677	ACTTT	2	10	69866	69875	20 %	60 %	0 %	20 %	15826905
53	NC_002677	CCTGC	2	10	71297	71306	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_002677	CTGGC	2	10	71557	71566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_002677	CGGAC	2	10	72053	72062	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_002677	GTCAC	2	10	72066	72075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_002677	CAAGT	2	10	72895	72904	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_002677	TTCGG	2	10	75222	75231	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002677	ATTGT	2	10	77336	77345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002677	GAGTC	2	10	77619	77628	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_002677	GTTAG	2	10	77696	77705	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002677	GCTAC	2	10	77962	77971	20 %	20 %	20 %	40 %	15826907
63	NC_002677	GATGC	2	10	78117	78126	20 %	20 %	40 %	20 %	15826907
64	NC_002677	GTGCT	2	10	78793	78802	0 %	40 %	40 %	20 %	15826907
65	NC_002677	GCATG	2	10	79469	79478	20 %	20 %	40 %	20 %	15826907
66	NC_002677	GTGAT	2	10	81040	81049	20 %	40 %	40 %	0 %	15826907
67	NC_002677	GGAAT	2	10	82482	82491	40 %	20 %	40 %	0 %	15826908
68	NC_002677	TCCTG	2	10	85586	85595	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_002677	CAACG	2	10	86643	86652	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_002677	GGTCA	2	10	89677	89686	20 %	20 %	40 %	20 %	15826913
71	NC_002677	CGGAG	2	10	90769	90778	20 %	0 %	60 %	20 %	15826914
72	NC_002677	TCGAC	2	10	91780	91789	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_002677	TGGTG	2	10	93180	93189	0 %	40 %	60 %	0 %	15826917
74	NC_002677	CTGTG	2	10	93954	93963	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002677	GGGCT	2	10	94020	94029	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002677	TTAAC	2	10	94045	94054	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002677	AGTTG	2	10	95093	95102	20 %	40 %	40 %	0 %	15826918
78	NC_002677	TCGAC	2	10	97608	97617	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_002677	TCGTT	2	10	98976	98985	0 %	60 %	20 %	20 %	15826920
80	NC_002677	GCCCA	2	10	100372	100381	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_002677	TTGCG	2	10	102648	102657	0 %	40 %	40 %	20 %	15826923
82	NC_002677	TGTGG	2	10	103777	103786	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002677	CCTAC	2	10	105364	105373	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_002677	GGTTG	2	10	105926	105935	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002677	GCCAT	2	10	106202	106211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_002677	GTGAG	2	10	106655	106664	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002677	CCGTC	2	10	108793	108802	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_002677	CCTAA	2	10	111518	111527	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_002677	ATCGC	2	10	111882	111891	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_002677	TGATC	2	10	112770	112779	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002677	TGGTG	2	10	113423	113432	0 %	40 %	60 %	0 %	15826926
92	NC_002677	AGCCG	2	10	114270	114279	20 %	0 %	40 %	40 %	15826927
93	NC_002677	GCACC	2	10	115273	115282	20 %	0 %	20 %	60 %	15826927
94	NC_002677	GCCGC	2	10	116304	116313	0 %	0 %	40 %	60 %	15826928
95	NC_002677	CGGCG	2	10	116543	116552	0 %	0 %	60 %	40 %	15826928
96	NC_002677	GTGCC	2	10	117457	117466	0 %	20 %	40 %	40 %	15826929
97	NC_002677	GCCGC	2	10	126433	126442	0 %	0 %	40 %	60 %	15826935
98	NC_002677	AGCGA	2	10	126630	126639	40 %	0 %	40 %	20 %	15826936
99	NC_002677	CGATG	2	10	128116	128125	20 %	20 %	40 %	20 %	15826936
100	NC_002677	GCGAC	2	10	129063	129072	20 %	0 %	40 %	40 %	15826936
101	NC_002677	GGCGA	2	10	129110	129119	20 %	0 %	60 %	20 %	15826936
102	NC_002677	CCTGG	2	10	132637	132646	0 %	20 %	40 %	40 %	15826937
103	NC_002677	TGAAT	2	10	134459	134468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002677	CGACA	2	10	136439	136448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_002677	TGGCA	2	10	137890	137899	20 %	20 %	40 %	20 %	15826938
106	NC_002677	GAACG	2	10	137905	137914	40 %	0 %	40 %	20 %	15826938
107	NC_002677	ACGCC	2	10	138154	138163	20 %	0 %	20 %	60 %	15826938
108	NC_002677	ACGGT	2	10	139578	139587	20 %	20 %	40 %	20 %	15826938
109	NC_002677	CGGAT	2	10	140763	140772	20 %	20 %	40 %	20 %	15826939
110	NC_002677	CCGGA	2	10	140938	140947	20 %	0 %	40 %	40 %	15826939
111	NC_002677	ACGGT	2	10	145520	145529	20 %	20 %	40 %	20 %	15826940
112	NC_002677	CTGGC	2	10	145883	145892	0 %	20 %	40 %	40 %	15826940
113	NC_002677	GGCTG	2	10	146929	146938	0 %	20 %	60 %	20 %	15826940
114	NC_002677	CACGG	2	10	147119	147128	20 %	0 %	40 %	40 %	15826940
115	NC_002677	ATGTC	2	10	148974	148983	20 %	40 %	20 %	20 %	15826941
116	NC_002677	CCTGG	2	10	149549	149558	0 %	20 %	40 %	40 %	15826942
117	NC_002677	CGCTG	2	10	152284	152293	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_002677	ATTCG	2	10	152473	152482	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_002677	GATCA	2	10	153551	153560	40 %	20 %	20 %	20 %	15826945
120	NC_002677	GCGAT	2	10	154094	154103	20 %	20 %	40 %	20 %	15826946
121	NC_002677	GCCGC	2	10	154167	154176	0 %	0 %	40 %	60 %	15826946
122	NC_002677	TGCCA	2	10	156748	156757	20 %	20 %	20 %	40 %	15826949
123	NC_002677	CGCAG	2	10	158222	158231	20 %	0 %	40 %	40 %	15826950
124	NC_002677	CGGGC	2	10	159470	159479	0 %	0 %	60 %	40 %	15826951
125	NC_002677	GTGGC	2	10	160313	160322	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_002677	CGTAG	2	10	161839	161848	20 %	20 %	40 %	20 %	15826953
127	NC_002677	AGCTG	2	10	165373	165382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_002677	CATGT	2	10	166855	166864	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_002677	GGCAG	2	10	168965	168974	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_002677	TCAGC	2	10	173170	173179	20 %	20 %	20 %	40 %	15826960
131	NC_002677	CAGGT	2	10	173761	173770	20 %	20 %	40 %	20 %	15826960
132	NC_002677	CGAAT	2	10	173995	174004	40 %	20 %	20 %	20 %	15826960
133	NC_002677	TTTCG	2	10	175450	175459	0 %	60 %	20 %	20 %	15826962
134	NC_002677	TCGCG	2	10	177251	177260	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_002677	GCAAC	2	10	177392	177401	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_002677	CGGTG	2	10	180140	180149	0 %	20 %	60 %	20 %	15826965
137	NC_002677	TCAGT	2	10	180679	180688	20 %	40 %	20 %	20 %	15826965
138	NC_002677	TGTCG	2	10	182388	182397	0 %	40 %	40 %	20 %	15826966
139	NC_002677	TGGCG	2	10	183840	183849	0 %	20 %	60 %	20 %	15826966
140	NC_002677	AGTGG	2	10	184818	184827	20 %	20 %	60 %	0 %	15826966
141	NC_002677	TTTGG	2	10	186044	186053	0 %	60 %	40 %	0 %	15826966
142	NC_002677	CCGGG	2	10	186735	186744	0 %	0 %	60 %	40 %	15826966
143	NC_002677	TCGGC	2	10	189274	189283	0 %	20 %	40 %	40 %	15826968
144	NC_002677	ACAGC	2	10	189750	189759	40 %	0 %	20 %	40 %	15826968
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147	NC_002677	GGGAT	2	10	194254	194263	20 %	20 %	60 %	0 %	15826970
148	NC_002677	GGTGG	2	10	194414	194423	0 %	20 %	80 %	0 %	15826970
149	NC_002677	GCACA	2	10	195261	195270	40 %	0 %	20 %	40 %	15826970
150	NC_002677	CTATC	2	10	195302	195311	20 %	40 %	0 %	40 %	15826970
151	NC_002677	TGGTG	2	10	198042	198051	0 %	40 %	60 %	0 %	15826970
152	NC_002677	GCGCC	2	10	199989	199998	0 %	0 %	40 %	60 %	15826970
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155	NC_002677	GGTGT	2	10	204779	204788	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
156	NC_002677	TCCGG	2	10	206279	206288	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
157	NC_002677	TGCCA	2	10	206567	206576	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_002677	CGTCC	2	10	206855	206864	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
159	NC_002677	TAACT	2	10	208226	208235	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_002677	GCGAA	2	10	208476	208485	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_002677	CGTCG	2	10	210440	210449	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_002677	CGGCT	2	10	210622	210631	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_002677	ACACT	2	10	210699	210708	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_002677	GTGTC	2	10	215768	215777	0 %	40 %	40 %	20 %	15826976
165	NC_002677	TCCGG	2	10	216418	216427	0 %	20 %	40 %	40 %	15826976
166	NC_002677	GTACT	2	10	216848	216857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_002677	CACGG	2	10	217203	217212	20 %	0 %	40 %	40 %	15826977
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176	NC_002677	ACCCT	2	10	230944	230953	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
177	NC_002677	AGCCA	2	10	233958	233967	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
178	NC_002677	TGGCC	2	10	240148	240157	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
179	NC_002677	GATTT	2	10	241078	241087	20 %	60 %	20 %	0 %	15826987
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181	NC_002677	CCAAG	2	10	243884	243893	40 %	0 %	20 %	40 %	15826989
182	NC_002677	TGGTG	2	10	244407	244416	0 %	40 %	60 %	0 %	15826990
183	NC_002677	GGTGG	2	10	244471	244480	0 %	20 %	80 %	0 %	15826990
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185	NC_002677	CGTTG	2	10	245728	245737	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
186	NC_002677	TGCGT	2	10	247777	247786	0 %	40 %	40 %	20 %	15826994
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191	NC_002677	TTTAT	2	10	251781	251790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_002677	GTCCT	2	10	253193	253202	0 %	40 %	20 %	40 %	15826998
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196	NC_002677	ACGTC	2	10	257801	257810	20 %	20 %	20 %	40 %	15827001
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202	NC_002677	TTCGT	2	10	261877	261886	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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256	NC_002677	GGATG	2	10	316028	316037	20 %	20 %	60 %	0 %	15827036
257	NC_002677	CGGAT	2	10	320965	320974	20 %	20 %	40 %	20 %	15827041
258	NC_002677	TTTGT	2	10	322294	322303	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_002677	TTGGG	2	10	322687	322696	0 %	40 %	60 %	0 %	15827042
260	NC_002677	GTGTT	2	10	323174	323183	0 %	60 %	40 %	0 %	15827043
261	NC_002677	GTGAT	2	10	323345	323354	20 %	40 %	40 %	0 %	15827043
262	NC_002677	ACTGT	2	10	327202	327211	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_002677	TCCGG	2	10	329202	329211	0 %	20 %	40 %	40 %	15827046
264	NC_002677	GCCAG	2	10	329946	329955	20 %	0 %	40 %	40 %	15827046
265	NC_002677	GCTGC	2	10	330620	330629	0 %	20 %	40 %	40 %	15827046
266	NC_002677	GTCGG	2	10	330924	330933	0 %	20 %	60 %	20 %	15827046
267	NC_002677	CAGCG	2	10	332586	332595	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
268	NC_002677	GTCTC	2	10	333030	333039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_002677	TCAGT	2	10	333095	333104	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_002677	GCCGC	2	10	335673	335682	0 %	0 %	40 %	60 %	15827048
271	NC_002677	TGACT	2	10	338394	338403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
272	NC_002677	TCCGA	2	10	338910	338919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
273	NC_002677	AACGG	2	10	340443	340452	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
274	NC_002677	GCGTG	2	10	344223	344232	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
275	NC_002677	TTCAG	2	10	352381	352390	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
276	NC_002677	GACAA	2	10	352548	352557	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
277	NC_002677	CAGCC	2	10	353008	353017	20 %	0 %	20 %	60 %	15827052
278	NC_002677	GGCAA	2	10	355339	355348	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
279	NC_002677	GCCTG	2	10	356201	356210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
280	NC_002677	TTGGA	2	10	356409	356418	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
281	NC_002677	GACAG	2	10	357402	357411	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_002677	CAACC	2	10	358852	358861	40 %	0 %	0 %	60 %	15827056
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404	NC_002677	GTCAA	2	10	500939	500948	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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411	NC_002677	CAGTG	2	10	505898	505907	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
412	NC_002677	TCGGC	2	10	506901	506910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
413	NC_002677	TCTCG	2	10	507876	507885	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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