MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 1239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002677	ACCAC	2	10	1448	1457	40 %	0 %	0 %	60 %	15826866
2	NC_002677	GCCGA	2	10	3027	3036	20 %	0 %	40 %	40 %	15826867
3	NC_002677	AGGGT	2	10	4724	4733	20 %	20 %	60 %	0 %	15826869
4	NC_002677	TGGTG	2	10	4902	4911	0 %	40 %	60 %	0 %	15826869
5	NC_002677	GCAGC	2	10	7392	7401	20 %	0 %	40 %	40 %	15826871
6	NC_002677	GGCAA	2	10	7655	7664	40 %	0 %	40 %	20 %	15826871
7	NC_002677	AAGCT	2	10	8612	8621	40 %	20 %	20 %	20 %	15826871
8	NC_002677	GGGGT	2	10	10919	10928	0 %	20 %	80 %	0 %	15826871
9	NC_002677	ACCGT	2	10	11624	11633	20 %	20 %	20 %	40 %	15826872
10	NC_002677	ACTGG	2	10	13039	13048	20 %	20 %	40 %	20 %	15826873
11	NC_002677	TCACC	2	10	19279	19288	20 %	20 %	0 %	60 %	15826879
12	NC_002677	TAGCG	2	10	22468	22477	20 %	20 %	40 %	20 %	15826881
13	NC_002677	TGGGG	2	10	25089	25098	0 %	20 %	80 %	0 %	15826883
14	NC_002677	CGGAT	2	10	26009	26018	20 %	20 %	40 %	20 %	15826883
15	NC_002677	CCGCG	2	10	28081	28090	0 %	0 %	40 %	60 %	15826885
16	NC_002677	GCCCT	2	10	28133	28142	0 %	20 %	20 %	60 %	15826885
17	NC_002677	CTCGA	2	10	28587	28596	20 %	20 %	20 %	40 %	15826885
18	NC_002677	ACCGT	2	10	34383	34392	20 %	20 %	20 %	40 %	15826890
19	NC_002677	CGATG	2	10	36380	36389	20 %	20 %	40 %	20 %	15826893
20	NC_002677	CGTAC	2	10	37994	38003	20 %	20 %	20 %	40 %	15826893
21	NC_002677	GCACC	2	10	38792	38801	20 %	0 %	20 %	60 %	15826893
22	NC_002677	GTGGC	2	10	53220	53229	0 %	20 %	60 %	20 %	15826895
23	NC_002677	CCGGG	2	10	59308	59317	0 %	0 %	60 %	40 %	15826897
24	NC_002677	GTCGA	2	10	59639	59648	20 %	20 %	40 %	20 %	15826898
25	NC_002677	ACATT	2	10	59956	59965	40 %	40 %	0 %	20 %	15826898
26	NC_002677	GCTGT	2	10	60027	60036	0 %	40 %	40 %	20 %	15826898
27	NC_002677	GGCAG	2	10	62598	62607	20 %	0 %	60 %	20 %	15826901
28	NC_002677	TCTGC	2	10	62944	62953	0 %	40 %	20 %	40 %	15826901
29	NC_002677	GTCAG	2	10	63743	63752	20 %	20 %	40 %	20 %	15826902
30	NC_002677	TCCGG	2	10	64088	64097	0 %	20 %	40 %	40 %	15826902
31	NC_002677	GAACT	2	10	65334	65343	40 %	20 %	20 %	20 %	15826903
32	NC_002677	GGCGT	2	10	68450	68459	0 %	20 %	60 %	20 %	15826904
33	NC_002677	ATTCG	2	10	69201	69210	20 %	40 %	20 %	20 %	15826905
34	NC_002677	CCCGT	2	10	69364	69373	0 %	20 %	20 %	60 %	15826905
35	NC_002677	ACTTT	2	10	69866	69875	20 %	60 %	0 %	20 %	15826905
36	NC_002677	GCTAC	2	10	77962	77971	20 %	20 %	20 %	40 %	15826907
37	NC_002677	GATGC	2	10	78117	78126	20 %	20 %	40 %	20 %	15826907
38	NC_002677	GTGCT	2	10	78793	78802	0 %	40 %	40 %	20 %	15826907
39	NC_002677	GCATG	2	10	79469	79478	20 %	20 %	40 %	20 %	15826907
40	NC_002677	GTGAT	2	10	81040	81049	20 %	40 %	40 %	0 %	15826907
41	NC_002677	GGAAT	2	10	82482	82491	40 %	20 %	40 %	0 %	15826908
42	NC_002677	GGTCA	2	10	89677	89686	20 %	20 %	40 %	20 %	15826913
43	NC_002677	CGGAG	2	10	90769	90778	20 %	0 %	60 %	20 %	15826914
44	NC_002677	TGGTG	2	10	93180	93189	0 %	40 %	60 %	0 %	15826917
45	NC_002677	AGTTG	2	10	95093	95102	20 %	40 %	40 %	0 %	15826918
46	NC_002677	TCGTT	2	10	98976	98985	0 %	60 %	20 %	20 %	15826920
47	NC_002677	TTGCG	2	10	102648	102657	0 %	40 %	40 %	20 %	15826923
48	NC_002677	TGGTG	2	10	113423	113432	0 %	40 %	60 %	0 %	15826926
49	NC_002677	AGCCG	2	10	114270	114279	20 %	0 %	40 %	40 %	15826927
50	NC_002677	GCACC	2	10	115273	115282	20 %	0 %	20 %	60 %	15826927
51	NC_002677	GCCGC	2	10	116304	116313	0 %	0 %	40 %	60 %	15826928
52	NC_002677	CGGCG	2	10	116543	116552	0 %	0 %	60 %	40 %	15826928
53	NC_002677	GTGCC	2	10	117457	117466	0 %	20 %	40 %	40 %	15826929
54	NC_002677	GCCGC	2	10	126433	126442	0 %	0 %	40 %	60 %	15826935
55	NC_002677	AGCGA	2	10	126630	126639	40 %	0 %	40 %	20 %	15826936
56	NC_002677	CGATG	2	10	128116	128125	20 %	20 %	40 %	20 %	15826936
57	NC_002677	GCGAC	2	10	129063	129072	20 %	0 %	40 %	40 %	15826936
58	NC_002677	GGCGA	2	10	129110	129119	20 %	0 %	60 %	20 %	15826936
59	NC_002677	CCTGG	2	10	132637	132646	0 %	20 %	40 %	40 %	15826937
60	NC_002677	TGGCA	2	10	137890	137899	20 %	20 %	40 %	20 %	15826938
61	NC_002677	GAACG	2	10	137905	137914	40 %	0 %	40 %	20 %	15826938
62	NC_002677	ACGCC	2	10	138154	138163	20 %	0 %	20 %	60 %	15826938
63	NC_002677	ACGGT	2	10	139578	139587	20 %	20 %	40 %	20 %	15826938
64	NC_002677	CGGAT	2	10	140763	140772	20 %	20 %	40 %	20 %	15826939
65	NC_002677	CCGGA	2	10	140938	140947	20 %	0 %	40 %	40 %	15826939
66	NC_002677	ACGGT	2	10	145520	145529	20 %	20 %	40 %	20 %	15826940
67	NC_002677	CTGGC	2	10	145883	145892	0 %	20 %	40 %	40 %	15826940
68	NC_002677	GGCTG	2	10	146929	146938	0 %	20 %	60 %	20 %	15826940
69	NC_002677	CACGG	2	10	147119	147128	20 %	0 %	40 %	40 %	15826940
70	NC_002677	ATGTC	2	10	148974	148983	20 %	40 %	20 %	20 %	15826941
71	NC_002677	CCTGG	2	10	149549	149558	0 %	20 %	40 %	40 %	15826942
72	NC_002677	GATCA	2	10	153551	153560	40 %	20 %	20 %	20 %	15826945
73	NC_002677	GCGAT	2	10	154094	154103	20 %	20 %	40 %	20 %	15826946
74	NC_002677	GCCGC	2	10	154167	154176	0 %	0 %	40 %	60 %	15826946
75	NC_002677	TGCCA	2	10	156748	156757	20 %	20 %	20 %	40 %	15826949
76	NC_002677	CGCAG	2	10	158222	158231	20 %	0 %	40 %	40 %	15826950
77	NC_002677	CGGGC	2	10	159470	159479	0 %	0 %	60 %	40 %	15826951
78	NC_002677	CGTAG	2	10	161839	161848	20 %	20 %	40 %	20 %	15826953
79	NC_002677	TCAGC	2	10	173170	173179	20 %	20 %	20 %	40 %	15826960
80	NC_002677	CAGGT	2	10	173761	173770	20 %	20 %	40 %	20 %	15826960
81	NC_002677	CGAAT	2	10	173995	174004	40 %	20 %	20 %	20 %	15826960
82	NC_002677	TTTCG	2	10	175450	175459	0 %	60 %	20 %	20 %	15826962
83	NC_002677	CGGTG	2	10	180140	180149	0 %	20 %	60 %	20 %	15826965
84	NC_002677	TCAGT	2	10	180679	180688	20 %	40 %	20 %	20 %	15826965
85	NC_002677	TGTCG	2	10	182388	182397	0 %	40 %	40 %	20 %	15826966
86	NC_002677	TGGCG	2	10	183840	183849	0 %	20 %	60 %	20 %	15826966
87	NC_002677	AGTGG	2	10	184818	184827	20 %	20 %	60 %	0 %	15826966
88	NC_002677	TTTGG	2	10	186044	186053	0 %	60 %	40 %	0 %	15826966
89	NC_002677	CCGGG	2	10	186735	186744	0 %	0 %	60 %	40 %	15826966
90	NC_002677	TCGGC	2	10	189274	189283	0 %	20 %	40 %	40 %	15826968
91	NC_002677	ACAGC	2	10	189750	189759	40 %	0 %	20 %	40 %	15826968
92	NC_002677	TGGCC	2	10	192666	192675	0 %	20 %	40 %	40 %	15826969
93	NC_002677	ACTGG	2	10	193019	193028	20 %	20 %	40 %	20 %	15826969
94	NC_002677	GGGAT	2	10	194254	194263	20 %	20 %	60 %	0 %	15826970
95	NC_002677	GGTGG	2	10	194414	194423	0 %	20 %	80 %	0 %	15826970
96	NC_002677	GCACA	2	10	195261	195270	40 %	0 %	20 %	40 %	15826970
97	NC_002677	CTATC	2	10	195302	195311	20 %	40 %	0 %	40 %	15826970
98	NC_002677	TGGTG	2	10	198042	198051	0 %	40 %	60 %	0 %	15826970
99	NC_002677	GCGCC	2	10	199989	199998	0 %	0 %	40 %	60 %	15826970
100	NC_002677	GTGTC	2	10	215768	215777	0 %	40 %	40 %	20 %	15826976
101	NC_002677	TCCGG	2	10	216418	216427	0 %	20 %	40 %	40 %	15826976
102	NC_002677	CACGG	2	10	217203	217212	20 %	0 %	40 %	40 %	15826977
103	NC_002677	CGGCG	2	10	217869	217878	0 %	0 %	60 %	40 %	15826977
104	NC_002677	TTGGT	2	10	220134	220143	0 %	60 %	40 %	0 %	15826979
105	NC_002677	CCACC	2	10	222429	222438	20 %	0 %	0 %	80 %	15826980
106	NC_002677	CCCGG	2	10	224082	224091	0 %	0 %	40 %	60 %	15826982
107	NC_002677	GCGTG	2	10	225876	225885	0 %	20 %	60 %	20 %	15826983
108	NC_002677	GATTT	2	10	241078	241087	20 %	60 %	20 %	0 %	15826987
109	NC_002677	GGCTT	2	10	243859	243868	0 %	40 %	40 %	20 %	15826989
110	NC_002677	CCAAG	2	10	243884	243893	40 %	0 %	20 %	40 %	15826989
111	NC_002677	TGGTG	2	10	244407	244416	0 %	40 %	60 %	0 %	15826990
112	NC_002677	GGTGG	2	10	244471	244480	0 %	20 %	80 %	0 %	15826990
113	NC_002677	TGCGT	2	10	247777	247786	0 %	40 %	40 %	20 %	15826994
114	NC_002677	CGGTG	2	10	248472	248481	0 %	20 %	60 %	20 %	15826995
115	NC_002677	AGCCG	2	10	248858	248867	20 %	0 %	40 %	40 %	15826995
116	NC_002677	GTGCT	2	10	249614	249623	0 %	40 %	40 %	20 %	15826996
117	NC_002677	GCGTG	2	10	249953	249962	0 %	20 %	60 %	20 %	15826996
118	NC_002677	GTCCT	2	10	253193	253202	0 %	40 %	20 %	40 %	15826998
119	NC_002677	GACAA	2	10	254290	254299	60 %	0 %	20 %	20 %	15826999
120	NC_002677	ACGTC	2	10	257801	257810	20 %	20 %	20 %	40 %	15827001
121	NC_002677	CTGTG	2	10	258724	258733	0 %	40 %	40 %	20 %	15827002
122	NC_002677	CGGTG	2	10	258971	258980	0 %	20 %	60 %	20 %	15827002
123	NC_002677	CGCGG	2	10	265504	265513	0 %	0 %	60 %	40 %	15827004
124	NC_002677	AGTCG	2	10	266092	266101	20 %	20 %	40 %	20 %	15827005
125	NC_002677	TCCGA	2	10	266714	266723	20 %	20 %	20 %	40 %	15827005
126	NC_002677	GTGCG	2	10	268925	268934	0 %	20 %	60 %	20 %	15827006
127	NC_002677	CGGCA	2	10	269754	269763	20 %	0 %	40 %	40 %	15827006
128	NC_002677	AGCTG	2	10	270649	270658	20 %	20 %	40 %	20 %	15827007
129	NC_002677	CTGCA	2	10	270789	270798	20 %	20 %	20 %	40 %	15827007
130	NC_002677	GATGC	2	10	273321	273330	20 %	20 %	40 %	20 %	15827008
131	NC_002677	CCCAG	2	10	274627	274636	20 %	0 %	20 %	60 %	15827008
132	NC_002677	GGTCC	2	10	274821	274830	0 %	20 %	40 %	40 %	15827008
133	NC_002677	CCGAC	2	10	275482	275491	20 %	0 %	20 %	60 %	15827009
134	NC_002677	GATCG	2	10	279807	279816	20 %	20 %	40 %	20 %	15827012
135	NC_002677	CTGAT	2	10	279980	279989	20 %	40 %	20 %	20 %	15827012
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