MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 8304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002677	CGTT	2	8	569	576	0 %	50 %	25 %	25 %	15826866
2	NC_002677	CGTT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002677	GTTG	2	8	2102	2109	0 %	50 %	50 %	0 %	15826867
4	NC_002677	TGTC	2	8	2753	2760	0 %	50 %	25 %	25 %	15826867
5	NC_002677	CTGA	2	8	3098	3105	25 %	25 %	25 %	25 %	15826867
6	NC_002677	GGAC	2	8	3350	3357	25 %	0 %	50 %	25 %	15826868
7	NC_002677	GATT	2	8	3526	3533	25 %	50 %	25 %	0 %	15826868
8	NC_002677	GGGC	2	8	3548	3555	0 %	0 %	75 %	25 %	15826868
9	NC_002677	GCCA	2	8	4157	4164	25 %	0 %	25 %	50 %	15826868
10	NC_002677	TGTA	2	8	6601	6608	25 %	50 %	25 %	0 %	15826870
11	NC_002677	AGCG	2	8	6990	6997	25 %	0 %	50 %	25 %	15826870
12	NC_002677	TAAA	2	8	7267	7274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002677	TGAC	2	8	8831	8838	25 %	25 %	25 %	25 %	15826871
14	NC_002677	CTAC	2	8	9710	9717	25 %	25 %	0 %	50 %	15826871
15	NC_002677	ACTG	2	8	10026	10033	25 %	25 %	25 %	25 %	15826871
16	NC_002677	TTGC	2	8	10375	10382	0 %	50 %	25 %	25 %	15826871
17	NC_002677	AATT	2	8	10530	10537	50 %	50 %	0 %	0 %	15826871
18	NC_002677	GGGC	2	8	10660	10667	0 %	0 %	75 %	25 %	15826871
19	NC_002677	TTGG	2	8	10864	10871	0 %	50 %	50 %	0 %	15826871
20	NC_002677	CAGG	2	8	10957	10964	25 %	0 %	50 %	25 %	15826871
21	NC_002677	CGAA	2	8	11205	11212	50 %	0 %	25 %	25 %	15826872
22	NC_002677	TCCG	2	8	12610	12617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002677	TAGA	2	8	13739	13746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002677	CTTG	2	8	13885	13892	0 %	50 %	25 %	25 %	15826874
25	NC_002677	ACAT	3	12	14217	14228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002677	TTGA	2	8	14321	14328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002677	TTGG	2	8	14476	14483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002677	GCAT	2	8	14712	14719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002677	GTTG	2	8	14853	14860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002677	GAAA	2	8	14914	14921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002677	ATTT	2	8	15007	15014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002677	GCTG	2	8	15435	15442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002677	GACT	2	8	15510	15517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002677	CGGT	2	8	15558	15565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002677	TGGA	2	8	15640	15647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002677	CCTT	2	8	15684	15691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002677	GACC	2	8	16433	16440	25 %	0 %	25 %	50 %	15826875
38	NC_002677	CAGC	2	8	16567	16574	25 %	0 %	25 %	50 %	15826876
39	NC_002677	GCCC	2	8	18078	18085	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_002677	CGAT	2	8	18099	18106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002677	CCGG	2	8	18239	18246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002677	TCAT	2	8	18717	18724	25 %	50 %	0 %	25 %	15826878
43	NC_002677	CACC	2	8	19648	19655	25 %	0 %	0 %	75 %	15826879
44	NC_002677	ATGA	2	8	20462	20469	50 %	25 %	25 %	0 %	15826879
45	NC_002677	GCAA	2	8	21266	21273	50 %	0 %	25 %	25 %	15826880
46	NC_002677	CCGG	2	8	21320	21327	0 %	0 %	50 %	50 %	15826880
47	NC_002677	TTGG	2	8	21338	21345	0 %	50 %	50 %	0 %	15826880
48	NC_002677	GGCC	2	8	21361	21368	0 %	0 %	50 %	50 %	15826880
49	NC_002677	GCCG	2	8	21856	21863	0 %	0 %	50 %	50 %	15826880
50	NC_002677	TTGG	2	8	24930	24937	0 %	50 %	50 %	0 %	15826882
51	NC_002677	GTGG	2	8	25215	25222	0 %	25 %	75 %	0 %	15826883
52	NC_002677	GTTG	2	8	25251	25258	0 %	50 %	50 %	0 %	15826883
53	NC_002677	CTGT	2	8	25269	25276	0 %	50 %	25 %	25 %	15826883
54	NC_002677	TCAC	2	8	26001	26008	25 %	25 %	0 %	50 %	15826883
55	NC_002677	TCCG	2	8	26021	26028	0 %	25 %	25 %	50 %	15826883
56	NC_002677	GTAG	2	8	26227	26234	25 %	25 %	50 %	0 %	15826883
57	NC_002677	GCAC	2	8	26361	26368	25 %	0 %	25 %	50 %	15826883
58	NC_002677	CGGC	2	8	27543	27550	0 %	0 %	50 %	50 %	15826885
59	NC_002677	CTGG	2	8	27805	27812	0 %	25 %	50 %	25 %	15826885
60	NC_002677	CGGG	2	8	28241	28248	0 %	0 %	75 %	25 %	15826885
61	NC_002677	TTTG	2	8	29030	29037	0 %	75 %	25 %	0 %	15826886
62	NC_002677	CTGG	2	8	29071	29078	0 %	25 %	50 %	25 %	15826886
63	NC_002677	GTTG	2	8	29119	29126	0 %	50 %	50 %	0 %	15826886
64	NC_002677	GTTC	2	8	29560	29567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002677	TCCG	2	8	29584	29591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002677	CGAA	2	8	30677	30684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002677	CATT	2	8	30944	30951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002677	CGCC	2	8	31147	31154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_002677	CTGT	2	8	31391	31398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002677	CCAG	2	8	31476	31483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002677	ATTC	2	8	32035	32042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002677	CCGG	2	8	32718	32725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_002677	CGCT	2	8	32803	32810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002677	GTGC	2	8	33151	33158	0 %	25 %	50 %	25 %	15826889
75	NC_002677	TTGG	2	8	33604	33611	0 %	50 %	50 %	0 %	15826889
76	NC_002677	GGCA	2	8	33831	33838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002677	GCAA	2	8	33999	34006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002677	ACCA	2	8	34510	34517	50 %	0 %	0 %	50 %	15826890
79	NC_002677	GCCA	2	8	34519	34526	25 %	0 %	25 %	50 %	15826890
80	NC_002677	CGTG	2	8	35592	35599	0 %	25 %	50 %	25 %	15826892
81	NC_002677	CCAA	2	8	35624	35631	50 %	0 %	0 %	50 %	15826892
82	NC_002677	CGGA	2	8	36502	36509	25 %	0 %	50 %	25 %	15826893
83	NC_002677	ACCC	2	8	36714	36721	25 %	0 %	0 %	75 %	15826893
84	NC_002677	ATTG	2	8	36911	36918	25 %	50 %	25 %	0 %	15826893
85	NC_002677	CCGG	2	8	37337	37344	0 %	0 %	50 %	50 %	15826893
86	NC_002677	GGAC	2	8	37429	37436	25 %	0 %	50 %	25 %	15826893
87	NC_002677	CCGC	2	8	37825	37832	0 %	0 %	25 %	75 %	15826893
88	NC_002677	GACG	2	8	37941	37948	25 %	0 %	50 %	25 %	15826893
89	NC_002677	GGGC	2	8	38149	38156	0 %	0 %	75 %	25 %	15826893
90	NC_002677	ACCA	2	8	38871	38878	50 %	0 %	0 %	50 %	15826893
91	NC_002677	GGTT	2	8	39313	39320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002677	CTGC	2	8	39454	39461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002677	CAGC	2	8	39812	39819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002677	CTTT	2	8	40865	40872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002677	GATA	2	8	41065	41072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002677	ACGT	2	8	41253	41260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_002677	GAAA	2	8	41482	41489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002677	CCGG	2	8	41811	41818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002677	AGAT	2	8	41942	41949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002677	AGCT	2	8	42356	42363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002677	AGAA	2	8	42560	42567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002677	GCCG	2	8	43044	43051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002677	AGTT	2	8	43081	43088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002677	GTTG	2	8	43720	43727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002677	CGTA	2	8	44288	44295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002677	CCGA	2	8	44492	44499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002677	TTCG	2	8	44715	44722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002677	CCTA	2	8	44940	44947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002677	GCTT	2	8	45879	45886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_002677	GATC	2	8	46991	46998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002677	ATTG	2	8	48334	48341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002677	CACC	2	8	48822	48829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_002677	CATC	2	8	48948	48955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002677	GTTG	2	8	48959	48966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002677	CGAA	2	8	49419	49426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002677	GTGG	2	8	49468	49475	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002677	TCAG	2	8	49502	49509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002677	CCAC	2	8	49823	49830	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_002677	ACCC	2	8	50723	50730	25 %	0 %	0 %	75 %	15826894
120	NC_002677	GGCG	2	8	51974	51981	0 %	0 %	75 %	25 %	15826894
121	NC_002677	ATTC	2	8	52186	52193	25 %	50 %	0 %	25 %	15826895
122	NC_002677	AGCG	2	8	53265	53272	25 %	0 %	50 %	25 %	15826895
123	NC_002677	AAGG	2	8	53968	53975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002677	GCCG	2	8	54249	54256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002677	CTTT	2	8	54621	54628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002677	TGAC	2	8	54780	54787	25 %	25 %	25 %	25 %	15826896
127	NC_002677	TAGT	2	8	55126	55133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002677	AGCT	2	8	55323	55330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002677	GGTG	2	8	55626	55633	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002677	AATG	2	8	55986	55993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002677	GAAA	2	8	56726	56733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002677	ACCG	2	8	57216	57223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002677	GACT	2	8	57568	57575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002677	TCGA	2	8	59425	59432	25 %	25 %	25 %	25 %	15826897
135	NC_002677	GGTC	2	8	59453	59460	0 %	25 %	50 %	25 %	15826897
136	NC_002677	CCGG	2	8	59696	59703	0 %	0 %	50 %	50 %	15826898
137	NC_002677	CGAC	2	8	59863	59870	25 %	0 %	25 %	50 %	15826898
138	NC_002677	GTGC	2	8	60083	60090	0 %	25 %	50 %	25 %	15826898
139	NC_002677	TCGG	2	8	60164	60171	0 %	25 %	50 %	25 %	15826898
140	NC_002677	GCCC	2	8	61378	61385	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_002677	CGTG	2	8	61392	61399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002677	GCCT	2	8	61430	61437	0 %	25 %	25 %	50 %	15826899
143	NC_002677	TGAT	2	8	61464	61471	25 %	50 %	25 %	0 %	15826899
144	NC_002677	CTAT	2	8	62505	62512	25 %	50 %	0 %	25 %	15826901
145	NC_002677	TTGC	2	8	62911	62918	0 %	50 %	25 %	25 %	15826901
146	NC_002677	CTCG	2	8	63068	63075	0 %	25 %	25 %	50 %	15826901
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148	NC_002677	GCCG	2	8	63652	63659	0 %	0 %	50 %	50 %	15826902
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