MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 4256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002677	CGTT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002677	TAAA	2	8	7267	7274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002677	TCCG	2	8	12610	12617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002677	TAGA	2	8	13739	13746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002677	ACAT	3	12	14217	14228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002677	TTGA	2	8	14321	14328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002677	TTGG	2	8	14476	14483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002677	GCAT	2	8	14712	14719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002677	GTTG	2	8	14853	14860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002677	GAAA	2	8	14914	14921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002677	ATTT	2	8	15007	15014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002677	GCTG	2	8	15435	15442	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002677	GACT	2	8	15510	15517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002677	CGGT	2	8	15558	15565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002677	TGGA	2	8	15640	15647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002677	CCTT	2	8	15684	15691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_002677	GCCC	2	8	18078	18085	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_002677	CGAT	2	8	18099	18106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002677	CCGG	2	8	18239	18246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002677	GTTC	2	8	29560	29567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_002677	TCCG	2	8	29584	29591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_002677	CGAA	2	8	30677	30684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002677	CATT	2	8	30944	30951	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_002677	CGCC	2	8	31147	31154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_002677	CTGT	2	8	31391	31398	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002677	CCAG	2	8	31476	31483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002677	ATTC	2	8	32035	32042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002677	CCGG	2	8	32718	32725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002677	CGCT	2	8	32803	32810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002677	GGCA	2	8	33831	33838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_002677	GCAA	2	8	33999	34006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002677	GGTT	2	8	39313	39320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002677	CTGC	2	8	39454	39461	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002677	CAGC	2	8	39812	39819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_002677	CTTT	2	8	40865	40872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_002677	GATA	2	8	41065	41072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002677	ACGT	2	8	41253	41260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002677	GAAA	2	8	41482	41489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002677	CCGG	2	8	41811	41818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002677	AGAT	2	8	41942	41949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002677	AGCT	2	8	42356	42363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_002677	AGAA	2	8	42560	42567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002677	GCCG	2	8	43044	43051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002677	AGTT	2	8	43081	43088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002677	GTTG	2	8	43720	43727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002677	CGTA	2	8	44288	44295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002677	CCGA	2	8	44492	44499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002677	TTCG	2	8	44715	44722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002677	CCTA	2	8	44940	44947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002677	GCTT	2	8	45879	45886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002677	GATC	2	8	46991	46998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002677	ATTG	2	8	48334	48341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002677	CACC	2	8	48822	48829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_002677	CATC	2	8	48948	48955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002677	GTTG	2	8	48959	48966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002677	CGAA	2	8	49419	49426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002677	GTGG	2	8	49468	49475	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002677	TCAG	2	8	49502	49509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_002677	CCAC	2	8	49823	49830	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_002677	AAGG	2	8	53968	53975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002677	GCCG	2	8	54249	54256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002677	CTTT	2	8	54621	54628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_002677	TAGT	2	8	55126	55133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002677	AGCT	2	8	55323	55330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002677	GGTG	2	8	55626	55633	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002677	AATG	2	8	55986	55993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002677	GAAA	2	8	56726	56733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002677	ACCG	2	8	57216	57223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002677	GACT	2	8	57568	57575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_002677	GCCC	2	8	61378	61385	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_002677	CGTG	2	8	61392	61399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002677	TAGC	2	8	65173	65180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002677	CCGG	2	8	71770	71777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002677	TTTA	2	8	72087	72094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002677	TGCT	2	8	72194	72201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002677	CTAC	2	8	72446	72453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002677	GCCT	2	8	72670	72677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002677	CCAG	2	8	73331	73338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002677	CTCA	2	8	73355	73362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_002677	GTCT	2	8	73822	73829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002677	TTTG	2	8	74196	74203	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002677	GTGG	2	8	74520	74527	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002677	TGCT	2	8	74624	74631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_002677	GCAG	2	8	74987	74994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002677	CCAC	2	8	74999	75006	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_002677	GGCC	2	8	75534	75541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002677	CGGT	2	8	75781	75788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_002677	CTTA	2	8	75876	75883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002677	ATTA	2	8	76380	76387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002677	GGCG	2	8	76758	76765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002677	CGCC	2	8	76888	76895	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_002677	ACCG	2	8	76977	76984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002677	TTTA	2	8	77129	77136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002677	ACGG	2	8	77558	77565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002677	CAGG	2	8	77593	77600	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002677	GGCC	2	8	84269	84276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002677	ATGC	2	8	85915	85922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002677	GGTG	2	8	89336	89343	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002677	AGCA	2	8	91032	91039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002677	CACC	2	8	91560	91567	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_002677	TTCC	2	8	93275	93282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002677	TGAT	2	8	93285	93292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002677	AACT	2	8	93630	93637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002677	TGCT	2	8	96134	96141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002677	ACTT	2	8	96550	96557	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002677	GGGT	2	8	96688	96695	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002677	CAGC	2	8	97104	97111	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002677	TGAG	2	8	97146	97153	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002677	CGGC	2	8	97404	97411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002677	GCTG	2	8	98007	98014	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002677	GCAG	2	8	98132	98139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002677	CATC	2	8	102003	102010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002677	CCTG	2	8	103733	103740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002677	CTTG	2	8	103925	103932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002677	GAGC	2	8	104353	104360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002677	GGCC	2	8	104987	104994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002677	TGCT	2	8	105294	105301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002677	TGCT	2	8	105405	105412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_002677	GAAA	2	8	105810	105817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002677	TAGC	2	8	106424	106431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002677	GTAA	2	8	106989	106996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002677	TCGG	2	8	108387	108394	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002677	TGCA	2	8	108917	108924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002677	CTGT	2	8	111225	111232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_002677	TCGG	2	8	111622	111629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002677	GATC	2	8	112096	112103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002677	GCTT	2	8	113900	113907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002677	CTCG	2	8	121006	121013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002677	CCGA	2	8	124581	124588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002677	TTTA	2	8	133832	133839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002677	GTTT	2	8	134434	134441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002677	GTTC	2	8	134914	134921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002677	GCAT	2	8	135532	135539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002677	CCGG	2	8	136054	136061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002677	GCCG	2	8	143287	143294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_002677	TCGT	2	8	152256	152263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002677	GCTT	2	8	152424	152431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002677	TGGC	2	8	158048	158055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002677	TTGT	2	8	160434	160441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002677	TCCT	2	8	162905	162912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002677	CGAT	2	8	162923	162930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002677	ACGG	2	8	163240	163247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002677	GCAA	2	8	164087	164094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_002677	CTGA	2	8	164851	164858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002677	CATG	2	8	164865	164872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_002677	ACCG	2	8	165641	165648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002677	GTCA	2	8	166272	166279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002677	GTTG	2	8	166526	166533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002677	GCTG	2	8	166543	166550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_002677	GCTA	2	8	166759	166766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_002677	GTTC	2	8	179967	179974	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_002677	GATG	2	8	191976	191983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002677	CAAA	2	8	193876	193883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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