MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	AAATG	2	10	12242	12251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002662	CTATT	2	10	22435	22444	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_002662	ATGGA	2	10	22518	22527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002662	CTTAA	2	10	28604	28613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_002662	AAGTC	2	10	28745	28754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_002662	TTTTA	2	10	30092	30101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002662	AAATA	2	10	30858	30867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002662	TAATC	2	10	35398	35407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_002662	TGCCT	2	10	41122	41131	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002662	TAACT	2	10	43589	43598	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_002662	TTTGA	2	10	45697	45706	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002662	TTTTG	2	10	46180	46189	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002662	AAAAT	2	10	46951	46960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002662	TGCCT	2	10	48500	48509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_002662	GAAAT	2	10	55467	55476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002662	AGTAA	2	10	56500	56509	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002662	AAATA	2	10	57832	57841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002662	ATTCA	2	10	68745	68754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_002662	CTTAA	2	10	69359	69368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002662	ATTTT	2	10	70716	70725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002662	CAAAT	2	10	72181	72190	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_002662	AGTTT	2	10	75026	75035	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002662	AATAA	2	10	75180	75189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002662	TGAAA	2	10	78486	78495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002662	GTTGT	2	10	86520	86529	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002662	TCGTA	2	10	89090	89099	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_002662	TTGCA	2	10	90152	90161	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002662	CTATA	2	10	92937	92946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_002662	ATTCT	2	10	94779	94788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002662	CTATA	2	10	95436	95445	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002662	GTAAA	2	10	96325	96334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002662	AAAGA	2	10	105223	105232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002662	ATAGA	2	10	107080	107089	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002662	ATCTT	2	10	110408	110417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002662	TATGA	2	10	114315	114324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002662	TTTTA	2	10	132671	132680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002662	CGTCG	2	10	146589	146598	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_002662	TTCAA	2	10	147617	147626	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002662	TTTTG	2	10	169252	169261	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002662	TTTGA	2	10	174836	174845	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002662	AAAAT	2	10	176251	176260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002662	TATAA	2	10	179084	179093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002662	TTGGC	2	10	179427	179436	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002662	AGGAA	2	10	193011	193020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002662	TAAAA	2	10	195734	195743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002662	AAAGT	2	10	197956	197965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002662	ATTAT	2	10	200303	200312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002662	AAAAT	2	10	218583	218592	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002662	AAAAT	2	10	221207	221216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002662	AAAAG	2	10	230696	230705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002662	ATAAA	2	10	236717	236726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002662	TGAAT	2	10	242730	242739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002662	TTCCT	2	10	270076	270085	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_002662	AATAA	2	10	270096	270105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002662	TTTGC	2	10	270274	270283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002662	CAAAG	2	10	274091	274100	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_002662	TGTTT	2	10	275653	275662	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002662	TTTAC	2	10	283025	283034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_002662	AAATA	2	10	283731	283740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002662	ATAAA	2	10	287319	287328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002662	ATTTT	2	10	291117	291126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002662	TCAAA	2	10	309159	309168	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002662	AAAAT	2	10	312914	312923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002662	TAAAA	2	10	315574	315583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002662	TAAAA	2	10	323717	323726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002662	CCTTT	2	10	339933	339942	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_002662	TAAAA	2	10	340622	340631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002662	ATTGT	2	10	340650	340659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002662	TTATA	2	10	361367	361376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002662	CTTTC	2	10	365081	365090	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_002662	TATAA	2	10	371089	371098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002662	GTTTG	2	10	395085	395094	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002662	TATTT	2	10	401430	401439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002662	TTATA	2	10	403772	403781	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002662	TTAAA	2	10	408857	408866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002662	CAAAT	2	10	412129	412138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002662	TATAA	2	10	415550	415559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002662	CTTAT	2	10	422109	422118	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002662	GCCTT	2	10	447171	447180	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_002662	GGAAA	2	10	450406	450415	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002662	ATTAT	2	10	450923	450932	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002662	ATTTT	2	10	461307	461316	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002662	TTATA	2	10	461324	461333	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002662	TATAA	2	10	483834	483843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002662	TATAG	2	10	492370	492379	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002662	GAAAG	2	10	511202	511211	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002662	TAAGT	2	10	514385	514394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002662	ACTTA	2	10	516788	516797	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002662	ATAAA	2	10	517603	517612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002662	TAAAA	2	10	517822	517831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002662	ATAAA	2	10	534199	534208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002662	AGGAG	2	10	538227	538236	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002662	TCGTG	2	10	538637	538646	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_002662	AGGGA	2	10	542145	542154	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002662	TGTAG	2	10	542623	542632	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002662	TGTAA	2	10	548225	548234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002662	ATATT	2	10	549786	549795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002662	TTTTA	2	10	549920	549929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002662	TAAAA	2	10	549968	549977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002662	TATAA	2	10	558304	558313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002662	TTATT	2	10	561131	561140	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002662	GGATT	2	10	563075	563084	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002662	GGAAA	2	10	578699	578708	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002662	TAAAA	2	10	578780	578789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002662	TAAAA	2	10	578853	578862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002662	TAAAA	2	10	581952	581961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002662	ATGTA	2	10	582776	582785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002662	TCATT	2	10	583847	583856	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002662	CCAAA	2	10	596582	596591	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_002662	CAATG	2	10	596713	596722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_002662	AATTC	2	10	598218	598227	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_002662	ATTTG	2	10	599929	599938	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002662	AAAAT	2	10	604462	604471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002662	TTTTA	2	10	611699	611708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002662	TATTT	2	10	614017	614026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002662	AATTG	2	10	620441	620450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002662	AATTA	2	10	632272	632281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002662	AAAGG	2	10	632287	632296	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002662	TATTT	2	10	636825	636834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002662	ATAAA	2	10	636966	636975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002662	GTTTT	2	10	637440	637449	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002662	TGGAA	2	10	638974	638983	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002662	TTAAA	2	10	648928	648937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002662	AATTT	2	10	673004	673013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002662	TGTTA	2	10	679169	679178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002662	AAAAG	2	10	684864	684873	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002662	AATAA	2	10	685208	685217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002662	AAATT	2	10	686211	686220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002662	TAAAG	2	10	686439	686448	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002662	TATAA	2	10	687211	687220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002662	TAAAA	2	10	699862	699871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002662	TATAA	2	10	704408	704417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002662	TTATT	2	10	706500	706509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002662	ATTTT	2	10	710312	710321	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002662	TTTTG	2	10	714114	714123	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002662	GCTTT	2	10	725427	725436	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_002662	ATTTA	2	10	727761	727770	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002662	ATTTT	2	10	727927	727936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002662	ATTAA	2	10	748665	748674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002662	AATAT	2	10	750220	750229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002662	TTGTC	2	10	750242	750251	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_002662	TAAAA	2	10	750266	750275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002662	AAAGG	2	10	755381	755390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002662	TTAAT	2	10	762795	762804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002662	TATTT	2	10	763843	763852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002662	ATAAA	2	10	767702	767711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002662	AAAAT	2	10	773772	773781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002662	CGTAG	2	10	778722	778731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_002662	TGAAA	2	10	779380	779389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_002662	TTTGC	2	10	2208229	2208238	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
432	NC_002662	ATATT	2	10	2218395	2218404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_002662	TCCCT	2	10	2218572	2218581	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
434	NC_002662	CACGA	2	10	2222078	2222087	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
435	NC_002662	CTCTC	2	10	2222486	2222495	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
436	NC_002662	AGGCG	2	10	2227283	2227292	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
437	NC_002662	ATTTG	2	10	2242445	2242454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
438	NC_002662	TTTTA	2	10	2251117	2251126	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_002662	ATATT	2	10	2260906	2260915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_002662	TCCCT	2	10	2261083	2261092	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
441	NC_002662	CACGA	2	10	2264590	2264599	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
442	NC_002662	CTCTC	2	10	2264998	2265007	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
443	NC_002662	TAAAA	2	10	2275147	2275156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_002662	TCTAT	2	10	2276450	2276459	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
445	NC_002662	CTAAA	2	10	2276497	2276506	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
446	NC_002662	TAAAC	2	10	2283701	2283710	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
447	NC_002662	TTTAT	2	10	2284157	2284166	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_002662	ACTTT	2	10	2284828	2284837	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
449	NC_002662	TGTCT	2	10	2288288	2288297	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
450	NC_002662	ATCTT	2	10	2289423	2289432	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
451	NC_002662	CCTAT	2	10	2295847	2295856	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
452	NC_002662	ATTTT	2	10	2296951	2296960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_002662	CAAAA	2	10	2298000	2298009	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
454	NC_002662	CTATT	2	10	2300978	2300987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
455	NC_002662	CTTGG	2	10	2307021	2307030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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457	NC_002662	CTTAT	2	10	2325118	2325127	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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459	NC_002662	TTTTA	2	10	2333558	2333567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_002662	ATTAT	2	10	2334363	2334372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_002662	TAAAA	2	10	2338822	2338831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_002662	TTATG	2	10	2340420	2340429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
463	NC_002662	ATATT	2	10	2341136	2341145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_002662	TCCCT	2	10	2341313	2341322	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
465	NC_002662	CACGA	2	10	2344821	2344830	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
466	NC_002662	CTCTC	2	10	2345229	2345238	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
467	NC_002662	AAAAC	2	10	2354374	2354383	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
468	NC_002662	TAATA	2	10	2355657	2355666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_002662	ATATT	2	10	2360315	2360324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_002662	TCCCT	2	10	2360492	2360501	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
471	NC_002662	CACGA	2	10	2364000	2364009	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
472	NC_002662	CTCTC	2	10	2364408	2364417	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
473	NC_002662	ATAAG	2	10	2365409	2365418	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
474	NC_002662	TTTTA	2	10	2365535	2365544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.