MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 1518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	AACTG	2	10	615	624	40 %	20 %	20 %	20 %	15671983
2	NC_002662	ATAAA	2	10	7401	7410	80 %	20 %	0 %	0 %	15671986
3	NC_002662	AAGAT	2	10	10187	10196	60 %	20 %	20 %	0 %	30023968
4	NC_002662	AGTAA	2	10	10330	10339	60 %	20 %	20 %	0 %	15671987
5	NC_002662	TAATA	2	10	10514	10523	60 %	40 %	0 %	0 %	15671987
6	NC_002662	CTTTA	2	10	12636	12645	20 %	60 %	0 %	20 %	15671989
7	NC_002662	AATTT	2	10	13446	13455	40 %	60 %	0 %	0 %	15671991
8	NC_002662	ATAGG	2	10	13972	13981	40 %	20 %	40 %	0 %	15671991
9	NC_002662	ACTCT	2	10	14256	14265	20 %	40 %	0 %	40 %	15671991
10	NC_002662	TAAAT	2	10	15327	15336	60 %	40 %	0 %	0 %	15671992
11	NC_002662	ATTTT	2	10	17844	17853	20 %	80 %	0 %	0 %	15671995
12	NC_002662	AAATG	2	10	18082	18091	60 %	20 %	20 %	0 %	15671995
13	NC_002662	TACTT	2	10	19744	19753	20 %	60 %	0 %	20 %	15671995
14	NC_002662	TTTAG	2	10	21817	21826	20 %	60 %	20 %	0 %	15671998
15	NC_002662	GGGTT	2	10	23113	23122	0 %	40 %	60 %	0 %	15672000
16	NC_002662	ATTTT	2	10	24750	24759	20 %	80 %	0 %	0 %	15672001
17	NC_002662	TTTGG	2	10	25604	25613	0 %	60 %	40 %	0 %	15672002
18	NC_002662	TGGTA	2	10	27545	27554	20 %	40 %	40 %	0 %	15672003
19	NC_002662	TCATT	2	10	37065	37074	20 %	60 %	0 %	20 %	15672010
20	NC_002662	CGTTT	2	10	37324	37333	0 %	60 %	20 %	20 %	15672010
21	NC_002662	ATTTT	2	10	37427	37436	20 %	80 %	0 %	0 %	15672010
22	NC_002662	CTTTC	2	10	38267	38276	0 %	60 %	0 %	40 %	15672011
23	NC_002662	CAATC	2	10	40124	40133	40 %	20 %	0 %	40 %	15672013
24	NC_002662	CATGC	2	10	41668	41677	20 %	20 %	20 %	40 %	15672017
25	NC_002662	TTAAA	2	10	42164	42173	60 %	40 %	0 %	0 %	15672018
26	NC_002662	TACCC	2	10	42188	42197	20 %	20 %	0 %	60 %	15672018
27	NC_002662	ATGAA	2	10	45222	45231	60 %	20 %	20 %	0 %	15672024
28	NC_002662	AATAA	2	10	49680	49689	80 %	20 %	0 %	0 %	15672029
29	NC_002662	ACTTT	2	10	50601	50610	20 %	60 %	0 %	20 %	15672030
30	NC_002662	GATTG	2	10	50862	50871	20 %	40 %	40 %	0 %	15672031
31	NC_002662	AAAAG	2	10	51313	51322	80 %	0 %	20 %	0 %	15672032
32	NC_002662	ATTCA	2	10	51938	51947	40 %	40 %	0 %	20 %	15672032
33	NC_002662	AAATT	2	10	52291	52300	60 %	40 %	0 %	0 %	15672032
34	NC_002662	CAATT	2	10	53810	53819	40 %	40 %	0 %	20 %	15672034
35	NC_002662	TTGTA	2	10	53962	53971	20 %	60 %	20 %	0 %	15672035
36	NC_002662	GCTTC	2	10	54763	54772	0 %	40 %	20 %	40 %	15672036
37	NC_002662	ATCAA	2	10	56005	56014	60 %	20 %	0 %	20 %	15672038
38	NC_002662	GGATT	2	10	57317	57326	20 %	40 %	40 %	0 %	15672039
39	NC_002662	ATTAT	2	10	57485	57494	40 %	60 %	0 %	0 %	15672039
40	NC_002662	CTTAT	2	10	57678	57687	20 %	60 %	0 %	20 %	15672039
41	NC_002662	TATTG	2	10	59994	60003	20 %	60 %	20 %	0 %	15672041
42	NC_002662	TTTAA	2	10	60127	60136	40 %	60 %	0 %	0 %	15672041
43	NC_002662	TTAAT	2	10	61113	61122	40 %	60 %	0 %	0 %	15672042
44	NC_002662	CAAAA	2	10	62306	62315	80 %	0 %	0 %	20 %	15672043
45	NC_002662	TAGTA	2	10	62584	62593	40 %	40 %	20 %	0 %	15672043
46	NC_002662	GCTTG	2	10	63200	63209	0 %	40 %	40 %	20 %	15672044
47	NC_002662	TCCAT	2	10	63551	63560	20 %	40 %	0 %	40 %	15672044
48	NC_002662	GGCTT	2	10	66329	66338	0 %	40 %	40 %	20 %	15672046
49	NC_002662	AATTA	2	10	66833	66842	60 %	40 %	0 %	0 %	15672047
50	NC_002662	GACTT	2	10	67292	67301	20 %	40 %	20 %	20 %	15672048
51	NC_002662	GTTTT	2	10	67446	67455	0 %	80 %	20 %	0 %	15672048
52	NC_002662	TTTCA	2	10	67489	67498	20 %	60 %	0 %	20 %	15672048
53	NC_002662	AAATT	2	10	69086	69095	60 %	40 %	0 %	0 %	15672049
54	NC_002662	GGTTC	2	10	70508	70517	0 %	40 %	40 %	20 %	15672050
55	NC_002662	CTTTA	2	10	70543	70552	20 %	60 %	0 %	20 %	15672050
56	NC_002662	AATCA	2	10	76179	76188	60 %	20 %	0 %	20 %	15672055
57	NC_002662	CCATT	2	10	78267	78276	20 %	40 %	0 %	40 %	15672056
58	NC_002662	GAAGT	2	10	78989	78998	40 %	20 %	40 %	0 %	15672057
59	NC_002662	ATGAT	2	10	80003	80012	40 %	40 %	20 %	0 %	15672058
60	NC_002662	TGGTT	2	10	80999	81008	0 %	60 %	40 %	0 %	15672059
61	NC_002662	TTTAA	2	10	84013	84022	40 %	60 %	0 %	0 %	15672061
62	NC_002662	GAAAA	2	10	84538	84547	80 %	0 %	20 %	0 %	15672061
63	NC_002662	CCAAT	2	10	84940	84949	40 %	20 %	0 %	40 %	15672062
64	NC_002662	TACAG	2	10	85922	85931	40 %	20 %	20 %	20 %	15672062
65	NC_002662	TAAAA	2	10	89371	89380	80 %	20 %	0 %	0 %	15672067
66	NC_002662	TATTT	2	10	89383	89392	20 %	80 %	0 %	0 %	15672067
67	NC_002662	ACTAT	2	10	89812	89821	40 %	40 %	0 %	20 %	15672067
68	NC_002662	TAGAG	2	10	92028	92037	40 %	20 %	40 %	0 %	15672070
69	NC_002662	TAATA	2	10	92557	92566	60 %	40 %	0 %	0 %	15672071
70	NC_002662	TAGAG	2	10	94007	94016	40 %	20 %	40 %	0 %	15672072
71	NC_002662	ATTTA	2	10	98585	98594	40 %	60 %	0 %	0 %	15672078
72	NC_002662	TTTTA	2	10	101411	101420	20 %	80 %	0 %	0 %	15672081
73	NC_002662	TCAAG	2	10	106208	106217	40 %	20 %	20 %	20 %	15672087
74	NC_002662	GTTTG	2	10	106846	106855	0 %	60 %	40 %	0 %	15672087
75	NC_002662	TAGCT	2	10	110908	110917	20 %	40 %	20 %	20 %	15672090
76	NC_002662	AGTTG	2	10	110962	110971	20 %	40 %	40 %	0 %	15672090
77	NC_002662	TAAAA	2	10	111083	111092	80 %	20 %	0 %	0 %	15672091
78	NC_002662	CAGGT	2	10	112918	112927	20 %	20 %	40 %	20 %	15672093
79	NC_002662	TCTGG	2	10	113458	113467	0 %	40 %	40 %	20 %	15672093
80	NC_002662	GTTTG	2	10	114511	114520	0 %	60 %	40 %	0 %	15672094
81	NC_002662	TTTAC	2	10	117619	117628	20 %	60 %	0 %	20 %	15672097
82	NC_002662	ACAAT	2	10	118410	118419	60 %	20 %	0 %	20 %	15672097
83	NC_002662	GATTT	2	10	118481	118490	20 %	60 %	20 %	0 %	15672097
84	NC_002662	TTACA	2	10	119458	119467	40 %	40 %	0 %	20 %	15672098
85	NC_002662	CTAAT	2	10	122672	122681	40 %	40 %	0 %	20 %	15672101
86	NC_002662	AATAG	2	10	123720	123729	60 %	20 %	20 %	0 %	15672103
87	NC_002662	TGACC	2	10	124330	124339	20 %	20 %	20 %	40 %	15672103
88	NC_002662	TATTC	2	10	124934	124943	20 %	60 %	0 %	20 %	15672104
89	NC_002662	TTTTA	2	10	125667	125676	20 %	80 %	0 %	0 %	15672105
90	NC_002662	TGGAT	2	10	126792	126801	20 %	40 %	40 %	0 %	30023975
91	NC_002662	ATCTT	2	10	128250	128259	20 %	60 %	0 %	20 %	15672107
92	NC_002662	GAAAA	2	10	129701	129710	80 %	0 %	20 %	0 %	15672108
93	NC_002662	CCAAA	2	10	130529	130538	60 %	0 %	0 %	40 %	15672108
94	NC_002662	TGGCT	2	10	131490	131499	0 %	40 %	40 %	20 %	15672110
95	NC_002662	GCCAT	2	10	131690	131699	20 %	20 %	20 %	40 %	15672110
96	NC_002662	CAAAT	2	10	132069	132078	60 %	20 %	0 %	20 %	15672111
97	NC_002662	ATTTT	2	10	135993	136002	20 %	80 %	0 %	0 %	15672116
98	NC_002662	GCTTG	2	10	137039	137048	0 %	40 %	40 %	20 %	15672117
99	NC_002662	GAAGC	2	10	137688	137697	40 %	0 %	40 %	20 %	15672118
100	NC_002662	CAATG	2	10	138374	138383	40 %	20 %	20 %	20 %	15672119
101	NC_002662	TACAA	2	10	138489	138498	60 %	20 %	0 %	20 %	15672119
102	NC_002662	CAATT	2	10	139955	139964	40 %	40 %	0 %	20 %	15672121
103	NC_002662	TTGTA	2	10	140107	140116	20 %	60 %	20 %	0 %	15672122
104	NC_002662	GCTTC	2	10	140908	140917	0 %	40 %	20 %	40 %	15672123
105	NC_002662	TAAAA	2	10	142668	142677	80 %	20 %	0 %	0 %	15672126
106	NC_002662	ACCAA	2	10	148018	148027	60 %	0 %	0 %	40 %	15672132
107	NC_002662	AGTGA	2	10	149884	149893	40 %	20 %	40 %	0 %	15672133
108	NC_002662	ACAAA	2	10	150974	150983	80 %	0 %	0 %	20 %	15672133
109	NC_002662	AAATT	2	10	151823	151832	60 %	40 %	0 %	0 %	15672133
110	NC_002662	GCAAA	2	10	152045	152054	60 %	0 %	20 %	20 %	15672133
111	NC_002662	AATAC	2	10	152812	152821	60 %	20 %	0 %	20 %	15672133
112	NC_002662	GTAAA	2	10	153305	153314	60 %	20 %	20 %	0 %	15672133
113	NC_002662	AAGTC	2	10	155893	155902	40 %	20 %	20 %	20 %	15672134
114	NC_002662	TGTTT	2	10	157182	157191	0 %	80 %	20 %	0 %	15672135
115	NC_002662	GCTTT	2	10	160618	160627	0 %	60 %	20 %	20 %	15672140
116	NC_002662	TGTCA	2	10	161712	161721	20 %	40 %	20 %	20 %	15672141
117	NC_002662	TTTAT	2	10	161728	161737	20 %	80 %	0 %	0 %	15672141
118	NC_002662	TAATT	2	10	163265	163274	40 %	60 %	0 %	0 %	15672142
119	NC_002662	ACGGA	2	10	168138	168147	40 %	0 %	40 %	20 %	30023976
120	NC_002662	TGGTT	2	10	168967	168976	0 %	60 %	40 %	0 %	30023976
121	NC_002662	GAATT	2	10	170215	170224	40 %	40 %	20 %	0 %	15672148
122	NC_002662	TGAAA	2	10	171291	171300	60 %	20 %	20 %	0 %	15672149
123	NC_002662	AATTT	2	10	172979	172988	40 %	60 %	0 %	0 %	15672151
124	NC_002662	TCTTT	2	10	173847	173856	0 %	80 %	0 %	20 %	15672152
125	NC_002662	CCAAA	2	10	177947	177956	60 %	0 %	0 %	40 %	15672156
126	NC_002662	TTCTC	2	10	178647	178656	0 %	60 %	0 %	40 %	15672156
127	NC_002662	GTAAA	2	10	180146	180155	60 %	20 %	20 %	0 %	15672157
128	NC_002662	AAATT	2	10	181298	181307	60 %	40 %	0 %	0 %	15672158
129	NC_002662	ATTCG	2	10	182855	182864	20 %	40 %	20 %	20 %	15672159
130	NC_002662	ATTTT	2	10	184379	184388	20 %	80 %	0 %	0 %	15672161
131	NC_002662	TCACA	2	10	184773	184782	40 %	20 %	0 %	40 %	15672161
132	NC_002662	TTGGT	2	10	185920	185929	0 %	60 %	40 %	0 %	15672162
133	NC_002662	GAAGA	2	10	186483	186492	60 %	0 %	40 %	0 %	15672163
134	NC_002662	CAAGA	2	10	187084	187093	60 %	0 %	20 %	20 %	15672163
135	NC_002662	AATTG	2	10	187485	187494	40 %	40 %	20 %	0 %	15672164
136	NC_002662	ACAAT	2	10	190062	190071	60 %	20 %	0 %	20 %	15672169
137	NC_002662	AAATA	2	10	191223	191232	80 %	20 %	0 %	0 %	15672169
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