MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 6977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	CTTT	2	8	268	275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002662	TGTC	2	8	467	474	0 %	50 %	25 %	25 %	15671983
3	NC_002662	CTTG	2	8	495	502	0 %	50 %	25 %	25 %	15671983
4	NC_002662	AATC	2	8	643	650	50 %	25 %	0 %	25 %	15671983
5	NC_002662	TATT	2	8	818	825	25 %	75 %	0 %	0 %	15671983
6	NC_002662	ATGC	2	8	859	866	25 %	25 %	25 %	25 %	15671983
7	NC_002662	TGAC	2	8	884	891	25 %	25 %	25 %	25 %	15671983
8	NC_002662	GATT	2	8	1299	1306	25 %	50 %	25 %	0 %	15671983
9	NC_002662	TCAA	2	8	2038	2045	50 %	25 %	0 %	25 %	15671984
10	NC_002662	ATCA	2	8	2499	2506	50 %	25 %	0 %	25 %	15671984
11	NC_002662	TTGA	2	8	2611	2618	25 %	50 %	25 %	0 %	15671984
12	NC_002662	AGGT	2	8	2807	2814	25 %	25 %	50 %	0 %	15671984
13	NC_002662	TGAT	2	8	2888	2895	25 %	50 %	25 %	0 %	15671984
14	NC_002662	GTAC	2	8	3010	3017	25 %	25 %	25 %	25 %	15671984
15	NC_002662	TGTC	2	8	3069	3076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_002662	GAAA	2	8	3258	3265	75 %	0 %	25 %	0 %	15671985
17	NC_002662	AAAT	2	8	3986	3993	75 %	25 %	0 %	0 %	15671985
18	NC_002662	GAAA	2	8	4152	4159	75 %	0 %	25 %	0 %	15671985
19	NC_002662	ATCA	2	8	4918	4925	50 %	25 %	0 %	25 %	15671985
20	NC_002662	CTTT	2	8	4996	5003	0 %	75 %	0 %	25 %	15671985
21	NC_002662	AGAC	2	8	5677	5684	50 %	0 %	25 %	25 %	15671985
22	NC_002662	TTTA	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	15671985
23	NC_002662	ATCA	2	8	6022	6029	50 %	25 %	0 %	25 %	15671985
24	NC_002662	TGAA	2	8	6182	6189	50 %	25 %	25 %	0 %	15671985
25	NC_002662	ATGA	2	8	6346	6353	50 %	25 %	25 %	0 %	15671985
26	NC_002662	TATC	2	8	6866	6873	25 %	50 %	0 %	25 %	15671986
27	NC_002662	TTGA	2	8	7421	7428	25 %	50 %	25 %	0 %	15671986
28	NC_002662	TGAT	2	8	7623	7630	25 %	50 %	25 %	0 %	15671986
29	NC_002662	TGGT	2	8	7701	7708	0 %	50 %	50 %	0 %	15671986
30	NC_002662	CAAT	2	8	7718	7725	50 %	25 %	0 %	25 %	15671986
31	NC_002662	AATT	2	8	7803	7810	50 %	50 %	0 %	0 %	15671986
32	NC_002662	GATG	2	8	7879	7886	25 %	25 %	50 %	0 %	15671986
33	NC_002662	TTGA	2	8	8087	8094	25 %	50 %	25 %	0 %	15671986
34	NC_002662	GTTC	2	8	8129	8136	0 %	50 %	25 %	25 %	15671986
35	NC_002662	TCCT	2	8	8437	8444	0 %	50 %	0 %	50 %	15671986
36	NC_002662	GAAA	2	8	8836	8843	75 %	0 %	25 %	0 %	15671986
37	NC_002662	ATTT	2	8	9600	9607	25 %	75 %	0 %	0 %	15671986
38	NC_002662	TTTG	2	8	9685	9692	0 %	75 %	25 %	0 %	15671986
39	NC_002662	GATA	2	8	10062	10069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002662	TTTC	2	8	10625	10632	0 %	75 %	0 %	25 %	15671987
41	NC_002662	CAAT	2	8	10696	10703	50 %	25 %	0 %	25 %	15671987
42	NC_002662	TAAT	2	8	11088	11095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002662	AAAT	2	8	11379	11386	75 %	25 %	0 %	0 %	15671988
44	NC_002662	AATT	2	8	11522	11529	50 %	50 %	0 %	0 %	15671988
45	NC_002662	ACTT	2	8	11983	11990	25 %	50 %	0 %	25 %	15671988
46	NC_002662	AAGG	2	8	12334	12341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002662	TCAG	2	8	12392	12399	25 %	25 %	25 %	25 %	15671989
48	NC_002662	TCAA	2	8	12432	12439	50 %	25 %	0 %	25 %	15671989
49	NC_002662	CTTA	2	8	12489	12496	25 %	50 %	0 %	25 %	15671989
50	NC_002662	ATTT	2	8	12648	12655	25 %	75 %	0 %	0 %	15671989
51	NC_002662	ATTT	2	8	12659	12666	25 %	75 %	0 %	0 %	15671989
52	NC_002662	ATTG	2	8	12716	12723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002662	ACAA	2	8	12787	12794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002662	TTAA	2	8	12796	12803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002662	AAAG	2	8	12819	12826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002662	CAAA	2	8	12829	12836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002662	TAGC	2	8	12890	12897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_002662	AAAT	2	8	13123	13130	75 %	25 %	0 %	0 %	15671990
59	NC_002662	TGGT	2	8	13247	13254	0 %	50 %	50 %	0 %	15671990
60	NC_002662	TATT	2	8	13315	13322	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
61	NC_002662	CTTC	2	8	13419	13426	0 %	50 %	0 %	50 %	15671991
62	NC_002662	TTTA	2	8	13865	13872	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
63	NC_002662	TTTG	2	8	13908	13915	0 %	75 %	25 %	0 %	15671991
64	NC_002662	ATTT	2	8	14380	14387	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
65	NC_002662	AAAT	2	8	14530	14537	75 %	25 %	0 %	0 %	15671991
66	NC_002662	TTTC	2	8	15067	15074	0 %	75 %	0 %	25 %	15671991
67	NC_002662	ATTT	2	8	15183	15190	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
68	NC_002662	GGAA	2	8	15348	15355	50 %	0 %	50 %	0 %	15671992
69	NC_002662	AAAG	2	8	15733	15740	75 %	0 %	25 %	0 %	15671992
70	NC_002662	TAAA	2	8	15977	15984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002662	GAAA	2	8	16224	16231	75 %	0 %	25 %	0 %	15671993
72	NC_002662	ATGA	2	8	16796	16803	50 %	25 %	25 %	0 %	15671994
73	NC_002662	CGGT	2	8	16811	16818	0 %	25 %	50 %	25 %	15671994
74	NC_002662	CATG	2	8	16867	16874	25 %	25 %	25 %	25 %	15671994
75	NC_002662	GCGT	2	8	16899	16906	0 %	25 %	50 %	25 %	15671994
76	NC_002662	TGAT	2	8	18468	18475	25 %	50 %	25 %	0 %	15671995
77	NC_002662	GGAA	2	8	18793	18800	50 %	0 %	50 %	0 %	15671995
78	NC_002662	TCAA	2	8	19010	19017	50 %	25 %	0 %	25 %	15671995
79	NC_002662	AAAC	2	8	19563	19570	75 %	0 %	0 %	25 %	15671995
80	NC_002662	ATGT	2	8	21041	21048	25 %	50 %	25 %	0 %	15671996
81	NC_002662	CAAA	2	8	21368	21375	75 %	0 %	0 %	25 %	15671997
82	NC_002662	AATA	2	8	22939	22946	75 %	25 %	0 %	0 %	15672000
83	NC_002662	AAAT	2	8	23553	23560	75 %	25 %	0 %	0 %	15672000
84	NC_002662	GGTA	2	8	23614	23621	25 %	25 %	50 %	0 %	15672000
85	NC_002662	CAAT	2	8	24496	24503	50 %	25 %	0 %	25 %	15672001
86	NC_002662	TAAT	2	8	24542	24549	50 %	50 %	0 %	0 %	15672001
87	NC_002662	CAAA	2	8	24610	24617	75 %	0 %	0 %	25 %	15672001
88	NC_002662	AAGT	2	8	24671	24678	50 %	25 %	25 %	0 %	15672001
89	NC_002662	ATTG	2	8	25307	25314	25 %	50 %	25 %	0 %	15672002
90	NC_002662	TACT	2	8	25744	25751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002662	AATC	2	8	25995	26002	50 %	25 %	0 %	25 %	15672003
92	NC_002662	TTGC	2	8	26607	26614	0 %	50 %	25 %	25 %	15672003
93	NC_002662	ATGG	2	8	26853	26860	25 %	25 %	50 %	0 %	15672003
94	NC_002662	AAAC	2	8	27020	27027	75 %	0 %	0 %	25 %	15672003
95	NC_002662	TGAA	2	8	27106	27113	50 %	25 %	25 %	0 %	15672003
96	NC_002662	AAGA	2	8	27204	27211	75 %	0 %	25 %	0 %	15672003
97	NC_002662	TCAA	2	8	27218	27225	50 %	25 %	0 %	25 %	15672003
98	NC_002662	TGCT	2	8	27349	27356	0 %	50 %	25 %	25 %	15672003
99	NC_002662	CAAC	2	8	27378	27385	50 %	0 %	0 %	50 %	15672003
100	NC_002662	TATT	2	8	27577	27584	25 %	75 %	0 %	0 %	15672003
101	NC_002662	TGAT	2	8	27634	27641	25 %	50 %	25 %	0 %	15672003
102	NC_002662	GCGT	2	8	28332	28339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002662	TATT	2	8	28701	28708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002662	TTTA	2	8	28973	28980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002662	TGCT	2	8	29210	29217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002662	TGGT	2	8	29282	29289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002662	CAAT	2	8	29656	29663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002662	TGAT	2	8	30118	30125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002662	ATTA	2	8	30812	30819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002662	ATCA	2	8	31117	31124	50 %	25 %	0 %	25 %	15672004
111	NC_002662	AGCA	2	8	31389	31396	50 %	0 %	25 %	25 %	15672004
112	NC_002662	TAAA	2	8	31454	31461	75 %	25 %	0 %	0 %	15672004
113	NC_002662	TGAC	2	8	31511	31518	25 %	25 %	25 %	25 %	15672004
114	NC_002662	AAGC	2	8	31615	31622	50 %	0 %	25 %	25 %	15672004
115	NC_002662	ATAA	2	8	31930	31937	75 %	25 %	0 %	0 %	15672004
116	NC_002662	AAGA	2	8	32136	32143	75 %	0 %	25 %	0 %	15672004
117	NC_002662	AAGA	2	8	32516	32523	75 %	0 %	25 %	0 %	15672004
118	NC_002662	TTCA	2	8	32579	32586	25 %	50 %	0 %	25 %	15672004
119	NC_002662	GTTG	2	8	32987	32994	0 %	50 %	50 %	0 %	15672005
120	NC_002662	ATTA	2	8	33334	33341	50 %	50 %	0 %	0 %	15672005
121	NC_002662	TAAA	2	8	33453	33460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002662	AGTA	2	8	33466	33473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002662	AAAT	2	8	33574	33581	75 %	25 %	0 %	0 %	15672006
124	NC_002662	AGTG	2	8	34016	34023	25 %	25 %	50 %	0 %	15672006
125	NC_002662	TTAA	2	8	34292	34299	50 %	50 %	0 %	0 %	15672006
126	NC_002662	CGAA	2	8	34831	34838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_002662	CGGG	2	8	35377	35384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_002662	ATCA	2	8	35449	35456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002662	TCAA	2	8	35516	35523	50 %	25 %	0 %	25 %	15672007
130	NC_002662	CTTT	2	8	35554	35561	0 %	75 %	0 %	25 %	15672007
131	NC_002662	CGTT	2	8	35613	35620	0 %	50 %	25 %	25 %	15672007
132	NC_002662	CAAA	2	8	35852	35859	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002662	GTTT	2	8	37038	37045	0 %	75 %	25 %	0 %	15672010
134	NC_002662	TGAT	2	8	37191	37198	25 %	50 %	25 %	0 %	15672010
135	NC_002662	CGGT	2	8	37924	37931	0 %	25 %	50 %	25 %	15672011
136	NC_002662	CAGC	2	8	38606	38613	25 %	0 %	25 %	50 %	15672011
137	NC_002662	GTTT	2	8	38882	38889	0 %	75 %	25 %	0 %	15672011
138	NC_002662	CCAG	2	8	39139	39146	25 %	0 %	25 %	50 %	15672011
139	NC_002662	TTGC	2	8	40650	40657	0 %	50 %	25 %	25 %	15672014
140	NC_002662	TGTC	2	8	41005	41012	0 %	50 %	25 %	25 %	15672015
141	NC_002662	ATCA	2	8	41174	41181	50 %	25 %	0 %	25 %	15672016
142	NC_002662	ATGA	2	8	41363	41370	50 %	25 %	25 %	0 %	15672016
143	NC_002662	TCCC	2	8	41895	41902	0 %	25 %	0 %	75 %	15672018
144	NC_002662	TTTA	2	8	41919	41926	25 %	75 %	0 %	0 %	15672018
145	NC_002662	CTGT	2	8	41983	41990	0 %	50 %	25 %	25 %	15672018
146	NC_002662	TTTC	2	8	41991	41998	0 %	75 %	0 %	25 %	15672018
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