MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 5742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002662	TGTC	2	8	467	474	0 %	50 %	25 %	25 %	15671983
2	NC_002662	CTTG	2	8	495	502	0 %	50 %	25 %	25 %	15671983
3	NC_002662	AATC	2	8	643	650	50 %	25 %	0 %	25 %	15671983
4	NC_002662	TATT	2	8	818	825	25 %	75 %	0 %	0 %	15671983
5	NC_002662	ATGC	2	8	859	866	25 %	25 %	25 %	25 %	15671983
6	NC_002662	TGAC	2	8	884	891	25 %	25 %	25 %	25 %	15671983
7	NC_002662	GATT	2	8	1299	1306	25 %	50 %	25 %	0 %	15671983
8	NC_002662	TCAA	2	8	2038	2045	50 %	25 %	0 %	25 %	15671984
9	NC_002662	ATCA	2	8	2499	2506	50 %	25 %	0 %	25 %	15671984
10	NC_002662	TTGA	2	8	2611	2618	25 %	50 %	25 %	0 %	15671984
11	NC_002662	AGGT	2	8	2807	2814	25 %	25 %	50 %	0 %	15671984
12	NC_002662	TGAT	2	8	2888	2895	25 %	50 %	25 %	0 %	15671984
13	NC_002662	GTAC	2	8	3010	3017	25 %	25 %	25 %	25 %	15671984
14	NC_002662	GAAA	2	8	3258	3265	75 %	0 %	25 %	0 %	15671985
15	NC_002662	AAAT	2	8	3986	3993	75 %	25 %	0 %	0 %	15671985
16	NC_002662	GAAA	2	8	4152	4159	75 %	0 %	25 %	0 %	15671985
17	NC_002662	ATCA	2	8	4918	4925	50 %	25 %	0 %	25 %	15671985
18	NC_002662	CTTT	2	8	4996	5003	0 %	75 %	0 %	25 %	15671985
19	NC_002662	AGAC	2	8	5677	5684	50 %	0 %	25 %	25 %	15671985
20	NC_002662	TTTA	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	15671985
21	NC_002662	ATCA	2	8	6022	6029	50 %	25 %	0 %	25 %	15671985
22	NC_002662	TGAA	2	8	6182	6189	50 %	25 %	25 %	0 %	15671985
23	NC_002662	ATGA	2	8	6346	6353	50 %	25 %	25 %	0 %	15671985
24	NC_002662	TATC	2	8	6866	6873	25 %	50 %	0 %	25 %	15671986
25	NC_002662	TTGA	2	8	7421	7428	25 %	50 %	25 %	0 %	15671986
26	NC_002662	TGAT	2	8	7623	7630	25 %	50 %	25 %	0 %	15671986
27	NC_002662	TGGT	2	8	7701	7708	0 %	50 %	50 %	0 %	15671986
28	NC_002662	CAAT	2	8	7718	7725	50 %	25 %	0 %	25 %	15671986
29	NC_002662	AATT	2	8	7803	7810	50 %	50 %	0 %	0 %	15671986
30	NC_002662	GATG	2	8	7879	7886	25 %	25 %	50 %	0 %	15671986
31	NC_002662	TTGA	2	8	8087	8094	25 %	50 %	25 %	0 %	15671986
32	NC_002662	GTTC	2	8	8129	8136	0 %	50 %	25 %	25 %	15671986
33	NC_002662	TCCT	2	8	8437	8444	0 %	50 %	0 %	50 %	15671986
34	NC_002662	GAAA	2	8	8836	8843	75 %	0 %	25 %	0 %	15671986
35	NC_002662	ATTT	2	8	9600	9607	25 %	75 %	0 %	0 %	15671986
36	NC_002662	TTTG	2	8	9685	9692	0 %	75 %	25 %	0 %	15671986
37	NC_002662	TTTC	2	8	10625	10632	0 %	75 %	0 %	25 %	15671987
38	NC_002662	CAAT	2	8	10696	10703	50 %	25 %	0 %	25 %	15671987
39	NC_002662	AAAT	2	8	11379	11386	75 %	25 %	0 %	0 %	15671988
40	NC_002662	AATT	2	8	11522	11529	50 %	50 %	0 %	0 %	15671988
41	NC_002662	ACTT	2	8	11983	11990	25 %	50 %	0 %	25 %	15671988
42	NC_002662	TCAG	2	8	12392	12399	25 %	25 %	25 %	25 %	15671989
43	NC_002662	TCAA	2	8	12432	12439	50 %	25 %	0 %	25 %	15671989
44	NC_002662	CTTA	2	8	12489	12496	25 %	50 %	0 %	25 %	15671989
45	NC_002662	ATTT	2	8	12648	12655	25 %	75 %	0 %	0 %	15671989
46	NC_002662	ATTT	2	8	12659	12666	25 %	75 %	0 %	0 %	15671989
47	NC_002662	AAAT	2	8	13123	13130	75 %	25 %	0 %	0 %	15671990
48	NC_002662	TGGT	2	8	13247	13254	0 %	50 %	50 %	0 %	15671990
49	NC_002662	TATT	2	8	13315	13322	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
50	NC_002662	CTTC	2	8	13419	13426	0 %	50 %	0 %	50 %	15671991
51	NC_002662	TTTA	2	8	13865	13872	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
52	NC_002662	TTTG	2	8	13908	13915	0 %	75 %	25 %	0 %	15671991
53	NC_002662	ATTT	2	8	14380	14387	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
54	NC_002662	AAAT	2	8	14530	14537	75 %	25 %	0 %	0 %	15671991
55	NC_002662	TTTC	2	8	15067	15074	0 %	75 %	0 %	25 %	15671991
56	NC_002662	ATTT	2	8	15183	15190	25 %	75 %	0 %	0 %	15671991
57	NC_002662	GGAA	2	8	15348	15355	50 %	0 %	50 %	0 %	15671992
58	NC_002662	AAAG	2	8	15733	15740	75 %	0 %	25 %	0 %	15671992
59	NC_002662	GAAA	2	8	16224	16231	75 %	0 %	25 %	0 %	15671993
60	NC_002662	ATGA	2	8	16796	16803	50 %	25 %	25 %	0 %	15671994
61	NC_002662	CGGT	2	8	16811	16818	0 %	25 %	50 %	25 %	15671994
62	NC_002662	CATG	2	8	16867	16874	25 %	25 %	25 %	25 %	15671994
63	NC_002662	GCGT	2	8	16899	16906	0 %	25 %	50 %	25 %	15671994
64	NC_002662	TGAT	2	8	18468	18475	25 %	50 %	25 %	0 %	15671995
65	NC_002662	GGAA	2	8	18793	18800	50 %	0 %	50 %	0 %	15671995
66	NC_002662	TCAA	2	8	19010	19017	50 %	25 %	0 %	25 %	15671995
67	NC_002662	AAAC	2	8	19563	19570	75 %	0 %	0 %	25 %	15671995
68	NC_002662	ATGT	2	8	21041	21048	25 %	50 %	25 %	0 %	15671996
69	NC_002662	CAAA	2	8	21368	21375	75 %	0 %	0 %	25 %	15671997
70	NC_002662	AATA	2	8	22939	22946	75 %	25 %	0 %	0 %	15672000
71	NC_002662	AAAT	2	8	23553	23560	75 %	25 %	0 %	0 %	15672000
72	NC_002662	GGTA	2	8	23614	23621	25 %	25 %	50 %	0 %	15672000
73	NC_002662	CAAT	2	8	24496	24503	50 %	25 %	0 %	25 %	15672001
74	NC_002662	TAAT	2	8	24542	24549	50 %	50 %	0 %	0 %	15672001
75	NC_002662	CAAA	2	8	24610	24617	75 %	0 %	0 %	25 %	15672001
76	NC_002662	AAGT	2	8	24671	24678	50 %	25 %	25 %	0 %	15672001
77	NC_002662	ATTG	2	8	25307	25314	25 %	50 %	25 %	0 %	15672002
78	NC_002662	AATC	2	8	25995	26002	50 %	25 %	0 %	25 %	15672003
79	NC_002662	TTGC	2	8	26607	26614	0 %	50 %	25 %	25 %	15672003
80	NC_002662	ATGG	2	8	26853	26860	25 %	25 %	50 %	0 %	15672003
81	NC_002662	AAAC	2	8	27020	27027	75 %	0 %	0 %	25 %	15672003
82	NC_002662	TGAA	2	8	27106	27113	50 %	25 %	25 %	0 %	15672003
83	NC_002662	AAGA	2	8	27204	27211	75 %	0 %	25 %	0 %	15672003
84	NC_002662	TCAA	2	8	27218	27225	50 %	25 %	0 %	25 %	15672003
85	NC_002662	TGCT	2	8	27349	27356	0 %	50 %	25 %	25 %	15672003
86	NC_002662	CAAC	2	8	27378	27385	50 %	0 %	0 %	50 %	15672003
87	NC_002662	TATT	2	8	27577	27584	25 %	75 %	0 %	0 %	15672003
88	NC_002662	TGAT	2	8	27634	27641	25 %	50 %	25 %	0 %	15672003
89	NC_002662	ATCA	2	8	31117	31124	50 %	25 %	0 %	25 %	15672004
90	NC_002662	AGCA	2	8	31389	31396	50 %	0 %	25 %	25 %	15672004
91	NC_002662	TAAA	2	8	31454	31461	75 %	25 %	0 %	0 %	15672004
92	NC_002662	TGAC	2	8	31511	31518	25 %	25 %	25 %	25 %	15672004
93	NC_002662	AAGC	2	8	31615	31622	50 %	0 %	25 %	25 %	15672004
94	NC_002662	ATAA	2	8	31930	31937	75 %	25 %	0 %	0 %	15672004
95	NC_002662	AAGA	2	8	32136	32143	75 %	0 %	25 %	0 %	15672004
96	NC_002662	AAGA	2	8	32516	32523	75 %	0 %	25 %	0 %	15672004
97	NC_002662	TTCA	2	8	32579	32586	25 %	50 %	0 %	25 %	15672004
98	NC_002662	GTTG	2	8	32987	32994	0 %	50 %	50 %	0 %	15672005
99	NC_002662	ATTA	2	8	33334	33341	50 %	50 %	0 %	0 %	15672005
100	NC_002662	AAAT	2	8	33574	33581	75 %	25 %	0 %	0 %	15672006
101	NC_002662	AGTG	2	8	34016	34023	25 %	25 %	50 %	0 %	15672006
102	NC_002662	TTAA	2	8	34292	34299	50 %	50 %	0 %	0 %	15672006
103	NC_002662	TCAA	2	8	35516	35523	50 %	25 %	0 %	25 %	15672007
104	NC_002662	CTTT	2	8	35554	35561	0 %	75 %	0 %	25 %	15672007
105	NC_002662	CGTT	2	8	35613	35620	0 %	50 %	25 %	25 %	15672007
106	NC_002662	GTTT	2	8	37038	37045	0 %	75 %	25 %	0 %	15672010
107	NC_002662	TGAT	2	8	37191	37198	25 %	50 %	25 %	0 %	15672010
108	NC_002662	CGGT	2	8	37924	37931	0 %	25 %	50 %	25 %	15672011
109	NC_002662	CAGC	2	8	38606	38613	25 %	0 %	25 %	50 %	15672011
110	NC_002662	GTTT	2	8	38882	38889	0 %	75 %	25 %	0 %	15672011
111	NC_002662	CCAG	2	8	39139	39146	25 %	0 %	25 %	50 %	15672011
112	NC_002662	TTGC	2	8	40650	40657	0 %	50 %	25 %	25 %	15672014
113	NC_002662	TGTC	2	8	41005	41012	0 %	50 %	25 %	25 %	15672015
114	NC_002662	ATCA	2	8	41174	41181	50 %	25 %	0 %	25 %	15672016
115	NC_002662	ATGA	2	8	41363	41370	50 %	25 %	25 %	0 %	15672016
116	NC_002662	TCCC	2	8	41895	41902	0 %	25 %	0 %	75 %	15672018
117	NC_002662	TTTA	2	8	41919	41926	25 %	75 %	0 %	0 %	15672018
118	NC_002662	CTGT	2	8	41983	41990	0 %	50 %	25 %	25 %	15672018
119	NC_002662	TTTC	2	8	41991	41998	0 %	75 %	0 %	25 %	15672018
120	NC_002662	CGTG	2	8	42044	42051	0 %	25 %	50 %	25 %	15672018
121	NC_002662	CTTT	2	8	42754	42761	0 %	75 %	0 %	25 %	15672020
122	NC_002662	TCTT	2	8	43355	43362	0 %	75 %	0 %	25 %	30023970
123	NC_002662	GATA	2	8	44180	44187	50 %	25 %	25 %	0 %	15672022
124	NC_002662	GCGT	2	8	44594	44601	0 %	25 %	50 %	25 %	15672022
125	NC_002662	TGAT	2	8	44978	44985	25 %	50 %	25 %	0 %	15672023
126	NC_002662	ACGA	2	8	45411	45418	50 %	0 %	25 %	25 %	15672025
127	NC_002662	TTAG	2	8	45525	45532	25 %	50 %	25 %	0 %	15672025
128	NC_002662	GTGA	2	8	48201	48208	25 %	25 %	50 %	0 %	15672028
129	NC_002662	AAAG	2	8	49097	49104	75 %	0 %	25 %	0 %	15672029
130	NC_002662	TGTC	2	8	49285	49292	0 %	50 %	25 %	25 %	15672029
131	NC_002662	ATTT	2	8	50409	50416	25 %	75 %	0 %	0 %	15672030
132	NC_002662	AACA	2	8	50724	50731	75 %	0 %	0 %	25 %	15672031
133	NC_002662	TTTG	2	8	50732	50739	0 %	75 %	25 %	0 %	15672031
134	NC_002662	ATTT	2	8	51031	51038	25 %	75 %	0 %	0 %	15672032
135	NC_002662	ACCA	2	8	51092	51099	50 %	0 %	0 %	50 %	15672032
136	NC_002662	ATCA	2	8	51197	51204	50 %	25 %	0 %	25 %	15672032
137	NC_002662	AGAA	2	8	51248	51255	75 %	0 %	25 %	0 %	15672032
138	NC_002662	ATAA	2	8	51335	51342	75 %	25 %	0 %	0 %	15672032
139	NC_002662	TTCG	2	8	51382	51389	0 %	50 %	25 %	25 %	15672032
140	NC_002662	ATTT	2	8	51541	51548	25 %	75 %	0 %	0 %	15672032
141	NC_002662	AATA	2	8	52355	52362	75 %	25 %	0 %	0 %	15672032
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