MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EDL933 chromosome

Total Repeats: 3134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002655	CGCTG	2	10	710	719	0 %	20 %	40 %	40 %	15799682
2	NC_002655	ATTGC	2	10	3413	3422	20 %	40 %	20 %	20 %	15799683
3	NC_002655	CGCAG	2	10	8377	8386	20 %	0 %	40 %	40 %	15799688
4	NC_002655	CGTAC	2	10	9805	9814	20 %	20 %	20 %	40 %	15799689
5	NC_002655	CGCGC	2	10	10792	10801	0 %	0 %	40 %	60 %	15799691
6	NC_002655	CCGAT	2	10	16508	16517	20 %	20 %	20 %	40 %	15799697
7	NC_002655	AGCGA	2	10	16896	16905	40 %	0 %	40 %	20 %	15799697
8	NC_002655	GTTTT	2	10	19314	19323	0 %	80 %	20 %	0 %	15799701
9	NC_002655	TTTAT	2	10	20370	20379	20 %	80 %	0 %	0 %	15799701
10	NC_002655	AATGT	2	10	21846	21855	40 %	40 %	20 %	0 %	15799702
11	NC_002655	TGCAA	2	10	22059	22068	40 %	20 %	20 %	20 %	15799702
12	NC_002655	ATAAA	2	10	22130	22139	80 %	20 %	0 %	0 %	15799702
13	NC_002655	TAAAA	2	10	22403	22412	80 %	20 %	0 %	0 %	15799702
14	NC_002655	ATTGC	2	10	24145	24154	20 %	40 %	20 %	20 %	15799704
15	NC_002655	GCGAA	2	10	36841	36850	40 %	0 %	40 %	20 %	15799715
16	NC_002655	CCGTT	2	10	37735	37744	0 %	40 %	20 %	40 %	15799715
17	NC_002655	CACGG	2	10	38112	38121	20 %	0 %	40 %	40 %	15799715
18	NC_002655	CGAAT	2	10	40854	40863	40 %	20 %	20 %	20 %	15799720
19	NC_002655	CCATG	2	10	42392	42401	20 %	20 %	20 %	40 %	15799721
20	NC_002655	CCGTA	2	10	44038	44047	20 %	20 %	20 %	40 %	15799722
21	NC_002655	GTACA	2	10	44528	44537	40 %	20 %	20 %	20 %	15799722
22	NC_002655	TTAAA	2	10	44776	44785	60 %	40 %	0 %	0 %	15799722
23	NC_002655	ACCCA	2	10	45518	45527	40 %	0 %	0 %	60 %	15799723
24	NC_002655	TTTGA	2	10	47148	47157	20 %	60 %	20 %	0 %	161367660
25	NC_002655	CGGCG	2	10	47399	47408	0 %	0 %	60 %	40 %	161367660
26	NC_002655	AATCA	2	10	47681	47690	60 %	20 %	0 %	20 %	15799725
27	NC_002655	CGGTT	2	10	48636	48645	0 %	40 %	40 %	20 %	15799726
28	NC_002655	TGGCG	2	10	50326	50335	0 %	20 %	60 %	20 %	15799728
29	NC_002655	TGCAC	2	10	52088	52097	20 %	20 %	20 %	40 %	15799729
30	NC_002655	AGGGC	2	10	53172	53181	20 %	0 %	60 %	20 %	15799730
31	NC_002655	GGCGC	2	10	53206	53215	0 %	0 %	60 %	40 %	15799730
32	NC_002655	GAAAC	2	10	54019	54028	60 %	0 %	20 %	20 %	15799730
33	NC_002655	AACGT	2	10	56492	56501	40 %	20 %	20 %	20 %	15799735
34	NC_002655	GCGTC	2	10	59476	59485	0 %	20 %	40 %	40 %	15799738
35	NC_002655	ATGTT	2	10	60290	60299	20 %	60 %	20 %	0 %	15799739
36	NC_002655	CTTCG	2	10	60723	60732	0 %	40 %	20 %	40 %	15799739
37	NC_002655	TGCGT	2	10	61009	61018	0 %	40 %	40 %	20 %	15799739
38	NC_002655	AAAGT	2	10	68090	68099	60 %	20 %	20 %	0 %	15799743
39	NC_002655	GTGCT	2	10	69353	69362	0 %	40 %	40 %	20 %	15799744
40	NC_002655	GGTGA	2	10	70337	70346	20 %	20 %	60 %	0 %	15799744
41	NC_002655	CAGCG	2	10	71705	71714	20 %	0 %	40 %	40 %	15799746
42	NC_002655	GGATC	2	10	74200	74209	20 %	20 %	40 %	20 %	15799747
43	NC_002655	GGCAA	2	10	80852	80861	40 %	0 %	40 %	20 %	15799753
44	NC_002655	TTGCT	2	10	81587	81596	0 %	60 %	20 %	20 %	15799754
45	NC_002655	GATGG	2	10	82323	82332	20 %	20 %	60 %	0 %	15799754
46	NC_002655	GCTTC	2	10	83468	83477	0 %	40 %	20 %	40 %	15799755
47	NC_002655	CCTGG	2	10	84576	84585	0 %	20 %	40 %	40 %	15799756
48	NC_002655	GACCG	2	10	86843	86852	20 %	0 %	40 %	40 %	15799758
49	NC_002655	ATGTT	2	10	89390	89399	20 %	60 %	20 %	0 %	15799760
50	NC_002655	TGCAT	2	10	90332	90341	20 %	40 %	20 %	20 %	161367658
51	NC_002655	ATTCC	2	10	90502	90511	20 %	40 %	0 %	40 %	161367658
52	NC_002655	TTACG	2	10	91394	91403	20 %	40 %	20 %	20 %	161367658
53	NC_002655	AGTTC	2	10	95595	95604	20 %	40 %	20 %	20 %	15799766
54	NC_002655	CGTGG	2	10	96968	96977	0 %	20 %	60 %	20 %	15799768
55	NC_002655	GGGCT	2	10	101345	101354	0 %	20 %	60 %	20 %	15799771
56	NC_002655	GCCTG	2	10	101805	101814	0 %	20 %	40 %	40 %	15799772
57	NC_002655	ACCGT	2	10	103718	103727	20 %	20 %	20 %	40 %	15799773
58	NC_002655	ATCAG	2	10	105490	105499	40 %	20 %	20 %	20 %	15799775
59	NC_002655	TGACG	2	10	106962	106971	20 %	20 %	40 %	20 %	15799776
60	NC_002655	AGCCG	2	10	107258	107267	20 %	0 %	40 %	40 %	15799776
61	NC_002655	GCGCA	2	10	109586	109595	20 %	0 %	40 %	40 %	15799778
62	NC_002655	TGGCG	2	10	110580	110589	0 %	20 %	60 %	20 %	15799779
63	NC_002655	CCGGC	2	10	113550	113559	0 %	0 %	40 %	60 %	15799782
64	NC_002655	CGCGG	2	10	116759	116768	0 %	0 %	60 %	40 %	15799786
65	NC_002655	ATCCC	2	10	119003	119012	20 %	20 %	0 %	60 %	15799789
66	NC_002655	CATCG	2	10	119016	119025	20 %	20 %	20 %	40 %	15799790
67	NC_002655	TAACG	2	10	119710	119719	40 %	20 %	20 %	20 %	15799790
68	NC_002655	ATGCC	2	10	120169	120178	20 %	20 %	20 %	40 %	15799790
69	NC_002655	AATGC	2	10	121452	121461	40 %	20 %	20 %	20 %	15799791
70	NC_002655	TCTGT	2	10	122398	122407	0 %	60 %	20 %	20 %	15799793
71	NC_002655	GCATG	2	10	123491	123500	20 %	20 %	40 %	20 %	15799794
72	NC_002655	AGCAG	2	10	124829	124838	40 %	0 %	40 %	20 %	15799796
73	NC_002655	CGAAG	2	10	126744	126753	40 %	0 %	40 %	20 %	15799797
74	NC_002655	ACACG	2	10	126877	126886	40 %	0 %	20 %	40 %	15799797
75	NC_002655	TCGCG	2	10	127138	127147	0 %	20 %	40 %	40 %	15799797
76	NC_002655	GCATC	2	10	127228	127237	20 %	20 %	20 %	40 %	15799797
77	NC_002655	GACTG	2	10	128546	128555	20 %	20 %	40 %	20 %	15799798
78	NC_002655	AGAGC	2	10	128956	128965	40 %	0 %	40 %	20 %	15799798
79	NC_002655	AGGCG	2	10	134111	134120	20 %	0 %	60 %	20 %	15799801
80	NC_002655	GGTTG	2	10	134864	134873	0 %	40 %	60 %	0 %	15799801
81	NC_002655	TCTGG	2	10	137510	137519	0 %	40 %	40 %	20 %	15799802
82	NC_002655	GGGCA	2	10	138922	138931	20 %	0 %	60 %	20 %	161367656
83	NC_002655	CAGCG	2	10	139201	139210	20 %	0 %	40 %	40 %	15799804
84	NC_002655	ACGAC	2	10	140481	140490	40 %	0 %	20 %	40 %	15799805
85	NC_002655	CCGTC	2	10	146186	146195	0 %	20 %	20 %	60 %	161367655
86	NC_002655	GTGAA	2	10	146196	146205	40 %	20 %	40 %	0 %	161367655
87	NC_002655	GTTCA	2	10	146583	146592	20 %	40 %	20 %	20 %	15799810
88	NC_002655	ATCCA	2	10	146909	146918	40 %	20 %	0 %	40 %	15799810
89	NC_002655	CTTTA	2	10	148172	148181	20 %	60 %	0 %	20 %	15799812
90	NC_002655	TGGCG	2	10	148399	148408	0 %	20 %	60 %	20 %	15799812
91	NC_002655	TCCTC	2	10	148842	148851	0 %	40 %	0 %	60 %	15799812
92	NC_002655	TTTCA	2	10	150711	150720	20 %	60 %	0 %	20 %	15799815
93	NC_002655	CCGCA	2	10	153447	153456	20 %	0 %	20 %	60 %	15799818
94	NC_002655	CCTTT	2	10	155412	155421	0 %	60 %	0 %	40 %	15799819
95	NC_002655	TTTAA	2	10	156972	156981	40 %	60 %	0 %	0 %	15799822
96	NC_002655	TGGTT	2	10	157334	157343	0 %	60 %	40 %	0 %	161367654
97	NC_002655	GCGAG	2	10	162733	162742	20 %	0 %	60 %	20 %	161367653
98	NC_002655	GGCGT	2	10	163171	163180	0 %	20 %	60 %	20 %	161367653
99	NC_002655	ACCAC	2	10	166072	166081	40 %	0 %	0 %	60 %	15799831
100	NC_002655	GGCGT	2	10	167775	167784	0 %	20 %	60 %	20 %	15799832
101	NC_002655	CGACG	2	10	168814	168823	20 %	0 %	40 %	40 %	15799832
102	NC_002655	CTGCG	2	10	170950	170959	0 %	20 %	40 %	40 %	15799833
103	NC_002655	AAAAC	2	10	172801	172810	80 %	0 %	0 %	20 %	15799834
104	NC_002655	TGGTT	2	10	173058	173067	0 %	60 %	40 %	0 %	15799834
105	NC_002655	AACCT	2	10	175139	175148	40 %	20 %	0 %	40 %	15799836
106	NC_002655	TGGTC	2	10	175181	175190	0 %	40 %	40 %	20 %	15799836
107	NC_002655	TGGCG	2	10	176426	176435	0 %	20 %	60 %	20 %	15799837
108	NC_002655	GGTCC	2	10	181989	181998	0 %	20 %	40 %	40 %	15799842
109	NC_002655	ACGGG	2	10	183906	183915	20 %	0 %	60 %	20 %	15799844
110	NC_002655	GTGAT	2	10	186065	186074	20 %	40 %	40 %	0 %	15799845
111	NC_002655	GTGAT	2	10	186356	186365	20 %	40 %	40 %	0 %	15799845
112	NC_002655	GCCAG	2	10	190075	190084	20 %	0 %	40 %	40 %	15799849
113	NC_002655	GTTCT	2	10	191516	191525	0 %	60 %	20 %	20 %	15799849
114	NC_002655	CTGAA	2	10	193508	193517	40 %	20 %	20 %	20 %	15799851
115	NC_002655	AAGCG	2	10	193572	193581	40 %	0 %	40 %	20 %	15799851
116	NC_002655	TGGTG	2	10	195478	195487	0 %	40 %	60 %	0 %	15799853
117	NC_002655	TGCAC	2	10	195604	195613	20 %	20 %	20 %	40 %	15799853
118	NC_002655	TGCGC	2	10	195997	196006	0 %	20 %	40 %	40 %	15799853
119	NC_002655	CATGG	2	10	197698	197707	20 %	20 %	40 %	20 %	15799855
120	NC_002655	CAGAT	2	10	198737	198746	40 %	20 %	20 %	20 %	15799856
121	NC_002655	ACTTT	2	10	198870	198879	20 %	60 %	0 %	20 %	15799856
122	NC_002655	GACGT	2	10	202790	202799	20 %	20 %	40 %	20 %	15799859
123	NC_002655	CGACG	2	10	204616	204625	20 %	0 %	40 %	40 %	15799861
124	NC_002655	CCACG	2	10	206457	206466	20 %	0 %	20 %	60 %	15799863
125	NC_002655	ATGCC	2	10	207184	207193	20 %	20 %	20 %	40 %	15799864
126	NC_002655	TGGCC	2	10	208510	208519	0 %	20 %	40 %	40 %	15799866
127	NC_002655	ACCGC	2	10	208523	208532	20 %	0 %	20 %	60 %	15799866
128	NC_002655	GTAAC	2	10	209253	209262	40 %	20 %	20 %	20 %	15799866
129	NC_002655	AGCCG	2	10	209881	209890	20 %	0 %	40 %	40 %	15799866
130	NC_002655	GGTGG	2	10	209990	209999	0 %	20 %	80 %	0 %	15799866
131	NC_002655	TTAGT	2	10	216951	216960	20 %	60 %	20 %	0 %	15799870
132	NC_002655	ACGGT	2	10	221034	221043	20 %	20 %	40 %	20 %	15799876
133	NC_002655	TGATT	2	10	223875	223884	20 %	60 %	20 %	0 %	15799879
134	NC_002655	CGCAA	2	10	225325	225334	40 %	0 %	20 %	40 %	15799881
135	NC_002655	GTGAA	2	10	235704	235713	40 %	20 %	40 %	0 %	15799886
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151	NC_002655	CGGGG	2	10	267486	267495	0 %	0 %	80 %	20 %	15799917
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399	NC_002655	TAATC	2	10	699722	699731	40 %	40 %	0 %	20 %	15800302
400	NC_002655	GCAAT	2	10	700927	700936	40 %	20 %	20 %	20 %	15800303
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497	NC_002655	CAGTT	2	10	876515	876524	20 %	40 %	20 %	20 %	15800467
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499	NC_002655	GGCGC	2	10	881529	881538	0 %	0 %	60 %	40 %	15800473
500	NC_002655	GGTAC	2	10	881708	881717	20 %	20 %	40 %	20 %	15800473

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