MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 2528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002620	TTGT	2	8	570	577	0 %	75 %	25 %	0 %	15834626
2	NC_002620	TGCA	2	8	735	742	25 %	25 %	25 %	25 %	15834626
3	NC_002620	TTTA	2	8	1032	1039	25 %	75 %	0 %	0 %	15834626
4	NC_002620	ATGG	2	8	1134	1141	25 %	25 %	50 %	0 %	15834626
5	NC_002620	GCTA	2	8	1240	1247	25 %	25 %	25 %	25 %	15834626
6	NC_002620	TTTC	2	8	1320	1327	0 %	75 %	0 %	25 %	15834627
7	NC_002620	TGTA	2	8	2047	2054	25 %	50 %	25 %	0 %	15834627
8	NC_002620	TCTT	2	8	2843	2850	0 %	75 %	0 %	25 %	15834628
9	NC_002620	GAAG	2	8	3067	3074	50 %	0 %	50 %	0 %	15834628
10	NC_002620	AGAA	2	8	3097	3104	75 %	0 %	25 %	0 %	15834628
11	NC_002620	TTTC	2	8	3729	3736	0 %	75 %	0 %	25 %	15834629
12	NC_002620	TTTC	2	8	4098	4105	0 %	75 %	0 %	25 %	15834629
13	NC_002620	ATTG	2	8	4519	4526	25 %	50 %	25 %	0 %	15834629
14	NC_002620	TGTT	2	8	4602	4609	0 %	75 %	25 %	0 %	15834629
15	NC_002620	AGGA	2	8	4664	4671	50 %	0 %	50 %	0 %	15834629
16	NC_002620	GCTA	2	8	4687	4694	25 %	25 %	25 %	25 %	15834629
17	NC_002620	TGGC	2	8	4719	4726	0 %	25 %	50 %	25 %	15834629
18	NC_002620	GTTG	2	8	5204	5211	0 %	50 %	50 %	0 %	15834629
19	NC_002620	AATT	2	8	5688	5695	50 %	50 %	0 %	0 %	15834630
20	NC_002620	CGAG	2	8	5712	5719	25 %	0 %	50 %	25 %	15834630
21	NC_002620	CTTT	2	8	6215	6222	0 %	75 %	0 %	25 %	15834630
22	NC_002620	CTTT	2	8	6406	6413	0 %	75 %	0 %	25 %	15834630
23	NC_002620	TTCC	2	8	6917	6924	0 %	50 %	0 %	50 %	15834631
24	NC_002620	TCAA	2	8	7234	7241	50 %	25 %	0 %	25 %	15834631
25	NC_002620	TTGT	2	8	7470	7477	0 %	75 %	25 %	0 %	15834631
26	NC_002620	GAAT	2	8	7844	7851	50 %	25 %	25 %	0 %	532164369
27	NC_002620	ACAT	2	8	8695	8702	50 %	25 %	0 %	25 %	532164369
28	NC_002620	ACAA	2	8	8930	8937	75 %	0 %	0 %	25 %	532164369
29	NC_002620	GTGG	2	8	9479	9486	0 %	25 %	75 %	0 %	532164369
30	NC_002620	AGGT	2	8	9628	9635	25 %	25 %	50 %	0 %	532164369
31	NC_002620	CGAT	2	8	10126	10133	25 %	25 %	25 %	25 %	532164369
32	NC_002620	TAGA	2	8	10244	10251	50 %	25 %	25 %	0 %	532164369
33	NC_002620	GTCT	2	8	10295	10302	0 %	50 %	25 %	25 %	532164369
34	NC_002620	GAAG	2	8	11081	11088	50 %	0 %	50 %	0 %	15834633
35	NC_002620	AAAT	2	8	11350	11357	75 %	25 %	0 %	0 %	15834633
36	NC_002620	GGAG	2	8	11415	11422	25 %	0 %	75 %	0 %	15834633
37	NC_002620	TAGT	2	8	11594	11601	25 %	50 %	25 %	0 %	15834633
38	NC_002620	AAGA	2	8	11731	11738	75 %	0 %	25 %	0 %	15834633
39	NC_002620	AGAT	2	8	11779	11786	50 %	25 %	25 %	0 %	15834633
40	NC_002620	ACTG	2	8	12252	12259	25 %	25 %	25 %	25 %	15834633
41	NC_002620	AGAA	2	8	12382	12389	75 %	0 %	25 %	0 %	15834633
42	NC_002620	GTTT	2	8	12756	12763	0 %	75 %	25 %	0 %	15834633
43	NC_002620	AGGG	2	8	13606	13613	25 %	0 %	75 %	0 %	15834633
44	NC_002620	TTCA	2	8	13888	13895	25 %	50 %	0 %	25 %	15834633
45	NC_002620	TTCT	2	8	14048	14055	0 %	75 %	0 %	25 %	15834634
46	NC_002620	CTTG	2	8	14088	14095	0 %	50 %	25 %	25 %	15834634
47	NC_002620	CATT	2	8	14202	14209	25 %	50 %	0 %	25 %	15834634
48	NC_002620	TGGG	2	8	14216	14223	0 %	25 %	75 %	0 %	15834634
49	NC_002620	GTTT	2	8	14468	14475	0 %	75 %	25 %	0 %	15834634
50	NC_002620	CTTT	3	12	14612	14623	0 %	75 %	0 %	25 %	15834634
51	NC_002620	GGGT	2	8	14752	14759	0 %	25 %	75 %	0 %	15834634
52	NC_002620	GTTT	2	8	15460	15467	0 %	75 %	25 %	0 %	15834634
53	NC_002620	TTAG	2	8	15613	15620	25 %	50 %	25 %	0 %	15834635
54	NC_002620	TGTC	2	8	15730	15737	0 %	50 %	25 %	25 %	15834635
55	NC_002620	CAAA	2	8	15904	15911	75 %	0 %	0 %	25 %	15834635
56	NC_002620	GAAG	2	8	17534	17541	50 %	0 %	50 %	0 %	15834637
57	NC_002620	ATTA	2	8	18290	18297	50 %	50 %	0 %	0 %	15834637
58	NC_002620	CCTT	2	8	19076	19083	0 %	50 %	0 %	50 %	15834637
59	NC_002620	GAAC	2	8	20085	20092	50 %	0 %	25 %	25 %	15834638
60	NC_002620	GCTT	2	8	20199	20206	0 %	50 %	25 %	25 %	15834638
61	NC_002620	CTTT	2	8	20493	20500	0 %	75 %	0 %	25 %	15834638
62	NC_002620	ACGT	2	8	20812	20819	25 %	25 %	25 %	25 %	15834638
63	NC_002620	TGTT	2	8	21895	21902	0 %	75 %	25 %	0 %	15834640
64	NC_002620	CTTA	2	8	22034	22041	25 %	50 %	0 %	25 %	15834640
65	NC_002620	ATCT	2	8	22112	22119	25 %	50 %	0 %	25 %	15834640
66	NC_002620	AAAG	2	8	22241	22248	75 %	0 %	25 %	0 %	15834640
67	NC_002620	GATG	2	8	22482	22489	25 %	25 %	50 %	0 %	15834640
68	NC_002620	TGGG	2	8	22580	22587	0 %	25 %	75 %	0 %	15834640
69	NC_002620	GGGA	2	8	22732	22739	25 %	0 %	75 %	0 %	15834640
70	NC_002620	AGTT	2	8	22982	22989	25 %	50 %	25 %	0 %	15834641
71	NC_002620	AGAT	2	8	23159	23166	50 %	25 %	25 %	0 %	15834641
72	NC_002620	AGGC	2	8	23206	23213	25 %	0 %	50 %	25 %	15834641
73	NC_002620	TCTT	2	8	23232	23239	0 %	75 %	0 %	25 %	15834641
74	NC_002620	TTGC	2	8	23551	23558	0 %	50 %	25 %	25 %	15834642
75	NC_002620	TTGC	2	8	23985	23992	0 %	50 %	25 %	25 %	15834642
76	NC_002620	AGCA	2	8	24088	24095	50 %	0 %	25 %	25 %	15834642
77	NC_002620	CCTT	2	8	24848	24855	0 %	50 %	0 %	50 %	15834643
78	NC_002620	TCTT	2	8	24871	24878	0 %	75 %	0 %	25 %	15834643
79	NC_002620	AGGT	2	8	24912	24919	25 %	25 %	50 %	0 %	15834643
80	NC_002620	ACGA	2	8	25896	25903	50 %	0 %	25 %	25 %	15834644
81	NC_002620	TGCT	2	8	26361	26368	0 %	50 %	25 %	25 %	15834644
82	NC_002620	TTTG	2	8	27090	27097	0 %	75 %	25 %	0 %	15834645
83	NC_002620	CGGT	2	8	27271	27278	0 %	25 %	50 %	25 %	15834645
84	NC_002620	TTAG	2	8	28211	28218	25 %	50 %	25 %	0 %	15834645
85	NC_002620	TGAA	2	8	28504	28511	50 %	25 %	25 %	0 %	15834645
86	NC_002620	TCCT	2	8	28561	28568	0 %	50 %	0 %	50 %	15834646
87	NC_002620	ACTT	2	8	29197	29204	25 %	50 %	0 %	25 %	15834646
88	NC_002620	GCAA	2	8	30593	30600	50 %	0 %	25 %	25 %	15834648
89	NC_002620	TATC	2	8	31312	31319	25 %	50 %	0 %	25 %	15834649
90	NC_002620	ATGT	2	8	31559	31566	25 %	50 %	25 %	0 %	15834650
91	NC_002620	GAAA	2	8	31943	31950	75 %	0 %	25 %	0 %	15834650
92	NC_002620	ATGC	2	8	32695	32702	25 %	25 %	25 %	25 %	15834651
93	NC_002620	TTTC	2	8	32728	32735	0 %	75 %	0 %	25 %	15834651
94	NC_002620	TGCG	2	8	33068	33075	0 %	25 %	50 %	25 %	532164370
95	NC_002620	TTTA	2	8	33221	33228	25 %	75 %	0 %	0 %	15834653
96	NC_002620	GAAC	2	8	34666	34673	50 %	0 %	25 %	25 %	15834655
97	NC_002620	GAAG	2	8	34727	34734	50 %	0 %	50 %	0 %	15834655
98	NC_002620	ACGA	2	8	34736	34743	50 %	0 %	25 %	25 %	15834655
99	NC_002620	CTTG	2	8	34760	34767	0 %	50 %	25 %	25 %	15834655
100	NC_002620	ATGG	2	8	34966	34973	25 %	25 %	50 %	0 %	15834656
101	NC_002620	CATC	2	8	35793	35800	25 %	25 %	0 %	50 %	15834656
102	NC_002620	TCCA	2	8	35923	35930	25 %	25 %	0 %	50 %	15834656
103	NC_002620	TTTG	2	8	36142	36149	0 %	75 %	25 %	0 %	15834656
104	NC_002620	TCGT	2	8	36204	36211	0 %	50 %	25 %	25 %	15834656
105	NC_002620	CAGG	2	8	36734	36741	25 %	0 %	50 %	25 %	15834657
106	NC_002620	TCCT	2	8	37407	37414	0 %	50 %	0 %	50 %	15834657
107	NC_002620	TGGA	2	8	37638	37645	25 %	25 %	50 %	0 %	15834657
108	NC_002620	CTTT	2	8	38661	38668	0 %	75 %	0 %	25 %	15834658
109	NC_002620	GAAA	2	8	38774	38781	75 %	0 %	25 %	0 %	15834658
110	NC_002620	AATC	2	8	39113	39120	50 %	25 %	0 %	25 %	15834658
111	NC_002620	CAGC	2	8	39369	39376	25 %	0 %	25 %	50 %	15834658
112	NC_002620	AAGC	2	8	40715	40722	50 %	0 %	25 %	25 %	15834660
113	NC_002620	CAGA	2	8	40951	40958	50 %	0 %	25 %	25 %	15834660
114	NC_002620	CTTC	2	8	41227	41234	0 %	50 %	0 %	50 %	15834660
115	NC_002620	AACT	2	8	41282	41289	50 %	25 %	0 %	25 %	15834660
116	NC_002620	AAAG	2	8	41470	41477	75 %	0 %	25 %	0 %	15834660
117	NC_002620	CGAG	2	8	41531	41538	25 %	0 %	50 %	25 %	15834660
118	NC_002620	CCAA	2	8	41999	42006	50 %	0 %	0 %	50 %	15834660
119	NC_002620	AAAG	2	8	42164	42171	75 %	0 %	25 %	0 %	15834660
120	NC_002620	TGAT	2	8	42470	42477	25 %	50 %	25 %	0 %	15834660
121	NC_002620	TGTC	2	8	42610	42617	0 %	50 %	25 %	25 %	15834660
122	NC_002620	AATA	2	8	43087	43094	75 %	25 %	0 %	0 %	15834660
123	NC_002620	TTGC	2	8	43332	43339	0 %	50 %	25 %	25 %	15834661
124	NC_002620	TTAA	2	8	43666	43673	50 %	50 %	0 %	0 %	15834662
125	NC_002620	GCAG	2	8	43880	43887	25 %	0 %	50 %	25 %	15834663
126	NC_002620	AGTT	2	8	44110	44117	25 %	50 %	25 %	0 %	15834663
127	NC_002620	GATC	2	8	44378	44385	25 %	25 %	25 %	25 %	15834664
128	NC_002620	AATT	2	8	44429	44436	50 %	50 %	0 %	0 %	15834664
129	NC_002620	TCGC	2	8	44709	44716	0 %	25 %	25 %	50 %	15834664
130	NC_002620	GAGT	2	8	45077	45084	25 %	25 %	50 %	0 %	15834665
131	NC_002620	TCTA	2	8	45279	45286	25 %	50 %	0 %	25 %	15834665
132	NC_002620	ATGA	2	8	45805	45812	50 %	25 %	25 %	0 %	15834665
133	NC_002620	CAAG	2	8	46098	46105	50 %	0 %	25 %	25 %	15834665
134	NC_002620	AAGA	2	8	46226	46233	75 %	0 %	25 %	0 %	15834666
135	NC_002620	AGAA	2	8	46476	46483	75 %	0 %	25 %	0 %	15834666
136	NC_002620	TAAA	2	8	46707	46714	75 %	25 %	0 %	0 %	15834667
137	NC_002620	AAGG	2	8	46898	46905	50 %	0 %	50 %	0 %	15834667
138	NC_002620	TAGC	2	8	47028	47035	25 %	25 %	25 %	25 %	15834667
139	NC_002620	AGTT	2	8	47370	47377	25 %	50 %	25 %	0 %	15834667
140	NC_002620	AGGA	2	8	47466	47473	50 %	0 %	50 %	0 %	15834667
141	NC_002620	TTGT	2	8	48295	48302	0 %	75 %	25 %	0 %	15834668
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143	NC_002620	TTCC	2	8	48834	48841	0 %	50 %	0 %	50 %	15834669
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