MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 1290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002620	TTG	2	6	39	44	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002620	TTG	2	6	51	56	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002620	GAA	2	6	153	158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002620	CAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_002620	AGA	3	9	191	199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002620	TAA	2	6	203	208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002620	TCT	3	9	222	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002620	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002620	TAA	3	9	3174	3182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002620	CAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002620	TTG	2	6	5459	5464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002620	ATA	2	6	5562	5567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002620	TCT	2	6	16438	16443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002620	CTG	2	6	16723	16728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002620	TGG	2	6	16837	16842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002620	AAG	2	6	16884	16889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002620	TGT	3	9	16944	16952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002620	GAG	2	6	25280	25285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002620	CCT	2	6	25298	25303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_002620	TCT	2	6	25313	25318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_002620	CAA	2	6	25329	25334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002620	TGT	2	6	26427	26432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002620	TAA	2	6	26537	26542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002620	TGT	2	6	26569	26574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002620	AGA	2	6	32537	32542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002620	CTT	2	6	33433	33438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002620	TGT	2	6	33525	33530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002620	TGA	2	6	33531	33536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002620	ATA	2	6	33575	33580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002620	TGG	2	6	33701	33706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002620	AAG	2	6	33707	33712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002620	CTT	2	6	33722	33727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002620	TGG	2	6	33803	33808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002620	GAG	2	6	33895	33900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002620	CGG	2	6	33970	33975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002620	AGG	2	6	34134	34139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002620	TCA	2	6	34224	34229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002620	CGA	2	6	34401	34406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002620	TAG	2	6	34451	34456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002620	AAG	2	6	34507	34512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002620	TTA	2	6	34912	34917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002620	AGC	2	6	38274	38279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002620	AAT	2	6	38304	38309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002620	TCT	2	6	38381	38386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002620	GAT	2	6	39551	39556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002620	CTT	2	6	39635	39640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002620	AAT	2	6	39751	39756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002620	ACC	2	6	39930	39935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_002620	AGT	2	6	39963	39968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002620	GAG	2	6	40165	40170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002620	AAT	2	6	43131	43136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002620	TAG	2	6	46178	46183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002620	GTT	2	6	50379	50384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002620	CTT	2	6	50429	50434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002620	CAG	2	6	50458	50463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002620	TGG	2	6	50531	50536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002620	GCT	2	6	50572	50577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002620	GAA	2	6	50674	50679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002620	GCT	3	9	50728	50736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002620	GAA	2	6	50782	50787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002620	CGT	2	6	50824	50829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002620	AGC	2	6	50873	50878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002620	TAA	2	6	50892	50897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002620	GAA	2	6	50921	50926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002620	TTG	2	6	53094	53099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002620	GTC	2	6	53212	53217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002620	TCC	2	6	53338	53343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_002620	TCT	2	6	55228	55233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_002620	TCT	2	6	55237	55242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002620	AAG	2	6	55277	55282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002620	CTC	2	6	58276	58281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_002620	GTA	2	6	58331	58336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002620	TAG	2	6	58439	58444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002620	TCT	2	6	58468	58473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002620	GAA	2	6	58502	58507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002620	TGA	2	6	58608	58613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002620	TAA	2	6	58629	58634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002620	TAA	2	6	59820	59825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002620	GGC	2	6	59867	59872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002620	GAG	2	6	59924	59929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002620	AGC	2	6	59945	59950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002620	GAA	2	6	60039	60044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002620	TCT	2	6	60056	60061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002620	ATG	2	6	64723	64728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002620	TCT	2	6	64736	64741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002620	CAA	2	6	64742	64747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002620	TGT	2	6	64780	64785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002620	CAA	2	6	64818	64823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_002620	CTT	2	6	64879	64884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002620	GGC	2	6	64933	64938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_002620	AAT	2	6	64988	64993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002620	AGG	2	6	65046	65051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002620	AGA	2	6	69765	69770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002620	TTA	2	6	69775	69780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002620	CTG	2	6	72479	72484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_002620	AAG	2	6	74610	74615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002620	TTC	2	6	74631	74636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002620	TGT	2	6	74668	74673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002620	TTA	2	6	76004	76009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002620	TCT	2	6	76033	76038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002620	CTT	2	6	76047	76052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002620	TAA	2	6	76085	76090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002620	AAG	2	6	76111	76116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002620	TAA	2	6	76128	76133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002620	TTG	2	6	76153	76158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002620	GGA	2	6	76161	76166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002620	ATA	2	6	78415	78420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002620	TTA	2	6	78422	78427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002620	GAA	2	6	78431	78436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002620	TAT	2	6	81658	81663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002620	GGA	2	6	81670	81675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002620	AGA	2	6	81853	81858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002620	TTG	2	6	84384	84389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002620	ATG	2	6	84443	84448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002620	ATT	2	6	88008	88013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002620	TAA	2	6	88016	88021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002620	AAT	2	6	89543	89548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002620	GAA	2	6	89552	89557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002620	ATG	2	6	92870	92875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002620	TGA	2	6	94296	94301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002620	GAA	2	6	94364	94369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002620	ATT	2	6	101025	101030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002620	ATT	2	6	101042	101047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002620	ATA	2	6	101093	101098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002620	CCA	2	6	105791	105796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_002620	TCT	2	6	109906	109911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002620	AGA	2	6	111574	111579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002620	TCT	2	6	111582	111587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002620	AAG	3	9	111598	111606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002620	TCT	2	6	111668	111673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_002620	TTG	2	6	114323	114328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002620	CTT	2	6	114433	114438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002620	GTT	2	6	114512	114517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002620	CAG	2	6	114632	114637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002620	GAA	2	6	114650	114655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002620	TGA	2	6	114729	114734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002620	TGG	2	6	114756	114761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002620	AAG	2	6	114781	114786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002620	TTC	2	6	114825	114830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002620	TGT	2	6	114869	114874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002620	CGT	2	6	115111	115116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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