MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 13375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002620	GAA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834626
2	NC_002620	TGC	2	6	313	318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834626
3	NC_002620	AAG	2	6	384	389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834626
4	NC_002620	GAA	2	6	404	409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834626
5	NC_002620	ACA	2	6	678	683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834626
6	NC_002620	TTG	2	6	759	764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834626
7	NC_002620	ATG	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834626
8	NC_002620	TTC	2	6	901	906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834626
9	NC_002620	AGG	2	6	993	998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834626
10	NC_002620	CTG	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834626
11	NC_002620	AGT	2	6	1078	1083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834626
12	NC_002620	GCC	2	6	1121	1126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15834626
13	NC_002620	AAG	2	6	1149	1154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834626
14	NC_002620	CTT	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834627
15	NC_002620	TCT	2	6	1406	1411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834627
16	NC_002620	CTT	2	6	1443	1448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834627
17	NC_002620	TAA	2	6	1473	1478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834627
18	NC_002620	GAA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834627
19	NC_002620	GAA	2	6	1683	1688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834627
20	NC_002620	TCT	2	6	1727	1732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834627
21	NC_002620	TTG	2	6	1894	1899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834627
22	NC_002620	CTT	2	6	1944	1949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834627
23	NC_002620	ATG	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834627
24	NC_002620	CAA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834627
25	NC_002620	TAA	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834627
26	NC_002620	TCT	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834627
27	NC_002620	TAA	2	6	2247	2252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834627
28	NC_002620	CTT	2	6	2325	2330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834627
29	NC_002620	CGA	2	6	2479	2484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834627
30	NC_002620	TGA	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834627
31	NC_002620	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834627
32	NC_002620	CTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834628
33	NC_002620	TTG	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834628
34	NC_002620	ATT	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834628
35	NC_002620	ATC	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834629
36	NC_002620	CGT	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834629
37	NC_002620	AAC	2	6	3456	3461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834629
38	NC_002620	GAA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834629
39	NC_002620	ACA	2	6	3515	3520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834629
40	NC_002620	TTA	2	6	3533	3538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834629
41	NC_002620	AAG	2	6	3560	3565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834629
42	NC_002620	AAG	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834629
43	NC_002620	GGA	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834629
44	NC_002620	CAG	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834629
45	NC_002620	TTG	2	6	3753	3758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834629
46	NC_002620	AGG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834629
47	NC_002620	TGG	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15834629
48	NC_002620	GAA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834629
49	NC_002620	CTT	2	6	4059	4064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834629
50	NC_002620	CTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834629
51	NC_002620	CTT	2	6	4161	4166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834629
52	NC_002620	TTA	2	6	4292	4297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834629
53	NC_002620	AGA	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834629
54	NC_002620	ACA	2	6	4478	4483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834629
55	NC_002620	TTC	2	6	4494	4499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834629
56	NC_002620	GTT	2	6	4612	4617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834629
57	NC_002620	AGT	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834629
58	NC_002620	TAT	2	6	4842	4847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834629
59	NC_002620	TGG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15834629
60	NC_002620	GAA	2	6	5123	5128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834629
61	NC_002620	GTT	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834629
62	NC_002620	GAA	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834629
63	NC_002620	CTT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834630
64	NC_002620	AAG	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834630
65	NC_002620	GGA	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15834630
66	NC_002620	TGA	2	6	5778	5783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834630
67	NC_002620	GCT	2	6	5839	5844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15834630
68	NC_002620	TGG	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15834630
69	NC_002620	TCT	2	6	5941	5946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834630
70	NC_002620	CTA	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834630
71	NC_002620	CTT	2	6	6107	6112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834630
72	NC_002620	TTG	3	9	6126	6134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834630
73	NC_002620	ATT	2	6	6181	6186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834630
74	NC_002620	TAT	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834630
75	NC_002620	TAG	2	6	6254	6259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834630
76	NC_002620	TTG	2	6	6308	6313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834630
77	NC_002620	GTA	2	6	6323	6328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834630
78	NC_002620	GTT	2	6	6370	6375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834630
79	NC_002620	GAA	2	6	6547	6552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834630
80	NC_002620	AGA	2	6	6675	6680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834630
81	NC_002620	ACA	2	6	6694	6699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834630
82	NC_002620	TGG	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15834630
83	NC_002620	TTA	2	6	6813	6818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834631
84	NC_002620	ATT	2	6	6842	6847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834631
85	NC_002620	CAA	2	6	6929	6934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834631
86	NC_002620	TCT	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834631
87	NC_002620	ATT	2	6	6997	7002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834631
88	NC_002620	AGA	2	6	7003	7008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834631
89	NC_002620	TCC	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15834631
90	NC_002620	ATT	2	6	7048	7053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15834631
91	NC_002620	TCT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834631
92	NC_002620	TTG	2	6	7135	7140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834631
93	NC_002620	AGC	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834631
94	NC_002620	TGT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834631
95	NC_002620	GTT	3	9	7199	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834631
96	NC_002620	TTG	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834631
97	NC_002620	AGC	2	6	7389	7394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15834631
98	NC_002620	TAC	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834631
99	NC_002620	TCC	2	6	7603	7608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15834631
100	NC_002620	TTG	2	6	7617	7622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834631
101	NC_002620	ATC	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834631
102	NC_002620	TCA	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532164369
103	NC_002620	AAG	2	6	7959	7964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
104	NC_002620	TTG	2	6	8038	8043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532164369
105	NC_002620	TTG	2	6	8174	8179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532164369
106	NC_002620	ATA	2	6	8206	8211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532164369
107	NC_002620	AGA	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
108	NC_002620	GAA	2	6	8362	8367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
109	NC_002620	TGT	2	6	8403	8408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532164369
110	NC_002620	GAA	2	6	8410	8415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
111	NC_002620	CTA	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532164369
112	NC_002620	GAG	2	6	8650	8655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532164369
113	NC_002620	TCA	2	6	8851	8856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532164369
114	NC_002620	TGA	2	6	8899	8904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532164369
115	NC_002620	AAT	2	6	8958	8963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532164369
116	NC_002620	TAA	2	6	8982	8987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532164369
117	NC_002620	TGG	2	6	9058	9063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532164369
118	NC_002620	TGA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532164369
119	NC_002620	TTG	2	6	9171	9176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532164369
120	NC_002620	AGA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
121	NC_002620	AGA	2	6	9205	9210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
122	NC_002620	GAG	2	6	9213	9218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532164369
123	NC_002620	AAG	2	6	9368	9373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
124	NC_002620	CTT	3	9	9395	9403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532164369
125	NC_002620	GTA	2	6	9415	9420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532164369
126	NC_002620	AAT	2	6	9704	9709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532164369
127	NC_002620	TCA	2	6	9769	9774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532164369
128	NC_002620	AAC	2	6	9810	9815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532164369
129	NC_002620	TCA	2	6	9859	9864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532164369
130	NC_002620	GTT	2	6	9899	9904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532164369
131	NC_002620	TTC	2	6	10032	10037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532164369
132	NC_002620	TTC	2	6	10222	10227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532164369
133	NC_002620	TTG	2	6	10317	10322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532164369
134	NC_002620	GAT	3	9	10334	10342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532164369
135	NC_002620	AAG	2	6	10348	10353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
136	NC_002620	GAA	2	6	10447	10452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
137	NC_002620	GTT	2	6	10481	10486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532164369
138	NC_002620	GCT	2	6	10568	10573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532164369
139	NC_002620	GAA	2	6	10591	10596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532164369
140	NC_002620	GGA	2	6	10766	10771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532164369
141	NC_002620	TCT	2	6	11003	11008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834633
142	NC_002620	AAT	2	6	11029	11034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834633
143	NC_002620	GAA	2	6	11153	11158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834633
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145	NC_002620	GTA	2	6	11199	11204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834633
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150	NC_002620	AGA	2	6	11584	11589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834633
151	NC_002620	TGA	2	6	11630	11635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834633
152	NC_002620	CAT	2	6	11652	11657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834633
153	NC_002620	GTA	2	6	11866	11871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834633
154	NC_002620	GAA	2	6	11900	11905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834633
155	NC_002620	TAA	2	6	11965	11970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834633
156	NC_002620	GAA	2	6	12008	12013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834633
157	NC_002620	GAA	2	6	12092	12097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834633
158	NC_002620	AAG	2	6	12318	12323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834633
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161	NC_002620	TTG	2	6	12475	12480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834633
162	NC_002620	TAA	2	6	12481	12486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834633
163	NC_002620	AAC	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15834633
164	NC_002620	TCA	2	6	12542	12547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15834633
165	NC_002620	TGG	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15834633
166	NC_002620	GTT	2	6	12659	12664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15834633
167	NC_002620	TAA	2	6	12748	12753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15834633
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210	NC_002620	CTT	2	6	16072	16077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834635
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250	NC_002620	TTC	2	6	20015	20020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834638
251	NC_002620	CTT	2	6	20044	20049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834638
252	NC_002620	TGA	2	6	20051	20056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834638
253	NC_002620	AGT	2	6	20110	20115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834638
254	NC_002620	TTC	2	6	20150	20155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834638
255	NC_002620	GTA	2	6	20162	20167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834638
256	NC_002620	TTC	2	6	20168	20173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15834638
257	NC_002620	GAA	2	6	20226	20231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15834638
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259	NC_002620	AGT	2	6	20321	20326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15834638
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