MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia muridarum Nigg

Total Repeats: 2085

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002620	TC	3	6	147	152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002620	TG	4	8	615	622	0 %	50 %	50 %	0 %	15834626
3	NC_002620	TC	3	6	844	849	0 %	50 %	0 %	50 %	15834626
4	NC_002620	AG	3	6	1603	1608	50 %	0 %	50 %	0 %	15834627
5	NC_002620	TC	3	6	1662	1667	0 %	50 %	0 %	50 %	15834627
6	NC_002620	AG	3	6	1936	1941	50 %	0 %	50 %	0 %	15834627
7	NC_002620	AG	3	6	2089	2094	50 %	0 %	50 %	0 %	15834627
8	NC_002620	GA	3	6	3714	3719	50 %	0 %	50 %	0 %	15834629
9	NC_002620	AG	3	6	4281	4286	50 %	0 %	50 %	0 %	15834629
10	NC_002620	AG	3	6	5072	5077	50 %	0 %	50 %	0 %	15834629
11	NC_002620	GA	3	6	5346	5351	50 %	0 %	50 %	0 %	15834629
12	NC_002620	GA	3	6	5491	5496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002620	AG	3	6	5585	5590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002620	TC	3	6	5627	5632	0 %	50 %	0 %	50 %	15834630
15	NC_002620	GA	3	6	6579	6584	50 %	0 %	50 %	0 %	15834630
16	NC_002620	AG	3	6	6961	6966	50 %	0 %	50 %	0 %	15834631
17	NC_002620	AG	3	6	7420	7425	50 %	0 %	50 %	0 %	15834631
18	NC_002620	TA	3	6	7916	7921	50 %	50 %	0 %	0 %	532164369
19	NC_002620	AG	3	6	7984	7989	50 %	0 %	50 %	0 %	532164369
20	NC_002620	AG	3	6	8275	8280	50 %	0 %	50 %	0 %	532164369
21	NC_002620	TC	3	6	8704	8709	0 %	50 %	0 %	50 %	532164369
22	NC_002620	AG	3	6	9088	9093	50 %	0 %	50 %	0 %	532164369
23	NC_002620	AG	3	6	9389	9394	50 %	0 %	50 %	0 %	532164369
24	NC_002620	AT	3	6	10411	10416	50 %	50 %	0 %	0 %	532164369
25	NC_002620	GA	3	6	10637	10642	50 %	0 %	50 %	0 %	532164369
26	NC_002620	AG	5	10	10905	10914	50 %	0 %	50 %	0 %	15834633
27	NC_002620	GA	3	6	10920	10925	50 %	0 %	50 %	0 %	15834633
28	NC_002620	TG	3	6	11226	11231	0 %	50 %	50 %	0 %	15834633
29	NC_002620	TC	3	6	11385	11390	0 %	50 %	0 %	50 %	15834633
30	NC_002620	TA	3	6	11565	11570	50 %	50 %	0 %	0 %	15834633
31	NC_002620	GA	3	6	12014	12019	50 %	0 %	50 %	0 %	15834633
32	NC_002620	GA	3	6	12118	12123	50 %	0 %	50 %	0 %	15834633
33	NC_002620	CT	3	6	13579	13584	0 %	50 %	0 %	50 %	15834633
34	NC_002620	AG	3	6	13630	13635	50 %	0 %	50 %	0 %	15834633
35	NC_002620	AT	3	6	14922	14927	50 %	50 %	0 %	0 %	15834634
36	NC_002620	GT	3	6	15287	15292	0 %	50 %	50 %	0 %	15834634
37	NC_002620	AG	3	6	15862	15867	50 %	0 %	50 %	0 %	15834635
38	NC_002620	GA	3	6	16060	16065	50 %	0 %	50 %	0 %	15834635
39	NC_002620	AT	3	6	16548	16553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002620	GC	3	6	16960	16965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002620	GA	3	6	17324	17329	50 %	0 %	50 %	0 %	15834636
42	NC_002620	TA	3	6	18357	18362	50 %	50 %	0 %	0 %	15834637
43	NC_002620	CA	3	6	20119	20124	50 %	0 %	0 %	50 %	15834638
44	NC_002620	CT	3	6	22283	22288	0 %	50 %	0 %	50 %	15834640
45	NC_002620	TC	3	6	22529	22534	0 %	50 %	0 %	50 %	15834640
46	NC_002620	CT	3	6	22922	22927	0 %	50 %	0 %	50 %	15834641
47	NC_002620	CT	3	6	23132	23137	0 %	50 %	0 %	50 %	15834641
48	NC_002620	TG	3	6	23837	23842	0 %	50 %	50 %	0 %	15834642
49	NC_002620	AG	3	6	24338	24343	50 %	0 %	50 %	0 %	15834642
50	NC_002620	GA	3	6	25934	25939	50 %	0 %	50 %	0 %	15834644
51	NC_002620	TC	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002620	GA	3	6	26666	26671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002620	TC	3	6	26934	26939	0 %	50 %	0 %	50 %	15834645
54	NC_002620	TG	3	6	28040	28045	0 %	50 %	50 %	0 %	15834645
55	NC_002620	TC	3	6	28071	28076	0 %	50 %	0 %	50 %	15834645
56	NC_002620	AT	3	6	28292	28297	50 %	50 %	0 %	0 %	15834645
57	NC_002620	AT	3	6	28468	28473	50 %	50 %	0 %	0 %	15834645
58	NC_002620	GT	3	6	28791	28796	0 %	50 %	50 %	0 %	15834646
59	NC_002620	GA	3	6	28832	28837	50 %	0 %	50 %	0 %	15834646
60	NC_002620	TG	3	6	29566	29571	0 %	50 %	50 %	0 %	15834646
61	NC_002620	GA	3	6	29764	29769	50 %	0 %	50 %	0 %	15834646
62	NC_002620	TG	3	6	29931	29936	0 %	50 %	50 %	0 %	15834646
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66	NC_002620	AG	3	6	31903	31908	50 %	0 %	50 %	0 %	15834650
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68	NC_002620	GC	3	6	33051	33056	0 %	0 %	50 %	50 %	532164370
69	NC_002620	AG	3	6	33083	33088	50 %	0 %	50 %	0 %	532164370
70	NC_002620	CG	3	6	33653	33658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_002620	TA	3	6	33986	33991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75	NC_002620	TA	3	6	36067	36072	50 %	50 %	0 %	0 %	15834656
76	NC_002620	GC	3	6	36317	36322	0 %	0 %	50 %	50 %	15834656
77	NC_002620	TG	3	6	36347	36352	0 %	50 %	50 %	0 %	15834656
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89	NC_002620	GT	3	6	39307	39312	0 %	50 %	50 %	0 %	15834658
90	NC_002620	GA	3	6	39467	39472	50 %	0 %	50 %	0 %	15834658
91	NC_002620	AG	3	6	39833	39838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_002620	AT	3	6	50181	50186	50 %	50 %	0 %	0 %	15834669
105	NC_002620	AT	3	6	53276	53281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002620	TG	3	6	53598	53603	0 %	50 %	50 %	0 %	15834671
107	NC_002620	GC	3	6	53669	53674	0 %	0 %	50 %	50 %	15834671
108	NC_002620	AG	3	6	53720	53725	50 %	0 %	50 %	0 %	15834671
109	NC_002620	AG	3	6	54314	54319	50 %	0 %	50 %	0 %	15834671
110	NC_002620	AG	3	6	54332	54337	50 %	0 %	50 %	0 %	15834671
111	NC_002620	GA	3	6	55980	55985	50 %	0 %	50 %	0 %	15834674
112	NC_002620	GA	3	6	56461	56466	50 %	0 %	50 %	0 %	15834674
113	NC_002620	CT	4	8	56800	56807	0 %	50 %	0 %	50 %	15834675
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115	NC_002620	GC	3	6	56992	56997	0 %	0 %	50 %	50 %	15834675
116	NC_002620	TC	3	6	57013	57018	0 %	50 %	0 %	50 %	15834675
117	NC_002620	GC	3	6	58418	58423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002620	TC	3	6	59498	59503	0 %	50 %	0 %	50 %	15834677
119	NC_002620	CT	3	6	59840	59845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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121	NC_002620	AT	3	6	60391	60396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_002620	AG	3	6	61634	61639	50 %	0 %	50 %	0 %	15834679
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125	NC_002620	TG	3	6	61746	61751	0 %	50 %	50 %	0 %	15834679
126	NC_002620	AT	3	6	62172	62177	50 %	50 %	0 %	0 %	15834679
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