Penta-nucleotide Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 242

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_002608GTTAC210596820 %40 %20 %20 %Non-Coding
2NC_002608GTGGG210100810170 %20 %80 %0 %16119981
3NC_002608CCGTC210240824170 %20 %20 %60 %16119983
4NC_002608TATAA2105338534760 %40 %0 %0 %16119986
5NC_002608ATTGT2108392840120 %60 %20 %0 %16119988
6NC_002608AGTAA2108723873260 %20 %20 %0 %Non-Coding
7NC_002608CGCTG210906490730 %20 %40 %40 %Non-Coding
8NC_002608AAATG2109076908560 %20 %20 %0 %Non-Coding
9NC_002608CGTAT210107481075720 %40 %20 %20 %16119989
10NC_002608TCTCG21010878108870 %40 %20 %40 %16119989
11NC_002608CGCTT21013613136220 %40 %20 %40 %Non-Coding
12NC_002608AGTTG210152221523120 %40 %40 %0 %16119991
13NC_002608TCGCC21016364163730 %20 %20 %60 %Non-Coding
14NC_002608GAATC210189151892440 %20 %20 %20 %16119998
15NC_002608GCGTT21020524205330 %40 %40 %20 %16120001
16NC_002608TCGAG210241612417020 %20 %40 %20 %16120005
17NC_002608GAACG210252452525440 %0 %40 %20 %16120006
18NC_002608GACGG210253022531120 %0 %60 %20 %16120006
19NC_002608GAACG210255332554240 %0 %40 %20 %16120007
20NC_002608CTCCC21025666256750 %20 %0 %80 %16120007
21NC_002608CGATC210259412595020 %20 %20 %40 %16120007
22NC_002608AATCG210259632597240 %20 %20 %20 %16120007
23NC_002608TGCCC21026865268740 %20 %20 %60 %16120008
24NC_002608CCCGG21027112271210 %0 %40 %60 %16120008
25NC_002608ATCGG210276322764120 %20 %40 %20 %16120008
26NC_002608TGCGC21028776287850 %20 %40 %40 %16120008
27NC_002608CAACT210309733098240 %20 %0 %40 %16120011
28NC_002608TCGAG210329763298520 %20 %40 %20 %Non-Coding
29NC_002608AACAG210333793338860 %0 %20 %20 %Non-Coding
30NC_002608GTCCG21034335343440 %20 %40 %40 %Non-Coding
31NC_002608CGACG210348753488420 %0 %40 %40 %16120013
32NC_002608CTGAA210362403624940 %20 %20 %20 %16120014
33NC_002608TCGTC21037742377510 %40 %20 %40 %16120015
34NC_002608ACGTC210460334604220 %20 %20 %40 %16120027
35NC_002608CGCTA210471444715320 %20 %20 %40 %16120028
36NC_002608GTTCG21049250492590 %40 %40 %20 %16120031
37NC_002608GAACG210509905099940 %0 %40 %20 %16120032
38NC_002608AAACC210575515756060 %0 %0 %40 %Non-Coding
39NC_002608TCGTC21065245652540 %40 %20 %40 %16120049
40NC_002608CGCGA210677336774220 %0 %40 %40 %16120052
41NC_002608CGTCA210684136842220 %20 %20 %40 %16120053
42NC_002608CTGTG21068491685000 %40 %40 %20 %16120053
43NC_002608GAACT210708807088940 %20 %20 %20 %16120055
44NC_002608GTTCG21072567725760 %40 %40 %20 %16120057
45NC_002608CTCCG21072957729660 %20 %20 %60 %16120057
46NC_002608GAAGA210747067471560 %0 %40 %0 %Non-Coding
47NC_002608AGTTC210749757498420 %40 %20 %20 %16120059
48NC_002608GGACG210774407744920 %0 %60 %20 %16120062
49NC_002608AAGCG210824198242840 %0 %40 %20 %Non-Coding
50NC_002608TCCCA210836728368120 %20 %0 %60 %16120068
51NC_002608CCCGA210841318414020 %0 %20 %60 %16120068
52NC_002608ATCGT210856658567420 %40 %20 %20 %16120070
53NC_002608CCGTC21087386873950 %20 %20 %60 %16120073
54NC_002608TGCAT210899538996220 %40 %20 %20 %16120075
55NC_002608TCAGG210922759228420 %20 %40 %20 %Non-Coding
56NC_002608CAGTC210942199422820 %20 %20 %40 %16120081
57NC_002608CCACT210948849489320 %20 %0 %60 %16120081
58NC_002608TGACG210956599566820 %20 %40 %20 %16120082
59NC_002608GTGAG210970079701620 %20 %60 %0 %Non-Coding
60NC_002608ACACC210979929800140 %0 %0 %60 %16120084
61NC_002608TCCGC21098324983330 %20 %20 %60 %16120084
62NC_002608CGGAG21010055710056620 %0 %60 %20 %16120084
63NC_002608ATCGA21010237310238240 %20 %20 %20 %Non-Coding
64NC_002608TCGAG21010650310651220 %20 %40 %20 %Non-Coding
65NC_002608AACAG21010690610691560 %0 %20 %20 %Non-Coding
66NC_002608CAGAA21010756010756960 %0 %20 %20 %16120088
67NC_002608CAATA21010799910800860 %20 %0 %20 %16120088
68NC_002608GGGCG2101090931091020 %0 %80 %20 %16120089
69NC_002608TGGAG21011202811203720 %20 %60 %0 %16120090
70NC_002608GAAGA21011284811285760 %0 %40 %0 %Non-Coding
71NC_002608AGTTC21011311711312620 %40 %20 %20 %16120091
72NC_002608CGATC21011433611434520 %20 %20 %40 %16120093
73NC_002608GTCGG2101151241151330 %20 %60 %20 %16120093
74NC_002608GCGCC2101172671172760 %0 %40 %60 %16120093
75NC_002608TCCGT2101181041181130 %40 %20 %40 %16120094
76NC_002608TCTCG2101187141187230 %40 %20 %40 %16120094
77NC_002608TGGCG2101187531187620 %20 %60 %20 %16120094
78NC_002608CGGAC21011883711884620 %0 %40 %40 %16120094
79NC_002608TGCTC2101192391192480 %40 %20 %40 %16120094
80NC_002608AGGGA21012128512129440 %0 %60 %0 %16120095
81NC_002608GAAGA21012178112179060 %0 %40 %0 %Non-Coding
82NC_002608AGTTC21012205012205920 %40 %20 %20 %16120096
83NC_002608CTGTA21012749412750320 %40 %20 %20 %16120099
84NC_002608TCCAA21012766712767640 %20 %0 %40 %16120099
85NC_002608TCTGT2101278491278580 %60 %20 %20 %Non-Coding
86NC_002608CGGCG2101281151281240 %0 %60 %40 %Non-Coding
87NC_002608CTCGA21012825312826220 %20 %20 %40 %Non-Coding
88NC_002608TCTGT2101309281309370 %60 %20 %20 %16120102
89NC_002608AGGTG21013189913190820 %20 %60 %0 %16120102
90NC_002608TCTGT2101335281335370 %60 %20 %20 %Non-Coding
91NC_002608CGGCG2101337941338030 %0 %60 %40 %Non-Coding
92NC_002608CTCGA21013393213394120 %20 %20 %40 %Non-Coding
93NC_002608GGGGA21014088414089320 %0 %80 %0 %Non-Coding
94NC_002608GTGGG2101411831411920 %20 %80 %0 %Non-Coding
95NC_002608GACGT21014449214450120 %20 %40 %20 %16120118
96NC_002608AATTC21014600814601740 %40 %0 %20 %16120118
97NC_002608CGCTG2101462461462550 %20 %40 %40 %16120118
98NC_002608CACAG21014903014903940 %0 %20 %40 %16120120
99NC_002608GATCG21015069415070320 %20 %40 %20 %16120121
100NC_002608ACGAA21015204115205060 %0 %20 %20 %16120123
101NC_002608TGGTC2101533971534060 %40 %40 %20 %16120124
102NC_002608ATCGC21015668815669720 %20 %20 %40 %16120127
103NC_002608TCGAA21015960715961640 %20 %20 %20 %16120131
104NC_002608GATGG21015972515973420 %20 %60 %0 %16120131
105NC_002608GACCC21015985715986620 %0 %20 %60 %Non-Coding
106NC_002608GCACC21015987315988220 %0 %20 %60 %Non-Coding
107NC_002608AAGGC21015994015994940 %0 %40 %20 %Non-Coding
108NC_002608CTGAG21016344016344920 %20 %40 %20 %Non-Coding
109NC_002608GCTTT2101639141639230 %60 %20 %20 %16120139
110NC_002608TCGAG21016510416511320 %20 %40 %20 %16120141
111NC_002608GTGGC2101669331669420 %20 %60 %20 %16120143
112NC_002608CTCCG2101674151674240 %20 %20 %60 %16120143
113NC_002608GCCAC21016891916892820 %0 %20 %60 %16120146
114NC_002608TCCAG21016953616954520 %20 %20 %40 %16120147
115NC_002608TGACG21016975816976720 %20 %40 %20 %16120147
116NC_002608TTGGG2101727781727870 %40 %60 %0 %16120150
117NC_002608GACCG21017363817364720 %0 %40 %40 %16120150
118NC_002608CGGTG2101736901736990 %20 %60 %20 %16120151
119NC_002608CCCAG21017386417387320 %0 %20 %60 %16120151
120NC_002608GCGTC2101740041740130 %20 %40 %40 %16120151
121NC_002608ACGAC21017415417416340 %0 %20 %40 %16120151
122NC_002608CGTTT2101760131760220 %60 %20 %20 %16120152
123NC_002608ACCCA21017765617766540 %0 %0 %60 %16120154
124NC_002608ACGGC21017886917887820 %0 %40 %40 %16120154
125NC_002608GTGTA21018161618162520 %40 %40 %0 %Non-Coding
126NC_002608CCGAC21018181518182420 %0 %20 %60 %16120157
127NC_002608GCGAC21018378918379820 %0 %40 %40 %16120159
128NC_002608TGGGG2101853251853340 %20 %80 %0 %16120161
129NC_002608TCCGG2101857931858020 %20 %40 %40 %16120162
130NC_002608ACCAC21019214519215440 %0 %0 %60 %Non-Coding
131NC_002608GGCCA21019285219286120 %0 %40 %40 %16120173
132NC_002608AGCGA21019400119401040 %0 %40 %20 %16120174
133NC_002608GAGCG21019430119431020 %0 %60 %20 %16120175
134NC_002608CGGCG2101944031944120 %0 %60 %40 %16120175
135NC_002608GGCGG2101944331944420 %0 %80 %20 %Non-Coding
136NC_002608GCTTC2101953161953250 %40 %20 %40 %16120177
137NC_002608GGGTC2101964271964360 %20 %60 %20 %16120177
138NC_002608CGCGG2101971521971610 %0 %60 %40 %16120179
139NC_002608CGGTG2101979041979130 %20 %60 %20 %16120181
140NC_002608CGCGT2101982461982550 %20 %40 %40 %16120181
141NC_002608ACCCA21020126920127840 %0 %0 %60 %16120184
142NC_002608GCCGG2102017852017940 %0 %60 %40 %16120184
143NC_002608TGGCG2102020602020690 %20 %60 %20 %16120184
144NC_002608GTCGC2102058112058200 %20 %40 %40 %16120188
145NC_002608TTTCT2102058462058550 %80 %0 %20 %16120188
146NC_002608CGATT21020637020637920 %40 %20 %20 %Non-Coding
147NC_002608GGCGA21020816520817420 %0 %60 %20 %16120189
148NC_002608GTGGC2102082772082860 %20 %60 %20 %16120189
149NC_002608CGACG21020876220877120 %0 %40 %40 %Non-Coding
150NC_002608ATTCG21021465221466120 %40 %20 %20 %16120196
151NC_002608TTCGC2102163572163660 %40 %20 %40 %16120197
152NC_002608AATCA21022104222105160 %20 %0 %20 %Non-Coding
153NC_002608GACGC21022121422122320 %0 %40 %40 %Non-Coding
154NC_002608GCCGG2102217382217470 %0 %60 %40 %16120204
155NC_002608CTGTT2102240332240420 %60 %20 %20 %16120207
156NC_002608CCTCG2102245952246040 %20 %20 %60 %16120207
157NC_002608TCGTA21022480822481720 %40 %20 %20 %Non-Coding
158NC_002608GGCGT2102255092255180 %20 %60 %20 %16120208
159NC_002608CCCAG21022633522634420 %0 %20 %60 %16120208
160NC_002608GTGGC2102273322273410 %20 %60 %20 %Non-Coding
161NC_002608CACAA21022864622865560 %0 %0 %40 %Non-Coding
162NC_002608CGGGA21022932622933520 %0 %60 %20 %16120210
163NC_002608CCGCG2102327712327800 %0 %40 %60 %16120213
164NC_002608TCGGC2102331092331180 %20 %40 %40 %16120213
165NC_002608CATCG21023329623330520 %20 %20 %40 %16120213
166NC_002608GGTTG2102333072333160 %40 %60 %0 %16120213
167NC_002608ATCGT21023640623641520 %40 %20 %20 %Non-Coding
168NC_002608CGTGG2102370062370150 %20 %60 %20 %16120216
169NC_002608CCGAG21023899223900120 %0 %40 %40 %16120218
170NC_002608CGAGC21023953723954620 %0 %40 %40 %16120219
171NC_002608CGTCG2102406042406130 %20 %40 %40 %16120220
172NC_002608GACGC21024121424122320 %0 %40 %40 %16120221
173NC_002608AGTGT21024386124387020 %40 %40 %0 %16120222
174NC_002608GAGCA21024781624782540 %0 %40 %20 %16120225
175NC_002608ACCTC21024848024848920 %20 %0 %60 %16120226
176NC_002608ACGGA21025016325017240 %0 %40 %20 %16120227
177NC_002608CAGTT21025595925596820 %40 %20 %20 %16120231
178NC_002608CCACG21025598525599420 %0 %20 %60 %16120231
179NC_002608TCAAA21025758925759860 %20 %0 %20 %16120233
180NC_002608TCGAG21026215826216720 %20 %40 %20 %Non-Coding
181NC_002608AACAG21026256126257060 %0 %20 %20 %Non-Coding
182NC_002608CAGCT21026738326739220 %20 %20 %40 %Non-Coding
183NC_002608GCGAC21027199527200420 %0 %40 %40 %Non-Coding
184NC_002608GGGAG21027212727213620 %0 %80 %0 %Non-Coding
185NC_002608TCTGT2102730012730100 %60 %20 %20 %Non-Coding
186NC_002608CGGCG2102732672732760 %0 %60 %40 %Non-Coding
187NC_002608CTCGA21027340527341420 %20 %20 %40 %Non-Coding
188NC_002608ATCGG21027444127445020 %20 %40 %20 %Non-Coding
189NC_002608TGTCT2102757822757910 %60 %20 %20 %Non-Coding
190NC_002608ACTTC21027626727627620 %40 %0 %40 %Non-Coding
191NC_002608CGTCT2102781042781130 %40 %20 %40 %16120248
192NC_002608TCCGC2102792092792180 %20 %20 %60 %16120250
193NC_002608ACCGA21027987127988040 %0 %20 %40 %Non-Coding
194NC_002608ATGAG21028180328181240 %20 %40 %0 %16120251
195NC_002608GTTTC2102827532827620 %60 %20 %20 %16120252
196NC_002608TGCAG21028314628315520 %20 %40 %20 %Non-Coding
197NC_002608GCGTT2102868882868970 %40 %40 %20 %16120257
198NC_002608CACTC21028935628936520 %20 %0 %60 %16120259
199NC_002608CCAGG21029101329102220 %0 %40 %40 %16120259
200NC_002608ACCCC21029125629126520 %0 %0 %80 %Non-Coding
201NC_002608CCCCA21029134229135120 %0 %0 %80 %Non-Coding
202NC_002608AGTCC21029139929140820 %20 %20 %40 %16120260
203NC_002608GATGC21029256029256920 %20 %40 %20 %16120260
204NC_002608GGGGA21029286029286920 %0 %80 %0 %Non-Coding
205NC_002608GTGGG2102932242932330 %20 %80 %0 %Non-Coding
206NC_002608CTCGA21029486729487620 %20 %20 %40 %16120263
207NC_002608ATCGT21029497129498020 %40 %20 %20 %16120263
208NC_002608ACTCC21029801529802420 %20 %0 %60 %16120267
209NC_002608CCACG21029851629852520 %0 %20 %60 %16120267
210NC_002608TGAAC21029929229930140 %20 %20 %20 %16120268
211NC_002608GGAAG21030149130150040 %0 %60 %0 %Non-Coding
212NC_002608GACTC21030549530550420 %20 %20 %40 %16120275
213NC_002608GAAGA21030879030879960 %0 %40 %0 %Non-Coding
214NC_002608AGTTC21030905930906820 %40 %20 %20 %16120281
215NC_002608ACTGA21030942030942940 %20 %20 %20 %16120282
216NC_002608CGTGA21031204931205820 %20 %40 %20 %16120285
217NC_002608CGGAG21031411231412120 %0 %60 %20 %Non-Coding
218NC_002608TCGCC2103163703163790 %20 %20 %60 %16120291
219NC_002608ACCGG21031666731667620 %0 %40 %40 %16120291
220NC_002608CTGTG2103171933172020 %40 %40 %20 %Non-Coding
221NC_002608CCCAG21031788531789420 %0 %20 %60 %16120293
222NC_002608GATTC21031824931825820 %40 %20 %20 %16120293
223NC_002608GCGGG2103185813185900 %0 %80 %20 %Non-Coding
224NC_002608GAGCG21031873331874220 %0 %60 %20 %Non-Coding
225NC_002608CGAGG21032030332031220 %0 %60 %20 %16120297
226NC_002608GCTCG2103221543221630 %20 %40 %40 %16120300
227NC_002608CACGT21032457832458720 %20 %20 %40 %Non-Coding
228NC_002608CGATG21032484232485120 %20 %40 %20 %Non-Coding
229NC_002608CGGGC2103268413268500 %0 %60 %40 %16120305
230NC_002608GCGGT2103269453269540 %20 %60 %20 %Non-Coding
231NC_002608GGGCT2103301513301600 %20 %60 %20 %16120311
232NC_002608CTGTT2103305973306060 %60 %20 %20 %Non-Coding
233NC_002608ACTGC21033141033141920 %20 %20 %40 %16120312
234NC_002608CAATA21033202933203860 %20 %0 %20 %16120313
235NC_002608TTGGT2103399063399150 %60 %40 %0 %Non-Coding
236NC_002608TAGCG21035031535032420 %20 %40 %20 %16120334
237NC_002608GACGT21035142635143520 %20 %40 %20 %16120335
238NC_002608TTCAG21036121936122820 %40 %20 %20 %16120348
239NC_002608CGTCG2103625843625930 %20 %40 %40 %16120349
240NC_002608TCTGT2103640793640880 %60 %20 %20 %Non-Coding
241NC_002608CGGCG2103643453643540 %0 %60 %40 %Non-Coding
242NC_002608CTCGA21036448336449220 %20 %20 %40 %Non-Coding