MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002608	GTTAC	2	10	59	68	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002608	AGTAA	2	10	8723	8732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002608	CGCTG	2	10	9064	9073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_002608	AAATG	2	10	9076	9085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002608	CGCTT	2	10	13613	13622	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_002608	TCGCC	2	10	16364	16373	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_002608	TCGAG	2	10	32976	32985	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_002608	AACAG	2	10	33379	33388	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_002608	GTCCG	2	10	34335	34344	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002608	AAACC	2	10	57551	57560	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_002608	GAAGA	2	10	74706	74715	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002608	AAGCG	2	10	82419	82428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_002608	TCAGG	2	10	92275	92284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_002608	GTGAG	2	10	97007	97016	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002608	ATCGA	2	10	102373	102382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002608	TCGAG	2	10	106503	106512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002608	AACAG	2	10	106906	106915	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_002608	GAAGA	2	10	112848	112857	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002608	GAAGA	2	10	121781	121790	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002608	TCTGT	2	10	127849	127858	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_002608	CGGCG	2	10	128115	128124	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_002608	CTCGA	2	10	128253	128262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_002608	TCTGT	2	10	133528	133537	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_002608	CGGCG	2	10	133794	133803	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_002608	CTCGA	2	10	133932	133941	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_002608	GGGGA	2	10	140884	140893	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002608	GTGGG	2	10	141183	141192	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002608	GACCC	2	10	159857	159866	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_002608	GCACC	2	10	159873	159882	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_002608	AAGGC	2	10	159940	159949	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002608	CTGAG	2	10	163440	163449	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002608	GTGTA	2	10	181616	181625	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002608	ACCAC	2	10	192145	192154	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_002608	GGCGG	2	10	194433	194442	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
35	NC_002608	CGATT	2	10	206370	206379	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_002608	CGACG	2	10	208762	208771	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_002608	AATCA	2	10	221042	221051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_002608	GACGC	2	10	221214	221223	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_002608	TCGTA	2	10	224808	224817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002608	GTGGC	2	10	227332	227341	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_002608	CACAA	2	10	228646	228655	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_002608	ATCGT	2	10	236406	236415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_002608	TCGAG	2	10	262158	262167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002608	AACAG	2	10	262561	262570	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_002608	CAGCT	2	10	267383	267392	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_002608	GCGAC	2	10	271995	272004	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_002608	GGGAG	2	10	272127	272136	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002608	TCTGT	2	10	273001	273010	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002608	CGGCG	2	10	273267	273276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_002608	CTCGA	2	10	273405	273414	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_002608	ATCGG	2	10	274441	274450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_002608	TGTCT	2	10	275782	275791	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_002608	ACTTC	2	10	276267	276276	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_002608	ACCGA	2	10	279871	279880	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_002608	TGCAG	2	10	283146	283155	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_002608	ACCCC	2	10	291256	291265	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_002608	CCCCA	2	10	291342	291351	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
58	NC_002608	GGGGA	2	10	292860	292869	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002608	GTGGG	2	10	293224	293233	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002608	GGAAG	2	10	301491	301500	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002608	GAAGA	2	10	308790	308799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002608	CGGAG	2	10	314112	314121	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_002608	CTGTG	2	10	317193	317202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002608	GCGGG	2	10	318581	318590	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_002608	GAGCG	2	10	318733	318742	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002608	CACGT	2	10	324578	324587	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_002608	CGATG	2	10	324842	324851	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002608	GCGGT	2	10	326945	326954	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_002608	CTGTT	2	10	330597	330606	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002608	TTGGT	2	10	339906	339915	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002608	TCTGT	2	10	364079	364088	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_002608	CGGCG	2	10	364345	364354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_002608	CTCGA	2	10	364483	364492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.