MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002608	GCGA	2	8	102	109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002608	GCTG	2	8	558	565	0 %	25 %	50 %	25 %	16119980
3	NC_002608	GGTG	2	8	1158	1165	0 %	25 %	75 %	0 %	16119981
4	NC_002608	GTCT	2	8	1584	1591	0 %	50 %	25 %	25 %	16119982
5	NC_002608	GAAA	2	8	1770	1777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002608	CGGG	2	8	1910	1917	0 %	0 %	75 %	25 %	16119983
7	NC_002608	CCAC	2	8	2216	2223	25 %	0 %	0 %	75 %	16119983
8	NC_002608	CGCT	2	8	2715	2722	0 %	25 %	25 %	50 %	16119983
9	NC_002608	TCGC	2	8	2948	2955	0 %	25 %	25 %	50 %	16119983
10	NC_002608	GCGG	2	8	3856	3863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002608	TGAA	2	8	5687	5694	50 %	25 %	25 %	0 %	16119987
12	NC_002608	CTTG	2	8	5911	5918	0 %	50 %	25 %	25 %	16119987
13	NC_002608	CATT	2	8	6887	6894	25 %	50 %	0 %	25 %	16119987
14	NC_002608	TTGA	2	8	7606	7613	25 %	50 %	25 %	0 %	16119987
15	NC_002608	GACA	2	8	8566	8573	50 %	0 %	25 %	25 %	16119988
16	NC_002608	ACTA	2	8	8693	8700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002608	TGCA	2	8	9399	9406	25 %	25 %	25 %	25 %	16119989
18	NC_002608	CACG	3	12	9593	9604	25 %	0 %	25 %	50 %	16119989
19	NC_002608	GCAG	2	8	10307	10314	25 %	0 %	50 %	25 %	16119989
20	NC_002608	ATCC	2	8	10455	10462	25 %	25 %	0 %	50 %	16119989
21	NC_002608	CAAG	2	8	10509	10516	50 %	0 %	25 %	25 %	16119989
22	NC_002608	GAGG	2	8	10544	10551	25 %	0 %	75 %	0 %	16119989
23	NC_002608	ATTC	2	8	11280	11287	25 %	50 %	0 %	25 %	16119989
24	NC_002608	CGAC	2	8	12215	12222	25 %	0 %	25 %	50 %	16119989
25	NC_002608	CGGT	2	8	12871	12878	0 %	25 %	50 %	25 %	16119990
26	NC_002608	CCGT	2	8	13228	13235	0 %	25 %	25 %	50 %	16119990
27	NC_002608	GTAC	2	8	13240	13247	25 %	25 %	25 %	25 %	16119990
28	NC_002608	CTTG	2	8	13344	13351	0 %	50 %	25 %	25 %	16119990
29	NC_002608	AAGA	2	8	13444	13451	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002608	GTGA	2	8	13623	13630	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002608	TGCT	2	8	13993	14000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_002608	AGCA	2	8	14020	14027	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002608	GGAA	2	8	14254	14261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002608	GACT	2	8	15491	15498	25 %	25 %	25 %	25 %	16119991
35	NC_002608	CGCT	2	8	15545	15552	0 %	25 %	25 %	50 %	16119991
36	NC_002608	GAGC	2	8	15609	15616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002608	GGAT	2	8	16177	16184	25 %	25 %	50 %	0 %	16119992
38	NC_002608	CACG	2	8	16207	16214	25 %	0 %	25 %	50 %	16119992
39	NC_002608	TTCT	2	8	16855	16862	0 %	75 %	0 %	25 %	16119994
40	NC_002608	TCCG	2	8	16961	16968	0 %	25 %	25 %	50 %	16119994
41	NC_002608	GATT	2	8	17124	17131	25 %	50 %	25 %	0 %	16119994
42	NC_002608	TCGC	2	8	17270	17277	0 %	25 %	25 %	50 %	16119994
43	NC_002608	CCGT	2	8	17490	17497	0 %	25 %	25 %	50 %	16119994
44	NC_002608	CGAA	2	8	18078	18085	50 %	0 %	25 %	25 %	16119996
45	NC_002608	CCGG	2	8	18750	18757	0 %	0 %	50 %	50 %	16119998
46	NC_002608	CTCG	2	8	18768	18775	0 %	25 %	25 %	50 %	16119998
47	NC_002608	TGCT	2	8	19278	19285	0 %	50 %	25 %	25 %	16119999
48	NC_002608	GTCG	2	8	19959	19966	0 %	25 %	50 %	25 %	16120000
49	NC_002608	CTTG	2	8	20843	20850	0 %	50 %	25 %	25 %	16120002
50	NC_002608	GCCC	2	8	21020	21027	0 %	0 %	25 %	75 %	16120002
51	NC_002608	ACAA	2	8	23126	23133	75 %	0 %	0 %	25 %	16120004
52	NC_002608	CGTT	2	8	23528	23535	0 %	50 %	25 %	25 %	16120004
53	NC_002608	GCCG	2	8	23700	23707	0 %	0 %	50 %	50 %	16120004
54	NC_002608	ACGA	2	8	23952	23959	50 %	0 %	25 %	25 %	16120004
55	NC_002608	GTTC	2	8	24116	24123	0 %	50 %	25 %	25 %	16120005
56	NC_002608	CGAT	2	8	25034	25041	25 %	25 %	25 %	25 %	16120006
57	NC_002608	ATTC	2	8	25114	25121	25 %	50 %	0 %	25 %	16120006
58	NC_002608	ATGG	2	8	25737	25744	25 %	25 %	50 %	0 %	16120007
59	NC_002608	CGAA	2	8	26154	26161	50 %	0 %	25 %	25 %	16120007
60	NC_002608	CCCA	2	8	26754	26761	25 %	0 %	0 %	75 %	16120008
61	NC_002608	TGCT	2	8	28429	28436	0 %	50 %	25 %	25 %	16120008
62	NC_002608	GATT	2	8	29323	29330	25 %	50 %	25 %	0 %	16120008
63	NC_002608	CGAG	2	8	29448	29455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002608	TACA	2	8	29570	29577	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_002608	GGAC	2	8	29598	29605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_002608	GTCG	2	8	30199	30206	0 %	25 %	50 %	25 %	16120010
67	NC_002608	TCAC	2	8	30505	30512	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002608	AGCG	2	8	30652	30659	25 %	0 %	50 %	25 %	16120011
69	NC_002608	TTCC	2	8	31943	31950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002608	TTAG	2	8	32062	32069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002608	TGCT	2	8	32076	32083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002608	AGCA	2	8	32103	32110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002608	GTAC	2	8	32856	32863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002608	ACGG	2	8	32868	32875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_002608	GGCG	2	8	33125	33132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002608	CACC	2	8	33258	33265	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_002608	CTCC	2	8	33502	33509	0 %	25 %	0 %	75 %	16120012
78	NC_002608	CTGC	2	8	33604	33611	0 %	25 %	25 %	50 %	16120012
79	NC_002608	AGCA	2	8	34906	34913	50 %	0 %	25 %	25 %	16120013
80	NC_002608	CGCC	2	8	35046	35053	0 %	0 %	25 %	75 %	16120013
81	NC_002608	TGGA	2	8	35101	35108	25 %	25 %	50 %	0 %	16120013
82	NC_002608	CGTG	2	8	35274	35281	0 %	25 %	50 %	25 %	16120013
83	NC_002608	TCGC	2	8	35676	35683	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002608	AGGG	2	8	36762	36769	25 %	0 %	75 %	0 %	16120014
85	NC_002608	TCGA	2	8	37087	37094	25 %	25 %	25 %	25 %	16120015
86	NC_002608	TGCC	2	8	37240	37247	0 %	25 %	25 %	50 %	16120015
87	NC_002608	CGAA	2	8	37643	37650	50 %	0 %	25 %	25 %	16120015
88	NC_002608	CACG	2	8	37707	37714	25 %	0 %	25 %	50 %	16120015
89	NC_002608	CGAC	2	8	37877	37884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002608	AGTG	2	8	38344	38351	25 %	25 %	50 %	0 %	16120016
91	NC_002608	TTGA	2	8	38483	38490	25 %	50 %	25 %	0 %	16120016
92	NC_002608	ACTT	2	8	38619	38626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002608	GTAC	2	8	38951	38958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002608	ATCA	2	8	39615	39622	50 %	25 %	0 %	25 %	16120019
95	NC_002608	CGGC	2	8	39623	39630	0 %	0 %	50 %	50 %	16120019
96	NC_002608	TCAC	2	8	39821	39828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002608	TGCT	2	8	39927	39934	0 %	50 %	25 %	25 %	16120020
98	NC_002608	TTCG	2	8	40790	40797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_002608	GGGC	2	8	41528	41535	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002608	ACGT	2	8	42677	42684	25 %	25 %	25 %	25 %	16120023
101	NC_002608	CGGC	2	8	43033	43040	0 %	0 %	50 %	50 %	16120023
102	NC_002608	ACCC	2	8	43263	43270	25 %	0 %	0 %	75 %	16120023
103	NC_002608	CGAG	2	8	43500	43507	25 %	0 %	50 %	25 %	16120023
104	NC_002608	ACTG	2	8	43585	43592	25 %	25 %	25 %	25 %	16120023
105	NC_002608	TGAC	2	8	43699	43706	25 %	25 %	25 %	25 %	16120023
106	NC_002608	CGGA	2	8	43839	43846	25 %	0 %	50 %	25 %	16120024
107	NC_002608	GCCG	2	8	44133	44140	0 %	0 %	50 %	50 %	16120024
108	NC_002608	GACC	2	8	44704	44711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002608	GACG	2	8	45355	45362	25 %	0 %	50 %	25 %	16120025
110	NC_002608	AGTC	2	8	45500	45507	25 %	25 %	25 %	25 %	16120026
111	NC_002608	GTCT	2	8	45651	45658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_002608	TGCG	2	8	46360	46367	0 %	25 %	50 %	25 %	16120027
113	NC_002608	ACCG	2	8	46371	46378	25 %	0 %	25 %	50 %	16120027
114	NC_002608	CGCC	2	8	46691	46698	0 %	0 %	25 %	75 %	16120027
115	NC_002608	CGGC	2	8	46944	46951	0 %	0 %	50 %	50 %	16120027
116	NC_002608	GCCA	2	8	47046	47053	25 %	0 %	25 %	50 %	16120027
117	NC_002608	CGGG	2	8	48804	48811	0 %	0 %	75 %	25 %	16120030
118	NC_002608	CGAG	2	8	49377	49384	25 %	0 %	50 %	25 %	16120031
119	NC_002608	CCGT	2	8	49391	49398	0 %	25 %	25 %	50 %	16120031
120	NC_002608	CGAG	2	8	49724	49731	25 %	0 %	50 %	25 %	16120031
121	NC_002608	ACTG	2	8	50197	50204	25 %	25 %	25 %	25 %	16120032
122	NC_002608	GACG	2	8	50341	50348	25 %	0 %	50 %	25 %	16120032
123	NC_002608	ACGC	2	8	50561	50568	25 %	0 %	25 %	50 %	16120032
124	NC_002608	TCGT	2	8	51341	51348	0 %	50 %	25 %	25 %	16120033
125	NC_002608	GGCC	2	8	51877	51884	0 %	0 %	50 %	50 %	16120033
126	NC_002608	TGGA	2	8	52373	52380	25 %	25 %	50 %	0 %	16120033
127	NC_002608	ACCG	2	8	52683	52690	25 %	0 %	25 %	50 %	16120034
128	NC_002608	CAGA	2	8	54564	54571	50 %	0 %	25 %	25 %	16120037
129	NC_002608	TGCG	2	8	55399	55406	0 %	25 %	50 %	25 %	16120038
130	NC_002608	GCAG	2	8	55688	55695	25 %	0 %	50 %	25 %	16120039
131	NC_002608	CCGA	2	8	55706	55713	25 %	0 %	25 %	50 %	16120039
132	NC_002608	GCCG	2	8	56298	56305	0 %	0 %	50 %	50 %	16120040
133	NC_002608	CGCC	2	8	56658	56665	0 %	0 %	25 %	75 %	16120040
134	NC_002608	CGTC	2	8	56676	56683	0 %	25 %	25 %	50 %	16120040
135	NC_002608	CAGC	2	8	57387	57394	25 %	0 %	25 %	50 %	16120041
136	NC_002608	CGCT	2	8	57473	57480	0 %	25 %	25 %	50 %	16120041
137	NC_002608	GTTT	2	8	57534	57541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002608	AATG	2	8	57928	57935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002608	CTGG	2	8	57979	57986	0 %	25 %	50 %	25 %	16120042
140	NC_002608	TGTC	2	8	58018	58025	0 %	50 %	25 %	25 %	16120042
141	NC_002608	TTCA	2	8	58389	58396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002608	TTAG	2	8	58511	58518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002608	GGAA	2	8	58563	58570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002608	GGGT	2	8	58817	58824	0 %	25 %	75 %	0 %	16120043
145	NC_002608	GCAA	2	8	59296	59303	50 %	0 %	25 %	25 %	16120043
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