MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 6345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002608	GTG	2	6	37	42	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002608	ACC	2	6	71	76	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_002608	CGA	2	6	208	213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_002608	AAC	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002608	TGA	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119980
6	NC_002608	TCG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119980
7	NC_002608	GAC	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119980
8	NC_002608	TCT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119980
9	NC_002608	GAA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119980
10	NC_002608	CTC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119980
11	NC_002608	TTC	2	6	567	572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119980
12	NC_002608	TCG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119980
13	NC_002608	GTC	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119980
14	NC_002608	GGC	2	6	793	798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119980
15	NC_002608	GAT	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119981
16	NC_002608	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119981
17	NC_002608	CTT	2	6	1122	1127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119981
18	NC_002608	GTC	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119981
19	NC_002608	TTC	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002608	TGA	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119982
21	NC_002608	GTC	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119982
22	NC_002608	GTT	2	6	1422	1427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119982
23	NC_002608	GAG	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119982
24	NC_002608	ATA	2	6	1527	1532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119982
25	NC_002608	CGA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119982
26	NC_002608	CGC	2	6	1635	1640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119982
27	NC_002608	TGC	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119982
28	NC_002608	ATG	2	6	1740	1745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002608	CAG	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
30	NC_002608	GGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119983
31	NC_002608	CGC	2	6	2146	2151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119983
32	NC_002608	CTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
33	NC_002608	CGG	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
34	NC_002608	TCG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
35	NC_002608	TCC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119983
36	NC_002608	GCG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
37	NC_002608	TCC	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119983
38	NC_002608	GCG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
39	NC_002608	CGT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
40	NC_002608	TGA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119983
41	NC_002608	GCT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
42	NC_002608	GAC	2	6	2571	2576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
43	NC_002608	CGT	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
44	NC_002608	CAT	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119983
45	NC_002608	GAG	2	6	2694	2699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119983
46	NC_002608	AAC	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119983
47	NC_002608	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
48	NC_002608	CGA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
49	NC_002608	TGA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119983
50	NC_002608	GAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119983
51	NC_002608	ACT	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119983
52	NC_002608	CGT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
53	NC_002608	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
54	NC_002608	GGA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119983
55	NC_002608	ACG	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
56	NC_002608	CGG	2	6	3356	3361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
57	NC_002608	CGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
58	NC_002608	GTC	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
59	NC_002608	GCT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
60	NC_002608	TTC	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119983
61	NC_002608	GGA	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119983
62	NC_002608	TCG	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
63	NC_002608	TTG	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119983
64	NC_002608	CCA	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119983
65	NC_002608	CGT	2	6	3749	3754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002608	TTC	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002608	ACT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002608	TCC	2	6	4047	4052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_002608	AAG	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002608	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119984
71	NC_002608	CTG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119984
72	NC_002608	TAC	2	6	4317	4322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119984
73	NC_002608	TGG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119984
74	NC_002608	CGA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119984
75	NC_002608	CAG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119984
76	NC_002608	TAA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119984
77	NC_002608	CTA	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119984
78	NC_002608	AGA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119985
79	NC_002608	TCG	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_002608	ATT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119986
81	NC_002608	GAC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119986
82	NC_002608	GTC	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119986
83	NC_002608	GTC	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119986
84	NC_002608	CTC	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119986
85	NC_002608	ACC	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119986
86	NC_002608	ATG	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119986
87	NC_002608	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
88	NC_002608	ACA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119987
89	NC_002608	TGG	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119987
90	NC_002608	GGT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119987
91	NC_002608	TCT	2	6	5639	5644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
92	NC_002608	AAG	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119987
93	NC_002608	CGC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119987
94	NC_002608	TTG	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
95	NC_002608	CAA	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119987
96	NC_002608	GTC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119987
97	NC_002608	CTG	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119987
98	NC_002608	GTT	2	6	6035	6040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
99	NC_002608	TAC	2	6	6175	6180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
100	NC_002608	TCT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
101	NC_002608	TAC	2	6	6406	6411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
102	NC_002608	TCA	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
103	NC_002608	TGG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119987
104	NC_002608	TTC	2	6	6502	6507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
105	NC_002608	GGA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119987
106	NC_002608	TGT	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
107	NC_002608	TTG	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
108	NC_002608	CGG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119987
109	NC_002608	TCT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
110	NC_002608	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
111	NC_002608	AGT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
112	NC_002608	GAG	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119987
113	NC_002608	TCC	2	6	7289	7294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119987
114	NC_002608	TAG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
115	NC_002608	TAT	2	6	7408	7413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119987
116	NC_002608	TCG	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119987
117	NC_002608	GTA	2	6	7458	7463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
118	NC_002608	CAT	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
119	NC_002608	TAG	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
120	NC_002608	GCG	2	6	7706	7711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119987
121	NC_002608	TTG	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
122	NC_002608	TTC	2	6	7834	7839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
123	NC_002608	CTT	2	6	7878	7883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
124	NC_002608	GCA	2	6	7901	7906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119988
125	NC_002608	TCG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119988
126	NC_002608	TTC	2	6	8078	8083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
127	NC_002608	TCT	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
128	NC_002608	GGC	2	6	8164	8169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119988
129	NC_002608	TTC	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
130	NC_002608	TTC	3	9	8311	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
131	NC_002608	CCA	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119988
132	NC_002608	AGA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119988
133	NC_002608	GTT	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119988
134	NC_002608	TCA	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002608	CAT	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002608	TGG	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002608	GAA	2	6	8973	8978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002608	CTT	2	6	9026	9031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_002608	TCA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002608	TGC	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119989
141	NC_002608	TCG	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119989
142	NC_002608	CAG	2	6	9262	9267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119989
143	NC_002608	TAT	2	6	9295	9300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119989
144	NC_002608	CAA	3	9	9417	9425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119989
145	NC_002608	AGG	2	6	9446	9451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119989
146	NC_002608	CTG	2	6	9463	9468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119989
147	NC_002608	CTT	2	6	9519	9524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119989
148	NC_002608	ACT	2	6	9530	9535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119989
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150	NC_002608	ACA	2	6	9607	9612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119989
151	NC_002608	GAT	2	6	9765	9770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119989
152	NC_002608	CGA	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119989
153	NC_002608	CAG	2	6	9795	9800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119989
154	NC_002608	CGA	2	6	9968	9973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119989
155	NC_002608	CGC	2	6	10061	10066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119989
156	NC_002608	CCT	2	6	10129	10134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119989
157	NC_002608	CGG	2	6	10168	10173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119989
158	NC_002608	AGC	2	6	10174	10179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119989
159	NC_002608	TCT	2	6	10235	10240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119989
160	NC_002608	GAT	2	6	10290	10295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119989
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162	NC_002608	CGT	2	6	10371	10376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119989
163	NC_002608	ACA	2	6	10384	10389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119989
164	NC_002608	CAC	2	6	10436	10441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119989
165	NC_002608	GGA	2	6	10571	10576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119989
166	NC_002608	GTG	2	6	10699	10704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119989
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168	NC_002608	GGC	2	6	10800	10805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119989
169	NC_002608	GAA	2	6	10899	10904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119989
170	NC_002608	AAC	2	6	10924	10929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119989
171	NC_002608	ATC	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119989
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173	NC_002608	CAA	2	6	11049	11054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119989
174	NC_002608	GAC	2	6	11076	11081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119989
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200	NC_002608	GAC	2	6	12528	12533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_002608	CGA	2	6	15710	15715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_002608	GAA	2	6	15777	15782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119992
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262	NC_002608	CGA	2	6	16186	16191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119992
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368	NC_002608	TTC	2	6	22336	22341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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