MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 5148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002608	TGA	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119980
2	NC_002608	TCG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119980
3	NC_002608	GAC	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119980
4	NC_002608	TCT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119980
5	NC_002608	GAA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119980
6	NC_002608	CTC	2	6	504	509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119980
7	NC_002608	TTC	2	6	567	572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119980
8	NC_002608	TCG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119980
9	NC_002608	GTC	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119980
10	NC_002608	GGC	2	6	793	798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119980
11	NC_002608	GAT	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119981
12	NC_002608	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119981
13	NC_002608	CTT	2	6	1122	1127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119981
14	NC_002608	GTC	2	6	1149	1154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119981
15	NC_002608	TGA	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119982
16	NC_002608	GTC	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119982
17	NC_002608	GTT	2	6	1422	1427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119982
18	NC_002608	GAG	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119982
19	NC_002608	ATA	2	6	1527	1532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119982
20	NC_002608	CGA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119982
21	NC_002608	CGC	2	6	1635	1640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119982
22	NC_002608	TGC	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119982
23	NC_002608	CAG	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
24	NC_002608	GGT	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119983
25	NC_002608	CGC	2	6	2146	2151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119983
26	NC_002608	CTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
27	NC_002608	CGG	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
28	NC_002608	TCG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
29	NC_002608	TCC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119983
30	NC_002608	GCG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
31	NC_002608	TCC	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119983
32	NC_002608	GCG	2	6	2348	2353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
33	NC_002608	CGT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
34	NC_002608	TGA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119983
35	NC_002608	GCT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
36	NC_002608	GAC	2	6	2571	2576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
37	NC_002608	CGT	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
38	NC_002608	CAT	2	6	2649	2654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119983
39	NC_002608	GAG	2	6	2694	2699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119983
40	NC_002608	AAC	2	6	2733	2738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119983
41	NC_002608	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
42	NC_002608	CGA	2	6	2774	2779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
43	NC_002608	TGA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119983
44	NC_002608	GAA	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119983
45	NC_002608	ACT	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119983
46	NC_002608	CGT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
47	NC_002608	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
48	NC_002608	GGA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119983
49	NC_002608	ACG	2	6	3346	3351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119983
50	NC_002608	CGG	2	6	3356	3361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119983
51	NC_002608	CGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
52	NC_002608	GTC	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
53	NC_002608	GCT	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
54	NC_002608	TTC	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119983
55	NC_002608	GGA	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119983
56	NC_002608	TCG	2	6	3586	3591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119983
57	NC_002608	TTG	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119983
58	NC_002608	CCA	2	6	3698	3703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119983
59	NC_002608	TCG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119984
60	NC_002608	CTG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119984
61	NC_002608	TAC	2	6	4317	4322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119984
62	NC_002608	TGG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119984
63	NC_002608	CGA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119984
64	NC_002608	CAG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119984
65	NC_002608	TAA	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119984
66	NC_002608	CTA	2	6	4589	4594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119984
67	NC_002608	AGA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119985
68	NC_002608	ATT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119986
69	NC_002608	GAC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119986
70	NC_002608	GTC	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119986
71	NC_002608	GTC	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119986
72	NC_002608	CTC	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119986
73	NC_002608	ACC	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119986
74	NC_002608	ATG	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119986
75	NC_002608	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
76	NC_002608	ACA	2	6	5573	5578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119987
77	NC_002608	TGG	2	6	5581	5586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119987
78	NC_002608	GGT	2	6	5598	5603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119987
79	NC_002608	TCT	2	6	5639	5644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
80	NC_002608	AAG	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119987
81	NC_002608	CGC	2	6	5808	5813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119987
82	NC_002608	TTG	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
83	NC_002608	CAA	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119987
84	NC_002608	GTC	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119987
85	NC_002608	CTG	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119987
86	NC_002608	GTT	2	6	6035	6040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
87	NC_002608	TAC	2	6	6175	6180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
88	NC_002608	TCT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
89	NC_002608	TAC	2	6	6406	6411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
90	NC_002608	TCA	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
91	NC_002608	TGG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119987
92	NC_002608	TTC	2	6	6502	6507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
93	NC_002608	GGA	2	6	6530	6535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119987
94	NC_002608	TGT	2	6	6772	6777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
95	NC_002608	TTG	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
96	NC_002608	CGG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119987
97	NC_002608	TCT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
98	NC_002608	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
99	NC_002608	AGT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
100	NC_002608	GAG	2	6	7234	7239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119987
101	NC_002608	TCC	2	6	7289	7294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119987
102	NC_002608	TAG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
103	NC_002608	TAT	2	6	7408	7413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119987
104	NC_002608	TCG	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119987
105	NC_002608	GTA	2	6	7458	7463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
106	NC_002608	CAT	2	6	7521	7526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119987
107	NC_002608	TAG	2	6	7642	7647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119987
108	NC_002608	GCG	2	6	7706	7711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119987
109	NC_002608	TTG	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119987
110	NC_002608	TTC	2	6	7834	7839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119987
111	NC_002608	CTT	2	6	7878	7883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
112	NC_002608	GCA	2	6	7901	7906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119988
113	NC_002608	TCG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119988
114	NC_002608	TTC	2	6	8078	8083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
115	NC_002608	TCT	2	6	8090	8095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
116	NC_002608	GGC	2	6	8164	8169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119988
117	NC_002608	TTC	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
118	NC_002608	TTC	3	9	8311	8319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119988
119	NC_002608	CCA	2	6	8402	8407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119988
120	NC_002608	AGA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119988
121	NC_002608	GTT	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119988
122	NC_002608	TGC	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119989
123	NC_002608	TCG	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119989
124	NC_002608	CAG	2	6	9262	9267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119989
125	NC_002608	TAT	2	6	9295	9300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119989
126	NC_002608	CAA	3	9	9417	9425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119989
127	NC_002608	AGG	2	6	9446	9451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119989
128	NC_002608	CTG	2	6	9463	9468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119989
129	NC_002608	CTT	2	6	9519	9524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119989
130	NC_002608	ACT	2	6	9530	9535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119989
131	NC_002608	AAG	2	6	9574	9579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119989
132	NC_002608	ACA	2	6	9607	9612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119989
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257	NC_002608	GGC	2	6	18432	18437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119997
258	NC_002608	TCG	2	6	18439	18444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119997
259	NC_002608	TCG	2	6	18483	18488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119997
260	NC_002608	TGT	2	6	18645	18650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119997
261	NC_002608	CGT	3	9	18780	18788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119998
262	NC_002608	TCG	2	6	18812	18817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119998
263	NC_002608	CGT	3	9	18837	18845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119998
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265	NC_002608	TCG	2	6	18881	18886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119998
266	NC_002608	TCC	2	6	18895	18900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119998
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270	NC_002608	CGT	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119998
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272	NC_002608	CGA	2	6	19122	19127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119998
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278	NC_002608	GCT	2	6	19289	19294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119999
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280	NC_002608	GTC	2	6	19350	19355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119999
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282	NC_002608	GGA	2	6	19400	19405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119999
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285	NC_002608	CGG	2	6	19515	19520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16120000
286	NC_002608	TCG	2	6	19549	19554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120000
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288	NC_002608	CGA	2	6	19610	19615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120000
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290	NC_002608	TCT	2	6	19714	19719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120000
291	NC_002608	TCG	2	6	19732	19737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120000
292	NC_002608	GAC	2	6	19875	19880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120000
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295	NC_002608	GTT	2	6	19920	19925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16120000
296	NC_002608	GAC	2	6	19980	19985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120000
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299	NC_002608	GCC	2	6	20343	20348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120001
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302	NC_002608	TCA	2	6	20498	20503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120001
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372	NC_002608	GAC	2	6	25452	25457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120007
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377	NC_002608	CAT	3	9	25776	25784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16120007
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379	NC_002608	CTC	2	6	25825	25830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120007
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381	NC_002608	ACG	2	6	26110	26115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120007
382	NC_002608	GCT	2	6	26731	26736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
383	NC_002608	TCC	2	6	26855	26860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120008
384	NC_002608	GTC	2	6	26875	26880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120008
385	NC_002608	TCC	2	6	26927	26932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16120008
386	NC_002608	CCG	2	6	26933	26938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120008
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484	NC_002608	CGC	2	6	36217	36222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120014
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488	NC_002608	CGA	2	6	36538	36543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120014
489	NC_002608	GAG	2	6	36650	36655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16120014
490	NC_002608	ACG	2	6	36693	36698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16120014
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492	NC_002608	GAT	2	6	36840	36845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16120014
493	NC_002608	TTC	2	6	36861	36866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16120015
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497	NC_002608	CCG	2	6	37095	37100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16120015
498	NC_002608	CGT	2	6	37142	37147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16120015
499	NC_002608	CAA	2	6	37148	37153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16120015
500	NC_002608	ACC	2	6	37162	37167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16120015

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