MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 plasmid pNRC200

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002608	G	7	7	324	330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002608	T	6	6	4789	4794	0 %	100 %	0 %	0 %	16119985
3	NC_002608	T	7	7	7484	7490	0 %	100 %	0 %	0 %	16119987
4	NC_002608	C	6	6	12973	12978	0 %	0 %	0 %	100 %	16119990
5	NC_002608	G	6	6	13809	13814	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002608	G	6	6	21829	21834	0 %	0 %	100 %	0 %	16120002
7	NC_002608	C	6	6	25792	25797	0 %	0 %	0 %	100 %	16120007
8	NC_002608	C	11	11	29165	29175	0 %	0 %	0 %	100 %	16120008
9	NC_002608	G	6	6	52019	52024	0 %	0 %	100 %	0 %	16120033
10	NC_002608	G	6	6	62243	62248	0 %	0 %	100 %	0 %	16120046
11	NC_002608	C	6	6	64858	64863	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_002608	A	6	6	72029	72034	100 %	0 %	0 %	0 %	16120056
13	NC_002608	G	6	6	78502	78507	0 %	0 %	100 %	0 %	16120062
14	NC_002608	C	6	6	82227	82232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_002608	G	6	6	83063	83068	0 %	0 %	100 %	0 %	16120067
16	NC_002608	A	6	6	107315	107320	100 %	0 %	0 %	0 %	16120088
17	NC_002608	G	6	6	112789	112794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002608	C	6	6	121173	121178	0 %	0 %	0 %	100 %	16120095
19	NC_002608	A	6	6	130882	130887	100 %	0 %	0 %	0 %	16120102
20	NC_002608	T	6	6	133260	133265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002608	C	6	6	133428	133433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_002608	T	7	7	135699	135705	0 %	100 %	0 %	0 %	16120105
23	NC_002608	C	6	6	136036	136041	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_002608	T	6	6	139412	139417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002608	A	6	6	143060	143065	100 %	0 %	0 %	0 %	16120116
26	NC_002608	C	6	6	143427	143432	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_002608	G	6	6	143977	143982	0 %	0 %	100 %	0 %	16120117
28	NC_002608	A	6	6	144157	144162	100 %	0 %	0 %	0 %	16120117
29	NC_002608	C	6	6	148270	148275	0 %	0 %	0 %	100 %	16120120
30	NC_002608	C	6	6	154440	154445	0 %	0 %	0 %	100 %	16120125
31	NC_002608	G	6	6	160163	160168	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002608	G	6	6	161847	161852	0 %	0 %	100 %	0 %	16120135
33	NC_002608	T	6	6	162437	162442	0 %	100 %	0 %	0 %	16120137
34	NC_002608	A	6	6	166885	166890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002608	C	6	6	174399	174404	0 %	0 %	0 %	100 %	16120151
36	NC_002608	C	6	6	188890	188895	0 %	0 %	0 %	100 %	16120169
37	NC_002608	C	6	6	189242	189247	0 %	0 %	0 %	100 %	16120169
38	NC_002608	G	7	7	190637	190643	0 %	0 %	100 %	0 %	16120171
39	NC_002608	C	7	7	190766	190772	0 %	0 %	0 %	100 %	16120171
40	NC_002608	G	6	6	194619	194624	0 %	0 %	100 %	0 %	16120176
41	NC_002608	G	6	6	196679	196684	0 %	0 %	100 %	0 %	16120178
42	NC_002608	G	6	6	196695	196700	0 %	0 %	100 %	0 %	16120178
43	NC_002608	G	6	6	210072	210077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002608	C	6	6	210085	210090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_002608	G	6	6	210124	210129	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002608	G	6	6	210542	210547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002608	C	6	6	212173	212178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_002608	G	6	6	220821	220826	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002608	G	6	6	230066	230071	0 %	0 %	100 %	0 %	16120211
50	NC_002608	A	6	6	232677	232682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002608	C	6	6	233509	233514	0 %	0 %	0 %	100 %	16120213
52	NC_002608	A	6	6	242921	242926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002608	A	6	6	244797	244802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002608	A	6	6	249567	249572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002608	C	6	6	253229	253234	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
56	NC_002608	T	6	6	254720	254725	0 %	100 %	0 %	0 %	16120230
57	NC_002608	G	6	6	254813	254818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002608	A	6	6	255038	255043	100 %	0 %	0 %	0 %	16120231
59	NC_002608	G	6	6	256965	256970	0 %	0 %	100 %	0 %	16120232
60	NC_002608	A	6	6	260254	260259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002608	G	6	6	272367	272372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002608	C	6	6	276279	276284	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_002608	G	6	6	280024	280029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002608	T	6	6	280351	280356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002608	C	6	6	280904	280909	0 %	0 %	0 %	100 %	16120251
66	NC_002608	C	6	6	285023	285028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_002608	C	6	6	285804	285809	0 %	0 %	0 %	100 %	16120255
68	NC_002608	G	6	6	293160	293165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002608	G	6	6	299102	299107	0 %	0 %	100 %	0 %	16120267
70	NC_002608	A	6	6	304244	304249	100 %	0 %	0 %	0 %	16120274
71	NC_002608	C	6	6	304830	304835	0 %	0 %	0 %	100 %	16120275
72	NC_002608	A	6	6	305250	305255	100 %	0 %	0 %	0 %	16120275
73	NC_002608	G	6	6	308376	308381	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002608	A	7	7	314160	314166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002608	C	6	6	314486	314491	0 %	0 %	0 %	100 %	16120289
76	NC_002608	G	6	6	315425	315430	0 %	0 %	100 %	0 %	16120290
77	NC_002608	G	6	6	315564	315569	0 %	0 %	100 %	0 %	16120290
78	NC_002608	A	6	6	315606	315611	100 %	0 %	0 %	0 %	16120290
79	NC_002608	A	6	6	317758	317763	100 %	0 %	0 %	0 %	16120293
80	NC_002608	G	6	6	324784	324789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002608	G	6	6	326321	326326	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002608	G	6	6	326355	326360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002608	G	6	6	326389	326394	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002608	C	6	6	330723	330728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_002608	C	6	6	335220	335225	0 %	0 %	0 %	100 %	16120316
86	NC_002608	C	6	6	345444	345449	0 %	0 %	0 %	100 %	16120329

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.