MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 5911

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002607	CAAC	2	8	717	724	50 %	0 %	0 %	50 %	15789341
2	NC_002607	GACA	2	8	730	737	50 %	0 %	25 %	25 %	15789341
3	NC_002607	GCAC	2	8	939	946	25 %	0 %	25 %	50 %	15789341
4	NC_002607	ACCA	2	8	969	976	50 %	0 %	0 %	50 %	15789341
5	NC_002607	GCTT	2	8	1610	1617	0 %	50 %	25 %	25 %	15789342
6	NC_002607	TCAC	2	8	2042	2049	25 %	25 %	0 %	50 %	15789342
7	NC_002607	GCTC	2	8	2120	2127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002607	ATCA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	0 %	25 %	15789343
9	NC_002607	CGAA	2	8	2354	2361	50 %	0 %	25 %	25 %	15789343
10	NC_002607	ACCA	2	8	2538	2545	50 %	0 %	0 %	50 %	15789343
11	NC_002607	GCTG	2	8	3299	3306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_002607	CCGT	2	8	4103	4110	0 %	25 %	25 %	50 %	15789344
13	NC_002607	GTTC	2	8	4236	4243	0 %	50 %	25 %	25 %	15789344
14	NC_002607	CGGC	2	8	4445	4452	0 %	0 %	50 %	50 %	15789344
15	NC_002607	CACG	2	8	5073	5080	25 %	0 %	25 %	50 %	15789344
16	NC_002607	TCGA	2	8	5202	5209	25 %	25 %	25 %	25 %	15789344
17	NC_002607	TCGC	2	8	5818	5825	0 %	25 %	25 %	50 %	15789345
18	NC_002607	CGGC	2	8	6037	6044	0 %	0 %	50 %	50 %	15789345
19	NC_002607	CGTC	2	8	6632	6639	0 %	25 %	25 %	50 %	15789345
20	NC_002607	CTGC	2	8	7816	7823	0 %	25 %	25 %	50 %	15789346
21	NC_002607	CGCC	2	8	8506	8513	0 %	0 %	25 %	75 %	15789346
22	NC_002607	CGTC	2	8	9290	9297	0 %	25 %	25 %	50 %	15789347
23	NC_002607	CGCC	2	8	9770	9777	0 %	0 %	25 %	75 %	15789347
24	NC_002607	CTGC	2	8	10024	10031	0 %	25 %	25 %	50 %	15789348
25	NC_002607	GCCT	2	8	10181	10188	0 %	25 %	25 %	50 %	15789348
26	NC_002607	CGCT	2	8	10269	10276	0 %	25 %	25 %	50 %	15789348
27	NC_002607	ACCG	2	8	10664	10671	25 %	0 %	25 %	50 %	15789348
28	NC_002607	CGGC	2	8	10857	10864	0 %	0 %	50 %	50 %	15789348
29	NC_002607	CCCG	2	8	12101	12108	0 %	0 %	25 %	75 %	15789349
30	NC_002607	TCGG	2	8	12209	12216	0 %	25 %	50 %	25 %	15789349
31	NC_002607	CCCT	2	8	12803	12810	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_002607	ACTC	2	8	12811	12818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002607	TCGC	2	8	13166	13173	0 %	25 %	25 %	50 %	15789350
34	NC_002607	CGAT	2	8	13551	13558	25 %	25 %	25 %	25 %	15789351
35	NC_002607	TCCA	2	8	13640	13647	25 %	25 %	0 %	50 %	15789351
36	NC_002607	ACGG	2	8	13692	13699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_002607	TCGC	2	8	13907	13914	0 %	25 %	25 %	50 %	15789352
38	NC_002607	TCGT	2	8	14143	14150	0 %	50 %	25 %	25 %	15789352
39	NC_002607	GGCG	2	8	14446	14453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002607	TAGA	2	8	15286	15293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002607	TTTA	2	8	15977	15984	25 %	75 %	0 %	0 %	15789356
42	NC_002607	ACGA	2	8	16388	16395	50 %	0 %	25 %	25 %	15789357
43	NC_002607	GCAG	2	8	17238	17245	25 %	0 %	50 %	25 %	15789357
44	NC_002607	ACAA	2	8	17479	17486	75 %	0 %	0 %	25 %	15789357
45	NC_002607	GTTC	2	8	17562	17569	0 %	50 %	25 %	25 %	15789357
46	NC_002607	CTAA	2	8	18132	18139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002607	ACTG	2	8	18506	18513	25 %	25 %	25 %	25 %	15789358
48	NC_002607	CCAG	2	8	18622	18629	25 %	0 %	25 %	50 %	15789358
49	NC_002607	AGTC	2	8	18780	18787	25 %	25 %	25 %	25 %	15789358
50	NC_002607	CAAG	2	8	18860	18867	50 %	0 %	25 %	25 %	15789358
51	NC_002607	TGAG	2	8	18896	18903	25 %	25 %	50 %	0 %	15789358
52	NC_002607	CCGG	2	8	19175	19182	0 %	0 %	50 %	50 %	15789359
53	NC_002607	TGCC	2	8	19322	19329	0 %	25 %	25 %	50 %	15789359
54	NC_002607	GACC	2	8	19365	19372	25 %	0 %	25 %	50 %	15789359
55	NC_002607	TCGC	2	8	19441	19448	0 %	25 %	25 %	50 %	15789359
56	NC_002607	CGAT	2	8	19469	19476	25 %	25 %	25 %	25 %	15789359
57	NC_002607	CTCC	2	8	20092	20099	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_002607	AGCT	2	8	21148	21155	25 %	25 %	25 %	25 %	15789362
59	NC_002607	CGGT	2	8	21477	21484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002607	GGTG	2	8	21561	21568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002607	CCCT	2	8	21855	21862	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_002607	TTGG	2	8	22300	22307	0 %	50 %	50 %	0 %	15789363
63	NC_002607	CTGG	2	8	22341	22348	0 %	25 %	50 %	25 %	15789363
64	NC_002607	CACT	2	8	22566	22573	25 %	25 %	0 %	50 %	15789363
65	NC_002607	TGGC	2	8	22651	22658	0 %	25 %	50 %	25 %	15789363
66	NC_002607	ATGG	2	8	22879	22886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002607	ATAC	2	8	23081	23088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002607	CTTC	2	8	23555	23562	0 %	50 %	0 %	50 %	15789364
69	NC_002607	CGGC	2	8	23744	23751	0 %	0 %	50 %	50 %	15789364
70	NC_002607	GGGC	2	8	23846	23853	0 %	0 %	75 %	25 %	15789364
71	NC_002607	GCTG	2	8	23867	23874	0 %	25 %	50 %	25 %	15789364
72	NC_002607	CGAC	2	8	24171	24178	25 %	0 %	25 %	50 %	15789365
73	NC_002607	ACCC	2	8	24206	24213	25 %	0 %	0 %	75 %	15789365
74	NC_002607	CACC	2	8	24407	24414	25 %	0 %	0 %	75 %	15789365
75	NC_002607	CAAG	2	8	24458	24465	50 %	0 %	25 %	25 %	15789365
76	NC_002607	CCCT	2	8	24735	24742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_002607	CAGT	2	8	24997	25004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002607	TTCG	2	8	25163	25170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002607	CCTC	2	8	25229	25236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_002607	GCCA	2	8	25522	25529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002607	AACC	2	8	25536	25543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002607	CCCA	2	8	26091	26098	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_002607	ACCA	2	8	26211	26218	50 %	0 %	0 %	50 %	15789366
84	NC_002607	ATCA	2	8	26249	26256	50 %	25 %	0 %	25 %	15789366
85	NC_002607	TGCC	2	8	26793	26800	0 %	25 %	25 %	50 %	15789367
86	NC_002607	GTCA	2	8	27252	27259	25 %	25 %	25 %	25 %	15789367
87	NC_002607	GAGT	2	8	27340	27347	25 %	25 %	50 %	0 %	15789367
88	NC_002607	TTCA	2	8	27520	27527	25 %	50 %	0 %	25 %	15789367
89	NC_002607	GGCA	2	8	28029	28036	25 %	0 %	50 %	25 %	15789367
90	NC_002607	CCGT	2	8	28672	28679	0 %	25 %	25 %	50 %	15789367
91	NC_002607	AACT	2	8	29017	29024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002607	CACT	2	8	29995	30002	25 %	25 %	0 %	50 %	15789370
93	NC_002607	TCAC	2	8	30241	30248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002607	TACG	2	8	30323	30330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002607	CTTC	2	8	30451	30458	0 %	50 %	0 %	50 %	15789371
96	NC_002607	GTTG	2	8	30490	30497	0 %	50 %	50 %	0 %	15789371
97	NC_002607	CCCG	2	8	31070	31077	0 %	0 %	25 %	75 %	15789371
98	NC_002607	CAAG	2	8	31143	31150	50 %	0 %	25 %	25 %	15789371
99	NC_002607	CGGC	2	8	31343	31350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002607	GTCT	2	8	31644	31651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002607	CGAA	2	8	31937	31944	50 %	0 %	25 %	25 %	15789372
102	NC_002607	CCGG	2	8	32120	32127	0 %	0 %	50 %	50 %	15789373
103	NC_002607	CGAA	2	8	32173	32180	50 %	0 %	25 %	25 %	15789373
104	NC_002607	ACGG	2	8	32446	32453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002607	TTGA	2	8	32684	32691	25 %	50 %	25 %	0 %	15789374
106	NC_002607	TCGT	2	8	32850	32857	0 %	50 %	25 %	25 %	15789374
107	NC_002607	TTGT	2	8	33341	33348	0 %	75 %	25 %	0 %	15789375
108	NC_002607	AGCG	2	8	34109	34116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_002607	TATC	2	8	34360	34367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_002607	GTGG	2	8	35589	35596	0 %	25 %	75 %	0 %	15789377
111	NC_002607	GTGA	2	8	36160	36167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002607	ACTC	2	8	36559	36566	25 %	25 %	0 %	50 %	15789378
113	NC_002607	ACCA	2	8	36985	36992	50 %	0 %	0 %	50 %	15789379
114	NC_002607	CCGA	2	8	37231	37238	25 %	0 %	25 %	50 %	15789379
115	NC_002607	GCAA	2	8	37482	37489	50 %	0 %	25 %	25 %	15789379
116	NC_002607	TCGC	2	8	37604	37611	0 %	25 %	25 %	50 %	15789379
117	NC_002607	CCAG	2	8	38319	38326	25 %	0 %	25 %	50 %	15789380
118	NC_002607	ATCT	2	8	38461	38468	25 %	50 %	0 %	25 %	15789380
119	NC_002607	CGGA	2	8	38857	38864	25 %	0 %	50 %	25 %	15789380
120	NC_002607	CAGT	2	8	39729	39736	25 %	25 %	25 %	25 %	15789381
121	NC_002607	GTGC	2	8	39806	39813	0 %	25 %	50 %	25 %	15789381
122	NC_002607	CGCT	2	8	39951	39958	0 %	25 %	25 %	50 %	15789381
123	NC_002607	CTGG	2	8	40000	40007	0 %	25 %	50 %	25 %	15789381
124	NC_002607	CGTC	2	8	40675	40682	0 %	25 %	25 %	50 %	15789381
125	NC_002607	ACTC	2	8	40892	40899	25 %	25 %	0 %	50 %	15789381
126	NC_002607	GGCT	2	8	41688	41695	0 %	25 %	50 %	25 %	16554457
127	NC_002607	GGGA	2	8	42207	42214	25 %	0 %	75 %	0 %	15789383
128	NC_002607	ACGA	2	8	42426	42433	50 %	0 %	25 %	25 %	15789383
129	NC_002607	TTCT	2	8	42446	42453	0 %	75 %	0 %	25 %	15789383
130	NC_002607	CATG	2	8	42886	42893	25 %	25 %	25 %	25 %	15789384
131	NC_002607	GCCA	2	8	42926	42933	25 %	0 %	25 %	50 %	15789384
132	NC_002607	AATC	2	8	43024	43031	50 %	25 %	0 %	25 %	15789384
133	NC_002607	CCTC	2	8	43086	43093	0 %	25 %	0 %	75 %	15789384
134	NC_002607	TGTT	2	8	43278	43285	0 %	75 %	25 %	0 %	15789384
135	NC_002607	AGTT	2	8	43450	43457	25 %	50 %	25 %	0 %	15789384
136	NC_002607	CTTC	2	8	43576	43583	0 %	50 %	0 %	50 %	15789384
137	NC_002607	ATGA	2	8	44527	44534	50 %	25 %	25 %	0 %	15789385
138	NC_002607	ATCG	2	8	44942	44949	25 %	25 %	25 %	25 %	15789385
139	NC_002607	AGTT	2	8	45524	45531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002607	CTTC	2	8	45594	45601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002607	AATA	2	8	45606	45613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002607	GGTG	2	8	45846	45853	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002607	CGCC	2	8	45979	45986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_002607	CCGT	2	8	46236	46243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002607	GTAC	2	8	46248	46255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_002607	TGCT	2	8	47001	47008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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