MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002607	GCTC	2	8	2120	2127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002607	GCTG	2	8	3299	3306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002607	CCCT	2	8	12803	12810	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_002607	ACTC	2	8	12811	12818	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_002607	ACGG	2	8	13692	13699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002607	GGCG	2	8	14446	14453	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_002607	TAGA	2	8	15286	15293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002607	CTAA	2	8	18132	18139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002607	CTCC	2	8	20092	20099	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_002607	CGGT	2	8	21477	21484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002607	GGTG	2	8	21561	21568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002607	CCCT	2	8	21855	21862	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_002607	ATGG	2	8	22879	22886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002607	ATAC	2	8	23081	23088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002607	CCCT	2	8	24735	24742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_002607	CAGT	2	8	24997	25004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_002607	TTCG	2	8	25163	25170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_002607	CCTC	2	8	25229	25236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_002607	GCCA	2	8	25522	25529	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002607	AACC	2	8	25536	25543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002607	CCCA	2	8	26091	26098	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_002607	AACT	2	8	29017	29024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002607	TCAC	2	8	30241	30248	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002607	TACG	2	8	30323	30330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002607	CGGC	2	8	31343	31350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_002607	GTCT	2	8	31644	31651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_002607	ACGG	2	8	32446	32453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002607	AGCG	2	8	34109	34116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_002607	TATC	2	8	34360	34367	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_002607	GTGA	2	8	36160	36167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002607	AGTT	2	8	45524	45531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002607	CTTC	2	8	45594	45601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002607	AATA	2	8	45606	45613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002607	GGTG	2	8	45846	45853	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002607	CGCC	2	8	45979	45986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_002607	CCGT	2	8	46236	46243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002607	GTAC	2	8	46248	46255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_002607	TGCT	2	8	47001	47008	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_002607	AGCA	2	8	47028	47035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_002607	CTAA	2	8	47042	47049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_002607	TTCC	2	8	48520	48527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002607	GACG	2	8	48614	48621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002607	CCGA	2	8	49318	49325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_002607	GACT	2	8	52098	52105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002607	GGAA	2	8	52266	52273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002607	GGCA	2	8	53000	53007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002607	ACCG	2	8	53149	53156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002607	TGAG	2	8	54523	54530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002607	GAAC	2	8	55832	55839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_002607	TTAG	2	8	56181	56188	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002607	GGAA	2	8	56233	56240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002607	CAGT	2	8	57594	57601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_002607	GTTC	2	8	60317	60324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002607	GCTC	2	8	62855	62862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_002607	GTGG	2	8	63717	63724	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002607	AGAC	2	8	65986	65993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002607	TCAC	2	8	68822	68829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002607	CCTT	2	8	69542	69549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_002607	ACCA	2	8	70790	70797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002607	CGCC	2	8	71760	71767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_002607	CGGG	2	8	73579	73586	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_002607	GCCG	2	8	77908	77915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002607	GTGG	2	8	79606	79613	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002607	CCGG	2	8	81343	81350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002607	GCCC	2	8	81368	81375	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_002607	GCTG	2	8	82477	82484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002607	GCAG	2	8	84484	84491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002607	CCGT	2	8	84551	84558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002607	ACGC	2	8	86617	86624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_002607	CCGC	2	8	86719	86726	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_002607	CCGA	2	8	87515	87522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002607	TCGG	2	8	94360	94367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002607	TCTT	2	8	94377	94384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002607	CGCT	2	8	95193	95200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002607	CCGT	2	8	95520	95527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_002607	AAGA	2	8	96607	96614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002607	GTGA	2	8	96786	96793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002607	TGCT	2	8	97156	97163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002607	AGCA	2	8	97183	97190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002607	ACTG	2	8	97305	97312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002607	CCAT	2	8	99041	99048	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002607	CTCC	2	8	99093	99100	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_002607	TTAG	2	8	99347	99354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002607	TGCT	2	8	99361	99368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_002607	AGCA	2	8	99388	99395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_002607	GTAC	2	8	100141	100148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002607	ACGG	2	8	100153	100160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_002607	GGCG	2	8	100410	100417	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002607	CACC	2	8	100543	100550	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_002607	TGGC	2	8	100796	100803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002607	CGGA	2	8	101960	101967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_002607	ACTG	2	8	102014	102021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_002607	TTCT	2	8	108552	108559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002607	ACTC	2	8	110617	110624	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002607	CCCG	2	8	115098	115105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_002607	GCCA	2	8	115245	115252	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002607	CCAT	2	8	115420	115427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002607	GTCC	2	8	115679	115686	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002607	GACG	2	8	115813	115820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_002607	GCCG	2	8	115834	115841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002607	CGGC	2	8	119058	119065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002607	CGTG	2	8	119189	119196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_002607	CTGT	2	8	124823	124830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_002607	CCCG	2	8	128446	128453	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_002607	CACC	2	8	135367	135374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_002607	CTCG	2	8	144279	144286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002607	CCCG	2	8	148745	148752	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_002607	TCAC	2	8	155597	155604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002607	GCCG	2	8	155658	155665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002607	CCGG	2	8	158400	158407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002607	AATA	2	8	166645	166652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002607	CCAC	2	8	167258	167265	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_002607	CGTG	2	8	169364	169371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002607	CACG	2	8	171564	171571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002607	CGCT	2	8	174057	174064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002607	GCCC	2	8	174140	174147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_002607	CGCC	2	8	174166	174173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
118	NC_002607	GCCA	2	8	174219	174226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002607	GGCG	2	8	174427	174434	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_002607	GCCC	2	8	174480	174487	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_002607	GCGT	2	8	174947	174954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_002607	TAGA	2	8	175018	175025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002607	TACA	2	8	177557	177564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002607	CAAC	2	8	183877	183884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002607	CCCG	2	8	183886	183893	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_002607	CGGC	2	8	189731	189738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002607	CGGC	2	8	189873	189880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_002607	CGGC	2	8	191090	191097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002607	CGGA	2	8	196803	196810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_002607	CGCC	2	8	196956	196963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_002607	CGGA	2	8	200297	200304	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_002607	CGGC	2	8	200305	200312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002607	TCCC	2	8	211666	211673	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_002607	CGGC	2	8	218332	218339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002607	CGCC	2	8	218357	218364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_002607	ACCT	2	8	226659	226666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002607	CGAC	2	8	226675	226682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002607	CCCG	2	8	226796	226803	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_002607	GGAC	2	8	228869	228876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002607	GGCC	2	8	233024	233031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002607	CGGT	2	8	233301	233308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002607	GGCT	2	8	235642	235649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002607	CGCC	2	8	235675	235682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_002607	CGGG	2	8	237125	237132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002607	AGAT	2	8	246149	246156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002607	CCAG	2	8	246191	246198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002607	TGTC	2	8	246226	246233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002607	GACA	2	8	248087	248094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002607	CCGC	2	8	248234	248241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_002607	CCAG	2	8	264055	264062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_002607	CGGC	2	8	264202	264209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_002607	CGAG	2	8	264233	264240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_002607	CGCC	2	8	264946	264953	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
154	NC_002607	TCGC	2	8	274414	274421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_002607	GCCG	2	8	274698	274705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_002607	CGAC	2	8	274882	274889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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158	NC_002607	TGCC	2	8	305354	305361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_002607	CCGT	2	8	309251	309258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_002607	CGGC	2	8	309354	309361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_002607	GGCG	2	8	309751	309758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
162	NC_002607	ACGC	2	8	318106	318113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_002607	CACG	2	8	326453	326460	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_002607	CTCA	2	8	334342	334349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_002607	CGCC	2	8	342920	342927	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_002607	CGTA	2	8	351586	351593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_002607	TGGG	2	8	351606	351613	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
175	NC_002607	TACG	2	8	355059	355066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
176	NC_002607	CGCC	2	8	355129	355136	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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179	NC_002607	ACGT	2	8	368015	368022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_002607	GCCG	2	8	379293	379300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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183	NC_002607	CGCC	2	8	382567	382574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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187	NC_002607	CCGT	2	8	391372	391379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_002607	GCCG	2	8	394221	394228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
190	NC_002607	CGGC	2	8	400081	400088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
191	NC_002607	CGCC	2	8	400190	400197	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
192	NC_002607	CAGC	2	8	400235	400242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
193	NC_002607	CGGA	2	8	401100	401107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_002607	GCGG	2	8	576752	576759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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265	NC_002607	CACC	2	8	580340	580347	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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279	NC_002607	ACGT	2	8	609522	609529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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281	NC_002607	CAGC	2	8	622893	622900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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497	NC_002607	CGTA	2	8	1209394	1209401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_002607	CGGC	2	8	1212591	1212598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_002607	TAGA	2	8	1217399	1217406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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