MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halobacterium sp. NRC-1 chromosome

Total Repeats: 43602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002607	CGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002607	CCA	2	6	103	108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_002607	CCT	2	6	182	187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_002607	CGC	2	6	210	215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_002607	CGG	2	6	254	259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789341
6	NC_002607	CCG	2	6	342	347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789341
7	NC_002607	CAA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789341
8	NC_002607	GCG	2	6	492	497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789341
9	NC_002607	ACC	2	6	591	596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789341
10	NC_002607	TCT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15789341
11	NC_002607	TCG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789341
12	NC_002607	GCG	2	6	891	896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789341
13	NC_002607	CGA	3	9	925	933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789341
14	NC_002607	GCG	2	6	1044	1049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789341
15	NC_002607	CGC	2	6	1051	1056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789341
16	NC_002607	CGG	2	6	1123	1128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789341
17	NC_002607	CGA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789341
18	NC_002607	ACT	2	6	1224	1229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789341
19	NC_002607	CCG	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789341
20	NC_002607	CGT	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789341
21	NC_002607	GCG	2	6	1275	1280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789341
22	NC_002607	CAG	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789341
23	NC_002607	TCG	4	12	1416	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789341
24	NC_002607	CAT	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789342
25	NC_002607	CGG	2	6	1535	1540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789342
26	NC_002607	CGT	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789342
27	NC_002607	CGG	2	6	1628	1633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789342
28	NC_002607	GAG	2	6	1690	1695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789342
29	NC_002607	CGC	2	6	1696	1701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789342
30	NC_002607	CCT	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789342
31	NC_002607	CGG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789342
32	NC_002607	CAG	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789342
33	NC_002607	CTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789342
34	NC_002607	CGA	2	6	1944	1949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789342
35	NC_002607	GAG	3	9	2014	2022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789342
36	NC_002607	GAG	2	6	2062	2067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789342
37	NC_002607	TCG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789342
38	NC_002607	CAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789343
39	NC_002607	TGA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789343
40	NC_002607	CGT	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789343
41	NC_002607	TTC	2	6	2420	2425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15789343
42	NC_002607	ACA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789343
43	NC_002607	CCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789343
44	NC_002607	ACG	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789343
45	NC_002607	ATC	2	6	2619	2624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789343
46	NC_002607	ACC	3	9	2625	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789343
47	NC_002607	CGG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789343
48	NC_002607	TCG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789343
49	NC_002607	GAG	2	6	2790	2795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789343
50	NC_002607	AAC	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789343
51	NC_002607	TGG	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789343
52	NC_002607	TGA	2	6	2932	2937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789343
53	NC_002607	TGC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789343
54	NC_002607	AGC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789343
55	NC_002607	ACC	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789344
56	NC_002607	CTC	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789344
57	NC_002607	TCG	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
58	NC_002607	CGA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
59	NC_002607	TCG	3	9	3485	3493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
60	NC_002607	GCG	2	6	3538	3543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
61	NC_002607	CGC	2	6	3648	3653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
62	NC_002607	TTG	2	6	3658	3663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789344
63	NC_002607	GTC	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
64	NC_002607	CGT	2	6	3717	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
65	NC_002607	TAC	3	9	3742	3750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789344
66	NC_002607	GCA	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
67	NC_002607	GCT	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
68	NC_002607	CTG	2	6	3829	3834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
69	NC_002607	GTG	3	9	3835	3843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789344
70	NC_002607	GCT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
71	NC_002607	CGG	2	6	3867	3872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
72	NC_002607	CGC	3	9	3882	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
73	NC_002607	GTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789344
74	NC_002607	CGG	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
75	NC_002607	CTG	2	6	3949	3954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
76	NC_002607	CCG	2	6	3975	3980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
77	NC_002607	ACC	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789344
78	NC_002607	CGA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
79	NC_002607	CGC	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
80	NC_002607	CGC	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
81	NC_002607	GCT	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
82	NC_002607	CGC	2	6	4295	4300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
83	NC_002607	CGC	2	6	4317	4322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
84	NC_002607	CCG	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
85	NC_002607	GCG	2	6	4337	4342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
86	NC_002607	GCT	2	6	4404	4409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
87	NC_002607	TGC	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
88	NC_002607	CAC	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789344
89	NC_002607	GCG	2	6	4505	4510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
90	NC_002607	CGC	2	6	4512	4517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
91	NC_002607	CGT	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
92	NC_002607	CGA	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
93	NC_002607	AGG	2	6	4568	4573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15789344
94	NC_002607	TCG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
95	NC_002607	ACG	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
96	NC_002607	TCT	3	9	4661	4669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15789344
97	NC_002607	GCT	2	6	4749	4754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
98	NC_002607	GTT	2	6	4776	4781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789344
99	NC_002607	TCG	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
100	NC_002607	GGT	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789344
101	NC_002607	CCG	2	6	4891	4896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
102	NC_002607	TCG	2	6	4915	4920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
103	NC_002607	TCG	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
104	NC_002607	CGC	2	6	5021	5026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
105	NC_002607	CGA	2	6	5052	5057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
106	NC_002607	GCG	2	6	5086	5091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
107	NC_002607	CGA	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
108	NC_002607	CAC	2	6	5118	5123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789344
109	NC_002607	GGT	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15789344
110	NC_002607	ACG	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789344
111	NC_002607	TCC	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15789344
112	NC_002607	CGC	2	6	5271	5276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
113	NC_002607	TCG	2	6	5279	5284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
114	NC_002607	CGT	2	6	5409	5414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789344
115	NC_002607	CCG	2	6	5438	5443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
116	NC_002607	CCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
117	NC_002607	CGG	2	6	5583	5588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
118	NC_002607	CGG	2	6	5603	5608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789344
119	NC_002607	CCG	2	6	5609	5614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789344
120	NC_002607	GGC	2	6	5693	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789345
121	NC_002607	AAC	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15789345
122	NC_002607	GTT	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789345
123	NC_002607	CCA	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789345
124	NC_002607	CCG	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789345
125	NC_002607	AGA	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15789345
126	NC_002607	CTG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789345
127	NC_002607	GCG	3	9	6169	6177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789345
128	NC_002607	CAG	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789345
129	NC_002607	GCG	2	6	6229	6234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789345
130	NC_002607	CGT	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789345
131	NC_002607	TGC	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789345
132	NC_002607	CCA	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15789345
133	NC_002607	GCC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789345
134	NC_002607	ACG	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789345
135	NC_002607	GCT	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789345
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137	NC_002607	CGT	2	6	6788	6793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789345
138	NC_002607	CGA	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789345
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140	NC_002607	CGT	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789345
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143	NC_002607	GAC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789345
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158	NC_002607	CGA	2	6	7690	7695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15789346
159	NC_002607	ACT	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15789346
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162	NC_002607	CGG	2	6	7922	7927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15789346
163	NC_002607	TGA	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15789346
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199	NC_002607	CGC	2	6	9874	9879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
200	NC_002607	CCG	2	6	10121	10126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15789348
201	NC_002607	CGT	2	6	10168	10173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15789348
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243	NC_002607	CTC	2	6	12797	12802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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252	NC_002607	GAC	2	6	13768	13773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_002607	TTG	2	6	14083	14088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15789352
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260	NC_002607	TCC	2	6	14336	14341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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262	NC_002607	CGA	2	6	14460	14465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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