MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 478

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002578	TGAAGA	2	12	5922	5933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081192
2	NC_002578	GAGAGG	2	12	6398	6409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081192
3	NC_002578	AAGGAA	2	12	6665	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082633
4	NC_002578	GCTGAT	2	12	8276	8287	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081193
5	NC_002578	ACGGAA	2	12	8806	8817	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16081193
6	NC_002578	TTGTTA	2	12	16174	16185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16081201
7	NC_002578	ATAAAC	2	12	17180	17191	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16081202
8	NC_002578	CATGAC	2	12	20295	20306	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081204
9	NC_002578	GTAGTT	2	12	35322	35333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16081218
10	NC_002578	CTTGCT	2	12	37242	37253	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081220
11	NC_002578	CTGGCG	2	12	39193	39204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16081221
12	NC_002578	CCTGTG	2	12	41199	41210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082474
13	NC_002578	ATGTTC	2	12	41767	41778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082474
14	NC_002578	TTGATA	2	12	45718	45729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081223
15	NC_002578	AGGCAT	2	12	46074	46085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081224
16	NC_002578	GCTGTT	2	12	47260	47271	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16081225
17	NC_002578	AATAAG	2	12	49057	49068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16081226
18	NC_002578	CGATGA	2	12	51555	51566	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082476
19	NC_002578	ACTTCA	2	12	52772	52783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082477
20	NC_002578	CTATCT	2	12	53298	53309	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16082477
21	NC_002578	CATCAA	2	12	55800	55811	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16081234
22	NC_002578	ACATTG	2	12	56635	56646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081235
23	NC_002578	CTTTTC	2	12	57896	57907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081236
24	NC_002578	ACTTCC	2	12	59834	59845	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16081238
25	NC_002578	AGGGTG	2	12	66890	66901	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	16081241
26	NC_002578	GGCGGA	2	12	70735	70746	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16081245
27	NC_002578	CGAACA	2	12	71966	71977	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16081246
28	NC_002578	CAATGG	2	12	73046	73057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081247
29	NC_002578	GAATGA	2	12	75346	75357	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081249
30	NC_002578	TTGCCT	2	12	76086	76097	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081250
31	NC_002578	ACGTGG	2	12	81095	81106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16081254
32	NC_002578	TGTATA	2	12	82209	82220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081256
33	NC_002578	GCAGAG	2	12	86746	86757	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082481
34	NC_002578	CGATTC	2	12	92699	92710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082482
35	NC_002578	ACATCA	2	12	93794	93805	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16081267
36	NC_002578	CTACAA	2	12	94924	94935	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16081267
37	NC_002578	GGTAAA	2	12	101756	101767	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081275
38	NC_002578	TTTGAA	2	12	109084	109095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081280
39	NC_002578	ACGGAA	2	12	111485	111496	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16081283
40	NC_002578	CATTGT	2	12	115808	115819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081287
41	NC_002578	CTTCAT	2	12	116484	116495	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16081287
42	NC_002578	CGCTGG	2	12	116585	116596	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16081287
43	NC_002578	CCTCTG	2	12	117284	117295	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16081287
44	NC_002578	CCTACT	2	12	121508	121519	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16081290
45	NC_002578	GATCAG	2	12	126895	126906	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081292
46	NC_002578	CCATAT	2	12	136339	136350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081301
47	NC_002578	AAAGAA	2	12	138319	138330	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16081303
48	NC_002578	CGTATG	2	12	139741	139752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081304
49	NC_002578	AGCCTC	2	12	140291	140302	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16081304
50	NC_002578	TACAAT	2	12	143566	143577	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16081307
51	NC_002578	CAAGTC	2	12	144375	144386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081308
52	NC_002578	CTGAAT	2	12	149302	149313	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081310
53	NC_002578	ATCATA	2	12	151798	151809	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16081312
54	NC_002578	CTTTGC	2	12	153134	153145	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081313
55	NC_002578	CGCGAA	2	12	155456	155467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081315
56	NC_002578	ATGATA	2	12	155981	155992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082490
57	NC_002578	ATGACC	2	12	156609	156620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081316
58	NC_002578	TGATCA	2	12	159200	159211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081317
59	NC_002578	TCAACG	2	12	161432	161443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081319
60	NC_002578	CGCTCT	2	12	162039	162050	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16081319
61	NC_002578	ATATGC	2	12	171971	171982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081325
62	NC_002578	CACCTT	2	12	174765	174776	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082492
63	NC_002578	ATTCAG	2	12	183757	183768	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082494
64	NC_002578	CATCCG	2	12	186564	186575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16081338
65	NC_002578	CAAAGG	2	12	199900	199911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16082498
66	NC_002578	TCATCG	2	12	200301	200312	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082498
67	NC_002578	GTTGCG	2	12	200454	200465	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	16082498
68	NC_002578	ATGGAA	2	12	205301	205312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081354
69	NC_002578	GTTGTA	2	12	208228	208239	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16081357
70	NC_002578	GAGGAA	2	12	213394	213405	50 %	0 %	50 %	0 %	16082499
71	NC_002578	AGGGGA	2	12	213561	213572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081361
72	NC_002578	TCGTCT	2	12	218177	218188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081364
73	NC_002578	ATCTCG	2	12	221563	221574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081367
74	NC_002578	TACGAT	2	12	221925	221936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081367
75	NC_002578	CTGTCG	2	12	228174	228185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081372
76	NC_002578	ATGAAA	2	12	231441	231452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16081374
77	NC_002578	CGGCCG	2	12	234199	234210	0 %	0 %	50 %	50 %	16081377
78	NC_002578	TATGAA	2	12	235858	235869	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16081378
79	NC_002578	TATGAA	2	12	239363	239374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16081380
80	NC_002578	GCCAGG	2	12	240126	240137	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16081380
81	NC_002578	TGTAGG	2	12	255344	255355	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16081391
82	NC_002578	GATAAA	2	12	256354	256365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16081392
83	NC_002578	TTAACT	2	12	257602	257613	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16081393
84	NC_002578	CTGATC	2	12	263687	263698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081399
85	NC_002578	GGCGTA	2	12	265929	265940	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16081401
86	NC_002578	CCCTTG	2	12	266456	266467	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16081401
87	NC_002578	GTAAAG	2	12	266911	266922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16082504
88	NC_002578	ATGAAC	2	12	268497	268508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16081402
89	NC_002578	ACAAGA	2	12	268513	268524	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16081402
90	NC_002578	AGACGA	2	12	268912	268923	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16081402
91	NC_002578	ATGGAT	2	12	273015	273026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081405
92	NC_002578	CAAATG	2	12	273609	273620	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16081406
93	NC_002578	TGAAGG	2	12	275564	275575	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16081408
94	NC_002578	ATCAGG	2	12	281057	281068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081412
95	NC_002578	ATATGA	2	12	286051	286062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16081414
96	NC_002578	GGCACC	2	12	289536	289547	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16081417
97	NC_002578	ATTACA	2	12	296075	296086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16081422
98	NC_002578	GTATGC	2	12	297207	297218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081422
99	NC_002578	CGAGGA	2	12	300306	300317	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16081424
100	NC_002578	TTTATC	2	12	307751	307762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16082507
101	NC_002578	CAGCAT	2	12	310951	310962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081429
102	NC_002578	GCCATG	2	12	314271	314282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081432
103	NC_002578	GAGCCA	2	12	318652	318663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081434
104	NC_002578	ATAAAA	2	12	319185	319196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	16081435
105	NC_002578	AGGTTG	2	12	321115	321126	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16081435
106	NC_002578	TCTATG	2	12	325353	325364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081438
107	NC_002578	GTCGAA	2	12	325544	325555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081438
108	NC_002578	CCGGTT	2	12	330307	330318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081444
109	NC_002578	GCCAGA	2	12	332134	332145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081445
110	NC_002578	CCGCTG	2	12	339844	339855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16082511
111	NC_002578	ATTCTG	2	12	358470	358481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081469
112	NC_002578	GGTATG	2	12	361048	361059	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16081471
113	NC_002578	AAATCA	2	12	366853	366864	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16082515
114	NC_002578	TATGTA	2	12	367665	367676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082515
115	NC_002578	ATACTG	2	12	370666	370677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081478
116	NC_002578	GGCACG	2	12	373938	373949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16081480
117	NC_002578	TGAGGT	2	12	385588	385599	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16081494
118	NC_002578	GCAAAG	2	12	387558	387569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16081496
119	NC_002578	AATGGA	2	12	389169	389180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081498
120	NC_002578	CCTCTG	2	12	397601	397612	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16081504
121	NC_002578	TGCCTG	2	12	398916	398927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081505
122	NC_002578	CGTCAA	2	12	412138	412149	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081516
123	NC_002578	AGAGGA	2	12	415903	415914	50 %	0 %	50 %	0 %	16081519
124	NC_002578	AGGTGA	2	12	417617	417628	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16081520
125	NC_002578	TTACCG	2	12	421027	421038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081521
126	NC_002578	CTGAAG	2	12	437105	437116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081533
127	NC_002578	ATGGGC	2	12	437405	437416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16081533
128	NC_002578	CTATTC	2	12	437473	437484	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16081533
129	NC_002578	CTTGCT	2	12	438077	438088	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081533
130	NC_002578	TGCGGG	2	12	438124	438135	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16081533
131	NC_002578	TTGCCG	2	12	442886	442897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082520
132	NC_002578	TTCGGT	2	12	444963	444974	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16081540
133	NC_002578	TGCGCC	2	12	446208	446219	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16081542
134	NC_002578	CTCGAT	2	12	447019	447030	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081543
135	NC_002578	TGCACC	2	12	448108	448119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16081543
136	NC_002578	CAGGGC	2	12	457318	457329	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	16081551
137	NC_002578	CTGGAT	2	12	457394	457405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081551
138	NC_002578	TAACAG	2	12	457450	457461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16081551
139	NC_002578	GAAGGT	2	12	458020	458031	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16081551
140	NC_002578	CGTTCA	2	12	470877	470888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081565
141	NC_002578	GAGCAG	2	12	473385	473396	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16081568
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143	NC_002578	CTTTTT	2	12	476039	476050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	16081569
144	NC_002578	GTACGA	2	12	476939	476950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081572
145	NC_002578	GATCCG	2	12	477273	477284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081572
146	NC_002578	GCCCCT	2	12	478839	478850	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	16082521
147	NC_002578	ACGGCA	2	12	488294	488305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081579
148	NC_002578	ATGAGA	2	12	491655	491666	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081581
149	NC_002578	GATATA	2	12	492642	492653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16081583
150	NC_002578	CGCTGG	2	12	493665	493676	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16081584
151	NC_002578	CTGGCC	2	12	495191	495202	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16081586
152	NC_002578	CATCCA	2	12	503815	503826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16081592
153	NC_002578	AGATCG	2	12	505141	505152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081594
154	NC_002578	CTTTGC	2	12	511463	511474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081599
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168	NC_002578	TGAACC	2	12	539029	539040	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082526
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172	NC_002578	TCAAGC	2	12	544690	544701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081627
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186	NC_002578	AGCGAT	2	12	595304	595315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081668
187	NC_002578	TGGGGC	2	12	609853	609864	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16081683
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189	NC_002578	TGGTTA	2	12	614736	614747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16082647
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193	NC_002578	TCAGGT	2	12	635199	635210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081701
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213	NC_002578	GGTGTT	2	12	716064	716075	0 %	50 %	50 %	0 %	16081764
214	NC_002578	GCATAT	2	12	721041	721052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081768
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218	NC_002578	ATGGAC	2	12	729205	729216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081775
219	NC_002578	AGTATC	2	12	730638	730649	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081776
220	NC_002578	TTGAAT	2	12	737177	737188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081780
221	NC_002578	TGCTTT	2	12	741848	741859	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16081784
222	NC_002578	TAACTA	2	12	752781	752792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16081790
223	NC_002578	TATTGA	2	12	753973	753984	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081790
224	NC_002578	CAATAG	2	12	760266	760277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082550
225	NC_002578	ACATAA	2	12	766761	766772	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16081799
226	NC_002578	CATGAT	2	12	767537	767548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081800
227	NC_002578	AAATAC	2	12	771161	771172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16082649
228	NC_002578	CCCTCC	2	12	781677	781688	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	16081813
229	NC_002578	GCGGAG	2	12	785358	785369	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16082551
230	NC_002578	GATCAG	2	12	787583	787594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081814
231	NC_002578	GCGTCA	2	12	789022	789033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081817
232	NC_002578	AGCAAA	2	12	793992	794003	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16081822
233	NC_002578	GTATGC	2	12	795029	795040	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081823
234	NC_002578	AGCATG	2	12	797963	797974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081826
235	NC_002578	CAGGCC	2	12	800308	800319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16081828
236	NC_002578	ACGTTT	2	12	803962	803973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081832
237	NC_002578	GACATC	2	12	804219	804230	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081833
238	NC_002578	AAGATG	2	12	808014	808025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081836
239	NC_002578	CTGGTC	2	12	816395	816406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081842
240	NC_002578	ATGAGG	2	12	816848	816859	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16081842
241	NC_002578	CTTCAT	2	12	820703	820714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16081844
242	NC_002578	CTTCAC	2	12	820994	821005	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16081844
243	NC_002578	AGAGGA	2	12	822954	822965	50 %	0 %	50 %	0 %	16081846
244	NC_002578	GACGAT	2	12	823897	823908	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081847
245	NC_002578	CCGGAC	2	12	824752	824763	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16081847
246	NC_002578	CGTGAT	2	12	831331	831342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16081852
247	NC_002578	CGGCCT	2	12	834565	834576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16081854
248	NC_002578	CTCTTC	2	12	834639	834650	0 %	50 %	0 %	50 %	16081854
249	NC_002578	TCCTGA	2	12	834877	834888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081854
250	NC_002578	ATGATC	2	12	835812	835823	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082554
251	NC_002578	CGGCCT	2	12	835829	835840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16082554
252	NC_002578	CGGTGA	2	12	835963	835974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082554
253	NC_002578	CACCGT	2	12	837490	837501	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16081855
254	NC_002578	AAGGCC	2	12	840658	840669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081856
255	NC_002578	TCGTTC	2	12	840689	840700	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081856
256	NC_002578	TCCTCA	2	12	841136	841147	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16081856
257	NC_002578	CCATGT	2	12	841341	841352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081856
258	NC_002578	GAAGAC	2	12	844409	844420	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16081857
259	NC_002578	GATCAA	2	12	849547	849558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082651
260	NC_002578	GACAGC	2	12	854099	854110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081861
261	NC_002578	GCCGAC	2	12	854794	854805	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16081862
262	NC_002578	ATCAGG	2	12	856711	856722	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082558
263	NC_002578	CAACCG	2	12	861942	861953	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	16081867
264	NC_002578	CTGAAG	2	12	862667	862678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081867
265	NC_002578	GTACGA	2	12	870277	870288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081873
266	NC_002578	TGTCTA	2	12	874516	874527	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081876
267	NC_002578	TCTGCT	2	12	877836	877847	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081878
268	NC_002578	GGATAA	2	12	880894	880905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081880
269	NC_002578	ATGCGG	2	12	883602	883613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16081883
270	NC_002578	TCCTTC	2	12	887663	887674	0 %	50 %	0 %	50 %	16081885
271	NC_002578	ATTTAT	2	12	892551	892562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081888
272	NC_002578	AGAGGC	2	12	892760	892771	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16081888
273	NC_002578	GCGCTG	2	12	892833	892844	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16081888
274	NC_002578	AGCCAT	2	12	893908	893919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081889
275	NC_002578	GTTAGG	2	12	898934	898945	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16081891
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280	NC_002578	AGGTTG	2	12	911082	911093	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16081900
281	NC_002578	CTTCGA	2	12	911610	911621	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081901
282	NC_002578	TTTATA	2	12	912327	912338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081902
283	NC_002578	AAGCTG	2	12	913475	913486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081903
284	NC_002578	GTGTCC	2	12	915599	915610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081904
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286	NC_002578	GTGGCA	2	12	920675	920686	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16081909
287	NC_002578	CATAAA	2	12	922106	922117	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16081910
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289	NC_002578	ATGAAG	2	12	922787	922798	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081911
290	NC_002578	ACAAAA	2	12	926064	926075	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	16082563
291	NC_002578	GGATCC	2	12	932917	932928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081918
292	NC_002578	CTTATT	2	12	933790	933801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16081920
293	NC_002578	ATAGAG	2	12	934794	934805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16081921
294	NC_002578	GTACGA	2	12	937578	937589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081923
295	NC_002578	AGGAAA	2	12	937640	937651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081923
296	NC_002578	GGCGCC	2	12	941245	941256	0 %	0 %	50 %	50 %	16081927
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300	NC_002578	CTTGCT	2	12	945961	945972	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081931
301	NC_002578	TGTTAA	2	12	947991	948002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081932
302	NC_002578	ATATCG	2	12	950207	950218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081933
303	NC_002578	TGGAGA	2	12	951155	951166	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16081934
304	NC_002578	CAGATT	2	12	960236	960247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081941
305	NC_002578	ATCCAT	2	12	961603	961614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081942
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307	NC_002578	TTCTCG	2	12	968947	968958	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081949
308	NC_002578	GGCCAT	2	12	972646	972657	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081952
309	NC_002578	AACATA	2	12	988080	988091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16081966
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311	NC_002578	CTGAAT	2	12	991374	991385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081970
312	NC_002578	TTTGAA	2	12	999969	999980	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081979
313	NC_002578	TATCGA	2	12	1000526	1000537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081979
314	NC_002578	ATACTC	2	12	1004264	1004275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081981
315	NC_002578	ATTGAT	2	12	1004389	1004400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16081981
316	NC_002578	GGGTAT	2	12	1005793	1005804	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16081983
317	NC_002578	CTTTTT	2	12	1009478	1009489	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	16081986
318	NC_002578	GAGGAA	2	12	1015443	1015454	50 %	0 %	50 %	0 %	16081991
319	NC_002578	CTATTT	2	12	1017991	1018002	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16082653
320	NC_002578	AATGAA	2	12	1028002	1028013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16082003
321	NC_002578	CTATCG	2	12	1031159	1031170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082005
322	NC_002578	TGCATT	2	12	1045500	1045511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082015
323	NC_002578	TCCCTG	2	12	1048530	1048541	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16082018
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326	NC_002578	TATTTT	2	12	1054477	1054488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	16082023
327	NC_002578	TTACCC	2	12	1056711	1056722	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082025
328	NC_002578	ATCATG	2	12	1062074	1062085	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082029
329	NC_002578	GGAAAT	2	12	1063089	1063100	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16082030
330	NC_002578	TTTATC	2	12	1069471	1069482	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16082579
331	NC_002578	ATGAAT	2	12	1074559	1074570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082038
332	NC_002578	TTGATC	2	12	1097878	1097889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082059
333	NC_002578	CCAGCA	2	12	1099090	1099101	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	16082061
334	NC_002578	TAGATT	2	12	1105565	1105576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082067
335	NC_002578	CTATGC	2	12	1106172	1106183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082068
336	NC_002578	TGCCTT	2	12	1108046	1108057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16082069
337	NC_002578	CATACC	2	12	1116509	1116520	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16082076
338	NC_002578	CCACTC	2	12	1116738	1116749	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	16082076
339	NC_002578	CCTCAT	2	12	1124932	1124943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082084
340	NC_002578	TCAACT	2	12	1127148	1127159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082084
341	NC_002578	CATCGG	2	12	1127585	1127596	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082085
342	NC_002578	GTATCT	2	12	1129070	1129081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082085
343	NC_002578	CCTCCG	2	12	1139190	1139201	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	16082093
344	NC_002578	CCTGAT	2	12	1140041	1140052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082093
345	NC_002578	TTTCTG	2	12	1141574	1141585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16082095
346	NC_002578	CCATAG	2	12	1142674	1142685	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082096
347	NC_002578	AGCTTC	2	12	1145235	1145246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082099
348	NC_002578	ATCTAT	2	12	1147548	1147559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082101
349	NC_002578	ATCAGT	2	12	1152800	1152811	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298205267
350	NC_002578	GGCCAT	2	12	1154474	1154485	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082106
351	NC_002578	GGTATT	2	12	1158399	1158410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16082109
352	NC_002578	CGCTCA	2	12	1160433	1160444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16082111
353	NC_002578	GGCAGG	2	12	1161771	1161782	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16082112
354	NC_002578	TGGAAC	2	12	1166760	1166771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082118
355	NC_002578	GCTCAC	2	12	1168747	1168758	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16082120
356	NC_002578	TCATCC	2	12	1169273	1169284	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082120
357	NC_002578	TTATCG	2	12	1169508	1169519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082120
358	NC_002578	CCTATG	2	12	1170763	1170774	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082123
359	NC_002578	TGGATA	2	12	1171781	1171792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082124
360	NC_002578	TCACGT	2	12	1172542	1172553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082124
361	NC_002578	GGACAG	2	12	1175817	1175828	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082125
362	NC_002578	GCATTC	2	12	1177495	1177506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082127
363	NC_002578	GCATAA	2	12	1178016	1178027	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082128
364	NC_002578	TCCTTT	2	12	1178957	1178968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082129
365	NC_002578	ATCCTG	2	12	1182470	1182481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082134
366	NC_002578	CTTTAT	2	12	1182733	1182744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	16082134
367	NC_002578	GATGAC	2	12	1196094	1196105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082148
368	NC_002578	GCCGTG	2	12	1198599	1198610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16082149
369	NC_002578	ATTTCG	2	12	1200382	1200393	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082593
370	NC_002578	ATGGAA	2	12	1200427	1200438	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16082593
371	NC_002578	GTTATG	2	12	1202409	1202420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16082152
372	NC_002578	TATCAG	2	12	1202620	1202631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082153
373	NC_002578	CAGGCT	2	12	1204906	1204917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082153
374	NC_002578	CCTTTC	2	12	1206156	1206167	0 %	50 %	0 %	50 %	16082153
375	NC_002578	CACATG	2	12	1211613	1211624	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082158
376	NC_002578	TGAAAC	2	12	1212771	1212782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082159
377	NC_002578	CCATGT	2	12	1213343	1213354	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082159
378	NC_002578	CCTCAG	2	12	1214780	1214791	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16082160
379	NC_002578	CTATTA	2	12	1215233	1215244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082160
380	NC_002578	ATAGAT	2	12	1222592	1222603	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082657
381	NC_002578	CAGGGG	2	12	1225791	1225802	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	16082167
382	NC_002578	AGCTGG	2	12	1228329	1228340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082169
383	NC_002578	GGCCAT	2	12	1230632	1230643	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082171
384	NC_002578	GGTTGA	2	12	1231191	1231202	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16082172
385	NC_002578	AGTAAA	2	12	1238132	1238143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16082177
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388	NC_002578	CGCCGA	2	12	1244228	1244239	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082658
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394	NC_002578	GATCAG	2	12	1264985	1264996	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082203
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400	NC_002578	AAGGAT	2	12	1275062	1275073	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16082216
401	NC_002578	TTCTCC	2	12	1277023	1277034	0 %	50 %	0 %	50 %	16082598
402	NC_002578	CAGCAT	2	12	1277550	1277561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082598
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408	NC_002578	CCTATG	2	12	1302679	1302690	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082241
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412	NC_002578	CTTGCC	2	12	1312795	1312806	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16082253
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420	NC_002578	GGCCGG	2	12	1344279	1344290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082286
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432	NC_002578	GGATCA	2	12	1372265	1372276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082311
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441	NC_002578	TGCTTC	2	12	1421100	1421111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16082354
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443	NC_002578	GATCTG	2	12	1427658	1427669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16082359
444	NC_002578	CGAAGA	2	12	1428053	1428064	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16082359
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447	NC_002578	ATCCAA	2	12	1443950	1443961	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16082373
448	NC_002578	CTTCGT	2	12	1452996	1453007	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16082380
449	NC_002578	CTAGAC	2	12	1457485	1457496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082382
450	NC_002578	GCCTAT	2	12	1457771	1457782	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082382
451	NC_002578	CGAATA	2	12	1458089	1458100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082619
452	NC_002578	CATGGA	2	12	1458203	1458214	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082619
453	NC_002578	ATGAAG	2	12	1460405	1460416	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16082383
454	NC_002578	CGTGAA	2	12	1461129	1461140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082621
455	NC_002578	CGCCGA	2	12	1464744	1464755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082388
456	NC_002578	TCGGAT	2	12	1469565	1469576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16082392
457	NC_002578	TGTGGG	2	12	1469815	1469826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082392
458	NC_002578	TCATGA	2	12	1471972	1471983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082396
459	NC_002578	CTTCCC	2	12	1474145	1474156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082624
460	NC_002578	ATCTCC	2	12	1476855	1476866	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082398
461	NC_002578	GGTCTT	2	12	1483138	1483149	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16082402
462	NC_002578	GATCGA	2	12	1484995	1485006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082404
463	NC_002578	TTCCTG	2	12	1485970	1485981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16082405
464	NC_002578	GCCTGT	2	12	1489840	1489851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082409
465	NC_002578	AAGGGC	2	12	1503571	1503582	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082423
466	NC_002578	CTGAGG	2	12	1511128	1511139	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082429
467	NC_002578	GATGGA	2	12	1516137	1516148	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	16082432
468	NC_002578	CATCCT	2	12	1524308	1524319	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082440
469	NC_002578	ATTATG	2	12	1534191	1534202	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082446
470	NC_002578	GGAAGA	2	12	1535492	1535503	50 %	0 %	50 %	0 %	16082628
471	NC_002578	TCCTTC	2	12	1539471	1539482	0 %	50 %	0 %	50 %	16082450
472	NC_002578	TTCTCG	2	12	1539774	1539785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16082450
473	NC_002578	GTATCT	2	12	1541088	1541099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082451
474	NC_002578	CCTGAT	2	12	1548411	1548422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082455
475	NC_002578	AAACGT	2	12	1549129	1549140	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082456
476	NC_002578	ATCCTC	2	12	1550408	1550419	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	16082457
477	NC_002578	TGCAGA	2	12	1554651	1554662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082630
478	NC_002578	CCATAT	2	12	1560024	1560035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082465