MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002578	TAAT	2	8	10705	10712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002578	TAAA	2	8	12065	12072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002578	GAAG	2	8	15018	15025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002578	GGAG	2	8	15031	15038	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002578	AGCT	2	8	16751	16758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002578	TCCA	2	8	29244	29251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002578	TTAA	2	8	38843	38850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002578	GATC	2	8	40720	40727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002578	TTAA	2	8	42584	42591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002578	AGGA	2	8	46698	46705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002578	ATTG	2	8	66076	66083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002578	TTCA	2	8	66141	66148	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002578	GAAT	2	8	68285	68292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002578	AAAG	2	8	68400	68407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002578	GATG	2	8	69316	69323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002578	AAGT	2	8	69574	69581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002578	TTGC	2	8	72418	72425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_002578	ATCC	2	8	74731	74738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_002578	ATTC	2	8	74823	74830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_002578	ATAG	2	8	88348	88355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002578	ATTA	2	8	89939	89946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002578	TCGG	2	8	92056	92063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_002578	GGAA	2	8	96338	96345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002578	TTCA	2	8	101970	101977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_002578	TTTA	2	8	117468	117475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002578	AAAT	2	8	117511	117518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002578	TTCA	2	8	119114	119121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_002578	AATT	2	8	122598	122605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002578	TAGT	2	8	129201	129208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002578	TTTA	2	8	145116	145123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002578	GTAA	2	8	146678	146685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002578	CGTA	2	8	146899	146906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_002578	TATC	2	8	147036	147043	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002578	TGCA	2	8	147186	147193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_002578	TGAT	2	8	164060	164067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002578	AATA	2	8	164085	164092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002578	AAAT	2	8	168437	168444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002578	TTAA	2	8	168735	168742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002578	TATT	2	8	173199	173206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002578	AATT	2	8	176885	176892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002578	TCCT	2	8	179036	179043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_002578	ATTG	2	8	181378	181385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002578	TGAA	2	8	183081	183088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002578	GAAC	2	8	184383	184390	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_002578	TGAC	2	8	192293	192300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_002578	CTTT	2	8	192368	192375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002578	CTAG	2	8	192463	192470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_002578	ATTT	2	8	211469	211476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002578	AGAT	2	8	217117	217124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002578	ATGG	2	8	219952	219959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002578	ATTT	2	8	222049	222056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002578	CAGC	2	8	229573	229580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002578	ATTC	2	8	232572	232579	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_002578	ATAA	2	8	235406	235413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002578	TATC	2	8	237237	237244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002578	AATA	2	8	237246	237253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002578	AAGA	2	8	237857	237864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002578	ATAA	2	8	240942	240949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002578	GCAT	3	12	243666	243677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_002578	GATT	2	8	243792	243799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002578	TTTA	2	8	248111	248118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002578	CTGC	2	8	250157	250164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_002578	TTAT	2	8	252562	252569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002578	ATTT	2	8	252573	252580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002578	TTTA	2	8	257991	257998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002578	TCTT	2	8	264336	264343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_002578	CGAT	2	8	264363	264370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_002578	TGCA	2	8	266647	266654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002578	GAAA	2	8	271848	271855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002578	TGAT	2	8	272166	272173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002578	GGAA	2	8	287906	287913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002578	AATG	2	8	288252	288259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002578	GGAT	2	8	288303	288310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002578	ACAG	2	8	293069	293076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_002578	TTTC	2	8	293668	293675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002578	CTAT	2	8	295143	295150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_002578	ACTG	2	8	303818	303825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_002578	TCTA	2	8	306702	306709	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_002578	TTCG	2	8	308670	308677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_002578	TAAA	2	8	325635	325642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002578	GATC	2	8	328902	328909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_002578	CCAT	2	8	330965	330972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002578	ATTT	2	8	340486	340493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002578	ATAA	2	8	346374	346381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002578	TGAT	2	8	352088	352095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002578	TTCT	2	8	353095	353102	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_002578	GATT	2	8	356689	356696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002578	ATCA	2	8	363501	363508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_002578	CATT	2	8	363588	363595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002578	TTTG	2	8	367820	367827	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002578	TTAT	2	8	372383	372390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002578	TTGT	2	8	376669	376676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002578	GATC	2	8	378293	378300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002578	ATAA	2	8	380874	380881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002578	TTTC	2	8	380936	380943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_002578	TAAT	2	8	382122	382129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002578	TGGC	2	8	382241	382248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002578	TTTA	2	8	384292	384299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002578	GAAA	2	8	389911	389918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002578	CGGA	2	8	389959	389966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002578	GAGG	2	8	390069	390076	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002578	CAGC	2	8	391550	391557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002578	CACC	2	8	392049	392056	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_002578	TACT	2	8	392331	392338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_002578	ACTT	2	8	392432	392439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_002578	TTTA	2	8	393779	393786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002578	TCGG	2	8	396590	396597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_002578	AGTT	2	8	397429	397436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002578	TAAA	2	8	397979	397986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002578	TAAA	2	8	402948	402955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002578	ATAA	2	8	403606	403613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002578	CATG	2	8	406831	406838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_002578	TATC	2	8	406867	406874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_002578	ATCA	2	8	406888	406895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_002578	GTTT	2	8	406940	406947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002578	TCTG	2	8	410106	410113	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_002578	ATGC	2	8	413483	413490	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_002578	AGAT	2	8	422678	422685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002578	GGAT	2	8	423425	423432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002578	AATC	2	8	423547	423554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_002578	CTTC	2	8	429803	429810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002578	ATGG	2	8	431988	431995	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002578	ATTC	2	8	432352	432359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002578	GACT	2	8	432475	432482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_002578	GCAT	2	8	435814	435821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_002578	TAAT	2	8	436494	436501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002578	AAAG	2	8	439290	439297	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002578	GATT	2	8	440541	440548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002578	AATA	2	8	448653	448660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002578	AAAT	2	8	454564	454571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002578	TGTA	2	8	456393	456400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002578	AAAT	2	8	456412	456419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002578	TAAA	2	8	459079	459086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002578	ATTT	2	8	466837	466844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002578	TCAT	2	8	467751	467758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002578	CACG	2	8	468344	468351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002578	GATC	2	8	469994	470001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002578	TGGC	2	8	476323	476330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002578	TGAA	2	8	481376	481383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002578	AAAT	2	8	493201	493208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002578	AAAT	2	8	494874	494881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002578	TATC	2	8	495019	495026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002578	ATTT	2	8	502145	502152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002578	TCAT	2	8	504206	504213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_002578	TATG	2	8	504380	504387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002578	ACGG	2	8	509183	509190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_002578	TAAT	2	8	510298	510305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002578	CTGG	2	8	513315	513322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_002578	ATTT	2	8	515179	515186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002578	ATTA	2	8	515200	515207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002578	TAAA	2	8	521995	522002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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