MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 17506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002578	GAA	2	6	238	243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081187
2	NC_002578	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081187
3	NC_002578	AAG	2	6	277	282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081187
4	NC_002578	TGC	2	6	297	302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081187
5	NC_002578	GAA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081187
6	NC_002578	GCA	2	6	392	397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081187
7	NC_002578	GAT	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081187
8	NC_002578	GAA	2	6	546	551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081187
9	NC_002578	GAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081187
10	NC_002578	CAG	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081188
11	NC_002578	GCA	2	6	853	858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081188
12	NC_002578	GAA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081188
13	NC_002578	GTG	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081188
14	NC_002578	ATG	2	6	1286	1291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081188
15	NC_002578	TAC	2	6	1358	1363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081188
16	NC_002578	CTG	2	6	1370	1375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081188
17	NC_002578	CGA	2	6	1399	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081188
18	NC_002578	TAC	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081188
19	NC_002578	AGA	2	6	1623	1628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081188
20	NC_002578	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081188
21	NC_002578	GAG	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081188
22	NC_002578	CTG	2	6	1835	1840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081188
23	NC_002578	GAT	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081188
24	NC_002578	CTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081189
25	NC_002578	ATA	2	6	1934	1939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081189
26	NC_002578	TCT	2	6	1954	1959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081189
27	NC_002578	GAA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081189
28	NC_002578	ATA	2	6	2000	2005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081189
29	NC_002578	GAA	2	6	2023	2028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081189
30	NC_002578	ATG	2	6	2030	2035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081189
31	NC_002578	GAG	3	9	2111	2119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081189
32	NC_002578	AGT	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081190
33	NC_002578	TGT	2	6	2254	2259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081190
34	NC_002578	ATA	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081190
35	NC_002578	AGG	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
36	NC_002578	AGA	2	6	2517	2522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081190
37	NC_002578	GAT	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081190
38	NC_002578	GAT	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081190
39	NC_002578	GAG	2	6	2761	2766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
40	NC_002578	GCC	2	6	2855	2860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081190
41	NC_002578	GAG	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
42	NC_002578	CAC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081190
43	NC_002578	GCG	2	6	3324	3329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081190
44	NC_002578	ACA	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081190
45	NC_002578	GTT	2	6	3455	3460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081190
46	NC_002578	CAC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081190
47	NC_002578	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081190
48	NC_002578	TAC	2	6	3641	3646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081190
49	NC_002578	ACG	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081190
50	NC_002578	GGA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
51	NC_002578	CCG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081190
52	NC_002578	GGA	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
53	NC_002578	GCC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081190
54	NC_002578	AGG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
55	NC_002578	ATC	2	6	4042	4047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081190
56	NC_002578	AGG	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
57	NC_002578	ATA	2	6	4178	4183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081190
58	NC_002578	GGA	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081190
59	NC_002578	GCA	2	6	4198	4203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081190
60	NC_002578	CGA	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081190
61	NC_002578	AAT	2	6	4267	4272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081190
62	NC_002578	CAA	2	6	4314	4319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081190
63	NC_002578	TTG	2	6	4410	4415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081190
64	NC_002578	CAA	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081191
65	NC_002578	ATA	2	6	4767	4772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081191
66	NC_002578	GGA	2	6	4823	4828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081191
67	NC_002578	ATT	2	6	5035	5040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081191
68	NC_002578	ATC	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081191
69	NC_002578	ACT	2	6	5215	5220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081191
70	NC_002578	GCC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081191
71	NC_002578	GAG	2	6	5253	5258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081191
72	NC_002578	GAA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081191
73	NC_002578	CGA	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081191
74	NC_002578	CTC	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081191
75	NC_002578	TGA	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081191
76	NC_002578	GGA	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081191
77	NC_002578	GAG	2	6	5631	5636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081191
78	NC_002578	TTC	2	6	5709	5714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081191
79	NC_002578	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081191
80	NC_002578	GAA	2	6	5828	5833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081191
81	NC_002578	AGG	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081192
82	NC_002578	AAG	2	6	5903	5908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081192
83	NC_002578	AGG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081192
84	NC_002578	TTG	2	6	6009	6014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081192
85	NC_002578	CAT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081192
86	NC_002578	GAT	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081192
87	NC_002578	CTG	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081192
88	NC_002578	GAT	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081192
89	NC_002578	CAC	2	6	6418	6423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081192
90	NC_002578	AGA	3	9	6438	6446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081192
91	NC_002578	GAT	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082633
92	NC_002578	GAG	2	6	6689	6694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082633
93	NC_002578	AGG	2	6	6708	6713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082633
94	NC_002578	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082633
95	NC_002578	GAA	2	6	6816	6821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082633
96	NC_002578	AGG	2	6	6822	6827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082633
97	NC_002578	GAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082633
98	NC_002578	ATA	2	6	6848	6853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082633
99	NC_002578	AGA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082633
100	NC_002578	ATA	2	6	6929	6934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082633
101	NC_002578	GAT	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081193
102	NC_002578	GCA	2	6	7290	7295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081193
103	NC_002578	ATA	2	6	7395	7400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081193
104	NC_002578	GAA	2	6	7460	7465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081193
105	NC_002578	ATA	2	6	7473	7478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081193
106	NC_002578	CAG	2	6	7508	7513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081193
107	NC_002578	TGA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081193
108	NC_002578	AGA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081193
109	NC_002578	GGA	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081193
110	NC_002578	ATA	2	6	7839	7844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081193
111	NC_002578	GCC	2	6	7868	7873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081193
112	NC_002578	AGG	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081193
113	NC_002578	TTC	2	6	7914	7919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081193
114	NC_002578	TTC	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081193
115	NC_002578	CTG	2	6	8037	8042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081193
116	NC_002578	ATA	2	6	8055	8060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081193
117	NC_002578	ATC	2	6	8071	8076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081193
118	NC_002578	TGA	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081193
119	NC_002578	CGC	2	6	8134	8139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081193
120	NC_002578	TAG	2	6	8182	8187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081193
121	NC_002578	TTC	2	6	8217	8222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081193
122	NC_002578	TTC	2	6	8266	8271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081193
123	NC_002578	TGG	2	6	8311	8316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081193
124	NC_002578	ATA	2	6	8565	8570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081193
125	NC_002578	CGT	2	6	8618	8623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081193
126	NC_002578	ATA	2	6	8634	8639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081193
127	NC_002578	TTC	2	6	8787	8792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081193
128	NC_002578	ATA	2	6	9095	9100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081194
129	NC_002578	GGA	2	6	9104	9109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081194
130	NC_002578	ACG	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081194
131	NC_002578	GAA	2	6	9226	9231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081194
132	NC_002578	ATG	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081194
133	NC_002578	AAG	2	6	9280	9285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081194
134	NC_002578	ATG	2	6	9589	9594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082469
135	NC_002578	TAC	2	6	9651	9656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082469
136	NC_002578	GAA	2	6	9797	9802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082469
137	NC_002578	TGA	2	6	9844	9849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082469
138	NC_002578	CTT	2	6	9890	9895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082469
139	NC_002578	GAA	2	6	10023	10028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082469
140	NC_002578	ATT	2	6	10122	10127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082469
141	NC_002578	ATA	2	6	10170	10175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082469
142	NC_002578	GAA	2	6	10202	10207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082469
143	NC_002578	CTG	2	6	10209	10214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082469
144	NC_002578	TGC	2	6	10288	10293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082469
145	NC_002578	CAA	2	6	10355	10360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082469
146	NC_002578	AGA	3	9	10398	10406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082469
147	NC_002578	ATG	2	6	10649	10654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082469
148	NC_002578	TTC	2	6	10777	10782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081195
149	NC_002578	CTT	2	6	10800	10805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081195
150	NC_002578	CCT	2	6	10858	10863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081195
151	NC_002578	ATA	2	6	11169	11174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081195
152	NC_002578	ATG	2	6	11183	11188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081195
153	NC_002578	GAG	2	6	11238	11243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081195
154	NC_002578	TCA	2	6	11336	11341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081195
155	NC_002578	TCG	2	6	11387	11392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081195
156	NC_002578	CAG	2	6	11423	11428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081195
157	NC_002578	GAC	2	6	11436	11441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081195
158	NC_002578	AAG	2	6	11580	11585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081195
159	NC_002578	CCA	2	6	11591	11596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081195
160	NC_002578	ATC	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081195
161	NC_002578	AGA	2	6	11831	11836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081196
162	NC_002578	ATA	2	6	11845	11850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081196
163	NC_002578	TGA	2	6	11922	11927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081196
164	NC_002578	CTT	2	6	12012	12017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081196
165	NC_002578	CAA	2	6	12205	12210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081197
166	NC_002578	TAC	2	6	12590	12595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081197
167	NC_002578	GTT	2	6	12659	12664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081197
168	NC_002578	AAG	2	6	12686	12691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081197
169	NC_002578	ATG	2	6	12754	12759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082470
170	NC_002578	GAA	2	6	12792	12797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082470
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172	NC_002578	CAT	2	6	13016	13021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082470
173	NC_002578	TAC	2	6	13191	13196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082470
174	NC_002578	AAG	2	6	13203	13208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082470
175	NC_002578	GAG	2	6	13239	13244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082470
176	NC_002578	TCC	2	6	13343	13348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081198
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234	NC_002578	CTT	2	6	18215	18220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082634
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236	NC_002578	CAA	2	6	18355	18360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082634
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240	NC_002578	CAT	2	6	18920	18925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082471
241	NC_002578	CTC	2	6	19039	19044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082471
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244	NC_002578	GAA	2	6	19467	19472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082471
245	NC_002578	GCT	2	6	19476	19481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082471
246	NC_002578	CCT	2	6	19575	19580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082471
247	NC_002578	TGA	2	6	19609	19614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082471
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249	NC_002578	GCA	2	6	19893	19898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081204
250	NC_002578	CAG	2	6	19945	19950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081204
251	NC_002578	TGG	2	6	19955	19960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081204
252	NC_002578	GGA	2	6	20014	20019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081204
253	NC_002578	GCA	2	6	20038	20043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081204
254	NC_002578	ACT	2	6	20098	20103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081204
255	NC_002578	ACA	2	6	20118	20123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081204
256	NC_002578	GGC	3	9	20217	20225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081204
257	NC_002578	ATA	2	6	20283	20288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081204
258	NC_002578	CCA	2	6	20502	20507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082472
259	NC_002578	CTG	2	6	20586	20591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082472
260	NC_002578	AAG	2	6	20629	20634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082472
261	NC_002578	GGA	2	6	20668	20673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082472
262	NC_002578	GGC	2	6	20725	20730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082472
263	NC_002578	CTC	2	6	20764	20769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082472
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267	NC_002578	GGT	2	6	21228	21233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081205
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281	NC_002578	GTA	2	6	22344	22349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081205
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289	NC_002578	TCT	2	6	22987	22992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081206
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373	NC_002578	TCT	2	6	30727	30732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081216
374	NC_002578	CAG	3	9	31205	31213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
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379	NC_002578	AGG	3	9	31660	31668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
380	NC_002578	TGA	2	6	31796	31801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
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382	NC_002578	GCC	2	6	31965	31970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082473
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384	NC_002578	GAT	2	6	32160	32165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
385	NC_002578	TGG	2	6	32262	32267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082473
386	NC_002578	TAC	2	6	32361	32366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
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388	NC_002578	AGA	2	6	32505	32510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
389	NC_002578	TCA	3	9	32524	32532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
390	NC_002578	TAC	2	6	32538	32543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
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392	NC_002578	ATA	2	6	32655	32660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082473
393	NC_002578	AGA	2	6	32778	32783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
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