MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 569

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002528	TTTAA	2	10	200	209	40 %	60 %	0 %	0 %	15616631
2	NC_002528	TTAAT	2	10	1698	1707	40 %	60 %	0 %	0 %	15616631
3	NC_002528	ATTTT	2	10	2761	2770	20 %	80 %	0 %	0 %	15616632
4	NC_002528	TTTTA	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	15616632
5	NC_002528	AAAAT	2	10	5470	5479	80 %	20 %	0 %	0 %	15616636
6	NC_002528	ATTAA	2	10	6030	6039	60 %	40 %	0 %	0 %	15616636
7	NC_002528	ATGAA	2	10	7586	7595	60 %	20 %	20 %	0 %	15616638
8	NC_002528	TTTTC	2	10	9692	9701	0 %	80 %	0 %	20 %	15616640
9	NC_002528	TATAT	2	10	9868	9877	40 %	60 %	0 %	0 %	15616640
10	NC_002528	AAAAT	2	10	10594	10603	80 %	20 %	0 %	0 %	15616640
11	NC_002528	TAAGG	2	10	12212	12221	40 %	20 %	40 %	0 %	15616641
12	NC_002528	TTTTC	2	10	12606	12615	0 %	80 %	0 %	20 %	15616642
13	NC_002528	ATTTC	2	10	13392	13401	20 %	60 %	0 %	20 %	15616642
14	NC_002528	TACAA	2	10	14754	14763	60 %	20 %	0 %	20 %	15616644
15	NC_002528	TTTCT	2	10	15054	15063	0 %	80 %	0 %	20 %	15616645
16	NC_002528	TTAGT	2	10	15189	15198	20 %	60 %	20 %	0 %	15616645
17	NC_002528	TATCT	2	10	16579	16588	20 %	60 %	0 %	20 %	15616645
18	NC_002528	CAAAA	2	10	17576	17585	80 %	0 %	0 %	20 %	28952039
19	NC_002528	AACAA	2	10	21167	21176	80 %	0 %	0 %	20 %	15616649
20	NC_002528	ATTTG	2	10	22976	22985	20 %	60 %	20 %	0 %	15616652
21	NC_002528	TAAAA	2	10	23695	23704	80 %	20 %	0 %	0 %	15616653
22	NC_002528	TAATT	2	10	24052	24061	40 %	60 %	0 %	0 %	15616653
23	NC_002528	ATACA	2	10	24579	24588	60 %	20 %	0 %	20 %	15616653
24	NC_002528	TTTCT	2	10	27114	27123	0 %	80 %	0 %	20 %	28952040
25	NC_002528	TAAAC	2	10	27911	27920	60 %	20 %	0 %	20 %	15616656
26	NC_002528	AAAAT	2	10	28439	28448	80 %	20 %	0 %	0 %	15616656
27	NC_002528	AAAAT	2	10	29452	29461	80 %	20 %	0 %	0 %	15616657
28	NC_002528	ATCCA	2	10	34046	34055	40 %	20 %	0 %	40 %	15616660
29	NC_002528	TAAAT	2	10	34649	34658	60 %	40 %	0 %	0 %	15616660
30	NC_002528	CTTGT	2	10	37397	37406	0 %	60 %	20 %	20 %	15616662
31	NC_002528	AAATA	2	10	38222	38231	80 %	20 %	0 %	0 %	15616662
32	NC_002528	TACAT	2	10	39945	39954	40 %	40 %	0 %	20 %	15616662
33	NC_002528	CTTTG	2	10	40256	40265	0 %	60 %	20 %	20 %	15616662
34	NC_002528	TGATC	2	10	40449	40458	20 %	40 %	20 %	20 %	15616662
35	NC_002528	TGTTT	2	10	41688	41697	0 %	80 %	20 %	0 %	15616663
36	NC_002528	TCCAT	2	10	42224	42233	20 %	40 %	0 %	40 %	15616663
37	NC_002528	ATTTT	2	10	43801	43810	20 %	80 %	0 %	0 %	15616663
38	NC_002528	TTTAT	2	10	45688	45697	20 %	80 %	0 %	0 %	15616665
39	NC_002528	GTCAT	2	10	46843	46852	20 %	40 %	20 %	20 %	15616667
40	NC_002528	ATAAA	2	10	47850	47859	80 %	20 %	0 %	0 %	15616669
41	NC_002528	TTTAA	2	10	49003	49012	40 %	60 %	0 %	0 %	15616670
42	NC_002528	ATATT	2	10	49400	49409	40 %	60 %	0 %	0 %	15616670
43	NC_002528	ATTGT	2	10	49594	49603	20 %	60 %	20 %	0 %	15616670
44	NC_002528	GAGCA	2	10	50696	50705	40 %	0 %	40 %	20 %	15616671
45	NC_002528	ATAAA	2	10	50767	50776	80 %	20 %	0 %	0 %	15616671
46	NC_002528	TTTAA	2	10	51050	51059	40 %	60 %	0 %	0 %	15616672
47	NC_002528	AATAA	2	10	51107	51116	80 %	20 %	0 %	0 %	15616672
48	NC_002528	ATTGT	2	10	52648	52657	20 %	60 %	20 %	0 %	15616673
49	NC_002528	TAATT	2	10	53905	53914	40 %	60 %	0 %	0 %	15616674
50	NC_002528	GGAAA	2	10	54560	54569	60 %	0 %	40 %	0 %	15616675
51	NC_002528	GGAAT	2	10	54639	54648	40 %	20 %	40 %	0 %	15616675
52	NC_002528	AATTA	2	10	57068	57077	60 %	40 %	0 %	0 %	15616677
53	NC_002528	ATTAA	2	10	57592	57601	60 %	40 %	0 %	0 %	15616678
54	NC_002528	ATCTA	2	10	57816	57825	40 %	40 %	0 %	20 %	15616678
55	NC_002528	GAAAA	2	10	58182	58191	80 %	0 %	20 %	0 %	15616679
56	NC_002528	CTTTA	2	10	58306	58315	20 %	60 %	0 %	20 %	15616679
57	NC_002528	ATTTA	2	10	58824	58833	40 %	60 %	0 %	0 %	15616679
58	NC_002528	ATATT	2	10	61854	61863	40 %	60 %	0 %	0 %	15616681
59	NC_002528	CAATT	2	10	63574	63583	40 %	40 %	0 %	20 %	15616683
60	NC_002528	TACCG	2	10	64653	64662	20 %	20 %	20 %	40 %	15616684
61	NC_002528	TAATA	2	10	64744	64753	60 %	40 %	0 %	0 %	15616684
62	NC_002528	CATTC	2	10	65348	65357	20 %	40 %	0 %	40 %	15616685
63	NC_002528	AATGC	2	10	66867	66876	40 %	20 %	20 %	20 %	15616686
64	NC_002528	ATATT	2	10	66966	66975	40 %	60 %	0 %	0 %	15616686
65	NC_002528	ATTAA	2	10	67394	67403	60 %	40 %	0 %	0 %	15616686
66	NC_002528	AGAAA	2	10	68896	68905	80 %	0 %	20 %	0 %	15616688
67	NC_002528	ATCCC	2	10	69118	69127	20 %	20 %	0 %	60 %	15616689
68	NC_002528	AAATC	2	10	69265	69274	60 %	20 %	0 %	20 %	15616689
69	NC_002528	CTTTT	2	10	70484	70493	0 %	80 %	0 %	20 %	15616689
70	NC_002528	CATAT	2	10	72026	72035	40 %	40 %	0 %	20 %	15616691
71	NC_002528	TAAAT	2	10	72995	73004	60 %	40 %	0 %	0 %	15616692
72	NC_002528	ATGTT	2	10	75030	75039	20 %	60 %	20 %	0 %	15616693
73	NC_002528	GAAAA	2	10	75752	75761	80 %	0 %	20 %	0 %	15616693
74	NC_002528	TTTTA	2	10	75925	75934	20 %	80 %	0 %	0 %	15616693
75	NC_002528	GAAAA	2	10	76116	76125	80 %	0 %	20 %	0 %	15616693
76	NC_002528	AAATT	2	10	76761	76770	60 %	40 %	0 %	0 %	15616694
77	NC_002528	AATAC	2	10	78523	78532	60 %	20 %	0 %	20 %	15616695
78	NC_002528	TAAAT	2	10	79959	79968	60 %	40 %	0 %	0 %	15616697
79	NC_002528	GCTAT	2	10	81181	81190	20 %	40 %	20 %	20 %	15616698
80	NC_002528	AATTA	2	10	83157	83166	60 %	40 %	0 %	0 %	15616701
81	NC_002528	TTAAT	2	10	83621	83630	40 %	60 %	0 %	0 %	15616702
82	NC_002528	CAAAT	2	10	85400	85409	60 %	20 %	0 %	20 %	15616704
83	NC_002528	TCAAA	2	10	88550	88559	60 %	20 %	0 %	20 %	15616709
84	NC_002528	TTAAA	2	10	89004	89013	60 %	40 %	0 %	0 %	15616709
85	NC_002528	TTTAC	2	10	89075	89084	20 %	60 %	0 %	20 %	15616709
86	NC_002528	TAAAA	2	10	90415	90424	80 %	20 %	0 %	0 %	15616709
87	NC_002528	AAATT	2	10	90716	90725	60 %	40 %	0 %	0 %	15616709
88	NC_002528	GCAAT	2	10	94974	94983	40 %	20 %	20 %	20 %	15616713
89	NC_002528	GAATT	2	10	95106	95115	40 %	40 %	20 %	0 %	15616713
90	NC_002528	AGATC	2	10	96037	96046	40 %	20 %	20 %	20 %	15616714
91	NC_002528	ATATT	2	10	96533	96542	40 %	60 %	0 %	0 %	15616714
92	NC_002528	GATAT	2	10	97266	97275	40 %	40 %	20 %	0 %	15616715
93	NC_002528	TTTTA	2	10	100827	100836	20 %	80 %	0 %	0 %	15616717
94	NC_002528	CAGAA	2	10	102445	102454	60 %	0 %	20 %	20 %	15616718
95	NC_002528	TATTT	2	10	103319	103328	20 %	80 %	0 %	0 %	15616719
96	NC_002528	GAATT	2	10	106640	106649	40 %	40 %	20 %	0 %	15616722
97	NC_002528	TAAAA	2	10	107794	107803	80 %	20 %	0 %	0 %	15616723
98	NC_002528	TAAAA	2	10	107893	107902	80 %	20 %	0 %	0 %	15616723
99	NC_002528	ATTTT	2	10	108951	108960	20 %	80 %	0 %	0 %	15616724
100	NC_002528	TAATT	2	10	110181	110190	40 %	60 %	0 %	0 %	15616726
101	NC_002528	ATTAT	2	10	110508	110517	40 %	60 %	0 %	0 %	15616726
102	NC_002528	ATTTA	2	10	111145	111154	40 %	60 %	0 %	0 %	15616727
103	NC_002528	TGTTT	2	10	116727	116736	0 %	80 %	20 %	0 %	15616731
104	NC_002528	AGTAA	2	10	116818	116827	60 %	20 %	20 %	0 %	15616731
105	NC_002528	GAAAA	2	10	117249	117258	80 %	0 %	20 %	0 %	15616732
106	NC_002528	TATTT	2	10	117878	117887	20 %	80 %	0 %	0 %	15616733
107	NC_002528	ATTTA	2	10	118069	118078	40 %	60 %	0 %	0 %	15616733
108	NC_002528	TAAAA	2	10	119608	119617	80 %	20 %	0 %	0 %	15616735
109	NC_002528	AATAA	2	10	122916	122925	80 %	20 %	0 %	0 %	15616738
110	NC_002528	TAAAC	2	10	123453	123462	60 %	20 %	0 %	20 %	15616739
111	NC_002528	ATTAT	2	10	123912	123921	40 %	60 %	0 %	0 %	28952042
112	NC_002528	AAAGA	2	10	124622	124631	80 %	0 %	20 %	0 %	28952042
113	NC_002528	ATTAA	2	10	124706	124715	60 %	40 %	0 %	0 %	28952042
114	NC_002528	AAAAT	2	10	124772	124781	80 %	20 %	0 %	0 %	28952042
115	NC_002528	ATTTT	2	10	124958	124967	20 %	80 %	0 %	0 %	28952042
116	NC_002528	TAAAA	2	10	125774	125783	80 %	20 %	0 %	0 %	28952042
117	NC_002528	AATTT	2	10	125943	125952	40 %	60 %	0 %	0 %	15616741
118	NC_002528	GAAAA	2	10	126873	126882	80 %	0 %	20 %	0 %	15616741
119	NC_002528	AAAAT	2	10	127511	127520	80 %	20 %	0 %	0 %	15616742
120	NC_002528	TATTG	2	10	128354	128363	20 %	60 %	20 %	0 %	15616743
121	NC_002528	TAAAA	2	10	128903	128912	80 %	20 %	0 %	0 %	15616743
122	NC_002528	GTTCA	2	10	129440	129449	20 %	40 %	20 %	20 %	15616744
123	NC_002528	GCTAT	2	10	130698	130707	20 %	40 %	20 %	20 %	15616745
124	NC_002528	AATAT	2	10	130851	130860	60 %	40 %	0 %	0 %	15616745
125	NC_002528	GGATT	2	10	132539	132548	20 %	40 %	40 %	0 %	15616746
126	NC_002528	TGATT	2	10	132841	132850	20 %	60 %	20 %	0 %	15616746
127	NC_002528	ATTTT	2	10	133490	133499	20 %	80 %	0 %	0 %	15616748
128	NC_002528	ATTTG	2	10	133557	133566	20 %	60 %	20 %	0 %	15616748
129	NC_002528	TATGT	2	10	135158	135167	20 %	60 %	20 %	0 %	15616750
130	NC_002528	AAATA	2	10	135728	135737	80 %	20 %	0 %	0 %	15616750
131	NC_002528	TTATA	2	10	135839	135848	40 %	60 %	0 %	0 %	15616750
132	NC_002528	TCCTT	2	10	135899	135908	0 %	60 %	0 %	40 %	15616750
133	NC_002528	TGATT	2	10	135935	135944	20 %	60 %	20 %	0 %	15616750
134	NC_002528	AATTT	2	10	136371	136380	40 %	60 %	0 %	0 %	15616750
135	NC_002528	TTAAT	2	10	137128	137137	40 %	60 %	0 %	0 %	15616750
136	NC_002528	TTATT	2	10	137606	137615	20 %	80 %	0 %	0 %	15616752
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138	NC_002528	AAGAA	2	10	144771	144780	80 %	0 %	20 %	0 %	15616758
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