MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002528	CAAT	2	8	13938	13945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_002528	TAAA	2	8	14269	14276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002528	TAAA	2	8	18233	18240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002528	AAAT	2	8	20478	20485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002528	CAAT	2	8	20626	20633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_002528	ATTG	2	8	22934	22941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002528	TTAA	2	8	24876	24883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002528	ATTC	2	8	25879	25886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_002528	ATTG	2	8	29264	29271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002528	TTTC	2	8	30308	30315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002528	TTGT	2	8	30390	30397	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002528	AACT	2	8	31068	31075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_002528	TGCT	2	8	31081	31088	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_002528	TTTA	2	8	35624	35631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002528	ATTA	2	8	35754	35761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002528	TAAA	2	8	40578	40585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002528	AATT	2	8	44684	44691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002528	ATTA	2	8	44843	44850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002528	AATT	2	8	45844	45851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002528	AAAG	2	8	45854	45861	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002528	AAGT	2	8	48351	48358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002528	ATTT	2	8	48434	48441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002528	TAAA	2	8	48469	48476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002528	CTAC	2	8	48540	48547	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002528	CTGC	2	8	48822	48829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_002528	AATT	2	8	57416	57423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002528	TGAA	2	8	60800	60807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002528	TAAA	2	8	60862	60869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002528	ATTT	2	8	62730	62737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002528	TTAA	2	8	63094	63101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002528	AATG	2	8	63124	63131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002528	TTTA	2	8	64879	64886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002528	TAAT	2	8	67527	67534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002528	TAAA	2	8	71202	71209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002528	AGAT	2	8	74671	74678	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002528	TTTG	2	8	74712	74719	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002528	TTAT	2	8	76293	76300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002528	TATT	2	8	82282	82289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002528	TAAA	2	8	82325	82332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002528	AATT	2	8	87858	87865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002528	TAAA	2	8	91451	91458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002528	TCAT	2	8	93028	93035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_002528	TTTA	2	8	94298	94305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002528	ATTT	3	12	95786	95797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002528	AAAT	2	8	101457	101464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002528	AATT	2	8	101581	101588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002528	TATT	2	8	101688	101695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002528	AATA	2	8	101883	101890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002528	TATT	2	8	103082	103089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002528	TAAT	2	8	103252	103259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002528	AACA	2	8	103273	103280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_002528	GATA	2	8	111475	111482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002528	TAAT	2	8	115644	115651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002528	ATAA	2	8	121707	121714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002528	ATAA	2	8	125881	125888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002528	TAAT	2	8	125895	125902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002528	ATTA	2	8	127706	127713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002528	AAAT	2	8	128940	128947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002528	TTAA	2	8	128952	128959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002528	TGAT	2	8	130405	130412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002528	TTAA	2	8	130441	130448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002528	TAAA	2	8	133685	133692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002528	CAGA	2	8	143182	143189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002528	AGAA	2	8	143365	143372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002528	ATAA	2	8	143441	143448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002528	ATTT	2	8	145980	145987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002528	AAAT	2	8	146003	146010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002528	TTAT	2	8	146038	146045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002528	ATTT	2	8	148250	148257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002528	TTGT	2	8	149674	149681	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002528	ATTA	2	8	154158	154165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002528	TCTA	2	8	154243	154250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_002528	AAAT	2	8	160602	160609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002528	ATTT	2	8	169330	169337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002528	TAAA	2	8	169338	169345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002528	ATTT	2	8	179941	179948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002528	TAAT	2	8	180313	180320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002528	AATA	2	8	181961	181968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002528	TAAA	2	8	183401	183408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002528	CAAT	2	8	183437	183444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_002528	TAAA	2	8	184436	184443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002528	ATTA	2	8	184489	184496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002528	ATAA	2	8	188311	188318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002528	AAAT	2	8	199823	199830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002528	TAAT	2	8	201183	201190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002528	ATTA	2	8	202156	202163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002528	AGAA	2	8	202192	202199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002528	ATTA	2	8	202224	202231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002528	ATTA	2	8	203023	203030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002528	ACTT	2	8	203565	203572	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_002528	TTTA	2	8	205075	205082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002528	ATTA	2	8	211909	211916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002528	TATT	2	8	211927	211934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002528	AATT	2	8	212016	212023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002528	ATTT	2	8	212254	212261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002528	ACTA	2	8	212334	212341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_002528	TAAT	2	8	212344	212351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002528	ATGT	2	8	214594	214601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002528	TAAA	2	8	215187	215194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002528	TATT	2	8	215308	215315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002528	CTAT	2	8	218613	218620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_002528	ATTT	2	8	218628	218635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002528	ATTA	2	8	218676	218683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002528	ATTA	2	8	223635	223642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002528	TTAA	2	8	229316	229323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002528	ATTA	2	8	231175	231182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002528	ATTT	2	8	232401	232408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002528	ATAA	2	8	232466	232473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002528	TATT	2	8	232506	232513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002528	ATCA	2	8	232579	232586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_002528	ATTT	2	8	233790	233797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002528	ATTT	2	8	235423	235430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002528	ATTT	2	8	246984	246991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002528	AGAA	2	8	248295	248302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002528	TCTA	2	8	250581	250588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_002528	AATT	2	8	250735	250742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002528	CTGC	2	8	251124	251131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002528	AAGT	2	8	251162	251169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002528	TGAG	2	8	251468	251475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002528	ATTA	2	8	251503	251510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002528	TTGA	2	8	251590	251597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002528	TCTA	2	8	251800	251807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_002528	ATAA	2	8	251879	251886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002528	AAAT	2	8	251908	251915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002528	ATAA	2	8	251924	251931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002528	GTTT	2	8	251989	251996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002528	GAAA	2	8	252142	252149	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002528	ACAT	2	8	258647	258654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002528	ATTT	2	8	268308	268315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002528	AATT	2	8	273722	273729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002528	ATTA	2	8	273768	273775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002528	AAAT	2	8	273827	273834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002528	AAGG	2	8	275494	275501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002528	GCCT	2	8	275756	275763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002528	AGTA	2	8	276611	276618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002528	CAAT	2	8	276819	276826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_002528	ACAA	2	8	277890	277897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002528	ATAC	2	8	279290	279297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002528	ATTG	2	8	283416	283423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002528	GTTT	2	8	286375	286382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002528	ATTT	2	8	286415	286422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002528	TACA	2	8	291327	291334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002528	AAAT	2	8	293417	293424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002528	TAAA	2	8	294859	294866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002528	TATT	2	8	296767	296774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002528	ATTA	2	8	297387	297394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002528	AAAT	2	8	297428	297435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002528	AATA	2	8	299912	299919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002528	TTGA	2	8	303940	303947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002528	TTAA	2	8	303948	303955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.