MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 9752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002528	TAA	3	9	24	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002528	ATT	3	9	38	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002528	GTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
4	NC_002528	AGC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616631
5	NC_002528	TCA	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
6	NC_002528	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
7	NC_002528	GGT	2	6	395	400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616631
8	NC_002528	ATG	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616631
9	NC_002528	CTG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616631
10	NC_002528	CTA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
11	NC_002528	AAT	2	6	542	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616631
12	NC_002528	TGT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
13	NC_002528	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616631
14	NC_002528	AGG	2	6	673	678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15616631
15	NC_002528	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616631
16	NC_002528	CGC	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15616631
17	NC_002528	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
18	NC_002528	CAT	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
19	NC_002528	ATA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616631
20	NC_002528	TAG	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616631
21	NC_002528	ACT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
22	NC_002528	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616631
23	NC_002528	TTG	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
24	NC_002528	GCA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616631
25	NC_002528	GAT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616631
26	NC_002528	ACT	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
27	NC_002528	AGA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616631
28	NC_002528	ATT	2	6	1729	1734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
29	NC_002528	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
30	NC_002528	AGA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616631
31	NC_002528	ATC	2	6	1906	1911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
32	NC_002528	TCT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616631
33	NC_002528	GTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
34	NC_002528	GCT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616631
35	NC_002528	TTA	2	6	2039	2044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
36	NC_002528	ATA	2	6	2170	2175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002528	TCA	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616632
38	NC_002528	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616632
39	NC_002528	TCT	2	6	2383	2388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616632
40	NC_002528	ATT	2	6	2390	2395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616632
41	NC_002528	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616632
42	NC_002528	ATT	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616632
43	NC_002528	TGC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616632
44	NC_002528	TGG	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616632
45	NC_002528	TAA	2	6	3020	3025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616632
46	NC_002528	TGG	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616633
47	NC_002528	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616633
48	NC_002528	ATT	2	6	3410	3415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002528	ATT	2	6	3420	3425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002528	CCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15616634
51	NC_002528	ATT	2	6	3581	3586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616634
52	NC_002528	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616634
53	NC_002528	AGA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616634
54	NC_002528	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616634
55	NC_002528	AGT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616634
56	NC_002528	GAT	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616634
57	NC_002528	GTT	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616634
58	NC_002528	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616634
59	NC_002528	AAT	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
60	NC_002528	TTA	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616635
61	NC_002528	TGA	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616635
62	NC_002528	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
63	NC_002528	ATT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616635
64	NC_002528	ATA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
65	NC_002528	CAT	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616635
66	NC_002528	TTC	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616635
67	NC_002528	AAT	2	6	4447	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
68	NC_002528	ATC	2	6	4478	4483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616635
69	NC_002528	TAT	2	6	4619	4624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
70	NC_002528	TAT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
71	NC_002528	TAA	2	6	4697	4702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616636
72	NC_002528	AGT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
73	NC_002528	ATG	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
74	NC_002528	ATT	2	6	5076	5081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
75	NC_002528	ATT	2	6	5142	5147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
76	NC_002528	TGT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616636
77	NC_002528	AGA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616636
78	NC_002528	TAG	3	9	5197	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
79	NC_002528	ATT	2	6	5301	5306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
80	NC_002528	ATG	2	6	5308	5313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
81	NC_002528	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
82	NC_002528	ACC	2	6	5366	5371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15616636
83	NC_002528	TTA	2	6	5418	5423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
84	NC_002528	TAT	2	6	5513	5518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
85	NC_002528	CTA	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616636
86	NC_002528	CTG	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616636
87	NC_002528	ATT	2	6	5682	5687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
88	NC_002528	TGC	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616636
89	NC_002528	GAT	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
90	NC_002528	ATT	2	6	5816	5821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
91	NC_002528	TTG	2	6	5875	5880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616636
92	NC_002528	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616636
93	NC_002528	TGA	2	6	5897	5902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
94	NC_002528	ATT	3	9	5959	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
95	NC_002528	GAA	2	6	5979	5984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616636
96	NC_002528	TAA	2	6	5987	5992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616636
97	NC_002528	TAA	2	6	6078	6083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002528	TGG	2	6	6177	6182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616637
99	NC_002528	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616637
100	NC_002528	ATT	2	6	6242	6247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616637
101	NC_002528	GAA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616637
102	NC_002528	TGG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616637
103	NC_002528	TAT	2	6	6396	6401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616637
104	NC_002528	ATT	2	6	6448	6453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616637
105	NC_002528	ATA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616637
106	NC_002528	ATT	2	6	6661	6666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616637
107	NC_002528	TAA	2	6	6703	6708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616637
108	NC_002528	ATT	2	6	6714	6719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616637
109	NC_002528	GCT	2	6	6821	6826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616637
110	NC_002528	ATA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616637
111	NC_002528	TAG	2	6	6978	6983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002528	AAT	2	6	6993	6998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616638
113	NC_002528	ATC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616638
114	NC_002528	ATT	2	6	7021	7026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616638
115	NC_002528	GTC	2	6	7033	7038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616638
116	NC_002528	CAA	2	6	7126	7131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15616638
117	NC_002528	ATA	2	6	7286	7291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616638
118	NC_002528	GGT	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616638
119	NC_002528	ATG	2	6	7489	7494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616638
120	NC_002528	ACC	2	6	7647	7652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15616638
121	NC_002528	TGA	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616638
122	NC_002528	TAT	2	6	7727	7732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616638
123	NC_002528	ATA	2	6	7739	7744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616638
124	NC_002528	CAG	2	6	7802	7807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616638
125	NC_002528	AGA	2	6	7830	7835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616638
126	NC_002528	CAA	2	6	7865	7870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15616638
127	NC_002528	CTG	2	6	7910	7915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616638
128	NC_002528	CAA	2	6	7940	7945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15616638
129	NC_002528	GTC	2	6	8036	8041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616638
130	NC_002528	ATT	2	6	8131	8136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616638
131	NC_002528	ATT	2	6	8175	8180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616638
132	NC_002528	TAT	2	6	8301	8306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616638
133	NC_002528	TGA	2	6	8319	8324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616638
134	NC_002528	GAA	2	6	8362	8367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616638
135	NC_002528	GTT	2	6	8537	8542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616639
136	NC_002528	GAA	2	6	8595	8600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616639
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138	NC_002528	TGT	2	6	8642	8647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616639
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266	NC_002528	TAA	2	6	16947	16952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28952039
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