MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 2895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002506	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_002506	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002506	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002506	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	15600773
6	NC_002506	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	15600773
7	NC_002506	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	15600773
8	NC_002506	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	15600773
9	NC_002506	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	15600773
10	NC_002506	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	15600773
11	NC_002506	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	15600773
12	NC_002506	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	15600773
13	NC_002506	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	15600773
14	NC_002506	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002506	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	15600774
16	NC_002506	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	15600774
17	NC_002506	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_002506	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	15600776
19	NC_002506	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	15600776
20	NC_002506	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	15600777
21	NC_002506	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	15600777
22	NC_002506	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	15600777
23	NC_002506	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	471193270
24	NC_002506	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	471193270
25	NC_002506	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	471193270
26	NC_002506	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	15600779
27	NC_002506	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	15600779
28	NC_002506	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	15600779
29	NC_002506	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	15600779
30	NC_002506	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	15600779
31	NC_002506	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	15600779
32	NC_002506	GTTA	2	8	8302	8309	25 %	50 %	25 %	0 %	15600780
33	NC_002506	CTTG	2	8	8396	8403	0 %	50 %	25 %	25 %	15600780
34	NC_002506	AGTG	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	15600780
35	NC_002506	AGCA	2	8	8716	8723	50 %	0 %	25 %	25 %	471193271
36	NC_002506	AATG	2	8	9249	9256	50 %	25 %	25 %	0 %	15600782
37	NC_002506	TGGT	2	8	9407	9414	0 %	50 %	50 %	0 %	15600782
38	NC_002506	TCAA	2	8	10010	10017	50 %	25 %	0 %	25 %	15600782
39	NC_002506	GCCA	2	8	10439	10446	25 %	0 %	25 %	50 %	15600782
40	NC_002506	TTGA	2	8	10498	10505	25 %	50 %	25 %	0 %	15600782
41	NC_002506	AGTT	2	8	10746	10753	25 %	50 %	25 %	0 %	15600782
42	NC_002506	GTTG	2	8	11103	11110	0 %	50 %	50 %	0 %	15600782
43	NC_002506	CACG	2	8	11175	11182	25 %	0 %	25 %	50 %	15600782
44	NC_002506	TCAC	2	8	12132	12139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_002506	GTTT	2	8	12722	12729	0 %	75 %	25 %	0 %	15600784
46	NC_002506	ACCA	2	8	13345	13352	50 %	0 %	0 %	50 %	15600784
47	NC_002506	GAGT	2	8	13383	13390	25 %	25 %	50 %	0 %	15600784
48	NC_002506	GTGC	2	8	13462	13469	0 %	25 %	50 %	25 %	15600784
49	NC_002506	GCTG	2	8	13691	13698	0 %	25 %	50 %	25 %	15600784
50	NC_002506	GATG	2	8	14295	14302	25 %	25 %	50 %	0 %	15600784
51	NC_002506	CGAT	2	8	14860	14867	25 %	25 %	25 %	25 %	15600785
52	NC_002506	ATTG	2	8	15223	15230	25 %	50 %	25 %	0 %	15600785
53	NC_002506	TATG	2	8	18873	18880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002506	GGAT	2	8	19127	19134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002506	CAAG	2	8	19600	19607	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_002506	TCAT	2	8	19739	19746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_002506	ATTC	2	8	19866	19873	25 %	50 %	0 %	25 %	15600788
58	NC_002506	GGAA	2	8	20412	20419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002506	TGCC	2	8	20734	20741	0 %	25 %	25 %	50 %	15600789
60	NC_002506	GCGG	2	8	21048	21055	0 %	0 %	75 %	25 %	15600789
61	NC_002506	CGGG	2	8	21605	21612	0 %	0 %	75 %	25 %	15600789
62	NC_002506	GGGC	2	8	21691	21698	0 %	0 %	75 %	25 %	15600789
63	NC_002506	TTTC	2	8	21748	21755	0 %	75 %	0 %	25 %	15600789
64	NC_002506	TTGA	2	8	21960	21967	25 %	50 %	25 %	0 %	15600789
65	NC_002506	CAAC	2	8	22043	22050	50 %	0 %	0 %	50 %	15600789
66	NC_002506	GCAG	2	8	22308	22315	25 %	0 %	50 %	25 %	15600789
67	NC_002506	TGGC	2	8	23625	23632	0 %	25 %	50 %	25 %	15600791
68	NC_002506	ATTG	2	8	23701	23708	25 %	50 %	25 %	0 %	15600791
69	NC_002506	CAAA	2	8	23723	23730	75 %	0 %	0 %	25 %	15600791
70	NC_002506	ATTT	2	8	24179	24186	25 %	75 %	0 %	0 %	15600791
71	NC_002506	ATGA	2	8	25303	25310	50 %	25 %	25 %	0 %	15600791
72	NC_002506	ATCG	2	8	25827	25834	25 %	25 %	25 %	25 %	15600791
73	NC_002506	ATGG	2	8	26271	26278	25 %	25 %	50 %	0 %	15600791
74	NC_002506	TTAT	2	8	26711	26718	25 %	75 %	0 %	0 %	15600792
75	NC_002506	ATTT	2	8	26808	26815	25 %	75 %	0 %	0 %	15600792
76	NC_002506	TGGG	2	8	27010	27017	0 %	25 %	75 %	0 %	15600792
77	NC_002506	TGTT	2	8	27028	27035	0 %	75 %	25 %	0 %	15600792
78	NC_002506	GCGG	2	8	27073	27080	0 %	0 %	75 %	25 %	15600792
79	NC_002506	AAGA	2	8	27130	27137	75 %	0 %	25 %	0 %	15600792
80	NC_002506	ATTG	2	8	27156	27163	25 %	50 %	25 %	0 %	15600792
81	NC_002506	ATTT	2	8	27526	27533	25 %	75 %	0 %	0 %	15600793
82	NC_002506	AATG	2	8	27678	27685	50 %	25 %	25 %	0 %	15600793
83	NC_002506	TGAC	2	8	28215	28222	25 %	25 %	25 %	25 %	15600794
84	NC_002506	ACAA	2	8	28482	28489	75 %	0 %	0 %	25 %	15600794
85	NC_002506	TTGA	2	8	28763	28770	25 %	50 %	25 %	0 %	15600794
86	NC_002506	TAAA	2	8	28948	28955	75 %	25 %	0 %	0 %	15600794
87	NC_002506	TGGT	2	8	31073	31080	0 %	50 %	50 %	0 %	15600796
88	NC_002506	ACTG	2	8	31126	31133	25 %	25 %	25 %	25 %	15600796
89	NC_002506	ATTG	2	8	31698	31705	25 %	50 %	25 %	0 %	15600796
90	NC_002506	TATT	2	8	31965	31972	25 %	75 %	0 %	0 %	15600797
91	NC_002506	TTGG	2	8	32322	32329	0 %	50 %	50 %	0 %	15600797
92	NC_002506	GCAA	2	8	32569	32576	50 %	0 %	25 %	25 %	15600797
93	NC_002506	AATC	2	8	32793	32800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_002506	CAAA	2	8	32926	32933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_002506	ATCG	2	8	33844	33851	25 %	25 %	25 %	25 %	15600798
96	NC_002506	TATG	2	8	34411	34418	25 %	50 %	25 %	0 %	15600798
97	NC_002506	TACG	2	8	34706	34713	25 %	25 %	25 %	25 %	15600798
98	NC_002506	GACA	2	8	35050	35057	50 %	0 %	25 %	25 %	15600798
99	NC_002506	GTGA	2	8	35339	35346	25 %	25 %	50 %	0 %	15600798
100	NC_002506	TTGA	2	8	36118	36125	25 %	50 %	25 %	0 %	15600800
101	NC_002506	AATC	2	8	36934	36941	50 %	25 %	0 %	25 %	15600801
102	NC_002506	GTCA	2	8	37216	37223	25 %	25 %	25 %	25 %	15600801
103	NC_002506	GTTG	2	8	37428	37435	0 %	50 %	50 %	0 %	15600801
104	NC_002506	TGCA	2	8	37514	37521	25 %	25 %	25 %	25 %	15600801
105	NC_002506	TGAT	2	8	37544	37551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002506	TGGT	2	8	37832	37839	0 %	50 %	50 %	0 %	15600802
107	NC_002506	GGTT	2	8	38115	38122	0 %	50 %	50 %	0 %	15600802
108	NC_002506	TATG	2	8	38397	38404	25 %	50 %	25 %	0 %	15600802
109	NC_002506	AACG	2	8	39033	39040	50 %	0 %	25 %	25 %	15600802
110	NC_002506	TGAG	2	8	39795	39802	25 %	25 %	50 %	0 %	15600803
111	NC_002506	AGTG	2	8	40369	40376	25 %	25 %	50 %	0 %	15600804
112	NC_002506	GCAA	2	8	40569	40576	50 %	0 %	25 %	25 %	15600804
113	NC_002506	ACGT	2	8	40731	40738	25 %	25 %	25 %	25 %	15600804
114	NC_002506	TGGA	2	8	41426	41433	25 %	25 %	50 %	0 %	15600804
115	NC_002506	TCGT	2	8	41679	41686	0 %	50 %	25 %	25 %	15600804
116	NC_002506	TGTT	2	8	42027	42034	0 %	75 %	25 %	0 %	15600804
117	NC_002506	CAAG	2	8	43672	43679	50 %	0 %	25 %	25 %	471193272
118	NC_002506	TTTC	2	8	43752	43759	0 %	75 %	0 %	25 %	471193272
119	NC_002506	GTCG	2	8	44131	44138	0 %	25 %	50 %	25 %	15600807
120	NC_002506	CAAA	2	8	44229	44236	75 %	0 %	0 %	25 %	15600807
121	NC_002506	CCGC	2	8	44267	44274	0 %	0 %	25 %	75 %	15600807
122	NC_002506	AGTA	2	8	44442	44449	50 %	25 %	25 %	0 %	15600807
123	NC_002506	AAGT	2	8	45438	45445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002506	AGAA	2	8	46064	46071	75 %	0 %	25 %	0 %	15600808
125	NC_002506	CTTT	2	8	46115	46122	0 %	75 %	0 %	25 %	15600809
126	NC_002506	TGGT	2	8	46288	46295	0 %	50 %	50 %	0 %	15600809
127	NC_002506	TGGG	2	8	46922	46929	0 %	25 %	75 %	0 %	15600810
128	NC_002506	TTTC	2	8	47479	47486	0 %	75 %	0 %	25 %	15600811
129	NC_002506	CATA	2	8	47671	47678	50 %	25 %	0 %	25 %	15600811
130	NC_002506	CAGG	2	8	47713	47720	25 %	0 %	50 %	25 %	15600811
131	NC_002506	TGAG	2	8	48372	48379	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002506	TGGG	2	8	48895	48902	0 %	25 %	75 %	0 %	15600812
133	NC_002506	GTTG	2	8	49519	49526	0 %	50 %	50 %	0 %	15600812
134	NC_002506	CTTT	2	8	49933	49940	0 %	75 %	0 %	25 %	15600812
135	NC_002506	ATCT	2	8	50937	50944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_002506	AGTG	2	8	51298	51305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002506	ATCG	2	8	51752	51759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_002506	TCTG	2	8	52229	52236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_002506	AAGC	2	8	52401	52408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002506	CTCA	2	8	53321	53328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002506	AATC	2	8	53411	53418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_002506	GCGT	2	8	53879	53886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_002506	GAAA	2	8	53970	53977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002506	GATG	2	8	54201	54208	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002506	GATT	2	8	54557	54564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002506	CGTT	2	8	54834	54841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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148	NC_002506	GCAC	2	8	55396	55403	25 %	0 %	25 %	50 %	15600818
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151	NC_002506	GCAT	2	8	56771	56778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_002506	CTTT	2	8	57243	57250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_002506	GAAT	2	8	57335	57342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002506	CTCA	2	8	57894	57901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_002506	GATG	2	8	67105	67112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_002506	TCAA	2	8	68699	68706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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285	NC_002506	TTTA	2	8	102198	102205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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