MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 2244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	15600773
2	NC_002506	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	15600773
3	NC_002506	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	15600773
4	NC_002506	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	15600773
5	NC_002506	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	15600773
6	NC_002506	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	15600773
7	NC_002506	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	15600773
8	NC_002506	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	15600773
9	NC_002506	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	15600773
10	NC_002506	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	15600774
11	NC_002506	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	15600774
12	NC_002506	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	15600776
13	NC_002506	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	15600776
14	NC_002506	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	15600777
15	NC_002506	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	15600777
16	NC_002506	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	15600777
17	NC_002506	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	471193270
18	NC_002506	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	471193270
19	NC_002506	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	471193270
20	NC_002506	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	15600779
21	NC_002506	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	15600779
22	NC_002506	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	15600779
23	NC_002506	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	15600779
24	NC_002506	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	15600779
25	NC_002506	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	15600779
26	NC_002506	GTTA	2	8	8302	8309	25 %	50 %	25 %	0 %	15600780
27	NC_002506	CTTG	2	8	8396	8403	0 %	50 %	25 %	25 %	15600780
28	NC_002506	AGTG	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	15600780
29	NC_002506	AGCA	2	8	8716	8723	50 %	0 %	25 %	25 %	471193271
30	NC_002506	AATG	2	8	9249	9256	50 %	25 %	25 %	0 %	15600782
31	NC_002506	TGGT	2	8	9407	9414	0 %	50 %	50 %	0 %	15600782
32	NC_002506	TCAA	2	8	10010	10017	50 %	25 %	0 %	25 %	15600782
33	NC_002506	GCCA	2	8	10439	10446	25 %	0 %	25 %	50 %	15600782
34	NC_002506	TTGA	2	8	10498	10505	25 %	50 %	25 %	0 %	15600782
35	NC_002506	AGTT	2	8	10746	10753	25 %	50 %	25 %	0 %	15600782
36	NC_002506	GTTG	2	8	11103	11110	0 %	50 %	50 %	0 %	15600782
37	NC_002506	CACG	2	8	11175	11182	25 %	0 %	25 %	50 %	15600782
38	NC_002506	GTTT	2	8	12722	12729	0 %	75 %	25 %	0 %	15600784
39	NC_002506	ACCA	2	8	13345	13352	50 %	0 %	0 %	50 %	15600784
40	NC_002506	GAGT	2	8	13383	13390	25 %	25 %	50 %	0 %	15600784
41	NC_002506	GTGC	2	8	13462	13469	0 %	25 %	50 %	25 %	15600784
42	NC_002506	GCTG	2	8	13691	13698	0 %	25 %	50 %	25 %	15600784
43	NC_002506	GATG	2	8	14295	14302	25 %	25 %	50 %	0 %	15600784
44	NC_002506	CGAT	2	8	14860	14867	25 %	25 %	25 %	25 %	15600785
45	NC_002506	ATTG	2	8	15223	15230	25 %	50 %	25 %	0 %	15600785
46	NC_002506	ATTC	2	8	19866	19873	25 %	50 %	0 %	25 %	15600788
47	NC_002506	TGCC	2	8	20734	20741	0 %	25 %	25 %	50 %	15600789
48	NC_002506	GCGG	2	8	21048	21055	0 %	0 %	75 %	25 %	15600789
49	NC_002506	CGGG	2	8	21605	21612	0 %	0 %	75 %	25 %	15600789
50	NC_002506	GGGC	2	8	21691	21698	0 %	0 %	75 %	25 %	15600789
51	NC_002506	TTTC	2	8	21748	21755	0 %	75 %	0 %	25 %	15600789
52	NC_002506	TTGA	2	8	21960	21967	25 %	50 %	25 %	0 %	15600789
53	NC_002506	CAAC	2	8	22043	22050	50 %	0 %	0 %	50 %	15600789
54	NC_002506	GCAG	2	8	22308	22315	25 %	0 %	50 %	25 %	15600789
55	NC_002506	TGGC	2	8	23625	23632	0 %	25 %	50 %	25 %	15600791
56	NC_002506	ATTG	2	8	23701	23708	25 %	50 %	25 %	0 %	15600791
57	NC_002506	CAAA	2	8	23723	23730	75 %	0 %	0 %	25 %	15600791
58	NC_002506	ATTT	2	8	24179	24186	25 %	75 %	0 %	0 %	15600791
59	NC_002506	ATGA	2	8	25303	25310	50 %	25 %	25 %	0 %	15600791
60	NC_002506	ATCG	2	8	25827	25834	25 %	25 %	25 %	25 %	15600791
61	NC_002506	ATGG	2	8	26271	26278	25 %	25 %	50 %	0 %	15600791
62	NC_002506	TTAT	2	8	26711	26718	25 %	75 %	0 %	0 %	15600792
63	NC_002506	ATTT	2	8	26808	26815	25 %	75 %	0 %	0 %	15600792
64	NC_002506	TGGG	2	8	27010	27017	0 %	25 %	75 %	0 %	15600792
65	NC_002506	TGTT	2	8	27028	27035	0 %	75 %	25 %	0 %	15600792
66	NC_002506	GCGG	2	8	27073	27080	0 %	0 %	75 %	25 %	15600792
67	NC_002506	AAGA	2	8	27130	27137	75 %	0 %	25 %	0 %	15600792
68	NC_002506	ATTG	2	8	27156	27163	25 %	50 %	25 %	0 %	15600792
69	NC_002506	ATTT	2	8	27526	27533	25 %	75 %	0 %	0 %	15600793
70	NC_002506	AATG	2	8	27678	27685	50 %	25 %	25 %	0 %	15600793
71	NC_002506	TGAC	2	8	28215	28222	25 %	25 %	25 %	25 %	15600794
72	NC_002506	ACAA	2	8	28482	28489	75 %	0 %	0 %	25 %	15600794
73	NC_002506	TTGA	2	8	28763	28770	25 %	50 %	25 %	0 %	15600794
74	NC_002506	TAAA	2	8	28948	28955	75 %	25 %	0 %	0 %	15600794
75	NC_002506	TGGT	2	8	31073	31080	0 %	50 %	50 %	0 %	15600796
76	NC_002506	ACTG	2	8	31126	31133	25 %	25 %	25 %	25 %	15600796
77	NC_002506	ATTG	2	8	31698	31705	25 %	50 %	25 %	0 %	15600796
78	NC_002506	TATT	2	8	31965	31972	25 %	75 %	0 %	0 %	15600797
79	NC_002506	TTGG	2	8	32322	32329	0 %	50 %	50 %	0 %	15600797
80	NC_002506	GCAA	2	8	32569	32576	50 %	0 %	25 %	25 %	15600797
81	NC_002506	ATCG	2	8	33844	33851	25 %	25 %	25 %	25 %	15600798
82	NC_002506	TATG	2	8	34411	34418	25 %	50 %	25 %	0 %	15600798
83	NC_002506	TACG	2	8	34706	34713	25 %	25 %	25 %	25 %	15600798
84	NC_002506	GACA	2	8	35050	35057	50 %	0 %	25 %	25 %	15600798
85	NC_002506	GTGA	2	8	35339	35346	25 %	25 %	50 %	0 %	15600798
86	NC_002506	TTGA	2	8	36118	36125	25 %	50 %	25 %	0 %	15600800
87	NC_002506	AATC	2	8	36934	36941	50 %	25 %	0 %	25 %	15600801
88	NC_002506	GTCA	2	8	37216	37223	25 %	25 %	25 %	25 %	15600801
89	NC_002506	GTTG	2	8	37428	37435	0 %	50 %	50 %	0 %	15600801
90	NC_002506	TGCA	2	8	37514	37521	25 %	25 %	25 %	25 %	15600801
91	NC_002506	TGGT	2	8	37832	37839	0 %	50 %	50 %	0 %	15600802
92	NC_002506	GGTT	2	8	38115	38122	0 %	50 %	50 %	0 %	15600802
93	NC_002506	TATG	2	8	38397	38404	25 %	50 %	25 %	0 %	15600802
94	NC_002506	AACG	2	8	39033	39040	50 %	0 %	25 %	25 %	15600802
95	NC_002506	TGAG	2	8	39795	39802	25 %	25 %	50 %	0 %	15600803
96	NC_002506	AGTG	2	8	40369	40376	25 %	25 %	50 %	0 %	15600804
97	NC_002506	GCAA	2	8	40569	40576	50 %	0 %	25 %	25 %	15600804
98	NC_002506	ACGT	2	8	40731	40738	25 %	25 %	25 %	25 %	15600804
99	NC_002506	TGGA	2	8	41426	41433	25 %	25 %	50 %	0 %	15600804
100	NC_002506	TCGT	2	8	41679	41686	0 %	50 %	25 %	25 %	15600804
101	NC_002506	TGTT	2	8	42027	42034	0 %	75 %	25 %	0 %	15600804
102	NC_002506	CAAG	2	8	43672	43679	50 %	0 %	25 %	25 %	471193272
103	NC_002506	TTTC	2	8	43752	43759	0 %	75 %	0 %	25 %	471193272
104	NC_002506	GTCG	2	8	44131	44138	0 %	25 %	50 %	25 %	15600807
105	NC_002506	CAAA	2	8	44229	44236	75 %	0 %	0 %	25 %	15600807
106	NC_002506	CCGC	2	8	44267	44274	0 %	0 %	25 %	75 %	15600807
107	NC_002506	AGTA	2	8	44442	44449	50 %	25 %	25 %	0 %	15600807
108	NC_002506	AGAA	2	8	46064	46071	75 %	0 %	25 %	0 %	15600808
109	NC_002506	CTTT	2	8	46115	46122	0 %	75 %	0 %	25 %	15600809
110	NC_002506	TGGT	2	8	46288	46295	0 %	50 %	50 %	0 %	15600809
111	NC_002506	TGGG	2	8	46922	46929	0 %	25 %	75 %	0 %	15600810
112	NC_002506	TTTC	2	8	47479	47486	0 %	75 %	0 %	25 %	15600811
113	NC_002506	CATA	2	8	47671	47678	50 %	25 %	0 %	25 %	15600811
114	NC_002506	CAGG	2	8	47713	47720	25 %	0 %	50 %	25 %	15600811
115	NC_002506	TGGG	2	8	48895	48902	0 %	25 %	75 %	0 %	15600812
116	NC_002506	GTTG	2	8	49519	49526	0 %	50 %	50 %	0 %	15600812
117	NC_002506	CTTT	2	8	49933	49940	0 %	75 %	0 %	25 %	15600812
118	NC_002506	GACA	2	8	55341	55348	50 %	0 %	25 %	25 %	15600818
119	NC_002506	GCAC	2	8	55396	55403	25 %	0 %	25 %	50 %	15600818
120	NC_002506	AATG	2	8	56314	56321	50 %	25 %	25 %	0 %	15600819
121	NC_002506	AGTG	2	8	58400	58407	25 %	25 %	50 %	0 %	15600822
122	NC_002506	AGCC	2	8	58984	58991	25 %	0 %	25 %	50 %	15600822
123	NC_002506	CAAT	2	8	59141	59148	50 %	25 %	0 %	25 %	15600822
124	NC_002506	GTGG	2	8	59182	59189	0 %	25 %	75 %	0 %	15600822
125	NC_002506	CAGG	2	8	59370	59377	25 %	0 %	50 %	25 %	15600822
126	NC_002506	CCCG	2	8	59915	59922	0 %	0 %	25 %	75 %	471193273
127	NC_002506	TGCC	2	8	60152	60159	0 %	25 %	25 %	50 %	471193273
128	NC_002506	ATCA	2	8	60713	60720	50 %	25 %	0 %	25 %	471193273
129	NC_002506	GATT	2	8	60781	60788	25 %	50 %	25 %	0 %	471193273
130	NC_002506	GTTC	2	8	61057	61064	0 %	50 %	25 %	25 %	471193273
131	NC_002506	AGAT	2	8	61313	61320	50 %	25 %	25 %	0 %	161582046
132	NC_002506	CAAT	2	8	61796	61803	50 %	25 %	0 %	25 %	161582046
133	NC_002506	CTTG	2	8	61913	61920	0 %	50 %	25 %	25 %	161582046
134	NC_002506	GTTT	2	8	62471	62478	0 %	75 %	25 %	0 %	15600826
135	NC_002506	GGGT	2	8	63169	63176	0 %	25 %	75 %	0 %	15600826
136	NC_002506	CGTG	2	8	63367	63374	0 %	25 %	50 %	25 %	15600827
137	NC_002506	GTTG	2	8	63470	63477	0 %	50 %	50 %	0 %	15600827
138	NC_002506	GAGT	2	8	63534	63541	25 %	25 %	50 %	0 %	15600827
139	NC_002506	GGAT	2	8	65116	65123	25 %	25 %	50 %	0 %	15600828
140	NC_002506	TGAT	2	8	65216	65223	25 %	50 %	25 %	0 %	15600828
141	NC_002506	GTCA	2	8	65311	65318	25 %	25 %	25 %	25 %	15600828
142	NC_002506	GATT	2	8	65993	66000	25 %	50 %	25 %	0 %	15600829
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