MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 13202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002506	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002506	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002506	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_002506	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002506	AGC	3	9	309	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002506	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_002506	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002506	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002506	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_002506	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002506	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_002506	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002506	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002506	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002506	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002506	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002506	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600773
19	NC_002506	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600773
20	NC_002506	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600773
21	NC_002506	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600773
22	NC_002506	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
23	NC_002506	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600773
24	NC_002506	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
25	NC_002506	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
26	NC_002506	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
27	NC_002506	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600773
28	NC_002506	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600773
29	NC_002506	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600773
30	NC_002506	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600773
31	NC_002506	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
32	NC_002506	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600773
33	NC_002506	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600773
34	NC_002506	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600773
35	NC_002506	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
36	NC_002506	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
37	NC_002506	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
38	NC_002506	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600773
39	NC_002506	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600773
40	NC_002506	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600773
41	NC_002506	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002506	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_002506	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002506	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600774
45	NC_002506	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600774
46	NC_002506	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600774
47	NC_002506	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600774
48	NC_002506	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600774
49	NC_002506	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600774
50	NC_002506	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600775
51	NC_002506	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600775
52	NC_002506	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600775
53	NC_002506	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600775
54	NC_002506	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600775
55	NC_002506	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600776
56	NC_002506	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002506	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600777
58	NC_002506	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600777
59	NC_002506	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600777
60	NC_002506	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600777
61	NC_002506	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600777
62	NC_002506	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600777
63	NC_002506	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600777
64	NC_002506	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600777
65	NC_002506	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600777
66	NC_002506	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600777
67	NC_002506	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193270
68	NC_002506	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193270
69	NC_002506	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193270
70	NC_002506	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193270
71	NC_002506	CAT	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193270
72	NC_002506	GTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193270
73	NC_002506	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193270
74	NC_002506	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193270
75	NC_002506	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193270
76	NC_002506	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002506	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600779
78	NC_002506	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600779
79	NC_002506	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600779
80	NC_002506	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600779
81	NC_002506	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
82	NC_002506	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600779
83	NC_002506	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600779
84	NC_002506	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600779
85	NC_002506	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
86	NC_002506	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600779
87	NC_002506	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600779
88	NC_002506	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600779
89	NC_002506	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600779
90	NC_002506	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
91	NC_002506	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600779
92	NC_002506	TCG	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
93	NC_002506	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600779
94	NC_002506	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600779
95	NC_002506	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600779
96	NC_002506	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600779
97	NC_002506	TAA	2	6	8449	8454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600780
98	NC_002506	CAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193271
99	NC_002506	CAA	2	6	8584	8589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471193271
100	NC_002506	CAA	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471193271
101	NC_002506	GCC	2	6	8612	8617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193271
102	NC_002506	ACC	2	6	8854	8859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471193271
103	NC_002506	TGA	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193271
104	NC_002506	TAG	2	6	8987	8992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600782
105	NC_002506	CTT	2	6	9030	9035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600782
106	NC_002506	TGG	2	6	9087	9092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
107	NC_002506	TCA	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
108	NC_002506	GTG	2	6	9272	9277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
109	NC_002506	AGC	2	6	9290	9295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
110	NC_002506	CAG	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
111	NC_002506	TGC	2	6	9369	9374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
112	NC_002506	ATC	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
113	NC_002506	CAG	2	6	9475	9480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
114	NC_002506	CAG	2	6	9712	9717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
115	NC_002506	GCA	2	6	9966	9971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
116	NC_002506	TGC	2	6	10001	10006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
117	NC_002506	AGT	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600782
118	NC_002506	CTG	2	6	10147	10152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
119	NC_002506	CAT	2	6	10153	10158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
120	NC_002506	TGG	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
121	NC_002506	CGC	2	6	10387	10392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600782
122	NC_002506	CAT	2	6	10413	10418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
123	NC_002506	GCA	2	6	10452	10457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
124	NC_002506	GCG	2	6	10488	10493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600782
125	NC_002506	CGC	2	6	10507	10512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600782
126	NC_002506	CAG	2	6	10576	10581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
127	NC_002506	TGA	2	6	10619	10624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600782
128	NC_002506	GGC	3	9	10651	10659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600782
129	NC_002506	CAT	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
130	NC_002506	GCT	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
131	NC_002506	TCG	2	6	10901	10906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
132	NC_002506	CTT	2	6	10920	10925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600782
133	NC_002506	TGC	2	6	11003	11008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
134	NC_002506	GTC	2	6	11120	11125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
135	NC_002506	ACC	2	6	11225	11230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600782
136	NC_002506	TCA	2	6	11288	11293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
137	NC_002506	GGT	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
138	NC_002506	CAC	2	6	11317	11322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600782
139	NC_002506	TTA	2	6	11444	11449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600782
140	NC_002506	GCA	2	6	11457	11462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
141	NC_002506	ATC	2	6	11497	11502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
142	NC_002506	ACC	2	6	11511	11516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600782
143	NC_002506	TGG	2	6	11553	11558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
144	NC_002506	CGG	2	6	11571	11576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600782
145	NC_002506	TGC	2	6	11612	11617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
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147	NC_002506	TCT	2	6	11858	11863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_002506	TAC	2	6	11879	11884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_002506	AAC	2	6	11974	11979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_002506	ATT	2	6	11986	11991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002506	GGT	2	6	12073	12078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002506	CTC	3	9	12169	12177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_002506	TGA	2	6	12183	12188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002506	GGA	2	6	12197	12202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002506	AAG	2	6	12301	12306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600784
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158	NC_002506	GAA	2	6	12601	12606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600784
159	NC_002506	CAT	2	6	12617	12622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600784
160	NC_002506	GGT	2	6	12631	12636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600784
161	NC_002506	GCC	2	6	12649	12654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600784
162	NC_002506	GCG	2	6	12673	12678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600784
163	NC_002506	GAA	2	6	12742	12747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600784
164	NC_002506	AAG	2	6	12758	12763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600784
165	NC_002506	GTC	2	6	12856	12861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600784
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172	NC_002506	CTG	2	6	13405	13410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600784
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228	NC_002506	CAA	2	6	17226	17231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
229	NC_002506	TGG	2	6	17350	17355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_002506	GAT	2	6	17485	17490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_002506	GGC	2	6	18622	18627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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250	NC_002506	CAG	2	6	19305	19310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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254	NC_002506	GTG	2	6	19524	19529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_002506	CAC	2	6	20113	20118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600788
261	NC_002506	TGA	2	6	20269	20274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600788
262	NC_002506	GGC	2	6	20334	20339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_002506	TGG	2	6	20479	20484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600789
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