MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 10986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600773
2	NC_002506	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600773
3	NC_002506	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600773
4	NC_002506	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600773
5	NC_002506	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
6	NC_002506	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600773
7	NC_002506	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
8	NC_002506	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
9	NC_002506	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
10	NC_002506	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600773
11	NC_002506	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600773
12	NC_002506	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600773
13	NC_002506	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600773
14	NC_002506	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
15	NC_002506	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600773
16	NC_002506	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600773
17	NC_002506	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600773
18	NC_002506	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
19	NC_002506	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600773
20	NC_002506	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600773
21	NC_002506	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600773
22	NC_002506	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600773
23	NC_002506	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600773
24	NC_002506	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600774
25	NC_002506	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600774
26	NC_002506	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600774
27	NC_002506	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600774
28	NC_002506	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600774
29	NC_002506	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600774
30	NC_002506	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600775
31	NC_002506	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600775
32	NC_002506	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600775
33	NC_002506	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600775
34	NC_002506	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600775
35	NC_002506	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600776
36	NC_002506	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600777
37	NC_002506	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600777
38	NC_002506	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600777
39	NC_002506	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600777
40	NC_002506	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600777
41	NC_002506	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600777
42	NC_002506	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600777
43	NC_002506	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600777
44	NC_002506	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600777
45	NC_002506	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600777
46	NC_002506	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193270
47	NC_002506	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193270
48	NC_002506	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471193270
49	NC_002506	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193270
50	NC_002506	CAT	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193270
51	NC_002506	GTG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193270
52	NC_002506	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193270
53	NC_002506	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193270
54	NC_002506	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193270
55	NC_002506	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600779
56	NC_002506	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600779
57	NC_002506	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600779
58	NC_002506	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600779
59	NC_002506	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
60	NC_002506	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600779
61	NC_002506	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600779
62	NC_002506	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600779
63	NC_002506	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
64	NC_002506	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600779
65	NC_002506	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600779
66	NC_002506	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600779
67	NC_002506	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600779
68	NC_002506	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
69	NC_002506	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600779
70	NC_002506	TCG	2	6	7955	7960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600779
71	NC_002506	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600779
72	NC_002506	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600779
73	NC_002506	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600779
74	NC_002506	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600779
75	NC_002506	TAA	2	6	8449	8454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600780
76	NC_002506	CAT	2	6	8559	8564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193271
77	NC_002506	CAA	2	6	8584	8589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471193271
78	NC_002506	CAA	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471193271
79	NC_002506	GCC	2	6	8612	8617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471193271
80	NC_002506	ACC	2	6	8854	8859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471193271
81	NC_002506	TGA	2	6	8888	8893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193271
82	NC_002506	TAG	2	6	8987	8992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600782
83	NC_002506	CTT	2	6	9030	9035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600782
84	NC_002506	TGG	2	6	9087	9092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
85	NC_002506	TCA	2	6	9242	9247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
86	NC_002506	GTG	2	6	9272	9277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
87	NC_002506	AGC	2	6	9290	9295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
88	NC_002506	CAG	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
89	NC_002506	TGC	2	6	9369	9374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
90	NC_002506	ATC	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
91	NC_002506	CAG	2	6	9475	9480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
92	NC_002506	CAG	2	6	9712	9717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
93	NC_002506	GCA	2	6	9966	9971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
94	NC_002506	TGC	2	6	10001	10006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
95	NC_002506	AGT	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600782
96	NC_002506	CTG	2	6	10147	10152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
97	NC_002506	CAT	2	6	10153	10158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
98	NC_002506	TGG	2	6	10350	10355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
99	NC_002506	CGC	2	6	10387	10392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600782
100	NC_002506	CAT	2	6	10413	10418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
101	NC_002506	GCA	2	6	10452	10457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
102	NC_002506	GCG	2	6	10488	10493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600782
103	NC_002506	CGC	2	6	10507	10512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600782
104	NC_002506	CAG	2	6	10576	10581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
105	NC_002506	TGA	2	6	10619	10624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600782
106	NC_002506	GGC	3	9	10651	10659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600782
107	NC_002506	CAT	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
108	NC_002506	GCT	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
109	NC_002506	TCG	2	6	10901	10906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
110	NC_002506	CTT	2	6	10920	10925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600782
111	NC_002506	TGC	2	6	11003	11008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
112	NC_002506	GTC	2	6	11120	11125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
113	NC_002506	ACC	2	6	11225	11230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600782
114	NC_002506	TCA	2	6	11288	11293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
115	NC_002506	GGT	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
116	NC_002506	CAC	2	6	11317	11322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600782
117	NC_002506	TTA	2	6	11444	11449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600782
118	NC_002506	GCA	2	6	11457	11462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600782
119	NC_002506	ATC	2	6	11497	11502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600782
120	NC_002506	ACC	2	6	11511	11516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600782
121	NC_002506	TGG	2	6	11553	11558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600782
122	NC_002506	CGG	2	6	11571	11576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600782
123	NC_002506	TGC	2	6	11612	11617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600782
124	NC_002506	TCT	2	6	11694	11699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600782
125	NC_002506	AAG	2	6	12301	12306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600784
126	NC_002506	ACG	2	6	12418	12423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600784
127	NC_002506	CAA	2	6	12519	12524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600784
128	NC_002506	GAA	2	6	12601	12606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600784
129	NC_002506	CAT	2	6	12617	12622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600784
130	NC_002506	GGT	2	6	12631	12636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600784
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133	NC_002506	GAA	2	6	12742	12747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600784
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255	NC_002506	TCA	2	6	24408	24413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600791
256	NC_002506	GCA	3	9	24459	24467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600791
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259	NC_002506	TGA	2	6	24564	24569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600791
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380	NC_002506	TGG	2	6	35714	35719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600799
381	NC_002506	GAC	2	6	35726	35731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600799
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383	NC_002506	GCT	2	6	36099	36104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600800
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402	NC_002506	CGC	2	6	37918	37923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600802
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408	NC_002506	TGA	2	6	38354	38359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600802
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410	NC_002506	ATC	2	6	38512	38517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600802
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413	NC_002506	TGG	2	6	38895	38900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600802
414	NC_002506	TTA	2	6	39026	39031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600802
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488	NC_002506	ATG	2	6	45777	45782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600808
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490	NC_002506	CTT	2	6	45865	45870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600808
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495	NC_002506	GCG	2	6	46354	46359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600809
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497	NC_002506	ATC	2	6	46425	46430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600809
498	NC_002506	CCA	2	6	46652	46657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600809
499	NC_002506	AAT	2	6	46775	46780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600810
500	NC_002506	GGA	2	6	46808	46813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600810

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