MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 1775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002506	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002506	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	15600773
4	NC_002506	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	15600773
5	NC_002506	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	15600773
6	NC_002506	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	15600773
7	NC_002506	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	15600774
8	NC_002506	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002506	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002506	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	15600777
11	NC_002506	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	471193270
12	NC_002506	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	471193270
13	NC_002506	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	471193270
14	NC_002506	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	15600779
15	NC_002506	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	15600779
16	NC_002506	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	15600779
17	NC_002506	CT	3	6	7477	7482	0 %	50 %	0 %	50 %	15600779
18	NC_002506	TA	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	15600779
19	NC_002506	GC	4	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	15600779
20	NC_002506	AG	3	6	8514	8519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002506	TC	3	6	8771	8776	0 %	50 %	0 %	50 %	471193271
22	NC_002506	GC	3	6	9562	9567	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
23	NC_002506	GC	5	10	9594	9603	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
24	NC_002506	AG	3	6	9721	9726	50 %	0 %	50 %	0 %	15600782
25	NC_002506	GC	3	6	9954	9959	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
26	NC_002506	GC	3	6	10690	10695	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
27	NC_002506	TC	3	6	11701	11706	0 %	50 %	0 %	50 %	15600782
28	NC_002506	GT	3	6	12539	12544	0 %	50 %	50 %	0 %	15600784
29	NC_002506	CG	3	6	12807	12812	0 %	0 %	50 %	50 %	15600784
30	NC_002506	TG	4	8	13553	13560	0 %	50 %	50 %	0 %	15600784
31	NC_002506	GC	3	6	14496	14501	0 %	0 %	50 %	50 %	15600784
32	NC_002506	GA	3	6	14801	14806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002506	GC	3	6	15068	15073	0 %	0 %	50 %	50 %	15600785
34	NC_002506	CG	3	6	15737	15742	0 %	0 %	50 %	50 %	15600785
35	NC_002506	CT	3	6	18766	18771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002506	CG	3	6	19067	19072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002506	GT	3	6	19148	19153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002506	TA	3	6	19404	19409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002506	CT	3	6	20033	20038	0 %	50 %	0 %	50 %	15600788
40	NC_002506	TC	3	6	20804	20809	0 %	50 %	0 %	50 %	15600789
41	NC_002506	TG	3	6	20883	20888	0 %	50 %	50 %	0 %	15600789
42	NC_002506	GC	3	6	21512	21517	0 %	0 %	50 %	50 %	15600789
43	NC_002506	TG	4	8	22475	22482	0 %	50 %	50 %	0 %	15600789
44	NC_002506	GT	3	6	22485	22490	0 %	50 %	50 %	0 %	15600789
45	NC_002506	CT	3	6	23797	23802	0 %	50 %	0 %	50 %	15600791
46	NC_002506	GT	3	6	23836	23841	0 %	50 %	50 %	0 %	15600791
47	NC_002506	TC	3	6	24933	24938	0 %	50 %	0 %	50 %	15600791
48	NC_002506	AG	3	6	25104	25109	50 %	0 %	50 %	0 %	15600791
49	NC_002506	GC	3	6	25484	25489	0 %	0 %	50 %	50 %	15600791
50	NC_002506	AG	3	6	26166	26171	50 %	0 %	50 %	0 %	15600791
51	NC_002506	CG	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	15600791
52	NC_002506	GA	4	8	26741	26748	50 %	0 %	50 %	0 %	15600792
53	NC_002506	GC	3	6	27610	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	15600793
54	NC_002506	TG	3	6	27693	27698	0 %	50 %	50 %	0 %	15600793
55	NC_002506	GT	3	6	28144	28149	0 %	50 %	50 %	0 %	15600794
56	NC_002506	GC	3	6	28525	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	15600794
57	NC_002506	GT	3	6	28607	28612	0 %	50 %	50 %	0 %	15600794
58	NC_002506	GA	3	6	29443	29448	50 %	0 %	50 %	0 %	15600795
59	NC_002506	AG	3	6	29906	29911	50 %	0 %	50 %	0 %	15600795
60	NC_002506	TC	3	6	32938	32943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002506	AG	4	8	33020	33027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002506	CT	3	6	33863	33868	0 %	50 %	0 %	50 %	15600798
63	NC_002506	GC	3	6	34063	34068	0 %	0 %	50 %	50 %	15600798
64	NC_002506	AG	3	6	35632	35637	50 %	0 %	50 %	0 %	15600799
65	NC_002506	TC	4	8	35841	35848	0 %	50 %	0 %	50 %	15600799
66	NC_002506	CA	3	6	35945	35950	50 %	0 %	0 %	50 %	15600800
67	NC_002506	AG	3	6	36126	36131	50 %	0 %	50 %	0 %	15600800
68	NC_002506	GT	3	6	36766	36771	0 %	50 %	50 %	0 %	15600801
69	NC_002506	CT	3	6	37931	37936	0 %	50 %	0 %	50 %	15600802
70	NC_002506	CT	3	6	38321	38326	0 %	50 %	0 %	50 %	15600802
71	NC_002506	TG	3	6	39408	39413	0 %	50 %	50 %	0 %	15600803
72	NC_002506	TG	3	6	39702	39707	0 %	50 %	50 %	0 %	15600803
73	NC_002506	TG	3	6	41928	41933	0 %	50 %	50 %	0 %	15600804
74	NC_002506	TG	3	6	42230	42235	0 %	50 %	50 %	0 %	15600805
75	NC_002506	TA	3	6	43138	43143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002506	GC	3	6	44084	44089	0 %	0 %	50 %	50 %	15600807
77	NC_002506	GT	3	6	44357	44362	0 %	50 %	50 %	0 %	15600807
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79	NC_002506	GT	3	6	45071	45076	0 %	50 %	50 %	0 %	15600807
80	NC_002506	CG	4	8	45995	46002	0 %	0 %	50 %	50 %	15600808
81	NC_002506	CT	3	6	47147	47152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002506	AG	3	6	47471	47476	50 %	0 %	50 %	0 %	15600811
83	NC_002506	AT	3	6	48514	48519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002506	GA	3	6	48737	48742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002506	TG	3	6	48915	48920	0 %	50 %	50 %	0 %	15600812
86	NC_002506	CT	3	6	49173	49178	0 %	50 %	0 %	50 %	15600812
87	NC_002506	CA	3	6	49361	49366	50 %	0 %	0 %	50 %	15600812
88	NC_002506	GA	3	6	50432	50437	50 %	0 %	50 %	0 %	15600813
89	NC_002506	GA	3	6	50458	50463	50 %	0 %	50 %	0 %	15600813
90	NC_002506	CG	3	6	50547	50552	0 %	0 %	50 %	50 %	15600813
91	NC_002506	GT	3	6	51135	51140	0 %	50 %	50 %	0 %	15600814
92	NC_002506	TG	3	6	51526	51531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002506	GT	3	6	51712	51717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002506	TC	3	6	51800	51805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002506	TG	3	6	52196	52201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002506	GT	3	6	54855	54860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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100	NC_002506	AC	4	8	56591	56598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002506	CA	3	6	57288	57293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002506	AG	3	6	57406	57411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002506	CA	3	6	58421	58426	50 %	0 %	0 %	50 %	15600822
104	NC_002506	GA	3	6	58541	58546	50 %	0 %	50 %	0 %	15600822
105	NC_002506	GC	3	6	58597	58602	0 %	0 %	50 %	50 %	15600822
106	NC_002506	TG	3	6	60646	60651	0 %	50 %	50 %	0 %	471193273
107	NC_002506	TG	3	6	62015	62020	0 %	50 %	50 %	0 %	161582046
108	NC_002506	GA	3	6	62141	62146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002506	CT	3	6	62161	62166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002506	AG	3	6	62603	62608	50 %	0 %	50 %	0 %	15600826
111	NC_002506	TG	3	6	62650	62655	0 %	50 %	50 %	0 %	15600826
112	NC_002506	CG	3	6	62961	62966	0 %	0 %	50 %	50 %	15600826
113	NC_002506	GT	3	6	64053	64058	0 %	50 %	50 %	0 %	15600827
114	NC_002506	CA	3	6	64383	64388	50 %	0 %	0 %	50 %	15600828
115	NC_002506	GC	3	6	64563	64568	0 %	0 %	50 %	50 %	15600828
116	NC_002506	GC	3	6	64728	64733	0 %	0 %	50 %	50 %	15600828
117	NC_002506	GT	3	6	64838	64843	0 %	50 %	50 %	0 %	15600828
118	NC_002506	GT	3	6	66247	66252	0 %	50 %	50 %	0 %	15600829
119	NC_002506	GC	4	8	66363	66370	0 %	0 %	50 %	50 %	15600829
120	NC_002506	GA	3	6	66471	66476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002506	TG	3	6	67992	67997	0 %	50 %	50 %	0 %	15600832
122	NC_002506	GC	3	6	69212	69217	0 %	0 %	50 %	50 %	15600834
123	NC_002506	AC	3	6	69735	69740	50 %	0 %	0 %	50 %	15600834
124	NC_002506	TC	3	6	69926	69931	0 %	50 %	0 %	50 %	15600834
125	NC_002506	GC	3	6	70395	70400	0 %	0 %	50 %	50 %	15600834
126	NC_002506	CA	3	6	71804	71809	50 %	0 %	0 %	50 %	15600835
127	NC_002506	AG	3	6	72714	72719	50 %	0 %	50 %	0 %	15600835
128	NC_002506	TC	3	6	73933	73938	0 %	50 %	0 %	50 %	15600836
129	NC_002506	TC	3	6	75252	75257	0 %	50 %	0 %	50 %	15600836
130	NC_002506	TC	3	6	75289	75294	0 %	50 %	0 %	50 %	15600836
131	NC_002506	GC	3	6	75438	75443	0 %	0 %	50 %	50 %	15600837
132	NC_002506	GC	3	6	75614	75619	0 %	0 %	50 %	50 %	15600837
133	NC_002506	CA	3	6	76903	76908	50 %	0 %	0 %	50 %	15600838
134	NC_002506	GA	3	6	77687	77692	50 %	0 %	50 %	0 %	15600839
135	NC_002506	CG	3	6	77829	77834	0 %	0 %	50 %	50 %	15600839
136	NC_002506	CG	3	6	77888	77893	0 %	0 %	50 %	50 %	15600839
137	NC_002506	CT	3	6	78057	78062	0 %	50 %	0 %	50 %	15600839
138	NC_002506	TG	3	6	78124	78129	0 %	50 %	50 %	0 %	15600839
139	NC_002506	CT	3	6	78291	78296	0 %	50 %	0 %	50 %	15600839
140	NC_002506	CG	3	6	80933	80938	0 %	0 %	50 %	50 %	471193276
141	NC_002506	CG	3	6	82663	82668	0 %	0 %	50 %	50 %	15600844
142	NC_002506	GC	3	6	82814	82819	0 %	0 %	50 %	50 %	15600844
143	NC_002506	AC	3	6	83246	83251	50 %	0 %	0 %	50 %	15600845
144	NC_002506	AG	4	8	83372	83379	50 %	0 %	50 %	0 %	15600845
145	NC_002506	CA	3	6	83514	83519	50 %	0 %	0 %	50 %	15600845
146	NC_002506	GC	3	6	83727	83732	0 %	0 %	50 %	50 %	15600845
147	NC_002506	GA	3	6	84512	84517	50 %	0 %	50 %	0 %	15600846
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149	NC_002506	TG	3	6	86490	86495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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