MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002506	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002506	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002506	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002506	AG	3	6	8514	8519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002506	GA	3	6	14801	14806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002506	CT	3	6	18766	18771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002506	CG	3	6	19067	19072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_002506	GT	3	6	19148	19153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002506	TA	3	6	19404	19409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002506	TC	3	6	32938	32943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002506	AG	4	8	33020	33027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002506	TA	3	6	43138	43143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002506	CT	3	6	47147	47152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002506	AT	3	6	48514	48519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002506	GA	3	6	48737	48742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002506	TG	3	6	51526	51531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002506	GT	3	6	51712	51717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002506	TC	3	6	51800	51805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002506	TG	3	6	52196	52201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002506	GT	3	6	54855	54860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002506	AC	4	8	56591	56598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002506	CA	3	6	57288	57293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_002506	AG	3	6	57406	57411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002506	GA	3	6	62141	62146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002506	CT	3	6	62161	62166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002506	GA	3	6	66471	66476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002506	AC	3	6	86255	86260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002506	TG	3	6	86490	86495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002506	GA	3	6	88574	88579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002506	CA	3	6	89016	89021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_002506	TC	3	6	92389	92394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002506	AG	3	6	92493	92498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002506	GA	3	6	92545	92550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002506	CT	3	6	93572	93577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002506	TC	4	8	96698	96705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002506	TA	3	6	96740	96745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002506	TG	3	6	97463	97468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002506	TG	3	6	100551	100556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002506	CA	3	6	102355	102360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_002506	TG	3	6	109982	109987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002506	GA	3	6	110808	110813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002506	AT	3	6	115043	115048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002506	AT	3	6	116450	116455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002506	AT	3	6	116638	116643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002506	GA	3	6	147763	147768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002506	GT	3	6	148387	148392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002506	CT	3	6	148398	148403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_002506	GA	4	8	151243	151250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002506	AG	3	6	153048	153053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002506	GA	3	6	153529	153534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002506	GC	3	6	155081	155086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002506	TA	3	6	155111	155116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002506	TA	3	6	163783	163788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002506	GA	3	6	167928	167933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002506	AG	3	6	181581	181586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002506	AT	4	8	184238	184245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002506	AT	3	6	186023	186028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002506	CT	3	6	186307	186312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_002506	AC	3	6	196546	196551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_002506	GA	3	6	213054	213059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002506	GA	4	8	222234	222241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002506	CA	4	8	225508	225515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_002506	GT	3	6	230415	230420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002506	GC	3	6	232278	232283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002506	AC	3	6	232335	232340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002506	AT	3	6	237173	237178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002506	AG	3	6	237212	237217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002506	TG	3	6	237243	237248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002506	AT	3	6	237492	237497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002506	TC	3	6	237544	237549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_002506	AT	3	6	247380	247385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002506	CA	3	6	248746	248751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002506	TC	3	6	253752	253757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_002506	CT	3	6	255195	255200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_002506	GT	3	6	258685	258690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002506	AG	3	6	265288	265293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002506	CT	3	6	271608	271613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002506	GT	3	6	271801	271806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002506	CG	3	6	272697	272702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002506	GC	3	6	272845	272850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002506	CG	3	6	273135	273140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002506	TG	3	6	273241	273246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002506	TG	3	6	280277	280282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002506	CA	3	6	282203	282208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_002506	GA	3	6	283555	283560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002506	GC	3	6	283578	283583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002506	AC	3	6	290073	290078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002506	CT	3	6	290559	290564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002506	GT	3	6	292985	292990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002506	CA	3	6	293754	293759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002506	CA	3	6	294087	294092	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002506	AG	3	6	294254	294259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002506	GT	4	8	294313	294320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002506	TG	3	6	295714	295719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002506	TG	3	6	297924	297929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002506	GT	3	6	298672	298677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002506	AC	3	6	299002	299007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002506	GC	3	6	299548	299553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_002506	GC	3	6	299669	299674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002506	CA	3	6	300249	300254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002506	CA	3	6	306447	306452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002506	GA	3	6	309305	309310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002506	CG	3	6	311345	311350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_002506	TC	3	6	312414	312419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_002506	GT	3	6	313285	313290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002506	CG	3	6	314155	314160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002506	CA	3	6	314581	314586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_002506	CG	3	6	316881	316886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002506	TC	3	6	316979	316984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_002506	CG	3	6	317416	317421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_002506	CG	3	6	318477	318482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002506	CG	3	6	324429	324434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002506	CG	3	6	325114	325119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002506	CG	3	6	326777	326782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_002506	TC	3	6	326874	326879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002506	CG	3	6	328644	328649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_002506	CA	3	6	330708	330713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_002506	GT	3	6	332273	332278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002506	CG	3	6	333805	333810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002506	CG	3	6	335373	335378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002506	CG	3	6	335901	335906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002506	CA	3	6	340281	340286	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002506	GT	3	6	340410	340415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002506	CG	3	6	341049	341054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_002506	CG	3	6	342523	342528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_002506	GT	3	6	343819	343824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002506	CG	3	6	343887	343892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002506	CG	3	6	344546	344551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002506	CG	3	6	345303	345308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_002506	CG	3	6	345832	345837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002506	GC	3	6	350231	350236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002506	CG	3	6	351394	351399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_002506	CG	3	6	352720	352725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_002506	TG	3	6	353020	353025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002506	CG	3	6	358643	358648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_002506	GT	3	6	361394	361399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002506	GT	3	6	363278	363283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002506	TG	3	6	364409	364414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002506	TC	3	6	364834	364839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_002506	GT	3	6	365130	365135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002506	CG	3	6	366704	366709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002506	TG	3	6	368496	368501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002506	CG	3	6	372527	372532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_002506	CG	3	6	375580	375585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002506	CG	3	6	376155	376160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002506	CG	3	6	376637	376642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_002506	GT	3	6	377059	377064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002506	CG	3	6	378630	378635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_002506	CG	3	6	379166	379171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_002506	CG	3	6	380265	380270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_002506	GT	3	6	381353	381358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002506	CG	3	6	382097	382102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_002506	CG	3	6	382657	382662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.