MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 1407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002506	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	15600773
2	NC_002506	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	15600773
3	NC_002506	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	15600773
4	NC_002506	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	15600773
5	NC_002506	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	15600774
6	NC_002506	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	15600777
7	NC_002506	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	471193270
8	NC_002506	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	471193270
9	NC_002506	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	471193270
10	NC_002506	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	15600779
11	NC_002506	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	15600779
12	NC_002506	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	15600779
13	NC_002506	CT	3	6	7477	7482	0 %	50 %	0 %	50 %	15600779
14	NC_002506	TA	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	15600779
15	NC_002506	GC	4	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	15600779
16	NC_002506	TC	3	6	8771	8776	0 %	50 %	0 %	50 %	471193271
17	NC_002506	GC	3	6	9562	9567	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
18	NC_002506	GC	5	10	9594	9603	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
19	NC_002506	AG	3	6	9721	9726	50 %	0 %	50 %	0 %	15600782
20	NC_002506	GC	3	6	9954	9959	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
21	NC_002506	GC	3	6	10690	10695	0 %	0 %	50 %	50 %	15600782
22	NC_002506	TC	3	6	11701	11706	0 %	50 %	0 %	50 %	15600782
23	NC_002506	GT	3	6	12539	12544	0 %	50 %	50 %	0 %	15600784
24	NC_002506	CG	3	6	12807	12812	0 %	0 %	50 %	50 %	15600784
25	NC_002506	TG	4	8	13553	13560	0 %	50 %	50 %	0 %	15600784
26	NC_002506	GC	3	6	14496	14501	0 %	0 %	50 %	50 %	15600784
27	NC_002506	GC	3	6	15068	15073	0 %	0 %	50 %	50 %	15600785
28	NC_002506	CG	3	6	15737	15742	0 %	0 %	50 %	50 %	15600785
29	NC_002506	CT	3	6	20033	20038	0 %	50 %	0 %	50 %	15600788
30	NC_002506	TC	3	6	20804	20809	0 %	50 %	0 %	50 %	15600789
31	NC_002506	TG	3	6	20883	20888	0 %	50 %	50 %	0 %	15600789
32	NC_002506	GC	3	6	21512	21517	0 %	0 %	50 %	50 %	15600789
33	NC_002506	TG	4	8	22475	22482	0 %	50 %	50 %	0 %	15600789
34	NC_002506	GT	3	6	22485	22490	0 %	50 %	50 %	0 %	15600789
35	NC_002506	CT	3	6	23797	23802	0 %	50 %	0 %	50 %	15600791
36	NC_002506	GT	3	6	23836	23841	0 %	50 %	50 %	0 %	15600791
37	NC_002506	TC	3	6	24933	24938	0 %	50 %	0 %	50 %	15600791
38	NC_002506	AG	3	6	25104	25109	50 %	0 %	50 %	0 %	15600791
39	NC_002506	GC	3	6	25484	25489	0 %	0 %	50 %	50 %	15600791
40	NC_002506	AG	3	6	26166	26171	50 %	0 %	50 %	0 %	15600791
41	NC_002506	CG	3	6	26575	26580	0 %	0 %	50 %	50 %	15600791
42	NC_002506	GA	4	8	26741	26748	50 %	0 %	50 %	0 %	15600792
43	NC_002506	GC	3	6	27610	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	15600793
44	NC_002506	TG	3	6	27693	27698	0 %	50 %	50 %	0 %	15600793
45	NC_002506	GT	3	6	28144	28149	0 %	50 %	50 %	0 %	15600794
46	NC_002506	GC	3	6	28525	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	15600794
47	NC_002506	GT	3	6	28607	28612	0 %	50 %	50 %	0 %	15600794
48	NC_002506	GA	3	6	29443	29448	50 %	0 %	50 %	0 %	15600795
49	NC_002506	AG	3	6	29906	29911	50 %	0 %	50 %	0 %	15600795
50	NC_002506	CT	3	6	33863	33868	0 %	50 %	0 %	50 %	15600798
51	NC_002506	GC	3	6	34063	34068	0 %	0 %	50 %	50 %	15600798
52	NC_002506	AG	3	6	35632	35637	50 %	0 %	50 %	0 %	15600799
53	NC_002506	TC	4	8	35841	35848	0 %	50 %	0 %	50 %	15600799
54	NC_002506	CA	3	6	35945	35950	50 %	0 %	0 %	50 %	15600800
55	NC_002506	AG	3	6	36126	36131	50 %	0 %	50 %	0 %	15600800
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58	NC_002506	CT	3	6	38321	38326	0 %	50 %	0 %	50 %	15600802
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60	NC_002506	TG	3	6	39702	39707	0 %	50 %	50 %	0 %	15600803
61	NC_002506	TG	3	6	41928	41933	0 %	50 %	50 %	0 %	15600804
62	NC_002506	TG	3	6	42230	42235	0 %	50 %	50 %	0 %	15600805
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64	NC_002506	GT	3	6	44357	44362	0 %	50 %	50 %	0 %	15600807
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66	NC_002506	GT	3	6	45071	45076	0 %	50 %	50 %	0 %	15600807
67	NC_002506	CG	4	8	45995	46002	0 %	0 %	50 %	50 %	15600808
68	NC_002506	AG	3	6	47471	47476	50 %	0 %	50 %	0 %	15600811
69	NC_002506	TG	3	6	48915	48920	0 %	50 %	50 %	0 %	15600812
70	NC_002506	CT	3	6	49173	49178	0 %	50 %	0 %	50 %	15600812
71	NC_002506	CA	3	6	49361	49366	50 %	0 %	0 %	50 %	15600812
72	NC_002506	GA	3	6	50432	50437	50 %	0 %	50 %	0 %	15600813
73	NC_002506	GA	3	6	50458	50463	50 %	0 %	50 %	0 %	15600813
74	NC_002506	CG	3	6	50547	50552	0 %	0 %	50 %	50 %	15600813
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80	NC_002506	GA	3	6	58541	58546	50 %	0 %	50 %	0 %	15600822
81	NC_002506	GC	3	6	58597	58602	0 %	0 %	50 %	50 %	15600822
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93	NC_002506	GC	4	8	66363	66370	0 %	0 %	50 %	50 %	15600829
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102	NC_002506	TC	3	6	75252	75257	0 %	50 %	0 %	50 %	15600836
103	NC_002506	TC	3	6	75289	75294	0 %	50 %	0 %	50 %	15600836
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105	NC_002506	GC	3	6	75614	75619	0 %	0 %	50 %	50 %	15600837
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108	NC_002506	CG	3	6	77829	77834	0 %	0 %	50 %	50 %	15600839
109	NC_002506	CG	3	6	77888	77893	0 %	0 %	50 %	50 %	15600839
110	NC_002506	CT	3	6	78057	78062	0 %	50 %	0 %	50 %	15600839
111	NC_002506	TG	3	6	78124	78129	0 %	50 %	50 %	0 %	15600839
112	NC_002506	CT	3	6	78291	78296	0 %	50 %	0 %	50 %	15600839
113	NC_002506	CG	3	6	80933	80938	0 %	0 %	50 %	50 %	471193276
114	NC_002506	CG	3	6	82663	82668	0 %	0 %	50 %	50 %	15600844
115	NC_002506	GC	3	6	82814	82819	0 %	0 %	50 %	50 %	15600844
116	NC_002506	AC	3	6	83246	83251	50 %	0 %	0 %	50 %	15600845
117	NC_002506	AG	4	8	83372	83379	50 %	0 %	50 %	0 %	15600845
118	NC_002506	CA	3	6	83514	83519	50 %	0 %	0 %	50 %	15600845
119	NC_002506	GC	3	6	83727	83732	0 %	0 %	50 %	50 %	15600845
120	NC_002506	GA	3	6	84512	84517	50 %	0 %	50 %	0 %	15600846
121	NC_002506	GC	3	6	87202	87207	0 %	0 %	50 %	50 %	15600848
122	NC_002506	CG	3	6	87397	87402	0 %	0 %	50 %	50 %	15600848
123	NC_002506	TC	4	8	89679	89686	0 %	50 %	0 %	50 %	15600850
124	NC_002506	AG	3	6	90930	90935	50 %	0 %	50 %	0 %	15600851
125	NC_002506	GT	3	6	91394	91399	0 %	50 %	50 %	0 %	15600851
126	NC_002506	GT	3	6	93951	93956	0 %	50 %	50 %	0 %	15600854
127	NC_002506	CT	3	6	93993	93998	0 %	50 %	0 %	50 %	15600854
128	NC_002506	TC	3	6	94003	94008	0 %	50 %	0 %	50 %	15600854
129	NC_002506	GT	3	6	94695	94700	0 %	50 %	50 %	0 %	15600854
130	NC_002506	GT	3	6	94731	94736	0 %	50 %	50 %	0 %	15600854
131	NC_002506	CT	3	6	95618	95623	0 %	50 %	0 %	50 %	15600856
132	NC_002506	AG	3	6	96073	96078	50 %	0 %	50 %	0 %	15600856
133	NC_002506	GA	3	6	98573	98578	50 %	0 %	50 %	0 %	15600859
134	NC_002506	AT	3	6	98690	98695	50 %	50 %	0 %	0 %	15600859
135	NC_002506	GA	3	6	99617	99622	50 %	0 %	50 %	0 %	15600861
136	NC_002506	CA	3	6	100827	100832	50 %	0 %	0 %	50 %	15600863
137	NC_002506	AG	3	6	101858	101863	50 %	0 %	50 %	0 %	15600865
138	NC_002506	GA	3	6	102863	102868	50 %	0 %	50 %	0 %	15600866
139	NC_002506	AC	3	6	103394	103399	50 %	0 %	0 %	50 %	15600867
140	NC_002506	GC	3	6	104654	104659	0 %	0 %	50 %	50 %	15600868
141	NC_002506	CG	3	6	104927	104932	0 %	0 %	50 %	50 %	15600868
142	NC_002506	TG	3	6	106510	106515	0 %	50 %	50 %	0 %	15600869
143	NC_002506	TG	3	6	106693	106698	0 %	50 %	50 %	0 %	15600869
144	NC_002506	CA	3	6	107756	107761	50 %	0 %	0 %	50 %	15600870
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