MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 6383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002505	TTGA	2	8	269	276	25 %	50 %	25 %	0 %	15640033
2	NC_002505	ATCA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	15640033
3	NC_002505	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	15640035
4	NC_002505	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	15640035
5	NC_002505	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	15640035
6	NC_002505	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	15640035
7	NC_002505	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	15640035
8	NC_002505	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	15640036
9	NC_002505	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	15640036
10	NC_002505	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	15640036
11	NC_002505	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	15640036
12	NC_002505	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	15640036
13	NC_002505	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	15640036
14	NC_002505	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	15640036
15	NC_002505	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	15640036
16	NC_002505	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	15640037
17	NC_002505	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	15640038
18	NC_002505	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	15640038
19	NC_002505	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	15640038
20	NC_002505	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	15640040
21	NC_002505	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	15640040
22	NC_002505	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	15640041
23	NC_002505	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	15640041
24	NC_002505	CAGA	2	8	6560	6567	50 %	0 %	25 %	25 %	15640042
25	NC_002505	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	15640042
26	NC_002505	TGAG	2	8	7398	7405	25 %	25 %	50 %	0 %	15640044
27	NC_002505	GTAC	2	8	7682	7689	25 %	25 %	25 %	25 %	15640044
28	NC_002505	CAAC	2	8	8191	8198	50 %	0 %	0 %	50 %	15640044
29	NC_002505	CTTT	2	8	8376	8383	0 %	75 %	0 %	25 %	15640044
30	NC_002505	CGTG	2	8	8407	8414	0 %	25 %	50 %	25 %	15640044
31	NC_002505	GATT	2	8	8476	8483	25 %	50 %	25 %	0 %	15640044
32	NC_002505	CGTG	2	8	8485	8492	0 %	25 %	50 %	25 %	15640044
33	NC_002505	ACCA	2	8	8663	8670	50 %	0 %	0 %	50 %	15640044
34	NC_002505	GCAG	2	8	9065	9072	25 %	0 %	50 %	25 %	15640045
35	NC_002505	CTCA	2	8	9260	9267	25 %	25 %	0 %	50 %	15640045
36	NC_002505	CCAA	2	8	9312	9319	50 %	0 %	0 %	50 %	15640045
37	NC_002505	CGGA	2	8	10161	10168	25 %	0 %	50 %	25 %	15640046
38	NC_002505	AGCA	2	8	10477	10484	50 %	0 %	25 %	25 %	15640046
39	NC_002505	TCAA	2	8	10592	10599	50 %	25 %	0 %	25 %	15640046
40	NC_002505	GTCA	2	8	11309	11316	25 %	25 %	25 %	25 %	471237023
41	NC_002505	CCGA	2	8	11337	11344	25 %	0 %	25 %	50 %	471237023
42	NC_002505	ATGA	2	8	12162	12169	50 %	25 %	25 %	0 %	471237023
43	NC_002505	GCGG	2	8	12387	12394	0 %	0 %	75 %	25 %	471237023
44	NC_002505	TTGA	2	8	12666	12673	25 %	50 %	25 %	0 %	471237023
45	NC_002505	GATG	2	8	12785	12792	25 %	25 %	50 %	0 %	471237023
46	NC_002505	TACT	2	8	13128	13135	25 %	50 %	0 %	25 %	471237023
47	NC_002505	TTGA	2	8	13203	13210	25 %	50 %	25 %	0 %	471237023
48	NC_002505	GTCT	2	8	13303	13310	0 %	50 %	25 %	25 %	471237023
49	NC_002505	CTCG	2	8	14066	14073	0 %	25 %	25 %	50 %	533111996
50	NC_002505	CCAA	2	8	14329	14336	50 %	0 %	0 %	50 %	533111996
51	NC_002505	TTAA	2	8	14490	14497	50 %	50 %	0 %	0 %	15640049
52	NC_002505	CAAT	2	8	15452	15459	50 %	25 %	0 %	25 %	15640051
53	NC_002505	AGCG	2	8	16299	16306	25 %	0 %	50 %	25 %	15640051
54	NC_002505	GCCA	2	8	17013	17020	25 %	0 %	25 %	50 %	15640052
55	NC_002505	AGCC	2	8	17819	17826	25 %	0 %	25 %	50 %	15640052
56	NC_002505	CGGT	2	8	17839	17846	0 %	25 %	50 %	25 %	15640052
57	NC_002505	GTGC	2	8	18385	18392	0 %	25 %	50 %	25 %	15640052
58	NC_002505	TGCT	2	8	18624	18631	0 %	50 %	25 %	25 %	15640052
59	NC_002505	TTGG	2	8	18673	18680	0 %	50 %	50 %	0 %	15640052
60	NC_002505	AAGT	2	8	19200	19207	50 %	25 %	25 %	0 %	471237024
61	NC_002505	AAGT	2	8	19425	19432	50 %	25 %	25 %	0 %	471237024
62	NC_002505	TTGT	2	8	20235	20242	0 %	75 %	25 %	0 %	15640054
63	NC_002505	TGGA	2	8	20548	20555	25 %	25 %	50 %	0 %	15640054
64	NC_002505	TTGC	2	8	20712	20719	0 %	50 %	25 %	25 %	15640054
65	NC_002505	TTGT	2	8	21280	21287	0 %	75 %	25 %	0 %	15640056
66	NC_002505	CGAT	2	8	22410	22417	25 %	25 %	25 %	25 %	15640058
67	NC_002505	GCTG	2	8	22648	22655	0 %	25 %	50 %	25 %	15640058
68	NC_002505	ACCA	2	8	22677	22684	50 %	0 %	0 %	50 %	15640058
69	NC_002505	AATC	2	8	22813	22820	50 %	25 %	0 %	25 %	15640058
70	NC_002505	GTGA	2	8	22964	22971	25 %	25 %	50 %	0 %	15640058
71	NC_002505	AGGC	2	8	24145	24152	25 %	0 %	50 %	25 %	15640059
72	NC_002505	ACCG	2	8	24240	24247	25 %	0 %	25 %	50 %	15640059
73	NC_002505	CTGG	2	8	24632	24639	0 %	25 %	50 %	25 %	15640059
74	NC_002505	AGGT	2	8	25138	25145	25 %	25 %	50 %	0 %	15640060
75	NC_002505	TGCG	2	8	25389	25396	0 %	25 %	50 %	25 %	15640060
76	NC_002505	GTTT	2	8	25528	25535	0 %	75 %	25 %	0 %	15640060
77	NC_002505	CCGC	2	8	25642	25649	0 %	0 %	25 %	75 %	15640060
78	NC_002505	CGAT	2	8	25726	25733	25 %	25 %	25 %	25 %	15640060
79	NC_002505	TCGA	2	8	27352	27359	25 %	25 %	25 %	25 %	15640061
80	NC_002505	CCTT	2	8	27587	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	15640061
81	NC_002505	CTTG	2	8	27778	27785	0 %	50 %	25 %	25 %	15640062
82	NC_002505	CCAC	2	8	28919	28926	25 %	0 %	0 %	75 %	15640063
83	NC_002505	CATC	2	8	29196	29203	25 %	25 %	0 %	50 %	15640063
84	NC_002505	TCAT	2	8	30082	30089	25 %	50 %	0 %	25 %	15640064
85	NC_002505	TGCC	2	8	30436	30443	0 %	25 %	25 %	50 %	15640064
86	NC_002505	TGCG	2	8	33597	33604	0 %	25 %	50 %	25 %	161582037
87	NC_002505	TGGG	2	8	33686	33693	0 %	25 %	75 %	0 %	161582037
88	NC_002505	TTTG	2	8	34472	34479	0 %	75 %	25 %	0 %	471237025
89	NC_002505	CAAT	2	8	34903	34910	50 %	25 %	0 %	25 %	471237025
90	NC_002505	CCAA	2	8	35222	35229	50 %	0 %	0 %	50 %	471237025
91	NC_002505	CAAG	2	8	35510	35517	50 %	0 %	25 %	25 %	471237025
92	NC_002505	TAAG	2	8	36328	36335	50 %	25 %	25 %	0 %	15640069
93	NC_002505	TTTC	2	8	36573	36580	0 %	75 %	0 %	25 %	15640070
94	NC_002505	TGAG	2	8	36925	36932	25 %	25 %	50 %	0 %	15640071
95	NC_002505	GCCA	2	8	37193	37200	25 %	0 %	25 %	50 %	15640071
96	NC_002505	TGAG	2	8	37845	37852	25 %	25 %	50 %	0 %	15640072
97	NC_002505	TATT	2	8	38105	38112	25 %	75 %	0 %	0 %	15640072
98	NC_002505	GGTT	2	8	38171	38178	0 %	50 %	50 %	0 %	15640072
99	NC_002505	TCGC	2	8	38196	38203	0 %	25 %	25 %	50 %	15640072
100	NC_002505	GGTG	2	8	38327	38334	0 %	25 %	75 %	0 %	15640072
101	NC_002505	ACTG	2	8	38745	38752	25 %	25 %	25 %	25 %	15640073
102	NC_002505	TGGT	2	8	38760	38767	0 %	50 %	50 %	0 %	15640073
103	NC_002505	GCCA	2	8	39325	39332	25 %	0 %	25 %	50 %	15640074
104	NC_002505	CAAC	2	8	39685	39692	50 %	0 %	0 %	50 %	15640074
105	NC_002505	ACGT	2	8	40345	40352	25 %	25 %	25 %	25 %	15640074
106	NC_002505	GTGA	2	8	40854	40861	25 %	25 %	50 %	0 %	15640075
107	NC_002505	ATCA	2	8	40902	40909	50 %	25 %	0 %	25 %	15640075
108	NC_002505	ACTC	2	8	41264	41271	25 %	25 %	0 %	50 %	15640075
109	NC_002505	ACCA	2	8	41433	41440	50 %	0 %	0 %	50 %	15640075
110	NC_002505	TGGC	2	8	41776	41783	0 %	25 %	50 %	25 %	15640075
111	NC_002505	AGCG	2	8	41889	41896	25 %	0 %	50 %	25 %	15640075
112	NC_002505	GCGT	2	8	42108	42115	0 %	25 %	50 %	25 %	15640076
113	NC_002505	CAAT	2	8	42455	42462	50 %	25 %	0 %	25 %	15640076
114	NC_002505	AGTG	2	8	43217	43224	25 %	25 %	50 %	0 %	15640076
115	NC_002505	TCGC	2	8	43794	43801	0 %	25 %	25 %	50 %	15640077
116	NC_002505	CATC	2	8	43852	43859	25 %	25 %	0 %	50 %	15640077
117	NC_002505	ATTT	2	8	44297	44304	25 %	75 %	0 %	0 %	15640078
118	NC_002505	GGAC	2	8	44526	44533	25 %	0 %	50 %	25 %	15640078
119	NC_002505	GCGT	2	8	45369	45376	0 %	25 %	50 %	25 %	15640079
120	NC_002505	CAAG	2	8	45412	45419	50 %	0 %	25 %	25 %	15640079
121	NC_002505	GGTG	2	8	45529	45536	0 %	25 %	75 %	0 %	15640079
122	NC_002505	CAGC	2	8	45668	45675	25 %	0 %	25 %	50 %	15640079
123	NC_002505	GCAC	2	8	45982	45989	25 %	0 %	25 %	50 %	15640079
124	NC_002505	GCAG	2	8	45997	46004	25 %	0 %	50 %	25 %	15640079
125	NC_002505	TCGC	2	8	46463	46470	0 %	25 %	25 %	50 %	15640080
126	NC_002505	CTCA	2	8	46782	46789	25 %	25 %	0 %	50 %	15640080
127	NC_002505	GCTA	2	8	47186	47193	25 %	25 %	25 %	25 %	15640080
128	NC_002505	GCGA	2	8	49405	49412	25 %	0 %	50 %	25 %	15640083
129	NC_002505	CAGA	2	8	49670	49677	50 %	0 %	25 %	25 %	15640084
130	NC_002505	GCTA	2	8	50281	50288	25 %	25 %	25 %	25 %	15640086
131	NC_002505	GCCA	2	8	50385	50392	25 %	0 %	25 %	50 %	15640086
132	NC_002505	CGTG	2	8	50439	50446	0 %	25 %	50 %	25 %	15640086
133	NC_002505	TGCC	2	8	50918	50925	0 %	25 %	25 %	50 %	15640087
134	NC_002505	AATG	2	8	51280	51287	50 %	25 %	25 %	0 %	15640087
135	NC_002505	AATC	2	8	51494	51501	50 %	25 %	0 %	25 %	15640087
136	NC_002505	GTGC	2	8	51787	51794	0 %	25 %	50 %	25 %	15640088
137	NC_002505	CGAT	2	8	52380	52387	25 %	25 %	25 %	25 %	15640088
138	NC_002505	AGTG	2	8	52675	52682	25 %	25 %	50 %	0 %	15640089
139	NC_002505	TGCT	2	8	52862	52869	0 %	50 %	25 %	25 %	15640090
140	NC_002505	CAAG	2	8	60001	60008	50 %	0 %	25 %	25 %	15640093
141	NC_002505	AGTT	2	8	60737	60744	25 %	50 %	25 %	0 %	15640093
142	NC_002505	TTAA	2	8	61297	61304	50 %	50 %	0 %	0 %	15640093
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