MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 4949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002505	AT	4	8	12	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002505	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002505	GC	3	6	1315	1320	0 %	0 %	50 %	50 %	15640035
4	NC_002505	GA	3	6	4140	4145	50 %	0 %	50 %	0 %	15640037
5	NC_002505	GC	3	6	4200	4205	0 %	0 %	50 %	50 %	15640038
6	NC_002505	CG	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	15640040
7	NC_002505	AG	3	6	5186	5191	50 %	0 %	50 %	0 %	15640040
8	NC_002505	CG	3	6	5316	5321	0 %	0 %	50 %	50 %	15640040
9	NC_002505	TC	3	6	5524	5529	0 %	50 %	0 %	50 %	15640040
10	NC_002505	CA	3	6	6946	6951	50 %	0 %	0 %	50 %	15640042
11	NC_002505	TG	3	6	7101	7106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002505	TG	3	6	7264	7269	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002505	AG	3	6	8758	8763	50 %	0 %	50 %	0 %	15640044
14	NC_002505	GC	3	6	10505	10510	0 %	0 %	50 %	50 %	15640046
15	NC_002505	GT	3	6	10837	10842	0 %	50 %	50 %	0 %	15640046
16	NC_002505	GA	3	6	11090	11095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002505	GT	3	6	11458	11463	0 %	50 %	50 %	0 %	471237023
18	NC_002505	GC	3	6	12292	12297	0 %	0 %	50 %	50 %	471237023
19	NC_002505	TG	3	6	12961	12966	0 %	50 %	50 %	0 %	471237023
20	NC_002505	AG	3	6	14451	14456	50 %	0 %	50 %	0 %	15640049
21	NC_002505	AG	3	6	15008	15013	50 %	0 %	50 %	0 %	15640050
22	NC_002505	AC	3	6	15995	16000	50 %	0 %	0 %	50 %	15640051
23	NC_002505	TG	3	6	16573	16578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002505	GC	4	8	17003	17010	0 %	0 %	50 %	50 %	15640052
25	NC_002505	CA	3	6	19535	19540	50 %	0 %	0 %	50 %	471237024
26	NC_002505	CG	3	6	19877	19882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_002505	TC	3	6	20017	20022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_002505	CA	3	6	20131	20136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_002505	GT	3	6	20165	20170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002505	CG	3	6	20845	20850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_002505	TG	3	6	21726	21731	0 %	50 %	50 %	0 %	15640057
32	NC_002505	GA	3	6	21744	21749	50 %	0 %	50 %	0 %	15640057
33	NC_002505	CA	3	6	21751	21756	50 %	0 %	0 %	50 %	15640057
34	NC_002505	CG	3	6	22420	22425	0 %	0 %	50 %	50 %	15640058
35	NC_002505	AC	3	6	22602	22607	50 %	0 %	0 %	50 %	15640058
36	NC_002505	CA	3	6	23372	23377	50 %	0 %	0 %	50 %	15640059
37	NC_002505	GA	3	6	23575	23580	50 %	0 %	50 %	0 %	15640059
38	NC_002505	GC	3	6	23956	23961	0 %	0 %	50 %	50 %	15640059
39	NC_002505	GC	3	6	25106	25111	0 %	0 %	50 %	50 %	15640060
40	NC_002505	GA	4	8	25991	25998	50 %	0 %	50 %	0 %	15640060
41	NC_002505	AC	3	6	26280	26285	50 %	0 %	0 %	50 %	15640060
42	NC_002505	GC	3	6	26563	26568	0 %	0 %	50 %	50 %	15640060
43	NC_002505	GC	4	8	26575	26582	0 %	0 %	50 %	50 %	15640060
44	NC_002505	GT	3	6	26601	26606	0 %	50 %	50 %	0 %	15640060
45	NC_002505	AG	3	6	27003	27008	50 %	0 %	50 %	0 %	15640061
46	NC_002505	CG	3	6	27329	27334	0 %	0 %	50 %	50 %	15640061
47	NC_002505	GC	3	6	28364	28369	0 %	0 %	50 %	50 %	15640063
48	NC_002505	AG	3	6	29176	29181	50 %	0 %	50 %	0 %	15640063
49	NC_002505	TG	3	6	29226	29231	0 %	50 %	50 %	0 %	15640063
50	NC_002505	GC	3	6	29359	29364	0 %	0 %	50 %	50 %	15640063
51	NC_002505	TG	3	6	29575	29580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002505	AC	3	6	29922	29927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002505	TA	3	6	29992	29997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002505	CG	3	6	30202	30207	0 %	0 %	50 %	50 %	15640064
55	NC_002505	TG	3	6	30568	30573	0 %	50 %	50 %	0 %	15640064
56	NC_002505	CT	3	6	30818	30823	0 %	50 %	0 %	50 %	15640064
57	NC_002505	TC	3	6	30942	30947	0 %	50 %	0 %	50 %	15640064
58	NC_002505	CG	4	8	31048	31055	0 %	0 %	50 %	50 %	15640064
59	NC_002505	GC	3	6	31417	31422	0 %	0 %	50 %	50 %	15640064
60	NC_002505	GT	3	6	34729	34734	0 %	50 %	50 %	0 %	471237025
61	NC_002505	GC	3	6	34974	34979	0 %	0 %	50 %	50 %	471237025
62	NC_002505	GC	3	6	35031	35036	0 %	0 %	50 %	50 %	471237025
63	NC_002505	GC	3	6	37708	37713	0 %	0 %	50 %	50 %	15640071
64	NC_002505	CT	3	6	38253	38258	0 %	50 %	0 %	50 %	15640072
65	NC_002505	GT	3	6	38569	38574	0 %	50 %	50 %	0 %	15640073
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67	NC_002505	GC	3	6	39846	39851	0 %	0 %	50 %	50 %	15640074
68	NC_002505	CG	4	8	40024	40031	0 %	0 %	50 %	50 %	15640074
69	NC_002505	GC	3	6	41510	41515	0 %	0 %	50 %	50 %	15640075
70	NC_002505	GC	3	6	42097	42102	0 %	0 %	50 %	50 %	15640076
71	NC_002505	CT	3	6	42476	42481	0 %	50 %	0 %	50 %	15640076
72	NC_002505	CT	3	6	42821	42826	0 %	50 %	0 %	50 %	15640076
73	NC_002505	GC	3	6	42972	42977	0 %	0 %	50 %	50 %	15640076
74	NC_002505	GT	3	6	45270	45275	0 %	50 %	50 %	0 %	15640079
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79	NC_002505	GC	3	6	49419	49424	0 %	0 %	50 %	50 %	15640083
80	NC_002505	AC	3	6	49448	49453	50 %	0 %	0 %	50 %	15640083
81	NC_002505	GA	3	6	50681	50686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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83	NC_002505	GC	3	6	52371	52376	0 %	0 %	50 %	50 %	15640088
84	NC_002505	CT	3	6	52737	52742	0 %	50 %	0 %	50 %	15640089
85	NC_002505	TG	3	6	53649	53654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002505	AC	3	6	55041	55046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002505	AC	3	6	55210	55215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002505	CA	3	6	55384	55389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002505	AC	3	6	56713	56718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002505	CT	4	8	57268	57275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002505	GA	3	6	57417	57422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002505	GT	3	6	58608	58613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002505	TG	4	8	58718	58725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002505	TC	3	6	59105	59110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002505	AT	3	6	59121	59126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002505	CT	3	6	59880	59885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002505	TC	3	6	59930	59935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002505	TG	3	6	60187	60192	0 %	50 %	50 %	0 %	15640093
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100	NC_002505	GC	3	6	60603	60608	0 %	0 %	50 %	50 %	15640093
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102	NC_002505	CT	3	6	62484	62489	0 %	50 %	0 %	50 %	15640094
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108	NC_002505	GC	3	6	65649	65654	0 %	0 %	50 %	50 %	15640098
109	NC_002505	AG	3	6	67330	67335	50 %	0 %	50 %	0 %	15640099
110	NC_002505	GC	3	6	67417	67422	0 %	0 %	50 %	50 %	15640099
111	NC_002505	CA	3	6	67710	67715	50 %	0 %	0 %	50 %	15640099
112	NC_002505	GT	3	6	68063	68068	0 %	50 %	50 %	0 %	15640099
113	NC_002505	TC	3	6	68310	68315	0 %	50 %	0 %	50 %	15640100
114	NC_002505	GT	3	6	68334	68339	0 %	50 %	50 %	0 %	15640100
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116	NC_002505	CT	3	6	69900	69905	0 %	50 %	0 %	50 %	15640101
117	NC_002505	CG	3	6	71193	71198	0 %	0 %	50 %	50 %	15640103
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119	NC_002505	GT	3	6	72383	72388	0 %	50 %	50 %	0 %	15640104
120	NC_002505	TG	4	8	73594	73601	0 %	50 %	50 %	0 %	15640104
121	NC_002505	GC	3	6	74268	74273	0 %	0 %	50 %	50 %	471237026
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123	NC_002505	GC	3	6	74887	74892	0 %	0 %	50 %	50 %	15640106
124	NC_002505	AG	4	8	75138	75145	50 %	0 %	50 %	0 %	15640106
125	NC_002505	GT	3	6	75637	75642	0 %	50 %	50 %	0 %	15640107
126	NC_002505	GC	3	6	75988	75993	0 %	0 %	50 %	50 %	15640107
127	NC_002505	AG	3	6	76271	76276	50 %	0 %	50 %	0 %	15640108
128	NC_002505	CA	3	6	76306	76311	50 %	0 %	0 %	50 %	15640108
129	NC_002505	GC	3	6	78516	78521	0 %	0 %	50 %	50 %	15640112
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131	NC_002505	CT	3	6	79969	79974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002505	GC	3	6	80434	80439	0 %	0 %	50 %	50 %	15640114
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139	NC_002505	TG	3	6	84192	84197	0 %	50 %	50 %	0 %	15640117
140	NC_002505	CG	3	6	84238	84243	0 %	0 %	50 %	50 %	15640117
141	NC_002505	CA	3	6	84742	84747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_002505	CT	3	6	85432	85437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002505	TA	3	6	85806	85811	50 %	50 %	0 %	0 %	15640120
144	NC_002505	CG	3	6	87712	87717	0 %	0 %	50 %	50 %	15640122
145	NC_002505	GT	3	6	87805	87810	0 %	50 %	50 %	0 %	15640122
146	NC_002505	AC	3	6	87894	87899	50 %	0 %	0 %	50 %	15640122
147	NC_002505	GA	3	6	88333	88338	50 %	0 %	50 %	0 %	15640122
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