MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002491	TCTTAT	2	12	4070	4081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002491	TCGATT	2	12	23927	23938	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_002491	ATTTTT	2	12	43005	43016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002491	AGGCTT	2	12	88986	88997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_002491	AATTAA	2	12	93364	93375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002491	TGTAGG	2	12	136940	136951	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002491	TTCTAT	2	12	137632	137643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_002491	AATTTT	2	12	201671	201682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002491	CTATTT	2	12	207956	207967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_002491	TCCCCC	2	12	244585	244596	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_002491	AAACAA	2	12	250907	250918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_002491	TTTAAG	2	12	265833	265844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002491	ATTTTA	2	12	273857	273868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002491	AAATTT	2	12	277685	277696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002491	AGTAAT	2	12	329484	329495	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002491	AAAACT	2	12	332678	332689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_002491	AAAGAG	2	12	333541	333552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002491	ATCTTC	2	12	356107	356118	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002491	TAAAAA	2	12	365489	365500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002491	TTATTT	2	12	374655	374666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002491	ACAAAA	2	12	378720	378731	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_002491	CCCATG	2	12	412477	412488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_002491	ATTTTT	2	12	425927	425938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002491	TTTCCC	2	12	431524	431535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002491	TAGAGA	2	12	467920	467931	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002491	AAATAA	2	12	488249	488260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002491	AGAAAT	2	12	567368	567379	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002491	GAAAAA	2	12	603228	603239	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002491	TATTTT	2	12	605569	605580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002491	TAGGAG	2	12	606789	606800	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002491	CATTAA	2	12	637603	637614	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_002491	TTTTTA	2	12	654978	654989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002491	AAAAAC	2	12	661587	661598	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_002491	AATTAT	2	12	678743	678754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002491	TAGAAA	2	12	729855	729866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002491	GCCTAA	2	12	743577	743588	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002491	TATTTT	2	12	760653	760664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002491	GAATGC	2	12	767723	767734	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_002491	TAAATA	2	12	796065	796076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002491	TAAAAA	2	12	799157	799168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002491	ATTAAC	2	12	812731	812742	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_002491	TAAATT	2	12	921280	921291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002491	ATCCTG	2	12	928877	928888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_002491	TATTTA	2	12	937554	937565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002491	TCATGA	2	12	940844	940855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_002491	TTATTT	2	12	954541	954552	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002491	TAAGCA	2	12	980866	980877	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002491	TTTAAA	2	12	992466	992477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002491	AAGCGA	2	12	1002339	1002350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_002491	GTTATT	2	12	1010711	1010722	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002491	TAATTT	2	12	1062175	1062186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002491	TTTTTA	2	12	1077302	1077313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002491	ATTTCT	2	12	1088790	1088801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_002491	GAATAG	2	12	1107835	1107846	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002491	TTTCAA	2	12	1112369	1112380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_002491	TTATAA	2	12	1117703	1117714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002491	TTTGGA	2	12	1175373	1175384	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002491	ACTTTT	2	12	1207808	1207819	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_002491	TCCTAG	2	12	1219641	1219652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.