MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002491	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	15835536
2	NC_002491	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	15835538
3	NC_002491	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	15835538
4	NC_002491	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	15835539
5	NC_002491	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	15835540
6	NC_002491	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	15835540
7	NC_002491	AATAA	2	10	10375	10384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002491	TCGAA	2	10	12129	12138	40 %	20 %	20 %	20 %	15835544
9	NC_002491	GGGAT	2	10	13541	13550	20 %	20 %	60 %	0 %	15835545
10	NC_002491	GAGGG	2	10	13663	13672	20 %	0 %	80 %	0 %	15835545
11	NC_002491	GAGAG	2	10	15253	15262	40 %	0 %	60 %	0 %	15835545
12	NC_002491	TCTCG	2	10	22479	22488	0 %	40 %	20 %	40 %	15835551
13	NC_002491	GCTAT	2	10	26807	26816	20 %	40 %	20 %	20 %	15835554
14	NC_002491	TATTT	2	10	26933	26942	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002491	TCTAG	2	10	27100	27109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002491	AATAT	2	10	27185	27194	60 %	40 %	0 %	0 %	15835555
17	NC_002491	CCACT	2	10	27266	27275	20 %	20 %	0 %	60 %	15835555
18	NC_002491	TGCTT	2	10	33862	33871	0 %	60 %	20 %	20 %	15835558
19	NC_002491	ATCTT	2	10	34740	34749	20 %	60 %	0 %	20 %	15835560
20	NC_002491	TTTTC	2	10	35497	35506	0 %	80 %	0 %	20 %	15835560
21	NC_002491	TCAAA	2	10	36733	36742	60 %	20 %	0 %	20 %	15835561
22	NC_002491	GGCAA	2	10	37639	37648	40 %	0 %	40 %	20 %	15835562
23	NC_002491	AAGAC	2	10	41646	41655	60 %	0 %	20 %	20 %	15835564
24	NC_002491	TTTAA	2	10	42332	42341	40 %	60 %	0 %	0 %	15835565
25	NC_002491	ATTTG	2	10	43312	43321	20 %	60 %	20 %	0 %	15835566
26	NC_002491	CCGCT	2	10	46585	46594	0 %	20 %	20 %	60 %	15835570
27	NC_002491	GGATA	2	10	49626	49635	40 %	20 %	40 %	0 %	15835572
28	NC_002491	ATAAA	2	10	49773	49782	80 %	20 %	0 %	0 %	15835572
29	NC_002491	AGATC	2	10	51510	51519	40 %	20 %	20 %	20 %	15835574
30	NC_002491	CACAT	2	10	52389	52398	40 %	20 %	0 %	40 %	15835575
31	NC_002491	TCGAG	2	10	57265	57274	20 %	20 %	40 %	20 %	15835579
32	NC_002491	GAGAG	2	10	57825	57834	40 %	0 %	60 %	0 %	15835579
33	NC_002491	GCTAA	2	10	57862	57871	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_002491	AGCAA	2	10	58462	58471	60 %	0 %	20 %	20 %	15835580
35	NC_002491	AAACG	2	10	59089	59098	60 %	0 %	20 %	20 %	15835580
36	NC_002491	ATTTA	2	10	59470	59479	40 %	60 %	0 %	0 %	15835580
37	NC_002491	TAAGC	2	10	63409	63418	40 %	20 %	20 %	20 %	15835584
38	NC_002491	CTAAA	2	10	65839	65848	60 %	20 %	0 %	20 %	15835585
39	NC_002491	CTATA	2	10	67087	67096	40 %	40 %	0 %	20 %	15835588
40	NC_002491	AAAGT	2	10	68316	68325	60 %	20 %	20 %	0 %	15835589
41	NC_002491	CCGTG	2	10	69463	69472	0 %	20 %	40 %	40 %	15835590
42	NC_002491	TATTT	2	10	69858	69867	20 %	80 %	0 %	0 %	15835591
43	NC_002491	ATTTT	2	10	72385	72394	20 %	80 %	0 %	0 %	15835592
44	NC_002491	GAGTA	2	10	72533	72542	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002491	CCAAC	2	10	73910	73919	40 %	0 %	0 %	60 %	15835594
46	NC_002491	TGCCC	2	10	75611	75620	0 %	20 %	20 %	60 %	15835597
47	NC_002491	TTCTT	2	10	75724	75733	0 %	80 %	0 %	20 %	15835597
48	NC_002491	TACAT	2	10	76095	76104	40 %	40 %	0 %	20 %	15835598
49	NC_002491	CTAAC	2	10	76360	76369	40 %	20 %	0 %	40 %	15835598
50	NC_002491	TACGA	2	10	76897	76906	40 %	20 %	20 %	20 %	15835598
51	NC_002491	ACAAG	2	10	77015	77024	60 %	0 %	20 %	20 %	15835598
52	NC_002491	ATCTA	2	10	77631	77640	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_002491	AAATC	2	10	79046	79055	60 %	20 %	0 %	20 %	15835601
54	NC_002491	TCTTT	2	10	79273	79282	0 %	80 %	0 %	20 %	15835601
55	NC_002491	AAGAG	2	10	80009	80018	60 %	0 %	40 %	0 %	15835601
56	NC_002491	CAACC	2	10	80039	80048	40 %	0 %	0 %	60 %	15835601
57	NC_002491	TTTTC	2	10	83330	83339	0 %	80 %	0 %	20 %	15835603
58	NC_002491	TGATT	2	10	87728	87737	20 %	60 %	20 %	0 %	15835607
59	NC_002491	TCAAG	2	10	87840	87849	40 %	20 %	20 %	20 %	15835607
60	NC_002491	AGTTT	2	10	87909	87918	20 %	60 %	20 %	0 %	15835607
61	NC_002491	AAGGT	2	10	89057	89066	40 %	20 %	40 %	0 %	15835608
62	NC_002491	AAGAA	2	10	91065	91074	80 %	0 %	20 %	0 %	15835611
63	NC_002491	ATGTA	2	10	92644	92653	40 %	40 %	20 %	0 %	15835613
64	NC_002491	TCAAA	2	10	92683	92692	60 %	20 %	0 %	20 %	15835613
65	NC_002491	AGAAA	2	10	93800	93809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002491	TCTTT	2	10	93824	93833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_002491	ACCAA	2	10	95312	95321	60 %	0 %	0 %	40 %	15835616
68	NC_002491	GTGAT	2	10	96089	96098	20 %	40 %	40 %	0 %	15835616
69	NC_002491	CAAAA	2	10	98339	98348	80 %	0 %	0 %	20 %	15835617
70	NC_002491	ATTAT	2	10	99248	99257	40 %	60 %	0 %	0 %	15835617
71	NC_002491	TCTTG	2	10	100625	100634	0 %	60 %	20 %	20 %	15835617
72	NC_002491	CAAAA	2	10	101102	101111	80 %	0 %	0 %	20 %	15835617
73	NC_002491	TTTCC	2	10	103825	103834	0 %	60 %	0 %	40 %	15835620
74	NC_002491	CATAG	2	10	104222	104231	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002491	GCAAG	2	10	112112	112121	40 %	0 %	40 %	20 %	15835627
76	NC_002491	GTTAG	2	10	115484	115493	20 %	40 %	40 %	0 %	15835629
77	NC_002491	TGGTT	2	10	117566	117575	0 %	60 %	40 %	0 %	161353805
78	NC_002491	ATGTT	2	10	121377	121386	20 %	60 %	20 %	0 %	15835631
79	NC_002491	TGAAA	2	10	121646	121655	60 %	20 %	20 %	0 %	15835631
80	NC_002491	TAGCC	2	10	122592	122601	20 %	20 %	20 %	40 %	15835631
81	NC_002491	GAAGA	2	10	123644	123653	60 %	0 %	40 %	0 %	15835631
82	NC_002491	ATTGG	2	10	125309	125318	20 %	40 %	40 %	0 %	15835632
83	NC_002491	TAGAA	2	10	125830	125839	60 %	20 %	20 %	0 %	15835633
84	NC_002491	AGAAA	2	10	126135	126144	80 %	0 %	20 %	0 %	15835633
85	NC_002491	AAAAT	2	10	126727	126736	80 %	20 %	0 %	0 %	15835633
86	NC_002491	AAAAT	2	10	126767	126776	80 %	20 %	0 %	0 %	15835633
87	NC_002491	CTTAT	2	10	129843	129852	20 %	60 %	0 %	20 %	15835638
88	NC_002491	TTGGG	2	10	129992	130001	0 %	40 %	60 %	0 %	15835638
89	NC_002491	TTTCT	2	10	130208	130217	0 %	80 %	0 %	20 %	15835638
90	NC_002491	ATTTT	2	10	131668	131677	20 %	80 %	0 %	0 %	15835639
91	NC_002491	TCTGG	2	10	133981	133990	0 %	40 %	40 %	20 %	15835641
92	NC_002491	AATCT	2	10	134491	134500	40 %	40 %	0 %	20 %	15835641
93	NC_002491	CTTTT	2	10	135218	135227	0 %	80 %	0 %	20 %	15835642
94	NC_002491	TTGTT	2	10	138119	138128	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002491	AAGAT	2	10	139615	139624	60 %	20 %	20 %	0 %	15835645
96	NC_002491	AAGAA	2	10	140801	140810	80 %	0 %	20 %	0 %	15835645
97	NC_002491	CGCAT	2	10	141306	141315	20 %	20 %	20 %	40 %	15835645
98	NC_002491	CATAG	2	10	142555	142564	40 %	20 %	20 %	20 %	15835646
99	NC_002491	TTTTC	2	10	143910	143919	0 %	80 %	0 %	20 %	15835647
100	NC_002491	TATGT	2	10	144608	144617	20 %	60 %	20 %	0 %	15835648
101	NC_002491	GGTAG	2	10	144679	144688	20 %	20 %	60 %	0 %	15835648
102	NC_002491	GAAGA	2	10	147255	147264	60 %	0 %	40 %	0 %	15835651
103	NC_002491	AAAGA	2	10	151347	151356	80 %	0 %	20 %	0 %	15835656
104	NC_002491	TTTCT	2	10	152054	152063	0 %	80 %	0 %	20 %	15835658
105	NC_002491	GTAGA	2	10	153429	153438	40 %	20 %	40 %	0 %	15835658
106	NC_002491	TCTTT	2	10	153447	153456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_002491	AATAT	2	10	154150	154159	60 %	40 %	0 %	0 %	15835659
108	NC_002491	GATCA	2	10	154409	154418	40 %	20 %	20 %	20 %	15835659
109	NC_002491	TGAGG	2	10	155417	155426	20 %	20 %	60 %	0 %	15835659
110	NC_002491	TAGGA	2	10	155576	155585	40 %	20 %	40 %	0 %	15835659
111	NC_002491	GATAT	2	10	158224	158233	40 %	40 %	20 %	0 %	15835661
112	NC_002491	GGGGA	2	10	158348	158357	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002491	TTATA	2	10	160533	160542	40 %	60 %	0 %	0 %	15835662
114	NC_002491	TAGAG	2	10	161359	161368	40 %	20 %	40 %	0 %	15835663
115	NC_002491	ATACG	2	10	162049	162058	40 %	20 %	20 %	20 %	15835664
116	NC_002491	TATTT	2	10	163612	163621	20 %	80 %	0 %	0 %	15835665
117	NC_002491	CGGAT	2	10	165338	165347	20 %	20 %	40 %	20 %	15835667
118	NC_002491	TCAGT	2	10	165416	165425	20 %	40 %	20 %	20 %	15835667
119	NC_002491	GAAGT	2	10	166130	166139	40 %	20 %	40 %	0 %	15835667
120	NC_002491	GCAAA	2	10	166218	166227	60 %	0 %	20 %	20 %	15835667
121	NC_002491	TCTTT	2	10	167117	167126	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002491	TATTT	2	10	168847	168856	20 %	80 %	0 %	0 %	15835670
123	NC_002491	ATGTT	2	10	170292	170301	20 %	60 %	20 %	0 %	15835671
124	NC_002491	TCAGT	2	10	171097	171106	20 %	40 %	20 %	20 %	15835671
125	NC_002491	ATAGG	2	10	171739	171748	40 %	20 %	40 %	0 %	15835672
126	NC_002491	TTTGA	2	10	173709	173718	20 %	60 %	20 %	0 %	15835673
127	NC_002491	GAGAG	2	10	176168	176177	40 %	0 %	60 %	0 %	15835678
128	NC_002491	ATACC	2	10	176406	176415	40 %	20 %	0 %	40 %	15835678
129	NC_002491	TTTGC	2	10	176629	176638	0 %	60 %	20 %	20 %	15835678
130	NC_002491	TTTTC	2	10	177295	177304	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_002491	GAAGA	2	10	179060	179069	60 %	0 %	40 %	0 %	15835679
132	NC_002491	TTTTC	2	10	181166	181175	0 %	80 %	0 %	20 %	15835680
133	NC_002491	TCTCT	2	10	181218	181227	0 %	60 %	0 %	40 %	15835680
134	NC_002491	CATTT	2	10	181794	181803	20 %	60 %	0 %	20 %	15835680
135	NC_002491	TTTAT	2	10	181999	182008	20 %	80 %	0 %	0 %	15835680
136	NC_002491	TAAAA	2	10	184114	184123	80 %	20 %	0 %	0 %	15835683
137	NC_002491	TTATT	2	10	187873	187882	20 %	80 %	0 %	0 %	15835685
138	NC_002491	AGATT	2	10	188139	188148	40 %	40 %	20 %	0 %	15835685
139	NC_002491	AAAGA	2	10	190407	190416	80 %	0 %	20 %	0 %	15835685
140	NC_002491	CAAGA	2	10	193696	193705	60 %	0 %	20 %	20 %	15835686
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142	NC_002491	ATACC	2	10	197221	197230	40 %	20 %	0 %	40 %	15835688
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