MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002491	AGCA	2	8	98	105	50 %	0 %	25 %	25 %	15835536
2	NC_002491	AGGT	2	8	1004	1011	25 %	25 %	50 %	0 %	15835538
3	NC_002491	AGAA	2	8	1212	1219	75 %	0 %	25 %	0 %	15835538
4	NC_002491	GTGC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	50 %	25 %	15835538
5	NC_002491	CTAC	2	8	3133	3140	25 %	25 %	0 %	50 %	15835539
6	NC_002491	GAAC	2	8	3800	3807	50 %	0 %	25 %	25 %	15835539
7	NC_002491	TAAA	2	8	4341	4348	75 %	25 %	0 %	0 %	15835540
8	NC_002491	AAGG	2	8	4436	4443	50 %	0 %	50 %	0 %	15835540
9	NC_002491	AGGG	2	8	4887	4894	25 %	0 %	75 %	0 %	15835540
10	NC_002491	CTGT	2	8	4896	4903	0 %	50 %	25 %	25 %	15835540
11	NC_002491	GAAA	2	8	4976	4983	75 %	0 %	25 %	0 %	15835540
12	NC_002491	CATC	2	8	5197	5204	25 %	25 %	0 %	50 %	15835540
13	NC_002491	GATA	2	8	5566	5573	50 %	25 %	25 %	0 %	15835540
14	NC_002491	ACAG	2	8	5989	5996	50 %	0 %	25 %	25 %	15835540
15	NC_002491	GGAG	2	8	6437	6444	25 %	0 %	75 %	0 %	15835540
16	NC_002491	TGCT	2	8	7759	7766	0 %	50 %	25 %	25 %	15835542
17	NC_002491	TGCT	2	8	8089	8096	0 %	50 %	25 %	25 %	15835542
18	NC_002491	GCCT	2	8	8305	8312	0 %	25 %	25 %	50 %	15835542
19	NC_002491	TTAT	2	8	8540	8547	25 %	75 %	0 %	0 %	15835542
20	NC_002491	AAGA	2	8	9528	9535	75 %	0 %	25 %	0 %	15835542
21	NC_002491	AGCA	2	8	9704	9711	50 %	0 %	25 %	25 %	15835542
22	NC_002491	ATTT	2	8	11511	11518	25 %	75 %	0 %	0 %	15835544
23	NC_002491	GTAC	2	8	12382	12389	25 %	25 %	25 %	25 %	15835544
24	NC_002491	ATGG	2	8	12579	12586	25 %	25 %	50 %	0 %	15835544
25	NC_002491	GGCA	2	8	12614	12621	25 %	0 %	50 %	25 %	15835544
26	NC_002491	GCAG	2	8	14192	14199	25 %	0 %	50 %	25 %	15835545
27	NC_002491	TTCT	2	8	14473	14480	0 %	75 %	0 %	25 %	15835545
28	NC_002491	AGAA	2	8	14578	14585	75 %	0 %	25 %	0 %	15835545
29	NC_002491	AAGA	2	8	15060	15067	75 %	0 %	25 %	0 %	15835545
30	NC_002491	GATG	2	8	15136	15143	25 %	25 %	50 %	0 %	15835545
31	NC_002491	AGGC	2	8	15196	15203	25 %	0 %	50 %	25 %	15835545
32	NC_002491	TGGT	2	8	15283	15290	0 %	50 %	50 %	0 %	15835545
33	NC_002491	TTTA	2	8	15401	15408	25 %	75 %	0 %	0 %	15835545
34	NC_002491	TTGT	2	8	15752	15759	0 %	75 %	25 %	0 %	15835546
35	NC_002491	ATTT	2	8	16121	16128	25 %	75 %	0 %	0 %	15835546
36	NC_002491	ATCT	2	8	16526	16533	25 %	50 %	0 %	25 %	15835547
37	NC_002491	CCTA	2	8	17305	17312	25 %	25 %	0 %	50 %	15835547
38	NC_002491	GAAA	2	8	17443	17450	75 %	0 %	25 %	0 %	15835547
39	NC_002491	CTCA	2	8	17511	17518	25 %	25 %	0 %	50 %	15835547
40	NC_002491	AAGA	2	8	17775	17782	75 %	0 %	25 %	0 %	15835547
41	NC_002491	AGAT	2	8	17816	17823	50 %	25 %	25 %	0 %	15835547
42	NC_002491	TTTC	2	8	18552	18559	0 %	75 %	0 %	25 %	15835548
43	NC_002491	CTTT	2	8	18653	18660	0 %	75 %	0 %	25 %	15835548
44	NC_002491	AATT	2	8	18787	18794	50 %	50 %	0 %	0 %	15835548
45	NC_002491	CTTT	2	8	18830	18837	0 %	75 %	0 %	25 %	15835548
46	NC_002491	GTTC	2	8	19832	19839	0 %	50 %	25 %	25 %	15835548
47	NC_002491	GAGG	2	8	20153	20160	25 %	0 %	75 %	0 %	15835548
48	NC_002491	CTAC	2	8	21224	21231	25 %	25 %	0 %	50 %	15835550
49	NC_002491	AAAG	2	8	21647	21654	75 %	0 %	25 %	0 %	15835551
50	NC_002491	GAGC	2	8	21820	21827	25 %	0 %	50 %	25 %	15835551
51	NC_002491	CTAT	2	8	21958	21965	25 %	50 %	0 %	25 %	15835551
52	NC_002491	AAAC	2	8	24310	24317	75 %	0 %	0 %	25 %	15835552
53	NC_002491	ATTG	2	8	24862	24869	25 %	50 %	25 %	0 %	15835552
54	NC_002491	ATGG	2	8	25488	25495	25 %	25 %	50 %	0 %	15835553
55	NC_002491	TCAG	2	8	26768	26775	25 %	25 %	25 %	25 %	15835554
56	NC_002491	CTAC	2	8	27353	27360	25 %	25 %	0 %	50 %	15835555
57	NC_002491	CTAT	2	8	28391	28398	25 %	50 %	0 %	25 %	15835555
58	NC_002491	GGGA	2	8	28890	28897	25 %	0 %	75 %	0 %	15835556
59	NC_002491	GCCA	2	8	30429	30436	25 %	0 %	25 %	50 %	15835557
60	NC_002491	TTTC	2	8	30724	30731	0 %	75 %	0 %	25 %	15835557
61	NC_002491	AACG	2	8	30970	30977	50 %	0 %	25 %	25 %	15835557
62	NC_002491	TTGG	2	8	31318	31325	0 %	50 %	50 %	0 %	15835557
63	NC_002491	AGAA	2	8	31867	31874	75 %	0 %	25 %	0 %	15835557
64	NC_002491	TACA	2	8	32161	32168	50 %	25 %	0 %	25 %	15835557
65	NC_002491	TAGG	2	8	32848	32855	25 %	25 %	50 %	0 %	15835558
66	NC_002491	TGCT	2	8	33206	33213	0 %	50 %	25 %	25 %	15835558
67	NC_002491	ATGA	2	8	33578	33585	50 %	25 %	25 %	0 %	15835558
68	NC_002491	AAGG	2	8	34641	34648	50 %	0 %	50 %	0 %	15835559
69	NC_002491	AAGA	2	8	34843	34850	75 %	0 %	25 %	0 %	15835560
70	NC_002491	GGAT	2	8	35271	35278	25 %	25 %	50 %	0 %	15835560
71	NC_002491	CTCG	2	8	35445	35452	0 %	25 %	25 %	50 %	15835560
72	NC_002491	TGAC	2	8	35652	35659	25 %	25 %	25 %	25 %	15835560
73	NC_002491	TAGA	2	8	35966	35973	50 %	25 %	25 %	0 %	15835560
74	NC_002491	CTTT	2	8	36690	36697	0 %	75 %	0 %	25 %	15835561
75	NC_002491	ATAG	2	8	37250	37257	50 %	25 %	25 %	0 %	15835561
76	NC_002491	TATT	2	8	37353	37360	25 %	75 %	0 %	0 %	15835562
77	NC_002491	AGGT	2	8	37581	37588	25 %	25 %	50 %	0 %	15835562
78	NC_002491	TTCC	2	8	37903	37910	0 %	50 %	0 %	50 %	15835562
79	NC_002491	TAGG	2	8	38198	38205	25 %	25 %	50 %	0 %	15835562
80	NC_002491	TTGC	2	8	38445	38452	0 %	50 %	25 %	25 %	15835563
81	NC_002491	AGGG	2	8	38547	38554	25 %	0 %	75 %	0 %	15835563
82	NC_002491	TATG	2	8	38624	38631	25 %	50 %	25 %	0 %	15835563
83	NC_002491	GCTT	2	8	38798	38805	0 %	50 %	25 %	25 %	15835563
84	NC_002491	TTTG	2	8	38862	38869	0 %	75 %	25 %	0 %	15835563
85	NC_002491	AGGT	2	8	39840	39847	25 %	25 %	50 %	0 %	15835564
86	NC_002491	TGAG	2	8	39913	39920	25 %	25 %	50 %	0 %	15835564
87	NC_002491	GTAC	2	8	40164	40171	25 %	25 %	25 %	25 %	15835564
88	NC_002491	ACGT	2	8	40415	40422	25 %	25 %	25 %	25 %	15835564
89	NC_002491	CTTT	2	8	40849	40856	0 %	75 %	0 %	25 %	15835564
90	NC_002491	CATG	2	8	41227	41234	25 %	25 %	25 %	25 %	15835564
91	NC_002491	TTTA	2	8	41756	41763	25 %	75 %	0 %	0 %	15835564
92	NC_002491	ATAA	2	8	41772	41779	75 %	25 %	0 %	0 %	15835564
93	NC_002491	GAAA	2	8	42511	42518	75 %	0 %	25 %	0 %	15835565
94	NC_002491	TAAG	2	8	42931	42938	50 %	25 %	25 %	0 %	15835565
95	NC_002491	TTTC	2	8	43776	43783	0 %	75 %	0 %	25 %	15835567
96	NC_002491	TGAA	2	8	43941	43948	50 %	25 %	25 %	0 %	15835567
97	NC_002491	ATGC	2	8	44378	44385	25 %	25 %	25 %	25 %	15835568
98	NC_002491	CTCC	2	8	45360	45367	0 %	25 %	0 %	75 %	15835569
99	NC_002491	GTCT	2	8	46665	46672	0 %	50 %	25 %	25 %	15835570
100	NC_002491	ATCA	2	8	47126	47133	50 %	25 %	0 %	25 %	15835570
101	NC_002491	TGCC	2	8	47404	47411	0 %	25 %	25 %	50 %	15835570
102	NC_002491	TTTC	2	8	48984	48991	0 %	75 %	0 %	25 %	15835571
103	NC_002491	AGCA	2	8	50199	50206	50 %	0 %	25 %	25 %	15835572
104	NC_002491	AGGA	2	8	50494	50501	50 %	0 %	50 %	0 %	15835572
105	NC_002491	GAAA	2	8	50661	50668	75 %	0 %	25 %	0 %	15835572
106	NC_002491	CTTT	2	8	50713	50720	0 %	75 %	0 %	25 %	15835573
107	NC_002491	CCTT	2	8	51317	51324	0 %	50 %	0 %	50 %	15835573
108	NC_002491	AATG	2	8	51462	51469	50 %	25 %	25 %	0 %	15835573
109	NC_002491	GCAG	2	8	52639	52646	25 %	0 %	50 %	25 %	15835575
110	NC_002491	CCTA	2	8	52737	52744	25 %	25 %	0 %	50 %	15835575
111	NC_002491	AAGA	2	8	52861	52868	75 %	0 %	25 %	0 %	15835575
112	NC_002491	TCCT	2	8	53108	53115	0 %	50 %	0 %	50 %	15835575
113	NC_002491	TTTA	2	8	53322	53329	25 %	75 %	0 %	0 %	15835575
114	NC_002491	ATGA	2	8	54280	54287	50 %	25 %	25 %	0 %	15835577
115	NC_002491	CTTG	2	8	54400	54407	0 %	50 %	25 %	25 %	15835577
116	NC_002491	ATAG	2	8	55179	55186	50 %	25 %	25 %	0 %	15835577
117	NC_002491	AATC	2	8	56167	56174	50 %	25 %	0 %	25 %	15835578
118	NC_002491	GAAA	2	8	56806	56813	75 %	0 %	25 %	0 %	15835578
119	NC_002491	TCAT	2	8	57625	57632	25 %	50 %	0 %	25 %	15835579
120	NC_002491	GATG	2	8	57708	57715	25 %	25 %	50 %	0 %	15835579
121	NC_002491	GAAG	2	8	57766	57773	50 %	0 %	50 %	0 %	15835579
122	NC_002491	TGTC	2	8	58184	58191	0 %	50 %	25 %	25 %	15835580
123	NC_002491	TTTG	2	8	58616	58623	0 %	75 %	25 %	0 %	15835580
124	NC_002491	GGTG	2	8	59153	59160	0 %	25 %	75 %	0 %	15835580
125	NC_002491	GGAT	2	8	59296	59303	25 %	25 %	50 %	0 %	15835580
126	NC_002491	AGCA	2	8	59853	59860	50 %	0 %	25 %	25 %	15835580
127	NC_002491	TTCT	2	8	60869	60876	0 %	75 %	0 %	25 %	15835582
128	NC_002491	AATC	2	8	61171	61178	50 %	25 %	0 %	25 %	15835582
129	NC_002491	GTGG	3	12	61649	61660	0 %	25 %	75 %	0 %	15835582
130	NC_002491	GGAT	2	8	61795	61802	25 %	25 %	50 %	0 %	15835582
131	NC_002491	AGAA	2	8	61805	61812	75 %	0 %	25 %	0 %	15835582
132	NC_002491	TTCC	2	8	62339	62346	0 %	50 %	0 %	50 %	15835582
133	NC_002491	AGCA	2	8	62352	62359	50 %	0 %	25 %	25 %	15835582
134	NC_002491	AGTG	2	8	62533	62540	25 %	25 %	50 %	0 %	15835582
135	NC_002491	GAAG	2	8	62794	62801	50 %	0 %	50 %	0 %	15835582
136	NC_002491	GAAT	2	8	62862	62869	50 %	25 %	25 %	0 %	15835582
137	NC_002491	AAGG	2	8	63249	63256	50 %	0 %	50 %	0 %	15835583
138	NC_002491	TAGA	2	8	63361	63368	50 %	25 %	25 %	0 %	15835584
139	NC_002491	GAAA	2	8	63808	63815	75 %	0 %	25 %	0 %	15835584
140	NC_002491	CTAT	2	8	64330	64337	25 %	50 %	0 %	25 %	15835584
141	NC_002491	TCTA	2	8	64471	64478	25 %	50 %	0 %	25 %	15835584
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