MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae J138 chromosome

Total Repeats: 14101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002491	ATG	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835536
2	NC_002491	CCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835536
3	NC_002491	AGC	2	6	42	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835536
4	NC_002491	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835536
5	NC_002491	ATA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835536
6	NC_002491	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835536
7	NC_002491	AAT	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835536
8	NC_002491	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835537
9	NC_002491	CTT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835537
10	NC_002491	AAG	2	6	697	702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835537
11	NC_002491	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835537
12	NC_002491	GTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835537
13	NC_002491	ATA	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835538
14	NC_002491	ACA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835538
15	NC_002491	ACC	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835538
16	NC_002491	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835538
17	NC_002491	CAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835538
18	NC_002491	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835538
19	NC_002491	GGA	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835538
20	NC_002491	GCA	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835538
21	NC_002491	AGA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835538
22	NC_002491	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835538
23	NC_002491	TGA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835538
24	NC_002491	TCT	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835538
25	NC_002491	CTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835538
26	NC_002491	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835538
27	NC_002491	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835538
28	NC_002491	CAA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835538
29	NC_002491	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835538
30	NC_002491	AGG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835538
31	NC_002491	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835539
32	NC_002491	GAG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835539
33	NC_002491	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835539
34	NC_002491	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835539
35	NC_002491	GAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835539
36	NC_002491	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835539
37	NC_002491	ATG	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835539
38	NC_002491	GAG	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835539
39	NC_002491	GCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835539
40	NC_002491	GGT	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835539
41	NC_002491	CAG	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835539
42	NC_002491	CTC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835539
43	NC_002491	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
44	NC_002491	CTA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835540
45	NC_002491	AGA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835540
46	NC_002491	ATC	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835540
47	NC_002491	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835540
48	NC_002491	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835540
49	NC_002491	TAG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835540
50	NC_002491	TTC	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
51	NC_002491	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835540
52	NC_002491	AGT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835540
53	NC_002491	AGG	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835540
54	NC_002491	AAT	2	6	5060	5065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835540
55	NC_002491	CAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
56	NC_002491	TTA	2	6	5442	5447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835540
57	NC_002491	CAG	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
58	NC_002491	TTA	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835540
59	NC_002491	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835540
60	NC_002491	TTC	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
61	NC_002491	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835540
62	NC_002491	TTC	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
63	NC_002491	AAT	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835540
64	NC_002491	TAG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835540
65	NC_002491	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835540
66	NC_002491	AAG	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835540
67	NC_002491	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835540
68	NC_002491	CCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835540
69	NC_002491	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835540
70	NC_002491	GAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
71	NC_002491	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835540
72	NC_002491	GCA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835540
73	NC_002491	GCC	2	6	6840	6845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15835540
74	NC_002491	ATT	2	6	7650	7655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835542
75	NC_002491	GGT	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835542
76	NC_002491	TTC	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
77	NC_002491	TTC	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
78	NC_002491	GAA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
79	NC_002491	ATT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835542
80	NC_002491	GTG	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15835542
81	NC_002491	TTC	2	6	8045	8050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
82	NC_002491	TTC	2	6	8110	8115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
83	NC_002491	GAA	2	6	8117	8122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
84	NC_002491	TAG	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835542
85	NC_002491	GAA	2	6	8160	8165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
86	NC_002491	GTC	2	6	8166	8171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835542
87	NC_002491	GAT	2	6	8175	8180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835542
88	NC_002491	GCA	2	6	8204	8209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835542
89	NC_002491	GAG	2	6	8241	8246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835542
90	NC_002491	ATG	2	6	8314	8319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835542
91	NC_002491	AGA	2	6	8330	8335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
92	NC_002491	GTC	2	6	8358	8363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835542
93	NC_002491	TCT	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
94	NC_002491	AGA	2	6	8406	8411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
95	NC_002491	GAA	3	9	8418	8426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
96	NC_002491	CTA	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835542
97	NC_002491	TAG	2	6	8479	8484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835542
98	NC_002491	AAT	2	6	8517	8522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835542
99	NC_002491	ATT	2	6	8640	8645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835542
100	NC_002491	ATA	2	6	8809	8814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835542
101	NC_002491	TGA	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835542
102	NC_002491	TGA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835542
103	NC_002491	AGA	2	6	8995	9000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
104	NC_002491	TCT	2	6	9114	9119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
105	NC_002491	AGA	3	9	9206	9214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
106	NC_002491	GAC	2	6	9254	9259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15835542
107	NC_002491	GAA	2	6	9289	9294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
108	NC_002491	GGA	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835542
109	NC_002491	AAG	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
110	NC_002491	ACT	2	6	9487	9492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835542
111	NC_002491	AAG	2	6	9628	9633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
112	NC_002491	AGG	2	6	9790	9795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835542
113	NC_002491	GAA	2	6	9810	9815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
114	NC_002491	CTT	2	6	9867	9872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835542
115	NC_002491	ATT	2	6	10018	10023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835542
116	NC_002491	GAA	2	6	10119	10124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835542
117	NC_002491	GTT	2	6	10930	10935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835543
118	NC_002491	ATG	2	6	10945	10950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835543
119	NC_002491	TAC	2	6	11068	11073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835543
120	NC_002491	AGG	2	6	11141	11146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835543
121	NC_002491	AAG	2	6	11236	11241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835543
122	NC_002491	AGA	2	6	11769	11774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835544
123	NC_002491	AAG	2	6	11839	11844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835544
124	NC_002491	CAC	2	6	11848	11853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15835544
125	NC_002491	GAG	2	6	11941	11946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835544
126	NC_002491	GAG	2	6	12115	12120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835544
127	NC_002491	ACT	2	6	12174	12179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835544
128	NC_002491	ACA	2	6	12218	12223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15835544
129	NC_002491	ATC	2	6	12398	12403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15835544
130	NC_002491	TAG	2	6	12506	12511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835544
131	NC_002491	ATA	2	6	12548	12553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15835544
132	NC_002491	TGA	2	6	12632	12637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835544
133	NC_002491	AGA	2	6	12654	12659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835544
134	NC_002491	AGA	3	9	12672	12680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835544
135	NC_002491	GCT	2	6	12687	12692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835544
136	NC_002491	GAT	2	6	12697	12702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835544
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138	NC_002491	TGA	2	6	12714	12719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835544
139	NC_002491	GAA	2	6	12723	12728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835544
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166	NC_002491	AGA	2	6	14689	14694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15835545
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263	NC_002491	GAG	2	6	21952	21957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835551
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291	NC_002491	ATT	2	6	24400	24405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15835552
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368	NC_002491	GAG	2	6	31691	31696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15835557
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371	NC_002491	TGT	2	6	31852	31857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835557
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381	NC_002491	ATG	2	6	32940	32945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15835558
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383	NC_002491	CTC	2	6	33197	33202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15835558
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385	NC_002491	GCT	3	9	33267	33275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15835558
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390	NC_002491	TTG	2	6	33428	33433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15835558
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394	NC_002491	TTC	2	6	33615	33620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835558
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500	NC_002491	CTT	2	6	42522	42527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15835565

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