MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c plasmid pXF51

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002490	ATGCCT	2	12	41	52	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10956712
2	NC_002490	ACCAAT	2	12	981	992	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	10956713
3	NC_002490	GGAAGA	2	12	2247	2258	50 %	0 %	50 %	0 %	10956714
4	NC_002490	CCTGTA	2	12	9939	9950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10956723
5	NC_002490	AATCGC	2	12	11010	11021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	10956725
6	NC_002490	GGCGAT	2	12	16143	16154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	10956728
7	NC_002490	AAGGCA	2	12	16426	16437	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	10956728
8	NC_002490	AACAGC	2	12	16607	16618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	10956728
9	NC_002490	AAATTG	2	12	17738	17749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10956729
10	NC_002490	CTTGCG	2	12	18475	18486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10956730
11	NC_002490	TCAAGA	2	12	26804	26815	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10956746
12	NC_002490	TGCCAA	2	12	28508	28519	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	10956748
13	NC_002490	GTGCTT	2	12	29132	29143	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	10956748
14	NC_002490	CTGCGG	2	12	31875	31886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	10956752
15	NC_002490	GCTGAC	2	12	40245	40256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10956760
16	NC_002490	AGCCTT	2	12	41178	41189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10956761
17	NC_002490	TTCGAT	2	12	41850	41861	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	10956763
18	NC_002490	AGCCAA	2	12	42247	42258	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	10956763
19	NC_002490	TTTTGC	2	12	44659	44670	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10956766
20	NC_002490	TCCTCG	2	12	46691	46702	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	10956769
21	NC_002490	TCACGG	2	12	48152	48163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	10956771
22	NC_002490	TTTTGC	2	12	49648	49659	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10956773
23	NC_002490	TCTTGT	2	12	50230	50241	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	10956774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.