MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa 9a5c plasmid pXF51

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002490	GCGCG	2	10	1408	1417	0 %	0 %	60 %	40 %	10956714
2	NC_002490	TCAAG	2	10	1698	1707	40 %	20 %	20 %	20 %	10956714
3	NC_002490	TGCGG	2	10	2124	2133	0 %	20 %	60 %	20 %	10956714
4	NC_002490	AAAGT	2	10	3377	3386	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002490	CATCG	2	10	4306	4315	20 %	20 %	20 %	40 %	10956718
6	NC_002490	GTGGC	2	10	8620	8629	0 %	20 %	60 %	20 %	10956722
7	NC_002490	CTTTT	2	10	13404	13413	0 %	80 %	0 %	20 %	10956727
8	NC_002490	GCCAC	2	10	13863	13872	20 %	0 %	20 %	60 %	10956727
9	NC_002490	GGATT	2	10	16359	16368	20 %	40 %	40 %	0 %	10956728
10	NC_002490	CATTA	2	10	17870	17879	40 %	40 %	0 %	20 %	10956729
11	NC_002490	TTTTA	2	10	18084	18093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002490	CCTGC	2	10	19314	19323	0 %	20 %	20 %	60 %	10956732
13	NC_002490	TCCAT	2	10	21962	21971	20 %	40 %	0 %	40 %	10956737
14	NC_002490	TTGCT	2	10	22158	22167	0 %	60 %	20 %	20 %	10956738
15	NC_002490	ACTTT	2	10	23831	23840	20 %	60 %	0 %	20 %	10956742
16	NC_002490	TTTCA	2	10	24006	24015	20 %	60 %	0 %	20 %	10956742
17	NC_002490	ACCCC	2	10	25086	25095	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
18	NC_002490	CGCCA	2	10	26639	26648	20 %	0 %	20 %	60 %	10956745
19	NC_002490	AGGTA	2	10	27184	27193	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002490	CACTG	2	10	30094	30103	20 %	20 %	20 %	40 %	10956750
21	NC_002490	ACTCA	2	10	30415	30424	40 %	20 %	0 %	40 %	10956751
22	NC_002490	TTGTT	2	10	32033	32042	0 %	80 %	20 %	0 %	10956752
23	NC_002490	AAATG	2	10	33086	33095	60 %	20 %	20 %	0 %	10956754
24	NC_002490	CAAGG	2	10	34598	34607	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002490	TCCAT	2	10	34618	34627	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_002490	GTGCG	2	10	35770	35779	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_002490	TGATA	2	10	37467	37476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002490	GCTGG	2	10	38036	38045	0 %	20 %	60 %	20 %	10956757
29	NC_002490	CCACG	2	10	38357	38366	20 %	0 %	20 %	60 %	10956757
30	NC_002490	ACGTG	2	10	39816	39825	20 %	20 %	40 %	20 %	10956759
31	NC_002490	TTGCA	2	10	41500	41509	20 %	40 %	20 %	20 %	10956762
32	NC_002490	GCCAA	2	10	41826	41835	40 %	0 %	20 %	40 %	10956763
33	NC_002490	ACGAT	2	10	42903	42912	40 %	20 %	20 %	20 %	10956764
34	NC_002490	CAAAC	2	10	44787	44796	60 %	0 %	0 %	40 %	10956766
35	NC_002490	CGCCC	2	10	45323	45332	0 %	0 %	20 %	80 %	10956768
36	NC_002490	CATCA	2	10	45456	45465	40 %	20 %	0 %	40 %	10956768
37	NC_002490	GACGC	2	10	48592	48601	20 %	0 %	40 %	40 %	10956772
38	NC_002490	GCAAA	2	10	48891	48900	60 %	0 %	20 %	20 %	10956772
39	NC_002490	CAAAC	2	10	49776	49785	60 %	0 %	0 %	40 %	10956773
40	NC_002490	CATGT	2	10	50024	50033	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.